MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_007005	GTAA	2	8	350379	350386	50 %	25 %	25 %	0 %	66043599
7002	NC_007005	GTT	2	6	350427	350432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043600
7003	NC_007005	TCA	2	6	350433	350438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043600
7004	NC_007005	ATT	2	6	350482	350487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	66043600
7005	NC_007005	CTT	2	6	350504	350509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043600
7006	NC_007005	CGT	2	6	350543	350548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043600
7007	NC_007005	TCC	2	6	350567	350572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	66043600
7008	NC_007005	TGC	2	6	350636	350641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043600
7009	NC_007005	TCA	2	6	350667	350672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043600
7010	NC_007005	TCA	2	6	350697	350702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043600
7011	NC_007005	TGA	2	6	350745	350750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043600
7012	NC_007005	ATT	2	6	350886	350891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	66043600
7013	NC_007005	CAT	2	6	350976	350981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043600
7014	NC_007005	GGC	2	6	350985	350990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043600
7015	NC_007005	CAG	2	6	350991	350996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043600
7016	NC_007005	ATG	2	6	351085	351090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043600
7017	NC_007005	AGA	2	6	351144	351149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043600
7018	NC_007005	GTC	2	6	351160	351165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043600
7019	NC_007005	TCC	2	6	351198	351203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	66043600
7020	NC_007005	CTG	2	6	351214	351219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043600
7021	NC_007005	GGCA	2	8	351239	351246	25 %	0 %	50 %	25 %	66043600
7022	NC_007005	CAG	2	6	351273	351278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043600
7023	NC_007005	C	6	6	351388	351393	0 %	0 %	0 %	100 %	66043600
7024	NC_007005	TGG	2	6	351455	351460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043600
7025	NC_007005	CTA	2	6	351648	351653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043600
7026	NC_007005	GAC	2	6	351667	351672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043600
7027	NC_007005	GC	3	6	351679	351684	0 %	0 %	50 %	50 %	66043600
7028	NC_007005	CGG	2	6	351737	351742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043600
7029	NC_007005	TGG	2	6	351755	351760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043600
7030	NC_007005	ACC	2	6	351821	351826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043600
7031	NC_007005	CTGAT	2	10	351955	351964	20 %	40 %	20 %	20 %	66043600
7032	NC_007005	ATT	2	6	352189	352194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	66043601
7033	NC_007005	CGTTGT	2	12	352440	352451	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	66043601
7034	NC_007005	G	7	7	352518	352524	0 %	0 %	100 %	0 %	66043601
7035	NC_007005	GGC	2	6	352616	352621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043601
7036	NC_007005	T	6	6	352628	352633	0 %	100 %	0 %	0 %	66043601
7037	NC_007005	GAA	2	6	352661	352666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043601
7038	NC_007005	GAA	2	6	352721	352726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043601
7039	NC_007005	CAG	2	6	352745	352750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043601
7040	NC_007005	TG	3	6	352823	352828	0 %	50 %	50 %	0 %	66043601
7041	NC_007005	AGC	3	9	352841	352849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043601
7042	NC_007005	GAC	2	6	352874	352879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043601
7043	NC_007005	CCAG	2	8	352924	352931	25 %	0 %	25 %	50 %	66043601
7044	NC_007005	GCGG	2	8	353060	353067	0 %	0 %	75 %	25 %	66043602
7045	NC_007005	GCT	2	6	353097	353102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043602
7046	NC_007005	CGA	2	6	353141	353146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043602
7047	NC_007005	GGCT	2	8	353160	353167	0 %	25 %	50 %	25 %	66043602
7048	NC_007005	CG	3	6	353184	353189	0 %	0 %	50 %	50 %	66043602
7049	NC_007005	TGG	2	6	353281	353286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043602
7050	NC_007005	C	6	6	353316	353321	0 %	0 %	0 %	100 %	66043602
7051	NC_007005	GTT	2	6	353360	353365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043602
7052	NC_007005	CTG	2	6	353394	353399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043602
7053	NC_007005	GGCGCT	2	12	353431	353442	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	66043602
7054	NC_007005	ACC	2	6	353497	353502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043602
7055	NC_007005	CGC	2	6	353540	353545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043602
7056	NC_007005	GGC	2	6	353588	353593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043602
7057	NC_007005	ACG	2	6	353605	353610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043602
7058	NC_007005	TGC	2	6	353611	353616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043602
7059	NC_007005	CGG	2	6	353619	353624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043602
7060	NC_007005	TTG	2	6	353625	353630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043602
7061	NC_007005	ACC	2	6	353733	353738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043602
7062	NC_007005	CGG	2	6	353812	353817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043602
7063	NC_007005	TGT	2	6	353881	353886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043602
7064	NC_007005	TTG	2	6	353952	353957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043602
7065	NC_007005	CAA	2	6	353988	353993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043602
7066	NC_007005	AACGA	2	10	354117	354126	60 %	0 %	20 %	20 %	66043602
7067	NC_007005	T	6	6	354187	354192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_007005	AG	3	6	354208	354213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_007005	TGTT	2	8	354222	354229	0 %	75 %	25 %	0 %	66043603
