MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
101501	NC_007005	CAC	2	6	5098470	5098475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66047500
101502	NC_007005	GGC	2	6	5098560	5098565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047500
101503	NC_007005	GTG	2	6	5098569	5098574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66047500
101504	NC_007005	TGTT	2	8	5098588	5098595	0 %	75 %	25 %	0 %	66047500
101505	NC_007005	CGT	2	6	5098616	5098621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047500
101506	NC_007005	ACC	2	6	5098627	5098632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66047500
101507	NC_007005	CG	3	6	5098641	5098646	0 %	0 %	50 %	50 %	66047500
101508	NC_007005	GTA	2	6	5098689	5098694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66047500
101509	NC_007005	TAT	3	9	5098838	5098846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	66047500
101510	NC_007005	T	7	7	5098853	5098859	0 %	100 %	0 %	0 %	66047500
101511	NC_007005	CAG	2	6	5098864	5098869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101512	NC_007005	ACC	2	6	5098919	5098924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101513	NC_007005	CCAA	2	8	5098926	5098933	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101514	NC_007005	ACA	2	6	5099070	5099075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101515	NC_007005	AG	3	6	5099124	5099129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101516	NC_007005	CGT	2	6	5099162	5099167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047501
101517	NC_007005	CTG	2	6	5099258	5099263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047501
101518	NC_007005	GCG	2	6	5099431	5099436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047501
101519	NC_007005	GCA	2	6	5099486	5099491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047501
101520	NC_007005	GCG	2	6	5099575	5099580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047502
101521	NC_007005	CTTC	2	8	5099581	5099588	0 %	50 %	0 %	50 %	66047502
101522	NC_007005	GC	3	6	5099613	5099618	0 %	0 %	50 %	50 %	66047502
101523	NC_007005	GGC	2	6	5099633	5099638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047502
101524	NC_007005	CAC	2	6	5099797	5099802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66047502
101525	NC_007005	CCA	2	6	5099803	5099808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66047502
101526	NC_007005	GCC	2	6	5099843	5099848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66047502
101527	NC_007005	CGCGG	2	10	5099908	5099917	0 %	0 %	60 %	40 %	66047502
101528	NC_007005	GTC	2	6	5099933	5099938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047502
101529	NC_007005	CTT	2	6	5100010	5100015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66047502
101530	NC_007005	CTT	2	6	5100055	5100060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66047502
101531	NC_007005	TTC	2	6	5100117	5100122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66047502
101532	NC_007005	CG	3	6	5100125	5100130	0 %	0 %	50 %	50 %	66047502
101533	NC_007005	GGC	2	6	5100142	5100147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047502
101534	NC_007005	ACA	2	6	5100169	5100174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66047502
101535	NC_007005	GGCC	2	8	5100205	5100212	0 %	0 %	50 %	50 %	66047502
101536	NC_007005	CCTT	2	8	5100219	5100226	0 %	50 %	0 %	50 %	66047502
101537	NC_007005	GGC	2	6	5100287	5100292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047502
101538	NC_007005	CGC	2	6	5100313	5100318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66047502
101539	NC_007005	ATCGA	2	10	5100357	5100366	40 %	20 %	20 %	20 %	66047502
101540	NC_007005	ATG	2	6	5100405	5100410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66047502
101541	NC_007005	GC	3	6	5100471	5100476	0 %	0 %	50 %	50 %	66047502
101542	NC_007005	CTG	3	9	5100485	5100493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047502
101543	NC_007005	CGC	2	6	5100586	5100591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66047502
101544	NC_007005	CAC	2	6	5100599	5100604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66047502
101545	NC_007005	CCG	3	9	5100621	5100629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66047502
101546	NC_007005	TGG	2	6	5100655	5100660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66047502
101547	NC_007005	TTC	2	6	5100674	5100679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66047502
101548	NC_007005	GGC	2	6	5100744	5100749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047502
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101550	NC_007005	GT	3	6	5100784	5100789	0 %	50 %	50 %	0 %	66047502
101551	NC_007005	GCCC	2	8	5100815	5100822	0 %	0 %	25 %	75 %	66047502
101552	NC_007005	CGC	2	6	5100838	5100843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66047502
101553	NC_007005	TTGGCC	2	12	5100867	5100878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047502
101554	NC_007005	A	6	6	5100897	5100902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101555	NC_007005	GCA	2	6	5101015	5101020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101556	NC_007005	TAT	2	6	5101142	5101147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	66047503
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101562	NC_007005	TCG	2	6	5101336	5101341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047503
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101568	NC_007005	GCC	2	6	5101703	5101708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101569	NC_007005	GCT	2	6	5101776	5101781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047504
101570	NC_007005	GT	3	6	5101794	5101799	0 %	50 %	50 %	0 %	66047504
101571	NC_007005	ATC	2	6	5101805	5101810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66047504
101572	NC_007005	GCCG	2	8	5101861	5101868	0 %	0 %	50 %	50 %	66047504
101573	NC_007005	CG	3	6	5101867	5101872	0 %	0 %	50 %	50 %	66047504
101574	NC_007005	CAGAAA	2	12	5101951	5101962	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	66047504
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101579	NC_007005	A	7	7	5102274	5102280	100 %	0 %	0 %	0 %	66047504
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101583	NC_007005	CGAAAG	2	12	5102381	5102392	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	66047504
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101586	NC_007005	GTC	2	6	5102473	5102478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047504
