MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Photobacterium profundum SS9 chromosome 1

Total Repeats: 82373

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006370	TAC	2	6	147	152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54307238
2	NC_006370	T	6	6	160	165	0 %	100 %	0 %	0 %	54307238
3	NC_006370	TGT	2	6	209	214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54307238
4	NC_006370	GA	3	6	256	261	50 %	0 %	50 %	0 %	54307238
5	NC_006370	CTA	2	6	311	316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54307238
6	NC_006370	TAA	2	6	381	386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54307238
7	NC_006370	TGAT	2	8	479	486	25 %	50 %	25 %	0 %	54307238
8	NC_006370	TGC	2	6	561	566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54307238
9	NC_006370	GA	3	6	671	676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006370	ATT	2	6	745	750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54307239
11	NC_006370	AGAA	2	8	760	767	75 %	0 %	25 %	0 %	54307239
12	NC_006370	TCCT	2	8	775	782	0 %	50 %	0 %	50 %	54307239
13	NC_006370	AGA	2	6	783	788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54307239
14	NC_006370	TCA	2	6	789	794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54307239
15	NC_006370	TTC	2	6	845	850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54307239
16	NC_006370	GCCA	2	8	863	870	25 %	0 %	25 %	50 %	54307239
17	NC_006370	GAC	2	6	937	942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54307239
18	NC_006370	GTT	2	6	1058	1063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54307239
19	NC_006370	GTTG	2	8	1184	1191	0 %	50 %	50 %	0 %	54307239
20	NC_006370	TTG	2	6	1226	1231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54307239
21	NC_006370	TTC	2	6	1235	1240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54307239
22	NC_006370	GAT	2	6	1304	1309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54307239
23	NC_006370	GATGTG	2	12	1328	1339	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	54307239
24	NC_006370	AAT	2	6	1472	1477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54307239
25	NC_006370	ACG	2	6	1496	1501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54307239
26	NC_006370	ATG	2	6	1521	1526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54307239
27	NC_006370	AAG	2	6	1560	1565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54307239
28	NC_006370	TCT	3	9	1572	1580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54307239
29	NC_006370	AGC	2	6	1592	1597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54307239
30	NC_006370	CCA	2	6	1630	1635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54307239
31	NC_006370	GGGC	2	8	1788	1795	0 %	0 %	75 %	25 %	54307239
32	NC_006370	ACG	2	6	1823	1828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54307239
33	NC_006370	ATC	2	6	1830	1835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54307239
34	NC_006370	GCC	2	6	1853	1858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54307239
35	NC_006370	A	6	6	1910	1915	100 %	0 %	0 %	0 %	54307239
36	NC_006370	CAGCAA	2	12	1999	2010	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	54307239
37	NC_006370	ATG	2	6	2046	2051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54307239
38	NC_006370	AGG	2	6	2069	2074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54307239
39	NC_006370	GCTTA	2	10	2121	2130	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_006370	A	6	6	2130	2135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006370	CTTA	2	8	2181	2188	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_006370	A	7	7	2206	2212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006370	GCC	2	6	2225	2230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_006370	GT	3	6	2261	2266	0 %	50 %	50 %	0 %	54307240
45	NC_006370	CTTT	2	8	2271	2278	0 %	75 %	0 %	25 %	54307240
46	NC_006370	GAA	3	9	2368	2376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54307240
47	NC_006370	TCT	2	6	2406	2411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54307240
48	NC_006370	AC	3	6	2466	2471	50 %	0 %	0 %	50 %	54307240
49	NC_006370	GTA	2	6	2491	2496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54307240
50	NC_006370	GAA	2	6	2530	2535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54307240
51	NC_006370	GTGA	2	8	2538	2545	25 %	25 %	50 %	0 %	54307240
52	NC_006370	CAATG	2	10	2578	2587	40 %	20 %	20 %	20 %	54307240
53	NC_006370	T	6	6	2644	2649	0 %	100 %	0 %	0 %	54307240
54	NC_006370	CAT	2	6	2659	2664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54307240
55	NC_006370	CAC	2	6	2784	2789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54307240
