MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_007005	TCG	2	6	495842	495847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043725
10002	NC_007005	GAC	2	6	495868	495873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043725
10003	NC_007005	GCG	2	6	495905	495910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043725
10004	NC_007005	ATG	2	6	495926	495931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043725
10005	NC_007005	GCCT	2	8	495940	495947	0 %	25 %	25 %	50 %	66043725
10006	NC_007005	TTG	2	6	495986	495991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043725
10007	NC_007005	CAG	2	6	496114	496119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043725
10008	NC_007005	GTG	2	6	496175	496180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043725
10009	NC_007005	CGG	2	6	496183	496188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043725
10010	NC_007005	GCA	2	6	496215	496220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043725
10011	NC_007005	ACG	2	6	496233	496238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043725
10012	NC_007005	CAG	2	6	496267	496272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043725
10013	NC_007005	CG	3	6	496295	496300	0 %	0 %	50 %	50 %	66043725
10014	NC_007005	CTT	2	6	496306	496311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043725
10015	NC_007005	GGC	2	6	496416	496421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043725
10016	NC_007005	CCA	2	6	496431	496436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043725
10017	NC_007005	CAC	2	6	496446	496451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043725
10018	NC_007005	CGC	2	6	496485	496490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043725
10019	NC_007005	CG	3	6	496590	496595	0 %	0 %	50 %	50 %	66043725
10020	NC_007005	AGGG	2	8	496660	496667	25 %	0 %	75 %	0 %	66043725
10021	NC_007005	CCG	2	6	496673	496678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043725
10022	NC_007005	CGG	2	6	496731	496736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043725
10023	NC_007005	GA	3	6	496808	496813	50 %	0 %	50 %	0 %	66043725
10024	NC_007005	CTGTT	2	10	496842	496851	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10025	NC_007005	TGA	2	6	496959	496964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_007005	AGCG	2	8	497050	497057	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10027	NC_007005	CGC	2	6	497063	497068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10028	NC_007005	CTG	2	6	497073	497078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_007005	GTT	2	6	497163	497168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043726
10030	NC_007005	GGCTC	2	10	497180	497189	0 %	20 %	40 %	40 %	66043726
10031	NC_007005	GCC	2	6	497226	497231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043726
10032	NC_007005	GCA	2	6	497234	497239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043726
10033	NC_007005	TGA	2	6	497258	497263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043726
10034	NC_007005	CTT	2	6	497264	497269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043726
10035	NC_007005	CCGCA	2	10	497342	497351	20 %	0 %	20 %	60 %	66043726
10036	NC_007005	ATG	2	6	497395	497400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043726
10037	NC_007005	TCT	2	6	497429	497434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043726
10038	NC_007005	CGA	2	6	497444	497449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043726
10039	NC_007005	GAA	2	6	497472	497477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043726
10040	NC_007005	TTG	2	6	497515	497520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043726
10041	NC_007005	GTC	2	6	497535	497540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043726
10042	NC_007005	GC	3	6	497550	497555	0 %	0 %	50 %	50 %	66043726
10043	NC_007005	GGC	2	6	497577	497582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043726
10044	NC_007005	CCATGC	2	12	497663	497674	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	66043726
10045	NC_007005	CGC	2	6	497687	497692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043726
10046	NC_007005	GCG	2	6	497783	497788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043726
10047	NC_007005	CAG	2	6	497789	497794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043726
10048	NC_007005	GCA	2	6	497819	497824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043726
10049	NC_007005	CAG	2	6	497919	497924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043726
10050	NC_007005	GCG	2	6	497973	497978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043726
10051	NC_007005	GAG	2	6	497995	498000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_007005	TAA	2	6	498087	498092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_007005	TCAAGC	2	12	498110	498121	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_007005	CTTG	2	8	498141	498148	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10055	NC_007005	CTAT	2	8	498173	498180	25 %	50 %	0 %	25 %	66043727
10056	NC_007005	CTT	2	6	498299	498304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043727
10057	NC_007005	TTC	2	6	498313	498318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043727
10058	NC_007005	CCAT	2	8	498424	498431	25 %	25 %	0 %	50 %	66043727
10059	NC_007005	CAG	2	6	498486	498491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043727
10060	NC_007005	GTC	2	6	498501	498506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043727
10061	NC_007005	CTT	2	6	498566	498571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043727
10062	NC_007005	CAC	2	6	498636	498641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043727
10063	NC_007005	GC	3	6	498643	498648	0 %	0 %	50 %	50 %	66043727
10064	NC_007005	GGT	3	9	498696	498704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043727
10065	NC_007005	CGT	2	6	498758	498763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043727
10066	NC_007005	CGT	2	6	498962	498967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043727
10067	NC_007005	TTG	2	6	498991	498996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043727
10068	NC_007005	CGTTGA	2	12	499022	499033	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	66043727
10069	NC_007005	CAG	2	6	499071	499076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043727
10070	NC_007005	GTG	2	6	499090	499095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043727
10071	NC_007005	TTC	2	6	499098	499103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043727
10072	NC_007005	GAT	2	6	499149	499154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043727
10073	NC_007005	CGC	2	6	499166	499171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043727
10074	NC_007005	CGT	2	6	499172	499177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043727
