MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_007005	TGAGC	2	10	274411	274420	20 %	20 %	40 %	20 %	66043528
5502	NC_007005	TGA	2	6	274447	274452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043528
5503	NC_007005	CGT	2	6	274511	274516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043528
5504	NC_007005	GGC	2	6	274519	274524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043528
5505	NC_007005	GAA	2	6	274616	274621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043528
5506	NC_007005	TGA	2	6	274704	274709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043528
5507	NC_007005	TGC	2	6	274905	274910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_007005	T	6	6	274953	274958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_007005	CTCG	2	8	275004	275011	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5510	NC_007005	CTGG	2	8	275084	275091	0 %	25 %	50 %	25 %	66043529
5511	NC_007005	TCG	2	6	275098	275103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043529
5512	NC_007005	CTG	2	6	275136	275141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043529
5513	NC_007005	GC	3	6	275198	275203	0 %	0 %	50 %	50 %	66043529
5514	NC_007005	GCC	2	6	275211	275216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043529
5515	NC_007005	GGC	2	6	275246	275251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043529
5516	NC_007005	AGC	2	6	275293	275298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043529
5517	NC_007005	CGC	2	6	275380	275385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043529
5518	NC_007005	GGCT	2	8	275421	275428	0 %	25 %	50 %	25 %	66043529
5519	NC_007005	GCTGG	2	10	275480	275489	0 %	20 %	60 %	20 %	66043529
5520	NC_007005	GCG	2	6	275574	275579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043529
5521	NC_007005	GTGA	2	8	275616	275623	25 %	25 %	50 %	0 %	66043529
5522	NC_007005	CGAG	2	8	275629	275636	25 %	0 %	50 %	25 %	66043529
5523	NC_007005	CGC	2	6	275740	275745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043529
5524	NC_007005	CGCCTG	2	12	275751	275762	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	66043529
5525	NC_007005	TGA	2	6	275773	275778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043529
5526	NC_007005	CGA	2	6	275870	275875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043529
5527	NC_007005	CGC	2	6	275988	275993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043529
5528	NC_007005	CTG	2	6	276009	276014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043529
5529	NC_007005	CGC	2	6	276065	276070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043529
5530	NC_007005	GTG	2	6	276102	276107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043529
5531	NC_007005	G	6	6	276124	276129	0 %	0 %	100 %	0 %	66043529
5532	NC_007005	TCCG	2	8	276140	276147	0 %	25 %	25 %	50 %	66043529
5533	NC_007005	CGCA	2	8	276188	276195	25 %	0 %	25 %	50 %	66043529
5534	NC_007005	CGGCCT	2	12	276209	276220	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	66043529
5535	NC_007005	CGG	2	6	276251	276256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043529
5536	NC_007005	TGC	2	6	276325	276330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043529
5537	NC_007005	GA	3	6	276332	276337	50 %	0 %	50 %	0 %	66043529
5538	NC_007005	CGG	2	6	276437	276442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_007005	TCT	2	6	276594	276599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_007005	TTCA	2	8	276633	276640	25 %	50 %	0 %	25 %	66043530
5541	NC_007005	GGCA	2	8	276723	276730	25 %	0 %	50 %	25 %	66043530
5542	NC_007005	CAAC	2	8	276734	276741	50 %	0 %	0 %	50 %	66043530
5543	NC_007005	GCTT	2	8	276788	276795	0 %	50 %	25 %	25 %	66043530
5544	NC_007005	CTG	2	6	276867	276872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043530
5545	NC_007005	CTTC	2	8	276917	276924	0 %	50 %	0 %	50 %	66043530
5546	NC_007005	GAC	2	6	276927	276932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043530
5547	NC_007005	GGT	2	6	276942	276947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043530
5548	NC_007005	CAT	2	6	276995	277000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043530
5549	NC_007005	GCG	2	6	277039	277044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043530
5550	NC_007005	CGA	2	6	277086	277091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_007005	GAA	3	9	277094	277102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_007005	GAC	2	6	277127	277132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_007005	ACC	2	6	277172	277177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5554	NC_007005	CGA	2	6	277195	277200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_007005	GAT	2	6	277205	277210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_007005	TAA	2	6	277263	277268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_007005	TGC	2	6	277272	277277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_007005	T	8	8	277278	277285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_007005	CTG	2	6	277381	277386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043531
5560	NC_007005	TGC	2	6	277411	277416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043531
5561	NC_007005	CTG	2	6	277478	277483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043531
5562	NC_007005	GCAAG	2	10	277504	277513	40 %	0 %	40 %	20 %	66043531
5563	NC_007005	GA	3	6	277546	277551	50 %	0 %	50 %	0 %	66043531
5564	NC_007005	GCTG	2	8	277570	277577	0 %	25 %	50 %	25 %	66043531
5565	NC_007005	TTG	2	6	277642	277647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_007005	TAA	2	6	277712	277717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_007005	CTGCG	2	10	277816	277825	0 %	20 %	40 %	40 %	66043532
5568	NC_007005	TTCT	2	8	277898	277905	0 %	75 %	0 %	25 %	66043532
5569	NC_007005	ACA	2	6	277938	277943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043532
5570	NC_007005	TCGG	2	8	278043	278050	0 %	25 %	50 %	25 %	66043532
5571	NC_007005	GGC	2	6	278075	278080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043532
5572	NC_007005	AATCG	2	10	278081	278090	40 %	20 %	20 %	20 %	66043532
5573	NC_007005	GTT	2	6	278111	278116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043532
5574	NC_007005	CTTCG	2	10	278165	278174	0 %	40 %	20 %	40 %	66043532
5575	NC_007005	TGA	2	6	278200	278205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043532
5576	NC_007005	GCT	2	6	278249	278254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043532