7070	NC_007005	CAA	2	6	354232	354237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043603
7071	NC_007005	TCG	2	6	354264	354269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043603
7072	NC_007005	CG	3	6	354347	354352	0 %	0 %	50 %	50 %	66043603
7073	NC_007005	TCT	2	6	354612	354617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7074	NC_007005	T	7	7	354676	354682	0 %	100 %	0 %	0 %	66043604
7075	NC_007005	TGT	2	6	354720	354725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043604
7076	NC_007005	TGG	2	6	354738	354743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043604
7077	NC_007005	ACC	2	6	354752	354757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043604
7078	NC_007005	TCG	2	6	354789	354794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043604
7079	NC_007005	TGG	2	6	354948	354953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043604
7080	NC_007005	CAT	2	6	354991	354996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043604
7081	NC_007005	GC	3	6	354998	355003	0 %	0 %	50 %	50 %	66043604
7082	NC_007005	GTG	2	6	355142	355147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043604
7083	NC_007005	CCG	2	6	355155	355160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043604
7084	NC_007005	CTG	2	6	355169	355174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043604
7085	NC_007005	AGC	2	6	355233	355238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043604
7086	NC_007005	ATC	2	6	355310	355315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043604
7087	NC_007005	TCG	2	6	355341	355346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043604
7088	NC_007005	GGC	2	6	355423	355428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043604
7089	NC_007005	GAC	2	6	355438	355443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043604
7090	NC_007005	TTC	2	6	355457	355462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043604
7091	NC_007005	GAT	2	6	355513	355518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043604
7092	NC_007005	TCG	2	6	355587	355592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043604
7093	NC_007005	CAA	2	6	355690	355695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043604
7094	NC_007005	TGG	2	6	355722	355727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043604
7095	NC_007005	TGG	2	6	355811	355816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043604
7096	NC_007005	TTG	2	6	355851	355856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043604
7097	NC_007005	GA	3	6	355887	355892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_007005	TGGA	2	8	355901	355908	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_007005	GCT	2	6	355957	355962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7100	NC_007005	AG	3	6	355975	355980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_007005	CCG	2	6	355981	355986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7102	NC_007005	CGT	2	6	356039	356044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043605
7103	NC_007005	CGT	2	6	356057	356062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043605
7104	NC_007005	GCTGC	2	10	356122	356131	0 %	20 %	40 %	40 %	66043605
7105	NC_007005	TGC	2	6	356162	356167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043605
7106	NC_007005	CGC	2	6	356168	356173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043605
7107	NC_007005	ACG	2	6	356248	356253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043605
7108	NC_007005	TCG	2	6	356353	356358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043605
7109	NC_007005	CGC	2	6	356585	356590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043605
7110	NC_007005	GGT	2	6	356603	356608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043605
7111	NC_007005	GTCG	2	8	356619	356626	0 %	25 %	50 %	25 %	66043605
7112	NC_007005	GCT	2	6	356652	356657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043605
7113	NC_007005	GTC	2	6	356694	356699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043605
7114	NC_007005	CAG	2	6	356721	356726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043605
7115	NC_007005	GCT	2	6	356763	356768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043605
7116	NC_007005	CCACA	2	10	356802	356811	40 %	0 %	0 %	60 %	66043605
7117	NC_007005	CG	3	6	356813	356818	0 %	0 %	50 %	50 %	66043605
7118	NC_007005	GTG	2	6	356842	356847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043605
7119	NC_007005	TTG	2	6	356874	356879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043605
7120	NC_007005	ATGC	2	8	356942	356949	25 %	25 %	25 %	25 %	66043605
7121	NC_007005	GC	3	6	356963	356968	0 %	0 %	50 %	50 %	66043605
7122	NC_007005	CGT	2	6	356993	356998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043605
7123	NC_007005	CAC	2	6	357003	357008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043605
7124	NC_007005	TGCC	2	8	357026	357033	0 %	25 %	25 %	50 %	66043605
7125	NC_007005	CGG	2	6	357182	357187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043605
7126	NC_007005	GCCA	2	8	357241	357248	25 %	0 %	25 %	50 %	66043605
7127	NC_007005	TCG	2	6	357287	357292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043605
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7129	NC_007005	CGA	2	6	357305	357310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043605
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7131	NC_007005	CGC	2	6	357422	357427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043605
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7144	NC_007005	CGA	2	6	357972	357977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043605
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7152	NC_007005	CGCC	2	8	358315	358322	0 %	0 %	25 %	75 %	66043605
7153	NC_007005	GCA	2	6	358385	358390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043605
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7156	NC_007005	AGGG	2	8	358513	358520	25 %	0 %	75 %	0 %	66043605
7157	NC_007005	CGA	3	9	358523	358531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043605
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7162	NC_007005	GTC	2	6	358686	358691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043605