10075	NC_007005	TGGC	2	8	499200	499207	0 %	25 %	50 %	25 %	66043727
10076	NC_007005	CAC	2	6	499234	499239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043727
10077	NC_007005	TTC	3	9	499245	499253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043727
10078	NC_007005	GCA	2	6	499288	499293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043727
10079	NC_007005	GCA	2	6	499303	499308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043727
10080	NC_007005	ACG	2	6	499337	499342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043727
10081	NC_007005	CGG	2	6	499388	499393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043727
10082	NC_007005	GGCA	2	8	499479	499486	25 %	0 %	50 %	25 %	66043727
10083	NC_007005	GAT	2	6	499500	499505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043727
10084	NC_007005	GGC	2	6	499524	499529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043727
10085	NC_007005	TCCAT	2	10	499598	499607	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10086	NC_007005	AAC	2	6	499668	499673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10087	NC_007005	CTG	2	6	499701	499706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_007005	TTC	2	6	499791	499796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10089	NC_007005	TCTG	2	8	499836	499843	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10090	NC_007005	CAT	2	6	499903	499908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10091	NC_007005	CTG	2	6	500016	500021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043728
10092	NC_007005	GGC	2	6	500039	500044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043728
10093	NC_007005	GTG	2	6	500079	500084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043728
10094	NC_007005	CAT	2	6	500135	500140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043728
10095	NC_007005	CAA	2	6	500204	500209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043728
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10098	NC_007005	TCG	2	6	500589	500594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043729
10099	NC_007005	AGTTC	2	10	500617	500626	20 %	40 %	20 %	20 %	66043729
10100	NC_007005	ACG	2	6	500693	500698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043729
10101	NC_007005	GTC	2	6	500706	500711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043729
10102	NC_007005	CGA	2	6	500722	500727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043729
10103	NC_007005	CCA	2	6	500773	500778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043729
10104	NC_007005	GAA	2	6	500816	500821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043729
10105	NC_007005	TGA	2	6	500922	500927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043729
10106	NC_007005	CTCG	2	8	501064	501071	0 %	25 %	25 %	50 %	66043729
10107	NC_007005	GCT	2	6	501136	501141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043729
10108	NC_007005	GCG	2	6	501151	501156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043729
10109	NC_007005	TGC	2	6	501234	501239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043729
10110	NC_007005	GGC	2	6	501260	501265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043729
10111	NC_007005	AGC	2	6	501316	501321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043730
10112	NC_007005	AGC	2	6	501349	501354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043730
10113	NC_007005	GCC	2	6	501456	501461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043730
10114	NC_007005	CAG	2	6	501480	501485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043730
10115	NC_007005	GGT	2	6	501491	501496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043730
10116	NC_007005	GGT	2	6	501543	501548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043730
10117	NC_007005	GGT	2	6	501561	501566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043730
10118	NC_007005	GCA	3	9	501584	501592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043730
10119	NC_007005	CAG	2	6	501597	501602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043730
10120	NC_007005	GCCGA	2	10	501742	501751	20 %	0 %	40 %	40 %	66043730
10121	NC_007005	CGCGA	2	10	501782	501791	20 %	0 %	40 %	40 %	66043730
10122	NC_007005	CAG	2	6	501795	501800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043730
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10212	NC_007005	TTGA	2	8	505914	505921	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10213	NC_007005	ATG	2	6	505927	505932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10229	NC_007005	GC	3	6	506445	506450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10230	NC_007005	CAG	2	6	506563	506568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10240	NC_007005	CGT	2	6	507186	507191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043735
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10242	NC_007005	GAA	2	6	507220	507225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043735
10243	NC_007005	CA	3	6	507235	507240	50 %	0 %	0 %	50 %	66043735
10244	NC_007005	ATC	3	9	507272	507280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043735
10245	NC_007005	TCG	2	6	507320	507325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043735
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10248	NC_007005	CG	3	6	507576	507581	0 %	0 %	50 %	50 %	66043735
10249	NC_007005	CGA	2	6	507633	507638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043735
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10251	NC_007005	CGA	3	9	507698	507706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043735
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10255	NC_007005	GC	3	6	507763	507768	0 %	0 %	50 %	50 %	66043735
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10258	NC_007005	GGC	2	6	507853	507858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10259	NC_007005	AGAT	2	8	507869	507876	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10260	NC_007005	ACC	2	6	507945	507950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10261	NC_007005	CGG	2	6	507951	507956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10262	NC_007005	CGG	2	6	507991	507996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10263	NC_007005	GTG	2	6	508031	508036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10265	NC_007005	CCAC	2	8	508162	508169	25 %	0 %	0 %	75 %	66043736
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10269	NC_007005	GTGGC	2	10	508339	508348	0 %	20 %	60 %	20 %	66043736
10270	NC_007005	CGA	2	6	508373	508378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043736
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10273	NC_007005	CGG	2	6	508568	508573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043736
