MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
113001	NC_007005	TGC	2	6	5685674	5685679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048020
113002	NC_007005	TGA	2	6	5685692	5685697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66048020
113003	NC_007005	TGTT	2	8	5685710	5685717	0 %	75 %	25 %	0 %	66048020
113004	NC_007005	GCCA	2	8	5685736	5685743	25 %	0 %	25 %	50 %	66048020
113005	NC_007005	GC	3	6	5685769	5685774	0 %	0 %	50 %	50 %	66048020
113006	NC_007005	CAG	2	6	5685796	5685801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048020
113007	NC_007005	ACC	2	6	5685824	5685829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66048020
113008	NC_007005	CAG	2	6	5685941	5685946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048020
113009	NC_007005	CAA	2	6	5685984	5685989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66048020
113010	NC_007005	CGA	2	6	5685996	5686001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048020
113011	NC_007005	GGCT	2	8	5686015	5686022	0 %	25 %	50 %	25 %	66048020
113012	NC_007005	GTG	2	6	5686118	5686123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66048020
113013	NC_007005	CAA	2	6	5686180	5686185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66048020
113014	NC_007005	GGC	2	6	5686229	5686234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66048020
113015	NC_007005	CG	3	6	5686272	5686277	0 %	0 %	50 %	50 %	66048020
113016	NC_007005	CTG	2	6	5686294	5686299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048020
113017	NC_007005	CAG	2	6	5686321	5686326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048020
113018	NC_007005	GCC	2	6	5686462	5686467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66048020
113019	NC_007005	GCC	2	6	5686585	5686590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66048020
113020	NC_007005	GAT	2	6	5686699	5686704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66048020
113021	NC_007005	CT	3	6	5686731	5686736	0 %	50 %	0 %	50 %	66048020
113022	NC_007005	GTG	2	6	5686822	5686827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66048020
113023	NC_007005	TGC	2	6	5686833	5686838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048020
113024	NC_007005	CGA	2	6	5686869	5686874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048020
113025	NC_007005	GCT	2	6	5686889	5686894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048020
113026	NC_007005	AC	3	6	5686997	5687002	50 %	0 %	0 %	50 %	66048020
113027	NC_007005	GCC	2	6	5687169	5687174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66048020
113028	NC_007005	GCTG	2	8	5687211	5687218	0 %	25 %	50 %	25 %	66048020
113029	NC_007005	T	7	7	5687286	5687292	0 %	100 %	0 %	0 %	66048020
113030	NC_007005	CAC	2	6	5687412	5687417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66048021
113031	NC_007005	GCT	2	6	5687440	5687445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048021
113032	NC_007005	CAG	2	6	5687515	5687520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048021
113033	NC_007005	AAC	2	6	5687625	5687630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66048021
113034	NC_007005	GCC	2	6	5687667	5687672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66048021
113035	NC_007005	GACC	2	8	5687677	5687684	25 %	0 %	25 %	50 %	66048021
113036	NC_007005	AGA	2	6	5687715	5687720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66048021
113037	NC_007005	CAA	2	6	5687722	5687727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66048021
113038	NC_007005	GAT	2	6	5687895	5687900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66048022
113039	NC_007005	CCAG	2	8	5687915	5687922	25 %	0 %	25 %	50 %	66048022
113040	NC_007005	CGAG	2	8	5687924	5687931	25 %	0 %	50 %	25 %	66048022
113041	NC_007005	GAT	2	6	5687961	5687966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66048022
113042	NC_007005	GCA	2	6	5688058	5688063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048022
113043	NC_007005	GCA	2	6	5688097	5688102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048022
113044	NC_007005	GC	3	6	5688104	5688109	0 %	0 %	50 %	50 %	66048022
113045	NC_007005	GCA	2	6	5688215	5688220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048022
113046	NC_007005	GCAC	2	8	5688233	5688240	25 %	0 %	25 %	50 %	66048022
113047	NC_007005	CA	3	6	5688311	5688316	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113048	NC_007005	GAA	2	6	5688347	5688352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113049	NC_007005	ACC	2	6	5688355	5688360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113050	NC_007005	GTG	2	6	5688403	5688408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66048023
113051	NC_007005	GCTC	2	8	5688419	5688426	0 %	25 %	25 %	50 %	66048023
113052	NC_007005	ATG	2	6	5688457	5688462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66048023
113053	NC_007005	CTG	2	6	5688498	5688503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048023
113054	NC_007005	CG	4	8	5688505	5688512	0 %	0 %	50 %	50 %	66048023
113055	NC_007005	CTTCAT	2	12	5688602	5688613	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	66048023
113056	NC_007005	CAG	2	6	5688672	5688677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048023
113057	NC_007005	TCGC	2	8	5688686	5688693	0 %	25 %	25 %	50 %	66048023
113058	NC_007005	ATC	2	6	5688697	5688702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66048023
113059	NC_007005	TCC	2	6	5688757	5688762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	66048023
