MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a chromosome

Total Repeats: 121117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_007005	GCCA	2	8	221993	222000	25 %	0 %	25 %	50 %	66043477
4502	NC_007005	TGC	2	6	222067	222072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043477
4503	NC_007005	GCC	2	6	222104	222109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043477
4504	NC_007005	GCT	2	6	222140	222145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043477
4505	NC_007005	TGC	2	6	222192	222197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043477
4506	NC_007005	GCC	2	6	222216	222221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043477
4507	NC_007005	GAA	2	6	222257	222262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043477
4508	NC_007005	CTTG	2	8	222421	222428	0 %	50 %	25 %	25 %	66043477
4509	NC_007005	CGG	2	6	222430	222435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043477
4510	NC_007005	TGGC	2	8	222486	222493	0 %	25 %	50 %	25 %	66043477
4511	NC_007005	GCC	2	6	222497	222502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043477
4512	NC_007005	AGC	2	6	222516	222521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043477
4513	NC_007005	TTCC	2	8	222551	222558	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4514	NC_007005	TCA	2	6	222703	222708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043478
4515	NC_007005	CCGC	2	8	222780	222787	0 %	0 %	25 %	75 %	66043478
4516	NC_007005	TGA	2	6	222961	222966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043478
4517	NC_007005	CG	3	6	223007	223012	0 %	0 %	50 %	50 %	66043479
4518	NC_007005	GC	3	6	223044	223049	0 %	0 %	50 %	50 %	66043479
4519	NC_007005	ACC	2	6	223095	223100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043479
4520	NC_007005	T	6	6	223144	223149	0 %	100 %	0 %	0 %	66043479
4521	NC_007005	CCG	2	6	223162	223167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043479
4522	NC_007005	GCT	2	6	223175	223180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043479
4523	NC_007005	CAG	2	6	223184	223189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043479
4524	NC_007005	GCA	2	6	223391	223396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043479
4525	NC_007005	CAG	2	6	223478	223483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043479
4526	NC_007005	GCG	2	6	223484	223489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043479
4527	NC_007005	CAG	2	6	223637	223642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043479
4528	NC_007005	GAC	2	6	223721	223726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043479
4529	NC_007005	GCG	2	6	223810	223815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043479
4530	NC_007005	CGG	2	6	223821	223826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043479
4531	NC_007005	GGCA	2	8	223834	223841	25 %	0 %	50 %	25 %	66043479
4532	NC_007005	GT	3	6	223863	223868	0 %	50 %	50 %	0 %	66043479
4533	NC_007005	GC	3	6	224001	224006	0 %	0 %	50 %	50 %	66043479
4534	NC_007005	TGC	2	6	224007	224012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043479
4535	NC_007005	GCT	2	6	224065	224070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043479
4536	NC_007005	CGT	2	6	224071	224076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043479
4537	NC_007005	GTT	2	6	224111	224116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043479
4538	NC_007005	TTC	2	6	224123	224128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043479
4539	NC_007005	CATG	2	8	224167	224174	25 %	25 %	25 %	25 %	66043479
4540	NC_007005	CGA	2	6	224308	224313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043479
4541	NC_007005	TCT	2	6	224371	224376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043479
4542	NC_007005	GCC	2	6	224401	224406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043479
4543	NC_007005	TTG	2	6	224466	224471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043479
4544	NC_007005	GC	3	6	224496	224501	0 %	0 %	50 %	50 %	66043479
4545	NC_007005	TGT	2	6	224680	224685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043479
4546	NC_007005	CG	3	6	224725	224730	0 %	0 %	50 %	50 %	66043479
4547	NC_007005	CCATGG	2	12	224731	224742	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	66043479
4548	NC_007005	GCA	2	6	224896	224901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043479
4549	NC_007005	CGG	2	6	225036	225041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043479
4550	NC_007005	TAC	2	6	225147	225152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_007005	GCC	2	6	225332	225337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043480
4552	NC_007005	AG	3	6	225365	225370	50 %	0 %	50 %	0 %	66043480
4553	NC_007005	TCA	2	6	225515	225520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_007005	CCA	2	6	225530	225535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4555	NC_007005	TGAG	2	8	225633	225640	25 %	25 %	50 %	0 %	66043481
4556	NC_007005	GC	3	6	225676	225681	0 %	0 %	50 %	50 %	66043481
4557	NC_007005	GTC	2	6	225689	225694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043481
4558	NC_007005	ACG	2	6	225702	225707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043481
4559	NC_007005	GAT	2	6	225764	225769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043481
4560	NC_007005	CTG	2	6	225815	225820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043481
4561	NC_007005	CGG	2	6	225824	225829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043481
4562	NC_007005	GC	3	6	225875	225880	0 %	0 %	50 %	50 %	66043481
4563	NC_007005	CTG	2	6	225929	225934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043481
4564	NC_007005	CGA	2	6	226030	226035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043481
4565	NC_007005	GC	3	6	226074	226079	0 %	0 %	50 %	50 %	66043481
4566	NC_007005	GTG	2	6	226080	226085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043481
4567	NC_007005	GC	3	6	226114	226119	0 %	0 %	50 %	50 %	66043481
4568	NC_007005	CGGA	2	8	226180	226187	25 %	0 %	50 %	25 %	66043481
4569	NC_007005	ATG	2	6	226194	226199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043481
