MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
103001	NC_007005	TGGC	2	8	5177401	5177408	0 %	25 %	50 %	25 %	66047552
103002	NC_007005	GTGA	2	8	5177494	5177501	25 %	25 %	50 %	0 %	66047552
103003	NC_007005	GCT	2	6	5177610	5177615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047552
103004	NC_007005	CAGG	2	8	5177617	5177624	25 %	0 %	50 %	25 %	66047552
103005	NC_007005	TGGC	2	8	5177649	5177656	0 %	25 %	50 %	25 %	66047552
103006	NC_007005	CAC	2	6	5177835	5177840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66047552
103007	NC_007005	GGCG	2	8	5177952	5177959	0 %	0 %	75 %	25 %	66047552
103008	NC_007005	TGT	2	6	5177964	5177969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66047552
103009	NC_007005	GGACG	2	10	5177988	5177997	20 %	0 %	60 %	20 %	66047552
103010	NC_007005	TTC	2	6	5178046	5178051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66047552
103011	NC_007005	GCA	2	6	5178080	5178085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047552
103012	NC_007005	GAT	2	6	5178154	5178159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66047552
103013	NC_007005	CAGC	2	8	5178432	5178439	25 %	0 %	25 %	50 %	66047552
103014	NC_007005	GGC	2	6	5178499	5178504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047552
103015	NC_007005	AAC	2	6	5178566	5178571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66047552
103016	NC_007005	CTG	2	6	5178580	5178585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047552
103017	NC_007005	CG	3	6	5178611	5178616	0 %	0 %	50 %	50 %	66047552
103018	NC_007005	AGA	2	6	5178666	5178671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66047552
103019	NC_007005	AGC	2	6	5178697	5178702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103020	NC_007005	GCC	2	6	5178753	5178758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103021	NC_007005	TCA	2	6	5178805	5178810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66047553
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103023	NC_007005	GGT	2	6	5178926	5178931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66047553
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103025	NC_007005	CCG	2	6	5178977	5178982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66047553
103026	NC_007005	GGT	2	6	5179024	5179029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66047553
103027	NC_007005	GTT	2	6	5179075	5179080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66047553
103028	NC_007005	G	6	6	5179083	5179088	0 %	0 %	100 %	0 %	66047553
103029	NC_007005	GGGCT	2	10	5179122	5179131	0 %	20 %	60 %	20 %	66047553
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103031	NC_007005	GGC	2	6	5179141	5179146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047553
103032	NC_007005	GC	3	6	5179145	5179150	0 %	0 %	50 %	50 %	66047553
103033	NC_007005	TGCT	2	8	5179191	5179198	0 %	50 %	25 %	25 %	66047553
103034	NC_007005	GTC	2	6	5179238	5179243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047553
103035	NC_007005	CTG	2	6	5179260	5179265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047553
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103038	NC_007005	TGT	2	6	5179355	5179360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66047553
103039	NC_007005	AG	3	6	5179414	5179419	50 %	0 %	50 %	0 %	66047553
103040	NC_007005	CAG	2	6	5179422	5179427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047553
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103042	NC_007005	CTG	2	6	5179617	5179622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047553
103043	NC_007005	GAC	2	6	5179698	5179703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047553
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103045	NC_007005	ATC	2	6	5179786	5179791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66047553
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103047	NC_007005	AAT	2	6	5179905	5179910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103048	NC_007005	GCCC	2	8	5179916	5179923	0 %	0 %	25 %	75 %	66047554
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103052	NC_007005	T	6	6	5180006	5180011	0 %	100 %	0 %	0 %	66047554
103053	NC_007005	GAA	2	6	5180012	5180017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66047554
103054	NC_007005	GCC	2	6	5180162	5180167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66047554
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103062	NC_007005	GC	3	6	5180794	5180799	0 %	0 %	50 %	50 %	66047555
103063	NC_007005	CGG	2	6	5180835	5180840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047555
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103069	NC_007005	TG	3	6	5181266	5181271	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103070	NC_007005	GC	3	6	5181356	5181361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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103082	NC_007005	GC	3	6	5181987	5181992	0 %	0 %	50 %	50 %	66047557
103083	NC_007005	GC	3	6	5182002	5182007	0 %	0 %	50 %	50 %	66047557
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103088	NC_007005	CGA	2	6	5182133	5182138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047557
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103090	NC_007005	GTG	2	6	5182178	5182183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66047557
