MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
104001	NC_007005	TCGA	2	8	5227238	5227245	25 %	25 %	25 %	25 %	66047599
104002	NC_007005	TCG	2	6	5227250	5227255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047599
104003	NC_007005	CGG	2	6	5227278	5227283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047599
104004	NC_007005	TGCCGG	2	12	5227296	5227307	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	66047599
104005	NC_007005	CCGC	2	8	5227365	5227372	0 %	0 %	25 %	75 %	66047599
104006	NC_007005	ACG	2	6	5227454	5227459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047599
104007	NC_007005	CAG	2	6	5227486	5227491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047599
104008	NC_007005	CA	3	6	5227518	5227523	50 %	0 %	0 %	50 %	66047599
104009	NC_007005	ACGGC	2	10	5227545	5227554	20 %	0 %	40 %	40 %	66047599
104010	NC_007005	TCA	2	6	5227611	5227616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66047599
104011	NC_007005	CCA	2	6	5227626	5227631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66047599
104012	NC_007005	CGA	2	6	5227669	5227674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047599
104013	NC_007005	GTCG	2	8	5227696	5227703	0 %	25 %	50 %	25 %	66047599
104014	NC_007005	GTT	2	6	5227711	5227716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66047599
104015	NC_007005	AGCG	2	8	5227845	5227852	25 %	0 %	50 %	25 %	66047600
104016	NC_007005	GCC	2	6	5227882	5227887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66047600
104017	NC_007005	CGA	2	6	5227896	5227901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047600
104018	NC_007005	AGCCC	2	10	5227920	5227929	20 %	0 %	20 %	60 %	66047600
104019	NC_007005	GTG	2	6	5227952	5227957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66047600
104020	NC_007005	GAT	2	6	5228029	5228034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66047600
104021	NC_007005	ACA	2	6	5228100	5228105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66047600
104022	NC_007005	ATC	2	6	5228186	5228191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66047600
104023	NC_007005	CCG	2	6	5228192	5228197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66047600
104024	NC_007005	CAGC	2	8	5228232	5228239	25 %	0 %	25 %	50 %	66047600
104025	NC_007005	GCT	2	6	5228280	5228285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047600
104026	NC_007005	GCG	2	6	5228299	5228304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047600
104027	NC_007005	ACC	2	6	5228327	5228332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66047600
104028	NC_007005	GCG	2	6	5228336	5228341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047600
104029	NC_007005	TGAT	2	8	5228459	5228466	25 %	50 %	25 %	0 %	66047600
104030	NC_007005	GCG	2	6	5228539	5228544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047600
104031	NC_007005	C	6	6	5228607	5228612	0 %	0 %	0 %	100 %	66047600
104032	NC_007005	CCA	2	6	5228626	5228631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66047600
104033	NC_007005	TTC	2	6	5228665	5228670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66047600
104034	NC_007005	TGA	2	6	5228712	5228717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66047600
104035	NC_007005	GCT	2	6	5228727	5228732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047600
104036	NC_007005	CTC	2	6	5228887	5228892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	66047600
104037	NC_007005	CGG	2	6	5228910	5228915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047600
104038	NC_007005	GTC	2	6	5228974	5228979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047600
104039	NC_007005	GCA	2	6	5228982	5228987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047600
104040	NC_007005	CAG	2	6	5229001	5229006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047600
104041	NC_007005	CGG	2	6	5229044	5229049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047600
104042	NC_007005	GCA	2	6	5229066	5229071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047600
104043	NC_007005	GTC	2	6	5229103	5229108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047600
104044	NC_007005	GATG	2	8	5229111	5229118	25 %	25 %	50 %	0 %	66047600
104045	NC_007005	CCAGC	2	10	5229157	5229166	20 %	0 %	20 %	60 %	66047600
104046	NC_007005	CGG	2	6	5229237	5229242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047600
104047	NC_007005	GCG	3	9	5229278	5229286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047600
104048	NC_007005	GCG	2	6	5229438	5229443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047600
104049	NC_007005	GGCGA	2	10	5229463	5229472	20 %	0 %	60 %	20 %	66047600
104050	NC_007005	CGG	2	6	5229492	5229497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047600
104051	NC_007005	GCCA	2	8	5229509	5229516	25 %	0 %	25 %	50 %	66047600
104052	NC_007005	CAG	2	6	5229580	5229585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047600
104053	NC_007005	GCA	2	6	5229603	5229608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047600
104054	NC_007005	CAC	2	6	5229614	5229619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66047600
104055	NC_007005	CAG	2	6	5229628	5229633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047600
104056	NC_007005	CCGGC	2	10	5229699	5229708	0 %	0 %	40 %	60 %	66047600
104057	NC_007005	CTG	3	9	5229757	5229765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047600
104058	NC_007005	GCC	2	6	5229880	5229885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66047600
104059	NC_007005	GCT	2	6	5229894	5229899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047600
104060	NC_007005	CA	3	6	5230036	5230041	50 %	0 %	0 %	50 %	66047600
104061	NC_007005	GCT	2	6	5230074	5230079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047600
104062	NC_007005	CAC	2	6	5230084	5230089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66047600
104063	NC_007005	CTG	2	6	5230156	5230161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047600
104064	NC_007005	GC	3	6	5230168	5230173	0 %	0 %	50 %	50 %	66047600
104065	NC_007005	TCC	2	6	5230184	5230189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	66047600
