MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
69001	NC_007005	TGC	3	9	3481601	3481609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046133
69002	NC_007005	CGC	2	6	3481654	3481659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66046133
69003	NC_007005	CAG	2	6	3481758	3481763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66046133
69004	NC_007005	AGCA	2	8	3481864	3481871	50 %	0 %	25 %	25 %	66046133
69005	NC_007005	ACT	3	9	3481919	3481927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66046133
69006	NC_007005	TAT	2	6	3481939	3481944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	66046133
69007	NC_007005	TGG	2	6	3481966	3481971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66046133
69008	NC_007005	TGG	2	6	3482026	3482031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66046133
69009	NC_007005	GCG	2	6	3482130	3482135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66046134
69010	NC_007005	CTG	3	9	3482137	3482145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046134
69011	NC_007005	ATC	2	6	3482146	3482151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66046134
69012	NC_007005	CTG	2	6	3482158	3482163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046134
69013	NC_007005	CTG	2	6	3482170	3482175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046134
69014	NC_007005	TCGC	2	8	3482228	3482235	0 %	25 %	25 %	50 %	66046134
69015	NC_007005	CGG	2	6	3482247	3482252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66046134
69016	NC_007005	CCG	2	6	3482282	3482287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66046134
69017	NC_007005	GAA	2	6	3482397	3482402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66046134
69018	NC_007005	GCA	2	6	3482423	3482428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66046134
69019	NC_007005	TTTC	2	8	3482430	3482437	0 %	75 %	0 %	25 %	66046134
69020	NC_007005	GCG	2	6	3482438	3482443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66046134
69021	NC_007005	GACC	2	8	3482451	3482458	25 %	0 %	25 %	50 %	66046134
69022	NC_007005	ACCT	2	8	3482515	3482522	25 %	25 %	0 %	50 %	66046134
69023	NC_007005	AGC	2	6	3482584	3482589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66046134
69024	NC_007005	CAT	3	9	3482595	3482603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66046134
69025	NC_007005	TGC	2	6	3482636	3482641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046134
69026	NC_007005	TGG	3	9	3482642	3482650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66046134
69027	NC_007005	GGC	2	6	3482659	3482664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66046134
69028	NC_007005	TGG	2	6	3482787	3482792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66046134
69029	NC_007005	CTG	2	6	3482809	3482814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046134
69030	NC_007005	GAGC	2	8	3482880	3482887	25 %	0 %	50 %	25 %	66046134
69031	NC_007005	TGG	2	6	3482930	3482935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66046134
69032	NC_007005	TCA	2	6	3482957	3482962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66046134
69033	NC_007005	GCT	2	6	3482982	3482987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046134
69034	NC_007005	TCT	2	6	3482999	3483004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66046134
69035	NC_007005	GGT	2	6	3483060	3483065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66046134
69036	NC_007005	GTT	2	6	3483075	3483080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66046134
69037	NC_007005	CTG	2	6	3483100	3483105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046134
69038	NC_007005	ATG	2	6	3483174	3483179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66046134
69039	NC_007005	CGC	2	6	3483190	3483195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66046135
69040	NC_007005	CGT	2	6	3483201	3483206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046135
69041	NC_007005	GCA	2	6	3483223	3483228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66046135
69042	NC_007005	CGC	2	6	3483231	3483236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66046135
69043	NC_007005	TGG	2	6	3483240	3483245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66046135
69044	NC_007005	GCT	2	6	3483314	3483319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046135
69045	NC_007005	AGC	2	6	3483370	3483375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66046135
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69047	NC_007005	GAC	2	6	3483483	3483488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66046135
69048	NC_007005	TGACC	2	10	3483500	3483509	20 %	20 %	20 %	40 %	66046135
69049	NC_007005	GCCC	2	8	3483523	3483530	0 %	0 %	25 %	75 %	66046135
69050	NC_007005	GAT	2	6	3483555	3483560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66046135
69051	NC_007005	GC	3	6	3483564	3483569	0 %	0 %	50 %	50 %	66046135
69052	NC_007005	TTA	2	6	3483677	3483682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	66046135
69053	NC_007005	CGG	2	6	3483683	3483688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66046135
69054	NC_007005	CTG	2	6	3483714	3483719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046135
69055	NC_007005	CTG	2	6	3483750	3483755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046135
69056	NC_007005	ATC	2	6	3483756	3483761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66046135
69057	NC_007005	TCG	2	6	3483772	3483777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046135
69058	NC_007005	TGG	2	6	3483789	3483794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66046135
69059	NC_007005	CTG	2	6	3483795	3483800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046135
69060	NC_007005	CAT	2	6	3483803	3483808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66046135
69061	NC_007005	GC	3	6	3483845	3483850	0 %	0 %	50 %	50 %	66046135
69062	NC_007005	GCC	2	6	3483888	3483893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66046135
69063	NC_007005	CG	3	6	3483894	3483899	0 %	0 %	50 %	50 %	66046135
69064	NC_007005	TGCC	2	8	3484036	3484043	0 %	25 %	25 %	50 %	66046135
69065	NC_007005	CTGG	2	8	3484100	3484107	0 %	25 %	50 %	25 %	66046135
69066	NC_007005	GCT	2	6	3484145	3484150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046135
