MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_007005	TCGG	2	8	399464	399471	0 %	25 %	50 %	25 %	66043641
8002	NC_007005	GCC	2	6	399487	399492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043641
8003	NC_007005	ACC	2	6	399509	399514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043641
8004	NC_007005	CCAG	2	8	399549	399556	25 %	0 %	25 %	50 %	66043641
8005	NC_007005	CTG	2	6	399571	399576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043641
8006	NC_007005	CGA	2	6	399585	399590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043641
8007	NC_007005	GAC	2	6	399684	399689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043641
8008	NC_007005	GCC	2	6	399694	399699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043641
8009	NC_007005	CAG	2	6	399814	399819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043641
8010	NC_007005	GA	3	6	399838	399843	50 %	0 %	50 %	0 %	66043641
8011	NC_007005	GTA	2	6	399847	399852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043641
8012	NC_007005	TCCA	2	8	399893	399900	25 %	25 %	0 %	50 %	66043641
8013	NC_007005	GGC	2	6	399922	399927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043641
8014	NC_007005	GCG	2	6	400010	400015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043641
8015	NC_007005	AGT	2	6	400076	400081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_007005	GTC	2	6	400120	400125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_007005	ATT	2	6	400127	400132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_007005	A	7	7	400138	400144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_007005	AAT	2	6	400149	400154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_007005	TCGT	2	8	400231	400238	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8021	NC_007005	GCA	2	6	400259	400264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_007005	TTC	2	6	400271	400276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_007005	ATG	2	6	400288	400293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_007005	AAT	2	6	400305	400310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_007005	AAC	2	6	400398	400403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043642
8026	NC_007005	GGT	2	6	400450	400455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043642
8027	NC_007005	CGG	2	6	400465	400470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043642
8028	NC_007005	GATGC	2	10	400482	400491	20 %	20 %	40 %	20 %	66043642
8029	NC_007005	GCT	2	6	400500	400505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043642
8030	NC_007005	ACA	2	6	400587	400592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043642
8031	NC_007005	TGG	2	6	400605	400610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043642
8032	NC_007005	GTT	2	6	400657	400662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043642
8033	NC_007005	CGG	2	6	400663	400668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043642
8034	NC_007005	GAT	2	6	400729	400734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043642
8035	NC_007005	CAG	2	6	400760	400765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043642
8036	NC_007005	ACA	2	6	400857	400862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043642
8037	NC_007005	CG	3	6	401006	401011	0 %	0 %	50 %	50 %	66043642
8038	NC_007005	CG	3	6	401020	401025	0 %	0 %	50 %	50 %	66043642
8039	NC_007005	ACT	2	6	401037	401042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043642
8040	NC_007005	AAC	2	6	401048	401053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043642
8041	NC_007005	ATC	2	6	401114	401119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043642
8042	NC_007005	CTGGC	2	10	401179	401188	0 %	20 %	40 %	40 %	66043642
8043	NC_007005	AGCCG	2	10	401227	401236	20 %	0 %	40 %	40 %	66043642
8044	NC_007005	GTGC	2	8	401255	401262	0 %	25 %	50 %	25 %	66043642
8045	NC_007005	GC	3	6	401276	401281	0 %	0 %	50 %	50 %	66043642
8046	NC_007005	GCC	2	6	401296	401301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043642
8047	NC_007005	CAG	2	6	401315	401320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_007005	TTG	2	6	401363	401368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043643
8049	NC_007005	GC	3	6	401384	401389	0 %	0 %	50 %	50 %	66043643
8050	NC_007005	TTGGTG	2	12	401435	401446	0 %	50 %	50 %	0 %	66043643
8051	NC_007005	TGC	2	6	401487	401492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043643
8052	NC_007005	G	6	6	401560	401565	0 %	0 %	100 %	0 %	66043643
8053	NC_007005	GCTG	2	8	401593	401600	0 %	25 %	50 %	25 %	66043643
8054	NC_007005	TGCG	2	8	401619	401626	0 %	25 %	50 %	25 %	66043643
8055	NC_007005	GCCAG	2	10	401685	401694	20 %	0 %	40 %	40 %	66043643
8056	NC_007005	ATG	2	6	401757	401762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043643
