MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus str. MIT 9313 chromosome

Total Repeats: 48061

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48001	NC_005071	AGG	2	6	2407484	2407489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33864536
48002	NC_005071	TGAT	2	8	2407621	2407628	25 %	50 %	25 %	0 %	33864536
48003	NC_005071	AAT	2	6	2407733	2407738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33864536
48004	NC_005071	CTA	2	6	2407750	2407755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33864536
48005	NC_005071	AATGG	2	10	2407772	2407781	40 %	20 %	40 %	0 %	33864536
48006	NC_005071	GA	3	6	2407817	2407822	50 %	0 %	50 %	0 %	33864536
48007	NC_005071	AAT	2	6	2407839	2407844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33864536
48008	NC_005071	GTT	2	6	2407880	2407885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33864536
48009	NC_005071	GGC	2	6	2407945	2407950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864536
48010	NC_005071	ATG	2	6	2407971	2407976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33864536
48011	NC_005071	AGT	2	6	2408018	2408023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33864536
48012	NC_005071	AGA	2	6	2408087	2408092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33864536
48013	NC_005071	TGA	2	6	2408186	2408191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33864536
48014	NC_005071	TAC	2	6	2408235	2408240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33864536
48015	NC_005071	ATTA	2	8	2408243	2408250	50 %	50 %	0 %	0 %	33864536
48016	NC_005071	TGC	2	6	2408444	2408449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864536
48017	NC_005071	AAGCC	2	10	2408450	2408459	40 %	0 %	20 %	40 %	33864536
48018	NC_005071	TCAA	2	8	2408508	2408515	50 %	25 %	0 %	25 %	33864536
48019	NC_005071	GGT	2	6	2408517	2408522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864536
48020	NC_005071	GA	3	6	2408528	2408533	50 %	0 %	50 %	0 %	33864536
48021	NC_005071	TTG	2	6	2408539	2408544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33864536
48022	NC_005071	TGGC	2	8	2408573	2408580	0 %	25 %	50 %	25 %	33864536
48023	NC_005071	GCC	2	6	2408755	2408760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864536
48024	NC_005071	GTG	2	6	2408830	2408835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864536
48025	NC_005071	AGC	2	6	2408855	2408860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864536
48026	NC_005071	AATC	2	8	2408904	2408911	50 %	25 %	0 %	25 %	33864537
48027	NC_005071	A	7	7	2408912	2408918	100 %	0 %	0 %	0 %	33864537
48028	NC_005071	CT	3	6	2408941	2408946	0 %	50 %	0 %	50 %	33864537
48029	NC_005071	AGC	2	6	2408993	2408998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864537
48030	NC_005071	AAG	2	6	2409001	2409006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33864537
48031	NC_005071	AGTG	2	8	2409014	2409021	25 %	25 %	50 %	0 %	33864537
48032	NC_005071	CCG	2	6	2409029	2409034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864537
48033	NC_005071	CTC	2	6	2409144	2409149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33864537
48034	NC_005071	ACC	2	6	2409195	2409200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864537
48035	NC_005071	ATC	2	6	2409216	2409221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33864537
48036	NC_005071	ATC	2	6	2409237	2409242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33864537
48037	NC_005071	TCA	2	6	2409298	2409303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33864537
48038	NC_005071	CGAA	2	8	2409361	2409368	50 %	0 %	25 %	25 %	33864537
48039	NC_005071	CT	3	6	2409513	2409518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48040	NC_005071	CT	3	6	2409521	2409526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48041	NC_005071	CCTC	2	8	2409548	2409555	0 %	25 %	0 %	75 %	33864538
48042	NC_005071	TGGCC	2	10	2409588	2409597	0 %	20 %	40 %	40 %	33864538
48043	NC_005071	AAG	2	6	2409658	2409663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33864538
48044	NC_005071	ACG	2	6	2409736	2409741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864538
48045	NC_005071	AAG	2	6	2409802	2409807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33864538
48046	NC_005071	CTG	5	15	2409850	2409864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864538
48047	NC_005071	A	6	6	2410075	2410080	100 %	0 %	0 %	0 %	33864538
48048	NC_005071	TTG	2	6	2410096	2410101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33864538
48049	NC_005071	ACAA	2	8	2410189	2410196	75 %	0 %	0 %	25 %	33864538
48050	NC_005071	ATG	2	6	2410224	2410229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33864538
48051	NC_005071	CAAG	2	8	2410236	2410243	50 %	0 %	25 %	25 %	33864538
48052	NC_005071	CAA	2	6	2410265	2410270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33864538
48053	NC_005071	CAA	2	6	2410325	2410330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33864538
48054	NC_005071	A	6	6	2410390	2410395	100 %	0 %	0 %	0 %	33864538
48055	NC_005071	TGC	2	6	2410454	2410459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864538
48056	NC_005071	ATT	2	6	2410472	2410477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33864538
48057	NC_005071	AAC	2	6	2410566	2410571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33864538
48058	NC_005071	TCATG	2	10	2410619	2410628	20 %	40 %	20 %	20 %	33864538
48059	NC_005071	AGCA	2	8	2410640	2410647	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48060	NC_005071	ATT	3	9	2410703	2410711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48061	NC_005071	TC	3	6	2410796	2410801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.