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10275	NC_007005	CGATG	2	10	508625	508634	20 %	20 %	40 %	20 %	66043736
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10279	NC_007005	GGCC	2	8	508832	508839	0 %	0 %	50 %	50 %	66043736
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10296	NC_007005	CTGA	2	8	509661	509668	25 %	25 %	25 %	25 %	66043736
10297	NC_007005	GCG	2	6	509724	509729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043736
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10303	NC_007005	AAAAGC	2	12	510003	510014	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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10310	NC_007005	CCAG	2	8	510257	510264	25 %	0 %	25 %	50 %	66043737
10311	NC_007005	CAG	2	6	510291	510296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043737
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10353	NC_007005	TG	3	6	512184	512189	0 %	50 %	50 %	0 %	66043739
10354	NC_007005	GTG	2	6	512210	512215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10355	NC_007005	TGC	2	6	512334	512339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043740
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10358	NC_007005	GCA	2	6	512551	512556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043740
10359	NC_007005	TCG	2	6	512559	512564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043740
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10361	NC_007005	CGT	2	6	512713	512718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043740
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10363	NC_007005	GC	3	6	512973	512978	0 %	0 %	50 %	50 %	66043741
10364	NC_007005	CCA	2	6	512993	512998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043741
10365	NC_007005	GGT	2	6	513033	513038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043741
10366	NC_007005	GTC	2	6	513090	513095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043741
10367	NC_007005	CGC	2	6	513105	513110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043741
10368	NC_007005	TCA	2	6	513137	513142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043741
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10370	NC_007005	AGGT	2	8	513295	513302	25 %	25 %	50 %	0 %	66043741
10371	NC_007005	CGC	2	6	513350	513355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043741
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10384	NC_007005	GCG	2	6	513953	513958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043741
10385	NC_007005	TGT	2	6	514102	514107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10387	NC_007005	TACC	2	8	514163	514170	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10388	NC_007005	TG	3	6	514224	514229	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10400	NC_007005	CAG	3	9	514595	514603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043742
10401	NC_007005	ATC	2	6	514620	514625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043742
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10440	NC_007005	CGG	2	6	515870	515875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043744
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10443	NC_007005	AAT	2	6	516233	516238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	66043744
10444	NC_007005	GACG	2	8	516321	516328	25 %	0 %	50 %	25 %	66043744
10445	NC_007005	CGG	2	6	516341	516346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043744
10446	NC_007005	GCT	2	6	516391	516396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043744
10447	NC_007005	GAG	2	6	516453	516458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10448	NC_007005	CT	3	6	516520	516525	0 %	50 %	0 %	50 %	66043745
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10453	NC_007005	CAT	2	6	516621	516626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043745
10454	NC_007005	TGGGCA	2	12	516788	516799	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	66043745
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10469	NC_007005	ATG	2	6	517309	517314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043745
10470	NC_007005	TCG	2	6	517369	517374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043745
10471	NC_007005	AAG	2	6	517435	517440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043745
10472	NC_007005	TGC	2	6	517507	517512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10473	NC_007005	CTGCC	2	10	517613	517622	0 %	20 %	20 %	60 %	66043746
10474	NC_007005	GCA	2	6	517630	517635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043746
10475	NC_007005	CGGCG	2	10	517707	517716	0 %	0 %	60 %	40 %	66043746
10476	NC_007005	GAAC	2	8	517720	517727	50 %	0 %	25 %	25 %	66043746
10477	NC_007005	TTG	2	6	517728	517733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043746
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10479	NC_007005	CAG	2	6	517787	517792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043746
10480	NC_007005	GTG	2	6	517935	517940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043746
10481	NC_007005	GC	3	6	517977	517982	0 %	0 %	50 %	50 %	66043746
10482	NC_007005	CTTG	2	8	517999	518006	0 %	50 %	25 %	25 %	66043746
10483	NC_007005	GTG	2	6	518100	518105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043746
10484	NC_007005	GTT	2	6	518188	518193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043746
10485	NC_007005	TGG	2	6	518203	518208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043746
10486	NC_007005	GGC	2	6	518213	518218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043746
10487	NC_007005	A	6	6	518256	518261	100 %	0 %	0 %	0 %	66043746
10488	NC_007005	TGG	2	6	518283	518288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10489	NC_007005	GC	3	6	518292	518297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10490	NC_007005	A	7	7	518318	518324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10491	NC_007005	CAT	2	6	518356	518361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10492	NC_007005	CTTT	2	8	518382	518389	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10493	NC_007005	T	6	6	518387	518392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10494	NC_007005	GGC	2	6	518422	518427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10495	NC_007005	T	7	7	518490	518496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10496	NC_007005	AC	4	8	518539	518546	50 %	0 %	0 %	50 %	66043747
10497	NC_007005	CTA	2	6	518603	518608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043747
10498	NC_007005	TTC	2	6	518637	518642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043747
10499	NC_007005	GGCT	2	8	518664	518671	0 %	25 %	50 %	25 %	66043747
10500	NC_007005	GCGTG	2	10	518746	518755	0 %	20 %	60 %	20 %	66043747

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