MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_007005	GCCGAT	2	12	542588	542599	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	66043767
11002	NC_007005	CGAC	2	8	542658	542665	25 %	0 %	25 %	50 %	66043767
11003	NC_007005	ACCT	2	8	542666	542673	25 %	25 %	0 %	50 %	66043767
11004	NC_007005	GCT	2	6	542686	542691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043767
11005	NC_007005	CG	3	6	542701	542706	0 %	0 %	50 %	50 %	66043767
11006	NC_007005	GC	3	6	542752	542757	0 %	0 %	50 %	50 %	66043767
11007	NC_007005	CG	3	6	542768	542773	0 %	0 %	50 %	50 %	66043767
11008	NC_007005	TGG	2	6	542880	542885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043767
11009	NC_007005	GGT	2	6	542920	542925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043767
11010	NC_007005	AGC	2	6	542937	542942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043767
11011	NC_007005	GGC	2	6	542975	542980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043767
11012	NC_007005	TCG	2	6	543084	543089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043767
11013	NC_007005	ATC	2	6	543128	543133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043767
11014	NC_007005	GGT	2	6	543151	543156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043767
11015	NC_007005	GAA	2	6	543209	543214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043767
11016	NC_007005	CG	3	6	543269	543274	0 %	0 %	50 %	50 %	66043767
11017	NC_007005	GCG	2	6	543327	543332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043767
11018	NC_007005	GAA	2	6	543392	543397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043767
11019	NC_007005	AAC	2	6	543423	543428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043767
11020	NC_007005	CG	3	6	543477	543482	0 %	0 %	50 %	50 %	66043767
11021	NC_007005	GCC	2	6	543565	543570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043767
11022	NC_007005	GTCCG	2	10	543571	543580	0 %	20 %	40 %	40 %	66043767
11023	NC_007005	GCGT	2	8	543582	543589	0 %	25 %	50 %	25 %	66043767
11024	NC_007005	GAT	2	6	543640	543645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043767
11025	NC_007005	CGCC	2	8	543694	543701	0 %	0 %	25 %	75 %	66043767
11026	NC_007005	TGC	2	6	543741	543746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043767
11027	NC_007005	ACGCA	2	10	543856	543865	40 %	0 %	20 %	40 %	66043767
11028	NC_007005	GCCT	2	8	543930	543937	0 %	25 %	25 %	50 %	66043767
11029	NC_007005	GCT	2	6	543943	543948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043767
11030	NC_007005	GCC	2	6	543971	543976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043767
11031	NC_007005	GCCA	3	12	543986	543997	25 %	0 %	25 %	50 %	66043767
11032	NC_007005	CAT	2	6	544105	544110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043767
11033	NC_007005	G	6	6	544181	544186	0 %	0 %	100 %	0 %	66043767
11034	NC_007005	GGT	2	6	544201	544206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043767
11035	NC_007005	GGC	2	6	544260	544265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11036	NC_007005	TCT	2	6	544282	544287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043768
11037	NC_007005	GGC	2	6	544306	544311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043768
11038	NC_007005	GGT	2	6	544362	544367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043768
11039	NC_007005	CGG	2	6	544403	544408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043768
11040	NC_007005	TGC	2	6	544480	544485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11041	NC_007005	TGA	2	6	544502	544507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043768
11042	NC_007005	TCG	2	6	544519	544524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11043	NC_007005	GGC	2	6	544650	544655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043768
11044	NC_007005	AGC	2	6	544660	544665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11045	NC_007005	CCAGGT	2	12	544676	544687	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11046	NC_007005	TGA	2	6	544751	544756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043768
11047	NC_007005	TGA	2	6	544766	544771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043768
11048	NC_007005	GAT	2	6	544788	544793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043768
11049	NC_007005	GCGGAT	2	12	544827	544838	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	66043768
11050	NC_007005	GATGGT	2	12	544866	544877	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	66043768
11051	NC_007005	ATG	2	6	544912	544917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043768
11052	NC_007005	GTG	2	6	545026	545031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043768
11053	NC_007005	CAG	2	6	545061	545066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11054	NC_007005	GTC	2	6	545071	545076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11055	NC_007005	CAG	2	6	545127	545132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11056	NC_007005	TGA	2	6	545162	545167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043768
11057	NC_007005	GAT	2	6	545169	545174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043768
11058	NC_007005	ATG	2	6	545257	545262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043768
11059	NC_007005	CGA	2	6	545318	545323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11060	NC_007005	CAG	2	6	545331	545336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11061	NC_007005	CTG	2	6	545361	545366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11062	NC_007005	TTC	2	6	545394	545399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043768
11063	NC_007005	TGTCGC	2	12	545408	545419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11064	NC_007005	GGC	2	6	545475	545480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043768
11065	NC_007005	ATC	3	9	545524	545532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043768
11066	NC_007005	GTA	3	9	545577	545585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043768
11067	NC_007005	CAG	2	6	545688	545693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11068	NC_007005	AGC	2	6	545701	545706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11069	NC_007005	TCA	2	6	545711	545716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043768
11070	NC_007005	CAC	2	6	545733	545738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043768
11071	NC_007005	CGT	2	6	545753	545758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11072	NC_007005	CCA	2	6	545801	545806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043768
11073	NC_007005	ACC	2	6	545815	545820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043768
11074	NC_007005	CCAG	2	8	545933	545940	25 %	0 %	25 %	50 %	66043768
11075	NC_007005	GCA	2	6	545954	545959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11076	NC_007005	CAG	2	6	546048	546053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11077	NC_007005	CAG	2	6	546063	546068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11078	NC_007005	GCC	2	6	546155	546160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043768
11079	NC_007005	CAG	2	6	546180	546185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11080	NC_007005	CAG	2	6	546198	546203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11081	NC_007005	TTG	2	6	546319	546324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043768