103091	NC_007005	TCG	2	6	5182207	5182212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047557
103092	NC_007005	GC	4	8	5182229	5182236	0 %	0 %	50 %	50 %	66047557
103093	NC_007005	ACGC	2	8	5182290	5182297	25 %	0 %	25 %	50 %	66047557
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103101	NC_007005	CGT	2	6	5182861	5182866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103102	NC_007005	CT	3	6	5182923	5182928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103103	NC_007005	A	6	6	5183032	5183037	100 %	0 %	0 %	0 %	66047558
103104	NC_007005	CAGGTC	2	12	5183064	5183075	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	66047558
103105	NC_007005	CTC	2	6	5183133	5183138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	66047558
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103108	NC_007005	TCG	2	6	5183236	5183241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047558
103109	NC_007005	ATCGAA	2	12	5183250	5183261	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	66047558
103110	NC_007005	CGA	2	6	5183357	5183362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047558
103111	NC_007005	GCA	2	6	5183375	5183380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047558
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103113	NC_007005	CGC	2	6	5183535	5183540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66047558
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103115	NC_007005	CGG	2	6	5183643	5183648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047558
103116	NC_007005	GCCG	2	8	5183670	5183677	0 %	0 %	50 %	50 %	66047558
103117	NC_007005	GGCCAC	2	12	5183814	5183825	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	66047558
103118	NC_007005	CCA	2	6	5183891	5183896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66047558
103119	NC_007005	TCG	2	6	5184282	5184287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047559
103120	NC_007005	GCG	2	6	5184322	5184327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047559
103121	NC_007005	GCT	2	6	5184342	5184347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047559
103122	NC_007005	GATC	2	8	5184432	5184439	25 %	25 %	25 %	25 %	66047559
103123	NC_007005	CAT	2	6	5184501	5184506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66047559
103124	NC_007005	AAC	2	6	5184575	5184580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66047559
103125	NC_007005	GCA	2	6	5184583	5184588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047559
103126	NC_007005	GCC	2	6	5184604	5184609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66047559
103127	NC_007005	CAC	2	6	5184643	5184648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66047560
103128	NC_007005	CTG	2	6	5184665	5184670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047560
103129	NC_007005	ACG	2	6	5184704	5184709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047560
103130	NC_007005	TGG	2	6	5184734	5184739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66047560
103131	NC_007005	CTG	2	6	5184758	5184763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047560
103132	NC_007005	GCT	2	6	5184781	5184786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047560
103133	NC_007005	CTG	2	6	5184812	5184817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047560
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103137	NC_007005	GC	3	6	5184978	5184983	0 %	0 %	50 %	50 %	66047560
103138	NC_007005	GCT	2	6	5184985	5184990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047560
103139	NC_007005	CTG	2	6	5185115	5185120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047560
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103141	NC_007005	GCA	2	6	5185168	5185173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047560
103142	NC_007005	CCG	2	6	5185275	5185280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66047560
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103144	NC_007005	GTCG	2	8	5185414	5185421	0 %	25 %	50 %	25 %	66047560
103145	NC_007005	GTC	2	6	5185508	5185513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047560
103146	NC_007005	GCCCC	2	10	5185553	5185562	0 %	0 %	20 %	80 %	66047561
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103148	NC_007005	TGGC	2	8	5185613	5185620	0 %	25 %	50 %	25 %	66047561
103149	NC_007005	CTG	2	6	5185694	5185699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047561
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103155	NC_007005	GCT	2	6	5185865	5185870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047561
103156	NC_007005	CTG	2	6	5185905	5185910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047561
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103163	NC_007005	GCT	2	6	5186266	5186271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047561
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103178	NC_007005	GCT	2	6	5186524	5186529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047561
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103181	NC_007005	TGC	2	6	5186559	5186564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047561
103182	NC_007005	GCT	2	6	5186569	5186574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047561
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103185	NC_007005	TCG	2	6	5186628	5186633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047561
