MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
70001	NC_007005	TGGC	2	8	3531661	3531668	0 %	25 %	50 %	25 %	66046171
70002	NC_007005	CAC	2	6	3531699	3531704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66046171
70003	NC_007005	GA	3	6	3531729	3531734	50 %	0 %	50 %	0 %	66046171
70004	NC_007005	TCA	2	6	3531743	3531748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66046171
70005	NC_007005	CG	3	6	3531888	3531893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70006	NC_007005	CAG	2	6	3531914	3531919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70007	NC_007005	CAG	2	6	3531945	3531950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70008	NC_007005	TTAT	2	8	3532040	3532047	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70009	NC_007005	GT	3	6	3532052	3532057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70010	NC_007005	ACG	2	6	3532075	3532080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70011	NC_007005	AAGG	2	8	3532081	3532088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70012	NC_007005	CGA	2	6	3532266	3532271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66046172
70013	NC_007005	T	6	6	3532402	3532407	0 %	100 %	0 %	0 %	66046172
70014	NC_007005	TTC	2	6	3532472	3532477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66046172
70015	NC_007005	GGT	2	6	3532615	3532620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66046172
70016	NC_007005	GGT	2	6	3532624	3532629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66046172
70017	NC_007005	TGG	2	6	3532635	3532640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66046172
70018	NC_007005	GGCT	2	8	3532674	3532681	0 %	25 %	50 %	25 %	66046172
70019	NC_007005	ACC	2	6	3532826	3532831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66046172
70020	NC_007005	CTT	2	6	3532843	3532848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66046172
70021	NC_007005	TCG	2	6	3532850	3532855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046172
70022	NC_007005	CAG	2	6	3532858	3532863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66046172
70023	NC_007005	GCT	2	6	3532999	3533004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046172
70024	NC_007005	CAG	2	6	3533065	3533070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66046172
70025	NC_007005	ATA	2	6	3533088	3533093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	66046172
70026	NC_007005	CTG	2	6	3533166	3533171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046173
70027	NC_007005	CG	3	6	3533172	3533177	0 %	0 %	50 %	50 %	66046173
70028	NC_007005	GAA	2	6	3533196	3533201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66046173
70029	NC_007005	TCGG	2	8	3533253	3533260	0 %	25 %	50 %	25 %	66046173
70030	NC_007005	GCC	2	6	3533310	3533315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66046173
70031	NC_007005	GC	4	8	3533417	3533424	0 %	0 %	50 %	50 %	66046173
70032	NC_007005	GCT	3	9	3533438	3533446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046173
70033	NC_007005	GCC	2	6	3533448	3533453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66046173
70034	NC_007005	CG	3	6	3533462	3533467	0 %	0 %	50 %	50 %	66046173
70035	NC_007005	CTG	2	6	3533520	3533525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046173
70036	NC_007005	TGT	2	6	3533576	3533581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66046173
70037	NC_007005	TTG	2	6	3533634	3533639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66046173
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70039	NC_007005	GCAGC	2	10	3533727	3533736	20 %	0 %	40 %	40 %	66046173
70040	NC_007005	CAC	2	6	3533772	3533777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66046173
70041	NC_007005	GGC	2	6	3533906	3533911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66046174
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70043	NC_007005	GAT	2	6	3533987	3533992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66046174
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70045	NC_007005	GCGA	2	8	3534036	3534043	25 %	0 %	50 %	25 %	66046174
70046	NC_007005	CGG	2	6	3534080	3534085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66046174
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70050	NC_007005	AAAG	2	8	3534234	3534241	75 %	0 %	25 %	0 %	66046174
70051	NC_007005	GAA	3	9	3534299	3534307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66046174
70052	NC_007005	AGAT	2	8	3534351	3534358	50 %	25 %	25 %	0 %	66046174
70053	NC_007005	CCAG	2	8	3534373	3534380	25 %	0 %	25 %	50 %	66046174
70054	NC_007005	GCA	2	6	3534397	3534402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66046174
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70056	NC_007005	CTG	2	6	3534426	3534431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046174
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70061	NC_007005	CAA	2	6	3534558	3534563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66046175
70062	NC_007005	AC	4	8	3534584	3534591	50 %	0 %	0 %	50 %	66046175
70063	NC_007005	TCA	2	6	3534599	3534604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66046175
70064	NC_007005	TGG	2	6	3534650	3534655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66046175
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70068	NC_007005	CGC	2	6	3535050	3535055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66046175
70069	NC_007005	GCAG	2	8	3535135	3535142	25 %	0 %	50 %	25 %	66046175