11082	NC_007005	TCG	2	6	546346	546351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11083	NC_007005	GC	3	6	546358	546363	0 %	0 %	50 %	50 %	66043768
11084	NC_007005	CAG	2	6	546486	546491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11085	NC_007005	GGC	2	6	546523	546528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043768
11086	NC_007005	AGC	2	6	546538	546543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11087	NC_007005	CTGTTT	2	12	546666	546677	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	66043768
11088	NC_007005	CAG	3	9	546693	546701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11089	NC_007005	TGC	2	6	546766	546771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11090	NC_007005	CTG	2	6	546786	546791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11091	NC_007005	CAG	2	6	546867	546872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11092	NC_007005	GCT	2	6	546873	546878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11093	NC_007005	GCC	2	6	546879	546884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043768
11094	NC_007005	GCG	2	6	546936	546941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043768
11095	NC_007005	GC	3	6	546987	546992	0 %	0 %	50 %	50 %	66043768
11096	NC_007005	GCTG	2	8	547016	547023	0 %	25 %	50 %	25 %	66043768
11097	NC_007005	GGC	2	6	547064	547069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043768
11098	NC_007005	GCA	2	6	547070	547075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11099	NC_007005	ATTG	2	8	547086	547093	25 %	50 %	25 %	0 %	66043768
11100	NC_007005	CTG	2	6	547179	547184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11101	NC_007005	CGT	2	6	547262	547267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11102	NC_007005	CTG	2	6	547290	547295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11103	NC_007005	TGC	2	6	547298	547303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11104	NC_007005	GCTG	2	8	547304	547311	0 %	25 %	50 %	25 %	66043768
11105	NC_007005	GCC	2	6	547341	547346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043768
11106	NC_007005	CAC	2	6	547365	547370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043768
11107	NC_007005	CTTT	2	8	547375	547382	0 %	75 %	0 %	25 %	66043768
11108	NC_007005	GCT	2	6	547436	547441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11109	NC_007005	TGCT	2	8	547474	547481	0 %	50 %	25 %	25 %	66043768
11110	NC_007005	GCG	2	6	547582	547587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043768
11111	NC_007005	CTG	2	6	547588	547593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11112	NC_007005	CGG	2	6	547601	547606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043768
11113	NC_007005	AGA	2	6	547620	547625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043768
11114	NC_007005	GCA	2	6	547648	547653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043768
11115	NC_007005	ATG	2	6	547690	547695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043768
11116	NC_007005	CGGG	2	8	547736	547743	0 %	0 %	75 %	25 %	161486740
11117	NC_007005	TTCCA	2	10	547813	547822	20 %	40 %	0 %	40 %	161486740
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11240	NC_007005	GTG	2	6	553821	553826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043771
11241	NC_007005	GC	4	8	553859	553866	0 %	0 %	50 %	50 %	66043771
11242	NC_007005	TCA	2	6	553911	553916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043771
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11244	NC_007005	CTG	2	6	554246	554251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043771
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11270	NC_007005	T	6	6	555545	555550	0 %	100 %	0 %	0 %	66043771
11271	NC_007005	CAGC	2	8	555594	555601	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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11277	NC_007005	GC	3	6	555979	555984	0 %	0 %	50 %	50 %	66043772
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11301	NC_007005	CGGT	2	8	557594	557601	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11302	NC_007005	CG	3	6	557676	557681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11359	NC_007005	GCA	2	6	561125	561130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161486739
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11362	NC_007005	CCG	2	6	561217	561222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161486739
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11376	NC_007005	T	6	6	561804	561809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11377	NC_007005	T	6	6	561863	561868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11378	NC_007005	ATTG	2	8	561956	561963	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11386	NC_007005	CAGA	2	8	562384	562391	50 %	0 %	25 %	25 %	66043774
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11415	NC_007005	TTC	3	9	563603	563611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11420	NC_007005	CAGC	2	8	564391	564398	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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11422	NC_007005	A	7	7	564430	564436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11423	NC_007005	CTT	2	6	564467	564472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11431	NC_007005	ATT	2	6	564911	564916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	66043776
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11481	NC_007005	TG	4	8	567530	567537	0 %	50 %	50 %	0 %	66043778
11482	NC_007005	AGC	2	6	567544	567549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043778
11483	NC_007005	GGC	2	6	567555	567560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043778
11484	NC_007005	GTC	2	6	567709	567714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043779
11485	NC_007005	TGGGCC	2	12	567773	567784	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	66043779
11486	NC_007005	CTG	2	6	567863	567868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043779
11487	NC_007005	CAC	2	6	567886	567891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043779
11488	NC_007005	CGC	2	6	567909	567914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043779
11489	NC_007005	TGC	2	6	568031	568036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043779
11490	NC_007005	GCA	2	6	568065	568070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043779
11491	NC_007005	CCG	2	6	568175	568180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11492	NC_007005	TGC	2	6	568213	568218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11493	NC_007005	TGCC	2	8	568234	568241	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11494	NC_007005	CTGC	2	8	568253	568260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11495	NC_007005	GCC	2	6	568334	568339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11496	NC_007005	CTG	2	6	568397	568402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043780
11497	NC_007005	GCT	3	9	568471	568479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043780
11498	NC_007005	CGG	2	6	568483	568488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043780
11499	NC_007005	ATG	2	6	568596	568601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043780
11500	NC_007005	TCA	2	6	568683	568688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043780

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