113060	NC_007005	CCT	2	6	5688797	5688802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	66048023
113061	NC_007005	GCTG	2	8	5688842	5688849	0 %	25 %	50 %	25 %	66048023
113062	NC_007005	CTGA	2	8	5688870	5688877	25 %	25 %	25 %	25 %	66048023
113063	NC_007005	CTC	2	6	5688933	5688938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	66048023
113064	NC_007005	GTT	2	6	5688984	5688989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66048023
113065	NC_007005	GTC	2	6	5689017	5689022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048023
113066	NC_007005	TGC	2	6	5689039	5689044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048023
113067	NC_007005	GCA	2	6	5689064	5689069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048023
113068	NC_007005	CAGG	2	8	5689106	5689113	25 %	0 %	50 %	25 %	66048023
113069	NC_007005	CAC	2	6	5689203	5689208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66048023
113070	NC_007005	CCA	2	6	5689209	5689214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66048023
113071	NC_007005	CAG	3	9	5689230	5689238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048023
113072	NC_007005	GCA	3	9	5689280	5689288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048023
113073	NC_007005	CAG	2	6	5689365	5689370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048023
113074	NC_007005	TCA	2	6	5689469	5689474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66048023
113075	NC_007005	CGA	2	6	5689529	5689534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048023
113076	NC_007005	GA	3	6	5689744	5689749	50 %	0 %	50 %	0 %	66048023
113077	NC_007005	TTCA	2	8	5689759	5689766	25 %	50 %	0 %	25 %	66048023
113078	NC_007005	ATC	2	6	5689826	5689831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66048024
113079	NC_007005	CG	3	6	5689838	5689843	0 %	0 %	50 %	50 %	66048024
113080	NC_007005	CGG	2	6	5689848	5689853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66048024
113081	NC_007005	CCA	2	6	5689864	5689869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66048024
113082	NC_007005	CGC	2	6	5689936	5689941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66048024
113083	NC_007005	GCA	2	6	5689960	5689965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048024
113084	NC_007005	GTC	2	6	5689980	5689985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048024
113085	NC_007005	GCT	2	6	5689996	5690001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048024
113086	NC_007005	GCG	2	6	5690084	5690089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66048024
113087	NC_007005	CAG	2	6	5690111	5690116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048024
113088	NC_007005	ATC	2	6	5690147	5690152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66048024
113089	NC_007005	TCC	2	6	5690181	5690186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	66048024
113090	NC_007005	CAT	2	6	5690207	5690212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66048024
113091	NC_007005	GGC	2	6	5690239	5690244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66048024
113092	NC_007005	CCAT	2	8	5690259	5690266	25 %	25 %	0 %	50 %	66048024
113093	NC_007005	ACG	2	6	5690292	5690297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048024
113094	NC_007005	TGC	2	6	5690310	5690315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048024
113095	NC_007005	CTA	2	6	5690416	5690421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66048024
113096	NC_007005	TGA	2	6	5690451	5690456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113097	NC_007005	AAC	2	6	5690641	5690646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113098	NC_007005	TGT	2	6	5690713	5690718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66048025
113099	NC_007005	GCC	2	6	5690781	5690786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66048025
113100	NC_007005	CAG	2	6	5690850	5690855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048025
113101	NC_007005	CGC	2	6	5690904	5690909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66048025
113102	NC_007005	CAC	3	9	5690918	5690926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66048025
113103	NC_007005	GGC	2	6	5690955	5690960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66048025
113104	NC_007005	GCC	2	6	5690982	5690987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66048025
113105	NC_007005	CTGGAG	2	12	5691012	5691023	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	66048025
113106	NC_007005	GGT	2	6	5691050	5691055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66048025
113107	NC_007005	GCG	2	6	5691072	5691077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66048025
113108	NC_007005	GC	3	6	5691102	5691107	0 %	0 %	50 %	50 %	66048025
113109	NC_007005	CGGG	2	8	5691159	5691166	0 %	0 %	75 %	25 %	66048025
113110	NC_007005	CTG	2	6	5691222	5691227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048025
113111	NC_007005	GCGCC	2	10	5691230	5691239	0 %	0 %	40 %	60 %	66048025
113112	NC_007005	GC	3	6	5691273	5691278	0 %	0 %	50 %	50 %	66048025
113113	NC_007005	ACC	2	6	5691279	5691284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66048025
113114	NC_007005	CGC	2	6	5691289	5691294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66048025
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113116	NC_007005	AGC	2	6	5691415	5691420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048025
113117	NC_007005	CGT	2	6	5691518	5691523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048025