5577	NC_007005	CAG	2	6	278258	278263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043532
5578	NC_007005	TGAGC	2	10	278554	278563	20 %	20 %	40 %	20 %	66043532
5579	NC_007005	CAG	2	6	278600	278605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043532
5580	NC_007005	GCG	2	6	278610	278615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043532
5581	NC_007005	CATG	2	8	278755	278762	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5582	NC_007005	GAA	2	6	278765	278770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_007005	GAT	2	6	278800	278805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_007005	AGC	2	6	278853	278858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043533
5585	NC_007005	GAC	2	6	278890	278895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043533
5586	NC_007005	TCC	2	6	278906	278911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	66043533
5587	NC_007005	GTG	2	6	279094	279099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043533
5588	NC_007005	CGG	2	6	279116	279121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043533
5589	NC_007005	AGC	2	6	279212	279217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043533
5590	NC_007005	GAT	2	6	279306	279311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043533
5591	NC_007005	AAG	2	6	279433	279438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043533
5592	NC_007005	GGC	2	6	279565	279570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043533
5593	NC_007005	CGA	2	6	279582	279587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043533
5594	NC_007005	GCT	2	6	279621	279626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043533
5595	NC_007005	TTCA	2	8	279631	279638	25 %	50 %	0 %	25 %	66043533
5596	NC_007005	GCC	2	6	279700	279705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043533
5597	NC_007005	CAACCT	2	12	279708	279719	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	66043533
5598	NC_007005	CTG	2	6	279757	279762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043533
5599	NC_007005	GCCC	2	8	279792	279799	0 %	0 %	25 %	75 %	66043533
5600	NC_007005	GC	3	6	279847	279852	0 %	0 %	50 %	50 %	66043533
5601	NC_007005	GAG	2	6	279892	279897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	66043533
5602	NC_007005	CG	3	6	279901	279906	0 %	0 %	50 %	50 %	66043533
5603	NC_007005	GCT	2	6	279909	279914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043533
5604	NC_007005	CAT	2	6	279972	279977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043533
5605	NC_007005	GTCA	2	8	280000	280007	25 %	25 %	25 %	25 %	66043533
5606	NC_007005	CAA	2	6	280032	280037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	66043533
5607	NC_007005	CA	3	6	280085	280090	50 %	0 %	0 %	50 %	66043533
5608	NC_007005	GCC	2	6	280129	280134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043533
5609	NC_007005	TGC	2	6	280281	280286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043534
5610	NC_007005	TGA	2	6	280404	280409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043534
5611	NC_007005	GCT	2	6	280465	280470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043534
5612	NC_007005	GGA	2	6	280471	280476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	66043534
5613	NC_007005	GCA	2	6	280561	280566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043534
5614	NC_007005	GATG	2	8	280642	280649	25 %	25 %	50 %	0 %	66043534
5615	NC_007005	CGCC	2	8	280783	280790	0 %	0 %	25 %	75 %	66043534
5616	NC_007005	GCC	2	6	280823	280828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043534
5617	NC_007005	CTG	2	6	280892	280897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043534
5618	NC_007005	CAT	2	6	280912	280917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043534
5619	NC_007005	CAG	2	6	280973	280978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043534
5620	NC_007005	CTG	2	6	281015	281020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043534
5621	NC_007005	GATC	2	8	281023	281030	25 %	25 %	25 %	25 %	66043534
5622	NC_007005	TGC	2	6	281157	281162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043534
5623	NC_007005	GC	4	8	281179	281186	0 %	0 %	50 %	50 %	66043534
5624	NC_007005	CTG	2	6	281225	281230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043534
5625	NC_007005	TGC	2	6	281289	281294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043534
5626	NC_007005	ACG	2	6	281295	281300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043534
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5628	NC_007005	GC	3	6	281347	281352	0 %	0 %	50 %	50 %	66043534
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5633	NC_007005	TGC	2	6	281574	281579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043534
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5635	NC_007005	CTG	2	6	281705	281710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043534
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5643	NC_007005	GGGCA	2	10	281954	281963	20 %	0 %	60 %	20 %	66043534
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5654	NC_007005	CAT	2	6	282855	282860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043535
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5656	NC_007005	CGCTC	2	10	282998	283007	0 %	20 %	20 %	60 %	66043536
5657	NC_007005	GACG	2	8	283009	283016	25 %	0 %	50 %	25 %	66043536
5658	NC_007005	CGG	2	6	283088	283093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043536
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5666	NC_007005	GGTCCA	2	12	283283	283294	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	66043536
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5993	NC_007005	TAAA	2	8	299804	299811	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5994	NC_007005	GC	3	6	299844	299849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5995	NC_007005	GGT	2	6	299880	299885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5996	NC_007005	T	6	6	299905	299910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5997	NC_007005	GGCA	2	8	299973	299980	25 %	0 %	50 %	25 %	66043551
5998	NC_007005	CCA	2	6	300002	300007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043551
5999	NC_007005	CAT	2	6	300039	300044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043551
6000	NC_007005	CTG	2	6	300073	300078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043551

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