MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
115501	NC_007005	CAAT	2	8	5812355	5812362	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115502	NC_007005	TG	3	6	5812408	5812413	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115503	NC_007005	CGGC	2	8	5812420	5812427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115504	NC_007005	AT	3	6	5812445	5812450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115505	NC_007005	GAC	2	6	5812459	5812464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115506	NC_007005	T	6	6	5812470	5812475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115507	NC_007005	GTT	2	6	5812660	5812665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66048124
115508	NC_007005	ATC	2	6	5812670	5812675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66048124
115509	NC_007005	ACG	2	6	5812827	5812832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048124
115510	NC_007005	CTG	2	6	5812913	5812918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048124
115511	NC_007005	TGA	2	6	5812978	5812983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66048124
115512	NC_007005	AGCC	2	8	5813016	5813023	25 %	0 %	25 %	50 %	66048124
115513	NC_007005	ACA	2	6	5813051	5813056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66048124
115514	NC_007005	CAA	2	6	5813134	5813139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66048124
115515	NC_007005	ACCA	2	8	5813264	5813271	50 %	0 %	0 %	50 %	66048124
115516	NC_007005	CGT	2	6	5813275	5813280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048124
115517	NC_007005	GC	3	6	5813281	5813286	0 %	0 %	50 %	50 %	66048124
115518	NC_007005	GCAAG	2	10	5813386	5813395	40 %	0 %	40 %	20 %	66048124
115519	NC_007005	TCG	2	6	5813427	5813432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048124
115520	NC_007005	GCG	2	6	5813541	5813546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66048124
115521	NC_007005	GC	3	6	5813572	5813577	0 %	0 %	50 %	50 %	66048124
115522	NC_007005	TTC	2	6	5813579	5813584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66048124
115523	NC_007005	GCCA	2	8	5813605	5813612	25 %	0 %	25 %	50 %	66048124
115524	NC_007005	GC	3	6	5813622	5813627	0 %	0 %	50 %	50 %	66048124
115525	NC_007005	CGA	2	6	5813704	5813709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048124
115526	NC_007005	CAG	2	6	5813710	5813715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048124
115527	NC_007005	GAC	2	6	5813738	5813743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048124
115528	NC_007005	GAA	2	6	5813819	5813824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66048124
115529	NC_007005	CG	3	6	5813842	5813847	0 %	0 %	50 %	50 %	66048124
115530	NC_007005	GCC	3	9	5813873	5813881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66048124
115531	NC_007005	CGC	2	6	5813895	5813900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66048124
115532	NC_007005	AAC	2	6	5813907	5813912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66048124
115533	NC_007005	GCC	2	6	5813921	5813926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66048124
115534	NC_007005	CTG	2	6	5813942	5813947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048124
115535	NC_007005	CG	3	6	5814130	5814135	0 %	0 %	50 %	50 %	66048124
115536	NC_007005	CGC	2	6	5814216	5814221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66048124
115537	NC_007005	CTG	2	6	5814233	5814238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048124
115538	NC_007005	AGC	3	9	5814354	5814362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048124
115539	NC_007005	GCG	2	6	5814402	5814407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66048124
115540	NC_007005	CAG	2	6	5814434	5814439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048124
115541	NC_007005	CAT	2	6	5814571	5814576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66048124
115542	NC_007005	AAGG	2	8	5814704	5814711	50 %	0 %	50 %	0 %	66048124
115543	NC_007005	GGCG	2	8	5814736	5814743	0 %	0 %	75 %	25 %	66048124
115544	NC_007005	CGA	2	6	5814917	5814922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115545	NC_007005	CAA	2	6	5815009	5815014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66048125
115546	NC_007005	TGC	2	6	5815052	5815057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048125
115547	NC_007005	TAC	2	6	5815180	5815185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66048125
115548	NC_007005	TCG	3	9	5815220	5815228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048125
115549	NC_007005	GGC	2	6	5815237	5815242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66048125
115550	NC_007005	CTG	2	6	5815273	5815278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048125
115551	NC_007005	CG	3	6	5815333	5815338	0 %	0 %	50 %	50 %	66048125
115552	NC_007005	GC	3	6	5815372	5815377	0 %	0 %	50 %	50 %	66048125
115553	NC_007005	AGC	2	6	5815421	5815426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048125
115554	NC_007005	CGC	2	6	5815451	5815456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66048125
115555	NC_007005	CAA	2	6	5815467	5815472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66048125
115556	NC_007005	GAT	2	6	5815485	5815490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66048125
115557	NC_007005	GCA	2	6	5815517	5815522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048125
115558	NC_007005	CTGC	2	8	5815530	5815537	0 %	25 %	25 %	50 %	66048125
115559	NC_007005	ACGC	2	8	5815629	5815636	25 %	0 %	25 %	50 %	66048125
115560	NC_007005	TCG	2	6	5815680	5815685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048125
115561	NC_007005	GGC	2	6	5815705	5815710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66048125
115562	NC_007005	GAC	2	6	5815732	5815737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048125
115563	NC_007005	CTGG	2	8	5815848	5815855	0 %	25 %	50 %	25 %	66048125
115564	NC_007005	CCG	2	6	5815871	5815876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66048125
115565	NC_007005	GGCCGA	2	12	5815884	5815895	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	66048125
115566	NC_007005	GCC	2	6	5815939	5815944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66048125