56	NC_006370	CAT	2	6	2806	2811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54307240
57	NC_006370	TGAA	2	8	2843	2850	50 %	25 %	25 %	0 %	54307240
58	NC_006370	AGT	2	6	2855	2860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54307240
59	NC_006370	AACC	2	8	2888	2895	50 %	0 %	0 %	50 %	54307240
60	NC_006370	TTAGGT	2	12	2907	2918	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	54307240
61	NC_006370	TTG	2	6	3003	3008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54307240
62	NC_006370	ACGC	2	8	3019	3026	25 %	0 %	25 %	50 %	54307240
63	NC_006370	TA	3	6	3057	3062	50 %	50 %	0 %	0 %	54307240
64	NC_006370	CTT	2	6	3072	3077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54307240
65	NC_006370	AGT	2	6	3105	3110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54307240
66	NC_006370	TGC	2	6	3121	3126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54307240
67	NC_006370	CTT	2	6	3184	3189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54307240
68	NC_006370	GTTG	2	8	3193	3200	0 %	50 %	50 %	0 %	54307240
69	NC_006370	CCA	2	6	3218	3223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54307240
70	NC_006370	ACC	2	6	3247	3252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54307240
71	NC_006370	TGC	2	6	3298	3303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54307240
72	NC_006370	CAGC	2	8	3435	3442	25 %	0 %	25 %	50 %	54307240
73	NC_006370	AAG	2	6	3553	3558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54307240
74	NC_006370	ATGA	2	8	3560	3567	50 %	25 %	25 %	0 %	54307240
75	NC_006370	CTG	2	6	3570	3575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54307240
76	NC_006370	TAA	2	6	3598	3603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54307240
77	NC_006370	CAC	2	6	3621	3626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54307240
78	NC_006370	TGT	2	6	3685	3690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54307240
79	NC_006370	CAC	2	6	3738	3743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54307240
80	NC_006370	TTG	2	6	3754	3759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54307240
81	NC_006370	TGT	2	6	3789	3794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54307240
82	NC_006370	TTGG	2	8	3895	3902	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006370	ACC	2	6	3918	3923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_006370	GTT	2	6	3924	3929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006370	CGC	2	6	3957	3962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_006370	CAA	2	6	3967	3972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_006370	TTA	2	6	4061	4066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006370	CAA	2	6	4139	4144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54307241
89	NC_006370	ACG	2	6	4194	4199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54307241
90	NC_006370	T	6	6	4292	4297	0 %	100 %	0 %	0 %	54307241
91	NC_006370	CAAGAC	2	12	4306	4317	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	54307241
92	NC_006370	GAT	2	6	4321	4326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54307241
93	NC_006370	GAG	2	6	4360	4365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54307241
94	NC_006370	T	6	6	4394	4399	0 %	100 %	0 %	0 %	54307241
95	NC_006370	GA	3	6	4432	4437	50 %	0 %	50 %	0 %	54307241
96	NC_006370	AAT	2	6	4454	4459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006370	ATT	2	6	4465	4470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006370	ACG	2	6	4495	4500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_006370	ATTG	2	8	4504	4511	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006370	TGCGCT	2	12	4557	4568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_006370	ACTG	2	8	4699	4706	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_006370	AAT	2	6	4717	4722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006370	T	6	6	4813	4818	0 %	100 %	0 %	0 %	54307242
104	NC_006370	TGGTG	2	10	4833	4842	0 %	40 %	60 %	0 %	54307242
105	NC_006370	TGA	2	6	4954	4959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54307242
106	NC_006370	T	6	6	4971	4976	0 %	100 %	0 %	0 %	54307242
107	NC_006370	TCA	2	6	5029	5034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54307242
108	NC_006370	AAT	2	6	5041	5046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54307242
109	NC_006370	TGC	2	6	5086	5091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54307242
110	NC_006370	ACC	2	6	5094	5099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54307242
111	NC_006370	TGC	2	6	5106	5111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54307242