101587	NC_007005	CG	3	6	5102672	5102677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101588	NC_007005	CAGC	2	8	5102685	5102692	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101589	NC_007005	TCCG	2	8	5102728	5102735	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101590	NC_007005	AGG	2	6	5102817	5102822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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101592	NC_007005	AG	3	6	5102882	5102887	50 %	0 %	50 %	0 %	66047505
101593	NC_007005	CCG	2	6	5102909	5102914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66047505
101594	NC_007005	A	6	6	5102996	5103001	100 %	0 %	0 %	0 %	66047505
101595	NC_007005	CAA	2	6	5103012	5103017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66047505
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101597	NC_007005	CGAAA	2	10	5103095	5103104	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
101598	NC_007005	A	6	6	5103102	5103107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101599	NC_007005	TCA	2	6	5103200	5103205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66047506
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101602	NC_007005	GC	3	6	5103359	5103364	0 %	0 %	50 %	50 %	66047506
101603	NC_007005	GGC	2	6	5103366	5103371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047506
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101606	NC_007005	GGC	2	6	5103420	5103425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047506
101607	NC_007005	GC	3	6	5103448	5103453	0 %	0 %	50 %	50 %	66047506
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101614	NC_007005	GCT	2	6	5103711	5103716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047506
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101734	NC_007005	GCG	2	6	5110159	5110164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047511
101735	NC_007005	CAC	2	6	5110186	5110191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66047511
101736	NC_007005	CAGCG	2	10	5110198	5110207	20 %	0 %	40 %	40 %	66047511
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101738	NC_007005	AGC	2	6	5110356	5110361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047511
101739	NC_007005	GCA	2	6	5110371	5110376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047511
101740	NC_007005	GCC	2	6	5110381	5110386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66047511
101741	NC_007005	GCG	2	6	5110410	5110415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047511
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101743	NC_007005	GGT	2	6	5110470	5110475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66047511
101744	NC_007005	ATC	2	6	5110508	5110513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66047511
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101751	NC_007005	TCA	2	6	5110811	5110816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66047512
101752	NC_007005	GC	3	6	5110843	5110848	0 %	0 %	50 %	50 %	66047512
101753	NC_007005	TGA	2	6	5110922	5110927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66047512
101754	NC_007005	CTG	2	6	5110932	5110937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047512
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101760	NC_007005	GGT	2	6	5111133	5111138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66047512
101761	NC_007005	GCA	2	6	5111144	5111149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047512
101762	NC_007005	TCAGGG	2	12	5111174	5111185	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	66047512
101763	NC_007005	GTGG	2	8	5111193	5111200	0 %	25 %	75 %	0 %	66047512
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101767	NC_007005	CG	3	6	5111473	5111478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101768	NC_007005	CA	3	6	5111528	5111533	50 %	0 %	0 %	50 %	66047513
101769	NC_007005	TCG	2	6	5111651	5111656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047513
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101821	NC_007005	GCG	2	6	5113956	5113961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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101847	NC_007005	TGC	2	6	5115187	5115192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047515
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101968	NC_007005	GCG	2	6	5121555	5121560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047522
101969	NC_007005	GGC	2	6	5121613	5121618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047522
101970	NC_007005	CTG	2	6	5121622	5121627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047522
101971	NC_007005	CCG	2	6	5121629	5121634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66047522
101972	NC_007005	TGGCC	2	10	5121651	5121660	0 %	20 %	40 %	40 %	66047522
101973	NC_007005	GGCG	2	8	5121669	5121676	0 %	0 %	75 %	25 %	66047522
101974	NC_007005	CACC	2	8	5121678	5121685	25 %	0 %	0 %	75 %	66047522
101975	NC_007005	CGG	2	6	5121704	5121709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047522
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101977	NC_007005	CTG	2	6	5121751	5121756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047522
101978	NC_007005	ACGGC	2	10	5121812	5121821	20 %	0 %	40 %	40 %	66047522
101979	NC_007005	GC	3	6	5121820	5121825	0 %	0 %	50 %	50 %	66047522
101980	NC_007005	ATGGGC	2	12	5121925	5121936	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	66047522
101981	NC_007005	CGT	2	6	5121954	5121959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047522
101982	NC_007005	CTG	2	6	5121979	5121984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047522
101983	NC_007005	CGA	2	6	5122089	5122094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047522
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101988	NC_007005	CAT	2	6	5122387	5122392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66047523
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101991	NC_007005	ACG	2	6	5122461	5122466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66047523
101992	NC_007005	GC	3	6	5122553	5122558	0 %	0 %	50 %	50 %	66047523
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101995	NC_007005	GT	3	6	5122671	5122676	0 %	50 %	50 %	0 %	66047523
101996	NC_007005	GCG	2	6	5122857	5122862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66047523
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101998	NC_007005	GCC	2	6	5122943	5122948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66047523
101999	NC_007005	CTG	2	6	5122982	5122987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66047523
102000	NC_007005	GAA	2	6	5123014	5123019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66047523

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