69067	NC_007005	AGGCG	2	10	3484160	3484169	20 %	0 %	60 %	20 %	66046135
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69069	NC_007005	TGC	2	6	3484361	3484366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046136
69070	NC_007005	GCA	2	6	3484391	3484396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66046136
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69072	NC_007005	CGA	2	6	3484428	3484433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66046136
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69077	NC_007005	TGA	2	6	3484679	3484684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66046136
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69082	NC_007005	TGC	2	6	3484775	3484780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046136
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69084	NC_007005	GCT	2	6	3484812	3484817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046136
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69088	NC_007005	TGC	2	6	3484949	3484954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046136
69089	NC_007005	TGC	2	6	3485006	3485011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046136
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69091	NC_007005	GCG	2	6	3485058	3485063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66046136
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69096	NC_007005	ACCGT	2	10	3485549	3485558	20 %	20 %	20 %	40 %	66046136
69097	NC_007005	GCT	2	6	3485577	3485582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046136
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69099	NC_007005	GTC	2	6	3485641	3485646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046136
69100	NC_007005	ACG	2	6	3485660	3485665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66046136
69101	NC_007005	GTC	2	6	3485689	3485694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046136
69102	NC_007005	ATG	2	6	3485711	3485716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66046136
69103	NC_007005	GGC	2	6	3485757	3485762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66046136
69104	NC_007005	G	7	7	3485805	3485811	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
69105	NC_007005	TCA	2	6	3485849	3485854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66046137
69106	NC_007005	TGC	3	9	3485886	3485894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046137
69107	NC_007005	CGG	3	9	3485905	3485913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66046137
69108	NC_007005	GCC	2	6	3485932	3485937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66046137
69109	NC_007005	AGGCGC	2	12	3485954	3485965	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	66046137
69110	NC_007005	GTT	2	6	3485968	3485973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66046137
69111	NC_007005	CTT	3	9	3485997	3486005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66046137
69112	NC_007005	ATG	2	6	3486083	3486088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66046137
69113	NC_007005	CAT	2	6	3486145	3486150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66046137
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69115	NC_007005	CG	3	6	3486163	3486168	0 %	0 %	50 %	50 %	66046137
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69354	NC_007005	TCA	2	6	3499196	3499201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66046145
69355	NC_007005	TCA	2	6	3499214	3499219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66046145
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69473	NC_007005	GTG	2	6	3505411	3505416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66046147
69474	NC_007005	CGC	2	6	3505430	3505435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66046147
69475	NC_007005	CGA	2	6	3505479	3505484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66046147
69476	NC_007005	TG	3	6	3505515	3505520	0 %	50 %	50 %	0 %	66046147
69477	NC_007005	CCG	3	9	3505592	3505600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66046147
69478	NC_007005	GAT	2	6	3505611	3505616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66046147
69479	NC_007005	GC	3	6	3505690	3505695	0 %	0 %	50 %	50 %	66046147
69480	NC_007005	CAC	2	6	3505710	3505715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66046147
69481	NC_007005	AGC	2	6	3505753	3505758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66046147
69482	NC_007005	C	6	6	3505832	3505837	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69483	NC_007005	ACG	2	6	3505845	3505850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66046148
69484	NC_007005	TCA	3	9	3505851	3505859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66046148
69485	NC_007005	GCC	2	6	3505934	3505939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66046148
69486	NC_007005	GGC	2	6	3505948	3505953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66046148
69487	NC_007005	GTG	2	6	3505970	3505975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66046148
69488	NC_007005	CGACAT	2	12	3506062	3506073	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	66046148
69489	NC_007005	CTG	2	6	3506198	3506203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66046148
69490	NC_007005	GGCGAC	2	12	3506243	3506254	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	66046148
69491	NC_007005	GAT	2	6	3506371	3506376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66046148
69492	NC_007005	AAGG	2	8	3506378	3506385	50 %	0 %	50 %	0 %	66046148
69493	NC_007005	ACC	3	9	3506447	3506455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66046148
69494	NC_007005	GGC	2	6	3506555	3506560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66046148
69495	NC_007005	GGA	2	6	3506578	3506583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	66046148
69496	NC_007005	CCA	2	6	3506613	3506618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66046148
69497	NC_007005	TGG	2	6	3506628	3506633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66046148
69498	NC_007005	GC	3	6	3506635	3506640	0 %	0 %	50 %	50 %	66046148
69499	NC_007005	GC	3	6	3506664	3506669	0 %	0 %	50 %	50 %	66046148
69500	NC_007005	CGC	2	6	3506798	3506803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66046149

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