112	NC_006370	ATC	2	6	5145	5150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54307242
113	NC_006370	TTG	2	6	5157	5162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54307242
114	NC_006370	T	6	6	5184	5189	0 %	100 %	0 %	0 %	54307242
115	NC_006370	CGT	2	6	5284	5289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54307242
116	NC_006370	CGTCA	2	10	5331	5340	20 %	20 %	20 %	40 %	54307242
117	NC_006370	A	6	6	5374	5379	100 %	0 %	0 %	0 %	54307242
118	NC_006370	CAC	3	9	5427	5435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54307242
119	NC_006370	T	7	7	5505	5511	0 %	100 %	0 %	0 %	54307242
120	NC_006370	ATCA	2	8	5514	5521	50 %	25 %	0 %	25 %	54307242
121	NC_006370	AATA	2	8	5593	5600	75 %	25 %	0 %	0 %	54307243
122	NC_006370	A	6	6	5624	5629	100 %	0 %	0 %	0 %	54307243
123	NC_006370	GCG	2	6	5777	5782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54307243
124	NC_006370	AAT	2	6	5846	5851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54307243
125	NC_006370	AATA	2	8	5933	5940	75 %	25 %	0 %	0 %	54307243
126	NC_006370	TAA	2	6	5964	5969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54307243
127	NC_006370	CAAG	2	8	5986	5993	50 %	0 %	25 %	25 %	54307243
128	NC_006370	GAAA	2	8	6004	6011	75 %	0 %	25 %	0 %	54307243
129	NC_006370	TCA	2	6	6142	6147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54307243
130	NC_006370	AATCGA	2	12	6172	6183	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	54307243
131	NC_006370	ATG	2	6	6189	6194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54307243
132	NC_006370	TTA	2	6	6254	6259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006370	T	6	6	6411	6416	0 %	100 %	0 %	0 %	54307244
134	NC_006370	T	6	6	6482	6487	0 %	100 %	0 %	0 %	54307244
135	NC_006370	TCAAT	2	10	6490	6499	40 %	40 %	0 %	20 %	54307244
136	NC_006370	GAA	2	6	6501	6506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54307244
137	NC_006370	TACG	2	8	6697	6704	25 %	25 %	25 %	25 %	54307244
138	NC_006370	GCC	2	6	6978	6983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54307244
139	NC_006370	TGT	2	6	7028	7033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54307244
140	NC_006370	AT	3	6	7064	7069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006370	CAT	2	6	7076	7081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_006370	T	7	7	7117	7123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006370	CAG	2	6	7307	7312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_006370	AAG	2	6	7404	7409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54307245
145	NC_006370	ATA	2	6	7467	7472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54307245
146	NC_006370	TAA	2	6	7531	7536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54307245
147	NC_006370	TGAA	2	8	7551	7558	50 %	25 %	25 %	0 %	54307245
148	NC_006370	GTT	2	6	7610	7615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54307245
149	NC_006370	TCT	2	6	7622	7627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54307245
150	NC_006370	GAT	2	6	7700	7705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54307245
151	NC_006370	TAA	2	6	7798	7803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54307245
152	NC_006370	TTG	2	6	7806	7811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54307245
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166	NC_006370	TGCTT	2	10	8149	8158	0 %	60 %	20 %	20 %	54307245
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173	NC_006370	AGA	2	6	8523	8528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54307245
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186	NC_006370	TGT	2	6	9262	9267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54307246
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267	NC_006370	TGA	2	6	12954	12959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54307248
268	NC_006370	GTAC	2	8	12991	12998	25 %	25 %	25 %	25 %	54307248
269	NC_006370	AGA	2	6	13098	13103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54307248
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392	NC_006370	T	7	7	18863	18869	0 %	100 %	0 %	0 %	54307254
393	NC_006370	TTC	2	6	18882	18887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
394	NC_006370	TTTGAA	2	12	18905	18916	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	54307255
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397	NC_006370	TTTGG	2	10	19101	19110	0 %	60 %	40 %	0 %	54307255
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400	NC_006370	A	6	6	19171	19176	100 %	0 %	0 %	0 %	54307255
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