MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Picrophilus torridus DSM 9790 chromosome

Total Repeats: 36928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005877	TTA	2	6	33	38	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	48477073
2	NC_005877	ATACT	2	10	73	82	40 %	40 %	0 %	20 %	48477073
3	NC_005877	TTA	2	6	99	104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	48477073
4	NC_005877	AT	3	6	111	116	50 %	50 %	0 %	0 %	48477073
5	NC_005877	TAGA	2	8	134	141	50 %	25 %	25 %	0 %	48477073
6	NC_005877	TTA	2	6	165	170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	48477073
7	NC_005877	CGTG	2	8	193	200	0 %	25 %	50 %	25 %	48477073
8	NC_005877	TTA	2	6	231	236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	48477073
9	NC_005877	ACA	2	6	243	248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	48477073
10	NC_005877	TTA	2	6	298	303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	48477073
11	NC_005877	TAA	2	6	317	322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	48477073
12	NC_005877	ATA	2	6	328	333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	48477073
13	NC_005877	T	6	6	355	360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005877	CAA	2	6	367	372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_005877	A	6	6	438	443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005877	A	8	8	464	471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005877	ATTTT	2	10	480	489	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005877	TTA	2	6	490	495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005877	AT	3	6	501	506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005877	TAA	2	6	507	512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005877	TATAT	2	10	525	534	40 %	60 %	0 %	0 %	48477074
22	NC_005877	TAT	2	6	563	568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	48477074
23	NC_005877	TCC	2	6	582	587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	48477074
24	NC_005877	AT	3	6	596	601	50 %	50 %	0 %	0 %	48477074
25	NC_005877	T	6	6	633	638	0 %	100 %	0 %	0 %	48477074
26	NC_005877	AT	3	6	652	657	50 %	50 %	0 %	0 %	48477074
27	NC_005877	AT	3	6	764	769	50 %	50 %	0 %	0 %	48477074
28	NC_005877	ATC	2	6	791	796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	48477075
29	NC_005877	T	6	6	821	826	0 %	100 %	0 %	0 %	48477075
30	NC_005877	AT	3	6	835	840	50 %	50 %	0 %	0 %	48477075
31	NC_005877	ATG	3	9	899	907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	48477075
32	NC_005877	ATC	2	6	930	935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	48477075
33	NC_005877	T	7	7	951	957	0 %	100 %	0 %	0 %	48477075
34	NC_005877	TCT	2	6	988	993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	48477075
35	NC_005877	TAA	2	6	1010	1015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	48477075
36	NC_005877	TTTAA	2	10	1018	1027	40 %	60 %	0 %	0 %	48477075
37	NC_005877	TCT	2	6	1098	1103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	48477075
38	NC_005877	ATA	2	6	1178	1183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	48477075
39	NC_005877	GGT	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	48477075
40	NC_005877	CTT	2	6	1237	1242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	48477075
41	NC_005877	ATT	2	6	1257	1262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	48477075
42	NC_005877	CTA	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	48477075
43	NC_005877	A	6	6	1288	1293	100 %	0 %	0 %	0 %	48477075
44	NC_005877	TCA	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	48477075
45	NC_005877	TATTTT	2	12	1365	1376	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	48477075
46	NC_005877	GCT	2	6	1417	1422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	48477075
47	NC_005877	ATA	2	6	1489	1494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	48477075
48	NC_005877	ATG	2	6	1529	1534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	48477075
49	NC_005877	A	6	6	1560	1565	100 %	0 %	0 %	0 %	48477075
50	NC_005877	ATA	2	6	1586	1591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	48477075
51	NC_005877	ATT	3	9	1630	1638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	48477075