115567	NC_007005	GCT	2	6	5815956	5815961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048125
115568	NC_007005	GTC	2	6	5815995	5816000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048125
115569	NC_007005	AGA	2	6	5816033	5816038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66048126
115570	NC_007005	CTG	2	6	5816142	5816147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048126
115571	NC_007005	ATG	2	6	5816169	5816174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66048126
115572	NC_007005	TCC	2	6	5816194	5816199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	66048126
115573	NC_007005	TC	3	6	5816219	5816224	0 %	50 %	0 %	50 %	66048126
115574	NC_007005	GAA	2	6	5816229	5816234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66048126
115575	NC_007005	C	6	6	5816259	5816264	0 %	0 %	0 %	100 %	66048126
115576	NC_007005	TAA	2	6	5816307	5816312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115577	NC_007005	T	6	6	5816319	5816324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115578	NC_007005	A	6	6	5816325	5816330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115579	NC_007005	GAC	2	6	5816338	5816343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115580	NC_007005	CGG	2	6	5816422	5816427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115581	NC_007005	CAC	2	6	5816446	5816451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115582	NC_007005	CA	3	6	5816476	5816481	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115583	NC_007005	CA	3	6	5816488	5816493	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115584	NC_007005	CTCAC	2	10	5816618	5816627	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
115585	NC_007005	GGA	2	6	5816674	5816679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115586	NC_007005	TCA	2	6	5816734	5816739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115587	NC_007005	CG	3	6	5816748	5816753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115588	NC_007005	CTG	2	6	5816815	5816820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115589	NC_007005	GCG	2	6	5816850	5816855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115590	NC_007005	TGA	2	6	5816955	5816960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66048127
115591	NC_007005	GCT	2	6	5816979	5816984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048127
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115593	NC_007005	GTG	2	6	5817013	5817018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66048127
115594	NC_007005	TCT	2	6	5817103	5817108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66048127
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115598	NC_007005	TTTC	2	8	5817195	5817202	0 %	75 %	0 %	25 %	66048127
115599	NC_007005	ATCG	2	8	5817213	5817220	25 %	25 %	25 %	25 %	66048127
115600	NC_007005	GCAAT	2	10	5817221	5817230	40 %	20 %	20 %	20 %	66048127
115601	NC_007005	GCT	3	9	5817483	5817491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048127
115602	NC_007005	A	7	7	5817502	5817508	100 %	0 %	0 %	0 %	66048127
115603	NC_007005	CT	3	6	5817630	5817635	0 %	50 %	0 %	50 %	66048127
115604	NC_007005	ATT	2	6	5817658	5817663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	66048127
115605	NC_007005	ACT	2	6	5817785	5817790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66048127
115606	NC_007005	TGGAG	2	10	5817848	5817857	20 %	20 %	60 %	0 %	66048127
115607	NC_007005	A	6	6	5817899	5817904	100 %	0 %	0 %	0 %	66048127
115608	NC_007005	ATTTC	2	10	5817998	5818007	20 %	60 %	0 %	20 %	66048127
115609	NC_007005	GGC	2	6	5818011	5818016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66048127
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115611	NC_007005	TGC	2	6	5818051	5818056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048128
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115614	NC_007005	TGATT	2	10	5818154	5818163	20 %	60 %	20 %	0 %	66048128
115615	NC_007005	GGA	2	6	5818199	5818204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	66048128
115616	NC_007005	GTT	2	6	5818221	5818226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66048128
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115618	NC_007005	AAAG	2	8	5818325	5818332	75 %	0 %	25 %	0 %	66048128
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115631	NC_007005	ATT	2	6	5819435	5819440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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115975	NC_007005	TGC	2	6	5837314	5837319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048147
115976	NC_007005	GCT	2	6	5837375	5837380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048147
115977	NC_007005	AGCG	2	8	5837386	5837393	25 %	0 %	50 %	25 %	66048147
115978	NC_007005	TGC	2	6	5837426	5837431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048147
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115980	NC_007005	ATTT	2	8	5837529	5837536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115981	NC_007005	GT	3	6	5837563	5837568	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115982	NC_007005	ATCTGC	2	12	5837631	5837642	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115983	NC_007005	GC	3	6	5837677	5837682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115984	NC_007005	AC	3	6	5837708	5837713	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115985	NC_007005	CGC	2	6	5837750	5837755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115986	NC_007005	AT	5	10	5837851	5837860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115987	NC_007005	T	6	6	5837947	5837952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115988	NC_007005	C	6	6	5838014	5838019	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
115989	NC_007005	GTA	2	6	5838109	5838114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115990	NC_007005	GCT	2	6	5838231	5838236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048148
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115994	NC_007005	T	6	6	5838534	5838539	0 %	100 %	0 %	0 %	66048148
115995	NC_007005	GATG	2	8	5838563	5838570	25 %	25 %	50 %	0 %	66048148
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