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7170	NC_007005	CTG	2	6	359161	359166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7173	NC_007005	TCT	2	6	359273	359278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7211	NC_007005	TCT	2	6	361185	361190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7212	NC_007005	AATG	2	8	361258	361265	50 %	25 %	25 %	0 %	66043608
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7215	NC_007005	TCA	2	6	361459	361464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043608
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7221	NC_007005	CTG	2	6	361933	361938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043608
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7224	NC_007005	GCA	2	6	362106	362111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043608
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7226	NC_007005	CTG	2	6	362142	362147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043608
7227	NC_007005	T	7	7	362208	362214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7228	NC_007005	AAT	2	6	362216	362221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7229	NC_007005	GT	3	6	362268	362273	0 %	50 %	50 %	0 %	66043609
7230	NC_007005	GGC	2	6	362275	362280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043609
7231	NC_007005	GCTTG	2	10	362284	362293	0 %	40 %	40 %	20 %	66043609
7232	NC_007005	GC	3	6	362298	362303	0 %	0 %	50 %	50 %	66043609
7233	NC_007005	GCG	2	6	362310	362315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043609
7234	NC_007005	GTG	2	6	362381	362386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043609
7235	NC_007005	GCTG	2	8	362488	362495	0 %	25 %	50 %	25 %	66043609
7236	NC_007005	GCC	2	6	362524	362529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043609
7237	NC_007005	CTG	2	6	362609	362614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043609
7238	NC_007005	CAA	2	6	362617	362622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043609
7239	NC_007005	ACA	2	6	362760	362765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043609
7240	NC_007005	CCG	2	6	362846	362851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043609
7241	NC_007005	GGC	2	6	362915	362920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043609
7242	NC_007005	ACC	2	6	362945	362950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043609
7243	NC_007005	ACG	2	6	362961	362966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043609
7244	NC_007005	ATC	2	6	363020	363025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043609
7245	NC_007005	TCG	2	6	363105	363110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043609
7246	NC_007005	CGC	2	6	363138	363143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043609
7247	NC_007005	GT	3	6	363183	363188	0 %	50 %	50 %	0 %	66043609
7248	NC_007005	GGC	2	6	363199	363204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043609
7249	NC_007005	TCT	2	6	363219	363224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043609
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7251	NC_007005	TCC	2	6	363389	363394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7252	NC_007005	GAA	2	6	363531	363536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7253	NC_007005	CTTT	2	8	363577	363584	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7254	NC_007005	TGCC	2	8	363638	363645	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7255	NC_007005	GTCG	2	8	363666	363673	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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7258	NC_007005	TTGC	2	8	363776	363783	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7259	NC_007005	TTGT	2	8	363829	363836	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7260	NC_007005	AGC	2	6	363839	363844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7261	NC_007005	TGG	2	6	363852	363857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7262	NC_007005	GAT	2	6	363881	363886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043610
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7265	NC_007005	CT	3	6	363929	363934	0 %	50 %	0 %	50 %	66043610
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7269	NC_007005	GCCT	2	8	364169	364176	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7270	NC_007005	CCGCTA	2	12	364228	364239	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	66043611
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7283	NC_007005	A	7	7	365092	365098	100 %	0 %	0 %	0 %	66043611
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7287	NC_007005	GT	3	6	365353	365358	0 %	50 %	50 %	0 %	66043612
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7314	NC_007005	TGT	2	6	366527	366532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7319	NC_007005	CA	3	6	366708	366713	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7320	NC_007005	TC	3	6	366732	366737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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7362	NC_007005	AAAGTC	2	12	368949	368960	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	66043614
7363	NC_007005	TCGT	2	8	369023	369030	0 %	50 %	25 %	25 %	66043615
7364	NC_007005	TCG	2	6	369045	369050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043615
7365	NC_007005	ACCG	2	8	369179	369186	25 %	0 %	25 %	50 %	66043615
7366	NC_007005	GAA	2	6	369193	369198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043615
7367	NC_007005	ACC	2	6	369281	369286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043615
7368	NC_007005	AAG	2	6	369326	369331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043615
7369	NC_007005	CGT	2	6	369375	369380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043615
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7494	NC_007005	CCA	2	6	374891	374896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043619
7495	NC_007005	TCG	2	6	374905	374910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043619
7496	NC_007005	GATC	2	8	374930	374937	25 %	25 %	25 %	25 %	66043619
7497	NC_007005	GAT	2	6	375015	375020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043619
7498	NC_007005	CTTG	2	8	375080	375087	0 %	50 %	25 %	25 %	66043619
7499	NC_007005	TGA	2	6	375110	375115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043619
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