MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
120501	NC_007005	TCGCC	2	10	6060160	6060169	0 %	20 %	20 %	60 %	66048333
120502	NC_007005	GGC	2	6	6060214	6060219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66048333
120503	NC_007005	TGC	2	6	6060281	6060286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048333
120504	NC_007005	CCG	2	6	6060340	6060345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66048333
120505	NC_007005	TTC	2	6	6060367	6060372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66048333
120506	NC_007005	GCT	2	6	6060417	6060422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048333
120507	NC_007005	CT	3	6	6060421	6060426	0 %	50 %	0 %	50 %	66048333
120508	NC_007005	ACC	2	6	6060436	6060441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66048333
120509	NC_007005	TCGG	2	8	6060485	6060492	0 %	25 %	50 %	25 %	66048333
120510	NC_007005	CGC	2	6	6060495	6060500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66048333
120511	NC_007005	GGCC	2	8	6060620	6060627	0 %	0 %	50 %	50 %	66048333
120512	NC_007005	GCG	2	6	6060652	6060657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66048333
120513	NC_007005	GTTGAT	2	12	6060702	6060713	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	66048333
120514	NC_007005	CG	3	6	6060729	6060734	0 %	0 %	50 %	50 %	66048333
120515	NC_007005	CGCT	2	8	6060774	6060781	0 %	25 %	25 %	50 %	66048333
120516	NC_007005	CTG	2	6	6060793	6060798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048333
120517	NC_007005	CTG	2	6	6060813	6060818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048333
120518	NC_007005	GAT	2	6	6060834	6060839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66048333
120519	NC_007005	CGTG	2	8	6060849	6060856	0 %	25 %	50 %	25 %	66048333
120520	NC_007005	CGG	2	6	6060858	6060863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66048333
120521	NC_007005	TTC	2	6	6060958	6060963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66048333
120522	NC_007005	GCTGGT	2	12	6060993	6061004	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	66048333
120523	NC_007005	TGC	2	6	6061091	6061096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048333
120524	NC_007005	TTC	2	6	6061099	6061104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66048333
120525	NC_007005	CTGGTA	2	12	6061156	6061167	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	66048333
120526	NC_007005	GCC	2	6	6061168	6061173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66048333
120527	NC_007005	TGC	2	6	6061178	6061183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048333
120528	NC_007005	GGT	4	12	6061239	6061250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66048333
120529	NC_007005	TCG	2	6	6061283	6061288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048333
120530	NC_007005	CA	3	6	6061313	6061318	50 %	0 %	0 %	50 %	66048333
120531	NC_007005	GCC	2	6	6061456	6061461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66048333
120532	NC_007005	CTT	2	6	6061524	6061529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66048333
120533	NC_007005	TCG	2	6	6061580	6061585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048333
120534	NC_007005	ATGCCG	2	12	6061586	6061597	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	66048333
120535	NC_007005	GCA	2	6	6061650	6061655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048333
120536	NC_007005	GCC	2	6	6061680	6061685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120537	NC_007005	AC	3	6	6061839	6061844	50 %	0 %	0 %	50 %	66048334
120538	NC_007005	CCA	2	6	6061853	6061858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66048334
120539	NC_007005	GGT	2	6	6061937	6061942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66048334
120540	NC_007005	CTACGA	2	12	6061994	6062005	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	66048334
120541	NC_007005	CTG	2	6	6062016	6062021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048334
120542	NC_007005	CAA	2	6	6062030	6062035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66048334
120543	NC_007005	CTG	2	6	6062049	6062054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048334
120544	NC_007005	CGA	2	6	6062105	6062110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048334
120545	NC_007005	CAT	2	6	6062180	6062185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66048334
120546	NC_007005	CTGGA	2	10	6062412	6062421	20 %	20 %	40 %	20 %	66048334
120547	NC_007005	CTA	2	6	6062459	6062464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66048334
120548	NC_007005	CTG	2	6	6062487	6062492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048334
120549	NC_007005	CTG	2	6	6062559	6062564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048334
120550	NC_007005	C	6	6	6062593	6062598	0 %	0 %	0 %	100 %	66048334
120551	NC_007005	CGT	2	6	6062639	6062644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048334
120552	NC_007005	TAG	2	6	6062688	6062693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66048334
120553	NC_007005	GAA	2	6	6062695	6062700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120554	NC_007005	GGT	2	6	6062822	6062827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120555	NC_007005	ATG	2	6	6062832	6062837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120556	NC_007005	AAT	2	6	6062880	6062885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120557	NC_007005	AGT	2	6	6063191	6063196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66048335
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120562	NC_007005	CTG	2	6	6063654	6063659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048335
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120570	NC_007005	GC	3	6	6064292	6064297	0 %	0 %	50 %	50 %	66048336
120571	NC_007005	ATC	2	6	6064349	6064354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66048336