8057	NC_007005	TTTG	2	8	401776	401783	0 %	75 %	25 %	0 %	66043643
8058	NC_007005	GC	4	8	401869	401876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8059	NC_007005	T	6	6	402023	402028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_007005	TGA	2	6	402174	402179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043644
8061	NC_007005	GCG	2	6	402184	402189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043644
8062	NC_007005	AGA	2	6	402278	402283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043644
8063	NC_007005	TGA	2	6	402294	402299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043644
8064	NC_007005	ACC	2	6	402347	402352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043644
8065	NC_007005	CGA	2	6	402408	402413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043644
8066	NC_007005	CAA	2	6	402516	402521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043644
8067	NC_007005	CG	4	8	402606	402613	0 %	0 %	50 %	50 %	66043644
8068	NC_007005	GAA	2	6	402646	402651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043644
8069	NC_007005	TGCTC	2	10	402717	402726	0 %	40 %	20 %	40 %	66043644
8070	NC_007005	CGC	2	6	402731	402736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043644
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8072	NC_007005	CTC	2	6	402842	402847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	66043644
8073	NC_007005	CGT	2	6	402901	402906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043644
8074	NC_007005	GGC	2	6	402939	402944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043644
8075	NC_007005	AAC	2	6	402973	402978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043644
8076	NC_007005	CAG	2	6	402996	403001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043644
8077	NC_007005	CTG	2	6	403033	403038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043644
8078	NC_007005	CGA	2	6	403167	403172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043644
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8080	NC_007005	CTGGG	2	10	403294	403303	0 %	20 %	60 %	20 %	66043644
8081	NC_007005	GCCTT	2	10	403370	403379	0 %	40 %	20 %	40 %	66043644
8082	NC_007005	AAGAC	2	10	403421	403430	60 %	0 %	20 %	20 %	66043644
8083	NC_007005	GAC	2	6	403453	403458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043644
8084	NC_007005	TGG	2	6	403469	403474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043644
8085	NC_007005	AAC	2	6	403477	403482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043644
8086	NC_007005	GTCAAG	2	12	403528	403539	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	66043644
8087	NC_007005	CCGA	2	8	403552	403559	25 %	0 %	25 %	50 %	66043644
8088	NC_007005	GC	3	6	403563	403568	0 %	0 %	50 %	50 %	66043644
8089	NC_007005	GCT	2	6	403614	403619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043644
8090	NC_007005	GAAGA	2	10	403636	403645	60 %	0 %	40 %	0 %	66043644
8091	NC_007005	GAAG	2	8	403656	403663	50 %	0 %	50 %	0 %	66043644
8092	NC_007005	CAAAGG	2	12	403791	403802	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	66043644
8093	NC_007005	AGC	2	6	403851	403856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043644
8094	NC_007005	CAG	2	6	403882	403887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043644
8095	NC_007005	GCA	2	6	403900	403905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043644
8096	NC_007005	CCCA	2	8	403906	403913	25 %	0 %	0 %	75 %	66043644
8097	NC_007005	CGA	2	6	404038	404043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043645
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8100	NC_007005	GAT	2	6	404348	404353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043645
8101	NC_007005	GC	3	6	404375	404380	0 %	0 %	50 %	50 %	66043645
8102	NC_007005	CTG	2	6	404414	404419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043645
8103	NC_007005	TGGC	2	8	404445	404452	0 %	25 %	50 %	25 %	66043645
8104	NC_007005	CGA	2	6	404503	404508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043645
8105	NC_007005	TGT	3	9	404577	404585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043645
8106	NC_007005	TTCTG	2	10	404592	404601	0 %	60 %	20 %	20 %	66043645
8107	NC_007005	GC	3	6	404779	404784	0 %	0 %	50 %	50 %	66043645
8108	NC_007005	TTC	2	6	404831	404836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043645
8109	NC_007005	TCT	2	6	404928	404933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043645
8110	NC_007005	CGT	3	9	404936	404944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043645
8111	NC_007005	CGA	2	6	404977	404982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043645
8112	NC_007005	ATC	2	6	405104	405109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043645
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8114	NC_007005	ATC	2	6	405251	405256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043645