4570	NC_007005	TGC	2	6	226307	226312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043482
4571	NC_007005	TTCGC	2	10	226342	226351	0 %	40 %	20 %	40 %	66043482
4572	NC_007005	CCTG	2	8	226387	226394	0 %	25 %	25 %	50 %	66043482
4573	NC_007005	GCC	2	6	226395	226400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043482
4574	NC_007005	TTC	2	6	226452	226457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043482
4575	NC_007005	CAG	2	6	226479	226484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043482
4576	NC_007005	CTT	2	6	226604	226609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043482
4577	NC_007005	CGA	2	6	226610	226615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043482
4578	NC_007005	GGA	2	6	226617	226622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	66043482
4579	NC_007005	TCG	2	6	226630	226635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043482
4580	NC_007005	AGC	2	6	226636	226641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043482
4581	NC_007005	CGCGCC	2	12	226661	226672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043482
4582	NC_007005	CAT	2	6	226694	226699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043482
4583	NC_007005	GCA	2	6	226795	226800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043482
4584	NC_007005	GCG	2	6	226834	226839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043482
4585	NC_007005	CGG	2	6	226883	226888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043482
4586	NC_007005	CG	3	6	226925	226930	0 %	0 %	50 %	50 %	66043482
4587	NC_007005	GGT	2	6	227015	227020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043482
4588	NC_007005	GGTTC	2	10	227135	227144	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4589	NC_007005	GC	3	6	227149	227154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4590	NC_007005	CGT	2	6	227173	227178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_007005	GGCT	2	8	227186	227193	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4592	NC_007005	GCG	2	6	227220	227225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_007005	GTT	2	6	227265	227270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_007005	CAG	2	6	227382	227387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_007005	CGC	2	6	227435	227440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043483
4596	NC_007005	GGCCAG	2	12	227574	227585	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	66043483
4597	NC_007005	TGC	2	6	227611	227616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043483
4598	NC_007005	AGCC	2	8	227648	227655	25 %	0 %	25 %	50 %	66043483
4599	NC_007005	GGT	2	6	227667	227672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043483
4600	NC_007005	GC	3	6	227711	227716	0 %	0 %	50 %	50 %	66043483
4601	NC_007005	TGG	2	6	227818	227823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043483
4602	NC_007005	AAG	2	6	227850	227855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043483
4603	NC_007005	GGC	2	6	227859	227864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043483
4604	NC_007005	GGC	2	6	227871	227876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043483
4605	NC_007005	GAT	2	6	227891	227896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043483
4606	NC_007005	TCGG	2	8	227907	227914	0 %	25 %	50 %	25 %	66043483
4607	NC_007005	GACC	2	8	227972	227979	25 %	0 %	25 %	50 %	66043483
4608	NC_007005	CCG	2	6	228028	228033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043483
4609	NC_007005	GC	3	6	228037	228042	0 %	0 %	50 %	50 %	66043483
4610	NC_007005	GC	3	6	228116	228121	0 %	0 %	50 %	50 %	66043483
4611	NC_007005	CCG	2	6	228189	228194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043484
4612	NC_007005	CTG	2	6	228267	228272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043484
4613	NC_007005	GAA	2	6	228296	228301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043484
4614	NC_007005	GCAAG	2	10	228326	228335	40 %	0 %	40 %	20 %	66043484
4615	NC_007005	TGC	2	6	228385	228390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043484
4616	NC_007005	TGG	2	6	228391	228396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043484
4617	NC_007005	ATC	2	6	228402	228407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	66043484
4618	NC_007005	TGG	2	6	228427	228432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043484
4619	NC_007005	TGCCT	2	10	228582	228591	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4620	NC_007005	TGC	2	6	228640	228645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043485
4621	NC_007005	GCG	2	6	228687	228692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043485
4622	NC_007005	CCA	2	6	228765	228770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043485
4623	NC_007005	CGA	2	6	228830	228835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043485
4624	NC_007005	TCCA	2	8	228841	228848	25 %	25 %	0 %	50 %	66043485
4625	NC_007005	CTG	2	6	228879	228884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043485
4626	NC_007005	CTG	2	6	228915	228920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043485
4627	NC_007005	GCG	2	6	228963	228968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043485
4628	NC_007005	CAC	2	6	229175	229180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043485
4629	NC_007005	CAGC	2	8	229308	229315	25 %	0 %	25 %	50 %	66043485
4630	NC_007005	TGA	2	6	229364	229369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043485
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4632	NC_007005	T	6	6	229452	229457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_007005	ATCG	2	8	229495	229502	25 %	25 %	25 %	25 %	66043486
4634	NC_007005	CTT	2	6	229557	229562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	66043486
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4641	NC_007005	CGA	2	6	229827	229832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043486
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4662	NC_007005	GCC	3	9	230865	230873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4663	NC_007005	GCGCC	2	10	230940	230949	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4664	NC_007005	ATC	2	6	231010	231015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4736	NC_007005	AGCCG	2	10	235018	235027	20 %	0 %	40 %	40 %	66043490