52	NC_005877	TAT	2	6	1659	1664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	48477075
53	NC_005877	AGA	2	6	1722	1727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	48477075
54	NC_005877	TAT	2	6	1728	1733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	48477075
55	NC_005877	ATA	2	6	1734	1739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	48477075
56	NC_005877	AAT	2	6	1795	1800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	48477076
57	NC_005877	CGG	2	6	1814	1819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	48477076
58	NC_005877	TA	3	6	1861	1866	50 %	50 %	0 %	0 %	48477076
59	NC_005877	CAA	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	48477076
60	NC_005877	A	6	6	1920	1925	100 %	0 %	0 %	0 %	48477076
61	NC_005877	ATCC	2	8	2069	2076	25 %	25 %	0 %	50 %	48477076
62	NC_005877	ATA	2	6	2144	2149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	48477076
63	NC_005877	CATA	2	8	2198	2205	50 %	25 %	0 %	25 %	48477076
64	NC_005877	ATA	2	6	2289	2294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	48477077
65	NC_005877	AT	3	6	2321	2326	50 %	50 %	0 %	0 %	48477077
66	NC_005877	TA	3	6	2327	2332	50 %	50 %	0 %	0 %	48477077
67	NC_005877	ATT	2	6	2354	2359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	48477077
68	NC_005877	TGT	2	6	2376	2381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	48477077
69	NC_005877	CAGC	2	8	2395	2402	25 %	0 %	25 %	50 %	48477077
70	NC_005877	A	6	6	2447	2452	100 %	0 %	0 %	0 %	48477077
71	NC_005877	CTA	2	6	2460	2465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	48477077
72	NC_005877	T	6	6	2494	2499	0 %	100 %	0 %	0 %	48477077
73	NC_005877	CCT	2	6	2539	2544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	48477077
74	NC_005877	GCCA	2	8	2553	2560	25 %	0 %	25 %	50 %	48477077
75	NC_005877	T	7	7	2620	2626	0 %	100 %	0 %	0 %	48477077
76	NC_005877	TATT	2	8	2661	2668	25 %	75 %	0 %	0 %	48477077
77	NC_005877	CCA	2	6	2669	2674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	48477077
78	NC_005877	TTA	2	6	2703	2708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	48477077
79	NC_005877	T	7	7	2713	2719	0 %	100 %	0 %	0 %	48477077
80	NC_005877	TTA	2	6	2725	2730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	48477077
81	NC_005877	TCA	2	6	2772	2777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	48477077
82	NC_005877	TAA	2	6	2785	2790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	48477077
83	NC_005877	ATT	2	6	2885	2890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	48477077
84	NC_005877	AT	3	6	2962	2967	50 %	50 %	0 %	0 %	48477077
85	NC_005877	CTT	2	6	3000	3005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	48477077
86	NC_005877	AAC	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	48477077
87	NC_005877	TGA	2	6	3113	3118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	48477077
88	NC_005877	ATT	2	6	3123	3128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	48477077
89	NC_005877	ATC	2	6	3176	3181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	48477077
90	NC_005877	TAA	2	6	3200	3205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	48477077
91	NC_005877	ATT	2	6	3231	3236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	48477077
92	NC_005877	CATT	2	8	3262	3269	25 %	50 %	0 %	25 %	48477077
93	NC_005877	CAT	2	6	3376	3381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	48477077
94	NC_005877	ATTTT	2	10	3390	3399	20 %	80 %	0 %	0 %	48477077
95	NC_005877	T	6	6	3396	3401	0 %	100 %	0 %	0 %	48477077
96	NC_005877	AGA	2	6	3453	3458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	48477077
97	NC_005877	TA	3	6	3479	3484	50 %	50 %	0 %	0 %	48477077
98	NC_005877	AAT	2	6	3485	3490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	48477077
99	NC_005877	TAT	2	6	3517	3522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	48477077
100	NC_005877	TAT	3	9	3539	3547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	48477077
101	NC_005877	TAA	2	6	3569	3574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	48477077
102	NC_005877	TTG	2	6	3598	3603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	48477077
103	NC_005877	TATT	3	12	3606	3617	25 %	75 %	0 %	0 %	48477077