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8118	NC_007005	TGA	2	6	405477	405482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043645
8119	NC_007005	TTC	3	9	405575	405583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043645
8120	NC_007005	CGTTG	2	10	405694	405703	0 %	40 %	40 %	20 %	66043645
8121	NC_007005	ACC	2	6	405710	405715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043645
8122	NC_007005	CTG	2	6	405722	405727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043645
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8124	NC_007005	TGC	2	6	405837	405842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043645
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8250	NC_007005	CG	3	6	411452	411457	0 %	0 %	50 %	50 %	66043647
8251	NC_007005	GCA	2	6	411487	411492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043647
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8259	NC_007005	GCA	2	6	411862	411867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043647
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8322	NC_007005	CAT	2	6	415188	415193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043653
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8324	NC_007005	CCAG	2	8	415265	415272	25 %	0 %	25 %	50 %	66043653
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8333	NC_007005	CAG	2	6	415564	415569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043654
8334	NC_007005	CAG	2	6	415627	415632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043654
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8345	NC_007005	GCA	2	6	416346	416351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043654
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8352	NC_007005	CAGG	2	8	416536	416543	25 %	0 %	50 %	25 %	66043654
8353	NC_007005	TCG	2	6	416585	416590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043654
8354	NC_007005	GC	4	8	416614	416621	0 %	0 %	50 %	50 %	66043654
8355	NC_007005	TTC	2	6	416629	416634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043654
8356	NC_007005	CGG	2	6	416665	416670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043654
8357	NC_007005	GCA	3	9	416682	416690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043654
8358	NC_007005	TCG	2	6	416696	416701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043654
8359	NC_007005	GCA	2	6	416715	416720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043654
8360	NC_007005	CAG	2	6	416737	416742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043654
8361	NC_007005	TGA	2	6	416754	416759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043654
8362	NC_007005	CAGC	2	8	416830	416837	25 %	0 %	25 %	50 %	66043654
8363	NC_007005	GCA	2	6	416844	416849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043654
8364	NC_007005	CCA	2	6	416869	416874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043654
8365	NC_007005	GGCAGG	2	12	416876	416887	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	66043654
8366	NC_007005	AAC	2	6	416891	416896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043654
8367	NC_007005	TCA	2	6	416900	416905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043654
8368	NC_007005	CGG	2	6	416945	416950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043654
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8370	NC_007005	GC	3	6	417009	417014	0 %	0 %	50 %	50 %	66043655
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8372	NC_007005	GCTTCG	2	12	417064	417075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043655
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8402	NC_007005	TA	3	6	418457	418462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8490	NC_007005	G	7	7	422650	422656	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8491	NC_007005	TGC	2	6	422861	422866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8492	NC_007005	GCG	2	6	422965	422970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8493	NC_007005	CAA	2	6	422998	423003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043663
8494	NC_007005	CCG	2	6	423017	423022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043663
8495	NC_007005	GTT	2	6	423030	423035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043663
8496	NC_007005	GTT	2	6	423051	423056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043663
8497	NC_007005	CAG	2	6	423139	423144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043663
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8499	NC_007005	GC	3	6	423153	423158	0 %	0 %	50 %	50 %	66043663
8500	NC_007005	GAA	2	6	423205	423210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043663

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