104066	NC_007005	AGCC	2	8	5230220	5230227	25 %	0 %	25 %	50 %	66047600
104067	NC_007005	GT	3	6	5230265	5230270	0 %	50 %	50 %	0 %	66047600
104068	NC_007005	TCG	2	6	5230274	5230279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047600
104069	NC_007005	CCAG	2	8	5230308	5230315	25 %	0 %	25 %	50 %	66047600
104070	NC_007005	GC	3	6	5230341	5230346	0 %	0 %	50 %	50 %	66047600
104071	NC_007005	GCA	3	9	5230353	5230361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047600
104072	NC_007005	TCA	2	6	5230365	5230370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66047600
104073	NC_007005	GA	3	6	5230410	5230415	50 %	0 %	50 %	0 %	66047600
104074	NC_007005	CAG	3	9	5230456	5230464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047600
104075	NC_007005	GCTC	2	8	5230491	5230498	0 %	25 %	25 %	50 %	66047600
104076	NC_007005	CAC	2	6	5230533	5230538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104077	NC_007005	AGGG	2	8	5230637	5230644	25 %	0 %	75 %	0 %	66047601
104078	NC_007005	CAA	2	6	5230646	5230651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66047601
104079	NC_007005	GGC	3	9	5230868	5230876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047601
104080	NC_007005	AGA	2	6	5230939	5230944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66047601
104081	NC_007005	GCG	2	6	5230971	5230976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047601
104082	NC_007005	GAC	2	6	5230987	5230992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047601
104083	NC_007005	GTG	2	6	5231003	5231008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66047601
104084	NC_007005	TGA	2	6	5231096	5231101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66047602
104085	NC_007005	ATT	2	6	5231103	5231108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	66047602
104086	NC_007005	CTG	2	6	5231113	5231118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047602
104087	NC_007005	GCA	2	6	5231188	5231193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047602
104088	NC_007005	GGCTC	2	10	5231234	5231243	0 %	20 %	40 %	40 %	66047602
104089	NC_007005	CTG	2	6	5231260	5231265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047602
104090	NC_007005	TGA	2	6	5231339	5231344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66047602
104091	NC_007005	CTG	2	6	5231377	5231382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047602
104092	NC_007005	TCG	2	6	5231426	5231431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047602
104093	NC_007005	GCG	2	6	5231494	5231499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047602
104094	NC_007005	T	6	6	5231523	5231528	0 %	100 %	0 %	0 %	66047602
104095	NC_007005	CGG	2	6	5231717	5231722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104096	NC_007005	GAA	2	6	5231804	5231809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66047603
104097	NC_007005	AGC	2	6	5231828	5231833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047603
104098	NC_007005	GT	3	6	5231842	5231847	0 %	50 %	50 %	0 %	66047603
104099	NC_007005	TGGC	2	8	5231970	5231977	0 %	25 %	50 %	25 %	66047603
104100	NC_007005	CAT	2	6	5232001	5232006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66047603
104101	NC_007005	A	6	6	5232026	5232031	100 %	0 %	0 %	0 %	66047603
104102	NC_007005	TCA	2	6	5232036	5232041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66047603
104103	NC_007005	ATT	2	6	5232066	5232071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	66047603
104104	NC_007005	GAA	2	6	5232092	5232097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66047603
104105	NC_007005	GCC	2	6	5232194	5232199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66047603
104106	NC_007005	CGA	2	6	5232205	5232210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047603
104107	NC_007005	GCA	2	6	5232289	5232294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047603
104108	NC_007005	GC	3	6	5232353	5232358	0 %	0 %	50 %	50 %	66047603
104109	NC_007005	TGC	2	6	5232444	5232449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047603
104110	NC_007005	CA	3	6	5232472	5232477	50 %	0 %	0 %	50 %	66047603
104111	NC_007005	ATTGGC	2	12	5232478	5232489	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	66047603
104112	NC_007005	ACG	2	6	5232574	5232579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047604
104113	NC_007005	CGGC	2	8	5232619	5232626	0 %	0 %	50 %	50 %	66047604
104114	NC_007005	GTC	2	6	5232678	5232683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047604
104115	NC_007005	GA	3	6	5232693	5232698	50 %	0 %	50 %	0 %	66047604
104116	NC_007005	ACC	2	6	5232700	5232705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66047604
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104234	NC_007005	TCG	2	6	5238638	5238643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047608
104235	NC_007005	GTC	2	6	5238649	5238654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047608
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104350	NC_007005	CCTG	2	8	5244067	5244074	0 %	25 %	25 %	50 %	66047612
104351	NC_007005	CTG	2	6	5244120	5244125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047612
104352	NC_007005	CCGC	2	8	5244208	5244215	0 %	0 %	25 %	75 %	66047612
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104356	NC_007005	CGT	2	6	5244425	5244430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047612
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104466	NC_007005	TGC	2	6	5248901	5248906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047614
104467	NC_007005	GC	4	8	5248947	5248954	0 %	0 %	50 %	50 %	66047614
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104496	NC_007005	CCAC	2	8	5250166	5250173	25 %	0 %	0 %	75 %	66047614
104497	NC_007005	CAGAG	2	10	5250321	5250330	40 %	0 %	40 %	20 %	66047614
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104499	NC_007005	GCCT	2	8	5250437	5250444	0 %	25 %	25 %	50 %	66047614
104500	NC_007005	GCC	2	6	5250445	5250450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66047614

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