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103189	NC_007005	AC	3	6	5186894	5186899	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103190	NC_007005	CGG	2	6	5186933	5186938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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103193	NC_007005	AATTG	2	10	5187073	5187082	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103194	NC_007005	ACGC	2	8	5187150	5187157	25 %	0 %	25 %	50 %	66047562
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103200	NC_007005	GCG	2	6	5187601	5187606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047563
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103202	NC_007005	CCAG	2	8	5187746	5187753	25 %	0 %	25 %	50 %	66047563
103203	NC_007005	CGGG	2	8	5187782	5187789	0 %	0 %	75 %	25 %	66047563
103204	NC_007005	TCA	2	6	5187811	5187816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66047563
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103211	NC_007005	CCGG	2	8	5188021	5188028	0 %	0 %	50 %	50 %	66047563
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103227	NC_007005	GCG	2	6	5188746	5188751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047564
103228	NC_007005	GCA	2	6	5188752	5188757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047564
103229	NC_007005	ATC	2	6	5188850	5188855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66047564
103230	NC_007005	GGT	2	6	5188965	5188970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66047564
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103232	NC_007005	CAG	2	6	5189152	5189157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047564
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103464	NC_007005	GAG	2	6	5201232	5201237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	66047574
103465	NC_007005	CGA	3	9	5201261	5201269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047574
103466	NC_007005	AC	3	6	5201293	5201298	50 %	0 %	0 %	50 %	66047574
103467	NC_007005	CAAG	2	8	5201299	5201306	50 %	0 %	25 %	25 %	66047574
103468	NC_007005	GCT	2	6	5201413	5201418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047575
103469	NC_007005	GCT	2	6	5201422	5201427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047575
103470	NC_007005	CCA	2	6	5201437	5201442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66047575
103471	NC_007005	CTG	2	6	5201450	5201455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047575
103472	NC_007005	TCG	2	6	5201475	5201480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047575
103473	NC_007005	CAT	2	6	5201518	5201523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66047575
103474	NC_007005	GAT	2	6	5201539	5201544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66047575
103475	NC_007005	CGG	2	6	5201583	5201588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047575
103476	NC_007005	TGC	2	6	5201596	5201601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047575
103477	NC_007005	TGC	2	6	5201652	5201657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047575
103478	NC_007005	CTG	2	6	5201669	5201674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047575
103479	NC_007005	TGA	2	6	5201704	5201709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66047575
103480	NC_007005	AAG	2	6	5201714	5201719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66047575
103481	NC_007005	CTG	2	6	5201720	5201725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047575
103482	NC_007005	TGC	3	9	5201766	5201774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047575
103483	NC_007005	CAACCA	2	12	5201788	5201799	50 %	0 %	0 %	50 %	66047575
103484	NC_007005	CGG	2	6	5201824	5201829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047575
103485	NC_007005	TCG	2	6	5201871	5201876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047575
103486	NC_007005	GCG	2	6	5201934	5201939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047575
103487	NC_007005	TTC	2	6	5201984	5201989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66047575
103488	NC_007005	GAC	2	6	5202005	5202010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047575
103489	NC_007005	TGA	2	6	5202036	5202041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66047575
103490	NC_007005	CATT	2	8	5202127	5202134	25 %	50 %	0 %	25 %	66047575
103491	NC_007005	TGC	2	6	5202135	5202140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047575
103492	NC_007005	TGC	2	6	5202175	5202180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103493	NC_007005	CTG	2	6	5202231	5202236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047576
103494	NC_007005	GGC	2	6	5202242	5202247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047576
103495	NC_007005	CTGGTG	2	12	5202294	5202305	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	66047576
103496	NC_007005	CGG	2	6	5202434	5202439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047576
103497	NC_007005	CTG	2	6	5202450	5202455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047576
103498	NC_007005	GCT	2	6	5202461	5202466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047576
103499	NC_007005	TGC	2	6	5202469	5202474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047576
103500	NC_007005	CGC	2	6	5202482	5202487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66047576

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