104	NC_005877	TAA	2	6	3677	3682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	48477077
105	NC_005877	ATC	2	6	3734	3739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	48477077
106	NC_005877	T	6	6	3749	3754	0 %	100 %	0 %	0 %	48477077
107	NC_005877	TTA	2	6	3772	3777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	48477077
108	NC_005877	T	7	7	3834	3840	0 %	100 %	0 %	0 %	48477077
109	NC_005877	TCC	2	6	3936	3941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	48477077
110	NC_005877	TCT	2	6	3947	3952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	48477077
111	NC_005877	T	6	6	3960	3965	0 %	100 %	0 %	0 %	48477077
112	NC_005877	TA	3	6	3971	3976	50 %	50 %	0 %	0 %	48477077
113	NC_005877	ATA	2	6	4059	4064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	48477078
114	NC_005877	TA	3	6	4063	4068	50 %	50 %	0 %	0 %	48477078
115	NC_005877	TTA	2	6	4093	4098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	48477078
116	NC_005877	TAAA	2	8	4115	4122	75 %	25 %	0 %	0 %	48477078
117	NC_005877	TGC	2	6	4209	4214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	48477078
118	NC_005877	GCA	2	6	4249	4254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	48477078
119	NC_005877	ATTT	2	8	4259	4266	25 %	75 %	0 %	0 %	48477078
120	NC_005877	CAT	2	6	4380	4385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	48477078
121	NC_005877	A	6	6	4403	4408	100 %	0 %	0 %	0 %	48477078
122	NC_005877	T	6	6	4414	4419	0 %	100 %	0 %	0 %	48477078
123	NC_005877	T	6	6	4462	4467	0 %	100 %	0 %	0 %	48477078
124	NC_005877	GCC	2	6	4581	4586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	48477078
125	NC_005877	ACC	2	6	4653	4658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_005877	CTG	2	6	4696	4701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	48477079
127	NC_005877	T	6	6	4707	4712	0 %	100 %	0 %	0 %	48477079
128	NC_005877	CCTT	2	8	4731	4738	0 %	50 %	0 %	50 %	48477079
129	NC_005877	TGC	2	6	4749	4754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	48477079
130	NC_005877	TAT	2	6	4777	4782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	48477079
131	NC_005877	ATC	2	6	4792	4797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	48477079
132	NC_005877	AT	4	8	4819	4826	50 %	50 %	0 %	0 %	48477079
133	NC_005877	CCT	2	6	4881	4886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	48477079
134	NC_005877	ATG	2	6	4899	4904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	48477079
135	NC_005877	TC	3	6	4912	4917	0 %	50 %	0 %	50 %	48477079
136	NC_005877	TAT	2	6	4939	4944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	48477079
137	NC_005877	ATT	2	6	4945	4950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	48477079
138	NC_005877	CCA	2	6	4982	4987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	48477079
139	NC_005877	GTT	2	6	5006	5011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	48477079
140	NC_005877	ATA	2	6	5025	5030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	48477079
141	NC_005877	TA	3	6	5086	5091	50 %	50 %	0 %	0 %	48477079
142	NC_005877	TCA	2	6	5153	5158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	48477079
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147	NC_005877	TCA	2	6	5361	5366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	48477079
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271	NC_005877	T	6	6	10870	10875	0 %	100 %	0 %	0 %	48477084
272	NC_005877	GGT	2	6	10878	10883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	48477084
273	NC_005877	ATCATA	2	12	11060	11071	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	48477084
274	NC_005877	TAA	2	6	11131	11136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	48477084
275	NC_005877	ATC	2	6	11138	11143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	48477084
276	NC_005877	AAT	2	6	11144	11149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	48477084
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278	NC_005877	TTG	2	6	11197	11202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	48477084
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283	NC_005877	TTA	2	6	11332	11337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	48477084
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