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4740	NC_007005	GCA	3	9	235413	235421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043491
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4745	NC_007005	GGTCAG	2	12	235756	235767	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	66043491
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4874	NC_007005	GTC	2	6	242215	242220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043498
4875	NC_007005	GGC	2	6	242222	242227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043498
4876	NC_007005	GC	3	6	242226	242231	0 %	0 %	50 %	50 %	66043498
4877	NC_007005	TCGG	2	8	242280	242287	0 %	25 %	50 %	25 %	66043498
4878	NC_007005	GCT	2	6	242297	242302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043498
4879	NC_007005	CTGG	2	8	242318	242325	0 %	25 %	50 %	25 %	66043498
4880	NC_007005	ATCA	2	8	242385	242392	50 %	25 %	0 %	25 %	66043498
4881	NC_007005	TGG	2	6	242422	242427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043498
4882	NC_007005	GCA	2	6	242437	242442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043498
4883	NC_007005	GCT	3	9	242471	242479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043498
4884	NC_007005	GCT	2	6	242528	242533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043498
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4887	NC_007005	GTG	3	9	242754	242762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	66043498
4888	NC_007005	GCT	2	6	242774	242779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043498
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4891	NC_007005	TGC	2	6	242848	242853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043498
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4895	NC_007005	TGA	2	6	243100	243105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043498
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4925	NC_007005	CGT	2	6	244492	244497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043499
4926	NC_007005	GCT	2	6	244523	244528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043499
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4932	NC_007005	TCAG	2	8	244835	244842	25 %	25 %	25 %	25 %	66043500
4933	NC_007005	CGA	2	6	244873	244878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043500
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4942	NC_007005	CAG	2	6	245456	245461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043500
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4944	NC_007005	GTT	2	6	245501	245506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	66043500
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4947	NC_007005	GC	4	8	245875	245882	0 %	0 %	50 %	50 %	66043500
4948	NC_007005	GA	3	6	245989	245994	50 %	0 %	50 %	0 %	66043500
4949	NC_007005	GGCCA	2	10	246089	246098	20 %	0 %	40 %	40 %	66043500
4950	NC_007005	TGC	2	6	246123	246128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043500
4951	NC_007005	CG	3	6	246164	246169	0 %	0 %	50 %	50 %	66043500
4952	NC_007005	CGAGC	2	10	246218	246227	20 %	0 %	40 %	40 %	66043500
4953	NC_007005	ATC	2	6	246333	246338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4954	NC_007005	TCA	2	6	246391	246396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4955	NC_007005	TGAA	2	8	246478	246485	50 %	25 %	25 %	0 %	66043501
4956	NC_007005	GGCA	2	8	246536	246543	25 %	0 %	50 %	25 %	66043501
4957	NC_007005	CGC	2	6	246582	246587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043501
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4959	NC_007005	CAG	2	6	246728	246733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043502
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4962	NC_007005	CAG	2	6	246830	246835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	66043502
4963	NC_007005	TGC	2	6	246903	246908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043502
4964	NC_007005	GCCT	2	8	246913	246920	0 %	25 %	25 %	50 %	66043502
4965	NC_007005	GCCGAT	2	12	246941	246952	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	66043502
4966	NC_007005	CGG	2	6	246982	246987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	66043502
4967	NC_007005	GGCA	2	8	247063	247070	25 %	0 %	50 %	25 %	66043502
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4973	NC_007005	CCG	2	6	247390	247395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043502
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4982	NC_007005	GCC	2	6	247757	247762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043502
4983	NC_007005	C	6	6	247777	247782	0 %	0 %	0 %	100 %	66043502
4984	NC_007005	GC	3	6	247793	247798	0 %	0 %	50 %	50 %	66043502
4985	NC_007005	GCAAC	2	10	247804	247813	40 %	0 %	20 %	40 %	66043502
4986	NC_007005	CCG	2	6	247866	247871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043502
4987	NC_007005	CA	3	6	247878	247883	50 %	0 %	0 %	50 %	66043502
4988	NC_007005	TCACC	2	10	247891	247900	20 %	20 %	0 %	60 %	66043502
4989	NC_007005	GAT	2	6	247912	247917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	66043502
4990	NC_007005	CTG	2	6	247932	247937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043502
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4993	NC_007005	TGG	2	6	248013	248018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4994	NC_007005	GGA	2	6	248033	248038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4995	NC_007005	TTCG	2	8	248152	248159	0 %	50 %	25 %	25 %	66043503
4996	NC_007005	TG	3	6	248162	248167	0 %	50 %	50 %	0 %	66043503
4997	NC_007005	CTG	2	6	248182	248187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	66043503
4998	NC_007005	ACC	2	6	248198	248203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	66043503
4999	NC_007005	GAA	2	6	248210	248215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	66043503
5000	NC_007005	GCC	2	6	248240	248245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	66043503

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