70070	NC_007005	CAGG	2	8	3535217	3535224	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70071	NC_007005	AT	3	6	3535244	3535249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70072	NC_007005	AGCATA	2	12	3535289	3535300	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70073	NC_007005	TGCC	2	8	3535313	3535320	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70074	NC_007005	TG	3	6	3535382	3535387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70075	NC_007005	CTGG	2	8	3535457	3535464	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70076	NC_007005	CA	3	6	3535497	3535502	50 %	0 %	0 %	50 %	66046176
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70080	NC_007005	CGGCG	2	10	3535867	3535876	0 %	0 %	60 %	40 %	66046176
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70093	NC_007005	C	6	6	3536778	3536783	0 %	0 %	0 %	100 %	66046178
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70111	NC_007005	CA	3	6	3537857	3537862	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70112	NC_007005	ACG	2	6	3537871	3537876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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70120	NC_007005	GGA	2	6	3538289	3538294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	66046180
70121	NC_007005	GGCCA	2	10	3538338	3538347	20 %	0 %	40 %	40 %	66046180
70122	NC_007005	AAGGC	2	10	3538357	3538366	40 %	0 %	40 %	20 %	66046180
70123	NC_007005	GCA	2	6	3538394	3538399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66046180
70124	NC_007005	TGT	2	6	3538453	3538458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66046180
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70142	NC_007005	GGTG	2	8	3539682	3539689	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
70143	NC_007005	TG	3	6	3539708	3539713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70144	NC_007005	T	6	6	3539782	3539787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70152	NC_007005	TGCG	2	8	3540257	3540264	0 %	25 %	50 %	25 %	66046182
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70209	NC_007005	CAT	2	6	3543462	3543467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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70221	NC_007005	GCG	2	6	3543990	3543995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66046187
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70225	NC_007005	CGTT	2	8	3544166	3544173	0 %	50 %	25 %	25 %	66046187
70226	NC_007005	TG	3	6	3544187	3544192	0 %	50 %	50 %	0 %	66046187
70227	NC_007005	CAG	2	6	3544220	3544225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66046187
70228	NC_007005	CTGG	2	8	3544242	3544249	0 %	25 %	50 %	25 %	66046187
70229	NC_007005	GC	3	6	3544294	3544299	0 %	0 %	50 %	50 %	66046187
70230	NC_007005	ATCG	2	8	3544333	3544340	25 %	25 %	25 %	25 %	66046187
70231	NC_007005	TGCCGG	2	12	3544351	3544362	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	66046187
70232	NC_007005	GGC	2	6	3544427	3544432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66046187
70233	NC_007005	TCAC	2	8	3544506	3544513	25 %	25 %	0 %	50 %	66046187
70234	NC_007005	TCA	2	6	3544581	3544586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66046187
70235	NC_007005	GTC	2	6	3544596	3544601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70236	NC_007005	GCT	2	6	3544713	3544718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046188
70237	NC_007005	GGC	2	6	3544731	3544736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66046188
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70239	NC_007005	CAT	2	6	3544913	3544918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66046188
70240	NC_007005	GGCTG	2	10	3545049	3545058	0 %	20 %	60 %	20 %	66046188
70241	NC_007005	TCGTC	2	10	3545077	3545086	0 %	40 %	20 %	40 %	66046188
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70243	NC_007005	GATG	2	8	3545186	3545193	25 %	25 %	50 %	0 %	66046188
70244	NC_007005	GCA	2	6	3545199	3545204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66046188
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70358	NC_007005	AGC	2	6	3549960	3549965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66046192
70359	NC_007005	CTG	2	6	3549975	3549980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046192
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70365	NC_007005	TCG	2	6	3550303	3550308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046192
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70371	NC_007005	CTG	2	6	3550545	3550550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046192
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70377	NC_007005	AAG	2	6	3550981	3550986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70378	NC_007005	TCCC	2	8	3550992	3550999	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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70475	NC_007005	GCA	2	6	3555608	3555613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66046197
70476	NC_007005	TGA	2	6	3555650	3555655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66046197
70477	NC_007005	CAG	2	6	3555945	3555950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66046197
70478	NC_007005	CAG	2	6	3555993	3555998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66046197
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70480	NC_007005	CGA	2	6	3556151	3556156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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