113118	NC_007005	TGCCGC	2	12	5691535	5691546	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	66048025
113119	NC_007005	ACGCAG	2	12	5691639	5691650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66048025
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113121	NC_007005	CG	3	6	5691745	5691750	0 %	0 %	50 %	50 %	66048025
113122	NC_007005	GC	3	6	5691813	5691818	0 %	0 %	50 %	50 %	66048025
113123	NC_007005	GCCACC	2	12	5691840	5691851	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	66048025
113124	NC_007005	TGC	2	6	5691951	5691956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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113132	NC_007005	GAA	2	6	5692216	5692221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66048026
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113141	NC_007005	GC	3	6	5692585	5692590	0 %	0 %	50 %	50 %	66048026
113142	NC_007005	CG	3	6	5692626	5692631	0 %	0 %	50 %	50 %	66048026
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113148	NC_007005	CTG	2	6	5692915	5692920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048026
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113152	NC_007005	TGG	2	6	5693142	5693147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66048026
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113192	NC_007005	TCG	2	6	5694518	5694523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048027
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113220	NC_007005	CGGC	2	8	5695874	5695881	0 %	0 %	50 %	50 %	66048027
113221	NC_007005	GGGC	2	8	5695896	5695903	0 %	0 %	75 %	25 %	66048027
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113224	NC_007005	TCG	2	6	5695943	5695948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048027
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113229	NC_007005	CTG	2	6	5696014	5696019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048027
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113348	NC_007005	TAA	2	6	5701600	5701605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	66048030
113349	NC_007005	ACCTC	2	10	5701652	5701661	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
113350	NC_007005	CAA	2	6	5701707	5701712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113351	NC_007005	A	6	6	5701753	5701758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113352	NC_007005	TA	3	6	5701805	5701810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113353	NC_007005	TCA	2	6	5701846	5701851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113354	NC_007005	A	7	7	5701851	5701857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113355	NC_007005	ATC	2	6	5701882	5701887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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113359	NC_007005	TCA	3	9	5702292	5702300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66048031
113360	NC_007005	GT	3	6	5702331	5702336	0 %	50 %	50 %	0 %	66048031
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113383	NC_007005	GAAGT	2	10	5703356	5703365	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
113384	NC_007005	A	7	7	5703585	5703591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113385	NC_007005	GCT	2	6	5703640	5703645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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113400	NC_007005	T	6	6	5704593	5704598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113401	NC_007005	GCT	2	6	5704749	5704754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048034
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113418	NC_007005	TGA	2	6	5705401	5705406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66048034
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113428	NC_007005	CTG	2	6	5705715	5705720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048034
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113451	NC_007005	GC	3	6	5706777	5706782	0 %	0 %	50 %	50 %	66048035
113452	NC_007005	GCT	2	6	5706863	5706868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66048035
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113456	NC_007005	A	6	6	5707031	5707036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113457	NC_007005	GCT	2	6	5707081	5707086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113458	NC_007005	CCA	2	6	5707100	5707105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113459	NC_007005	CAA	3	9	5707124	5707132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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113464	NC_007005	GAA	2	6	5707365	5707370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66048036
113465	NC_007005	ACC	2	6	5707392	5707397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66048036
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113467	NC_007005	GGA	2	6	5707517	5707522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	66048036
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113479	NC_007005	GAT	2	6	5708279	5708284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66048036
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113482	NC_007005	GAT	2	6	5708523	5708528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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113484	NC_007005	GC	3	6	5708625	5708630	0 %	0 %	50 %	50 %	66048037
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113500	NC_007005	CGCC	2	8	5709128	5709135	0 %	0 %	25 %	75 %	66048037

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