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120575	NC_007005	AGT	2	6	6064867	6064872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120576	NC_007005	CAG	2	6	6064877	6064882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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120578	NC_007005	AAT	2	6	6064995	6065000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120579	NC_007005	AGG	2	6	6065082	6065087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120580	NC_007005	CAGC	2	8	6065134	6065141	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120581	NC_007005	ACC	2	6	6065383	6065388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120582	NC_007005	GCA	2	6	6065411	6065416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120583	NC_007005	GCT	2	6	6065417	6065422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120584	NC_007005	GATT	2	8	6065470	6065477	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120585	NC_007005	TC	3	6	6065490	6065495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120586	NC_007005	CTTG	2	8	6065548	6065555	0 %	50 %	25 %	25 %	66048337
120587	NC_007005	CGG	2	6	6065608	6065613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66048337
120588	NC_007005	CAG	2	6	6065738	6065743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048337
120589	NC_007005	TGTT	2	8	6065765	6065772	0 %	75 %	25 %	0 %	66048337
120590	NC_007005	CAC	2	6	6065886	6065891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66048337
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120599	NC_007005	CTTG	2	8	6066247	6066254	0 %	50 %	25 %	25 %	66048338
120600	NC_007005	ATTA	2	8	6066389	6066396	50 %	50 %	0 %	0 %	66048338
120601	NC_007005	TTG	2	6	6066414	6066419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66048338
120602	NC_007005	AT	3	6	6066426	6066431	50 %	50 %	0 %	0 %	66048338
120603	NC_007005	GTATG	2	10	6066454	6066463	20 %	40 %	40 %	0 %	66048338
120604	NC_007005	A	6	6	6066509	6066514	100 %	0 %	0 %	0 %	66048338
120605	NC_007005	TGC	2	6	6066546	6066551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048338
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120610	NC_007005	CAAA	2	8	6066955	6066962	75 %	0 %	0 %	25 %	66048338
120611	NC_007005	A	6	6	6066960	6066965	100 %	0 %	0 %	0 %	66048338
120612	NC_007005	GC	3	6	6066971	6066976	0 %	0 %	50 %	50 %	66048338
120613	NC_007005	TGA	2	6	6066991	6066996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66048338
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120615	NC_007005	T	7	7	6067034	6067040	0 %	100 %	0 %	0 %	66048338
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120862	NC_007005	GATC	2	8	6079507	6079514	25 %	25 %	25 %	25 %	66048346
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120932	NC_007005	T	7	7	6082835	6082841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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120952	NC_007005	CAGC	2	8	6083905	6083912	25 %	0 %	25 %	50 %	66048352
120953	NC_007005	TGCC	2	8	6083974	6083981	0 %	25 %	25 %	50 %	66048352
120954	NC_007005	GCT	2	6	6084015	6084020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048352
120955	NC_007005	TGCCAC	2	12	6084120	6084131	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	66048352
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120957	NC_007005	GTCG	2	8	6084251	6084258	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120958	NC_007005	GC	3	6	6084298	6084303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120959	NC_007005	GAGC	2	8	6084390	6084397	25 %	0 %	50 %	25 %	66048353
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120962	NC_007005	GGTC	2	8	6084525	6084532	0 %	25 %	50 %	25 %	66048353
120963	NC_007005	GGCAA	2	10	6084725	6084734	40 %	0 %	40 %	20 %	66048353
120964	NC_007005	CTG	3	9	6084790	6084798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048353
120965	NC_007005	CTG	2	6	6084814	6084819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048353
120966	NC_007005	CTG	2	6	6084952	6084957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048353
120967	NC_007005	CAC	2	6	6085018	6085023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66048353
120968	NC_007005	TTC	2	6	6085066	6085071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66048353
120969	NC_007005	TGC	2	6	6085139	6085144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048353
120970	NC_007005	TTC	2	6	6085174	6085179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66048353
120971	NC_007005	GAC	2	6	6085296	6085301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048354
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120973	NC_007005	GCT	2	6	6085431	6085436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048354
120974	NC_007005	CGT	2	6	6085467	6085472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048354
120975	NC_007005	GCA	2	6	6085506	6085511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048354
120976	NC_007005	GAC	2	6	6085731	6085736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048354
120977	NC_007005	CAG	2	6	6085756	6085761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048354
120978	NC_007005	CCG	2	6	6085773	6085778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66048354
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120983	NC_007005	CTTG	2	8	6086054	6086061	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120984	NC_007005	GCG	2	6	6086080	6086085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66048355
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120989	NC_007005	CAG	2	6	6086407	6086412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048355
120990	NC_007005	CCG	2	6	6086465	6086470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66048355
120991	NC_007005	CAC	2	6	6086509	6086514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66048355
120992	NC_007005	CAA	2	6	6086599	6086604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66048355
120993	NC_007005	CGC	2	6	6086741	6086746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66048356
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120997	NC_007005	CTG	2	6	6086943	6086948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048356
120998	NC_007005	CAG	2	6	6087066	6087071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048356
120999	NC_007005	ATCGC	2	10	6087121	6087130	20 %	20 %	20 %	40 %	66048356
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