MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus str. MIT 9313 chromosome

Total Repeats: 48061

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46001	NC_005071	CTCAC	2	10	2311835	2311844	20 %	20 %	0 %	60 %	33864450
46002	NC_005071	CAGG	2	8	2312032	2312039	25 %	0 %	50 %	25 %	33864450
46003	NC_005071	GCA	2	6	2312115	2312120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864450
46004	NC_005071	AG	3	6	2312142	2312147	50 %	0 %	50 %	0 %	33864450
46005	NC_005071	CCAA	2	8	2312199	2312206	50 %	0 %	0 %	50 %	33864450
46006	NC_005071	ATCA	2	8	2312215	2312222	50 %	25 %	0 %	25 %	33864450
46007	NC_005071	TGCA	2	8	2312235	2312242	25 %	25 %	25 %	25 %	33864450
46008	NC_005071	GCA	2	6	2312305	2312310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864451
46009	NC_005071	CT	3	6	2312325	2312330	0 %	50 %	0 %	50 %	33864451
46010	NC_005071	ACA	2	6	2312378	2312383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33864451
46011	NC_005071	ACG	2	6	2312404	2312409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864451
46012	NC_005071	CTA	2	6	2312453	2312458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33864451
46013	NC_005071	AGC	2	6	2312504	2312509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864451
46014	NC_005071	TGG	2	6	2312515	2312520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864451
46015	NC_005071	TCAA	2	8	2312524	2312531	50 %	25 %	0 %	25 %	33864451
46016	NC_005071	TGG	2	6	2312538	2312543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864451
46017	NC_005071	GCA	2	6	2312586	2312591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864451
46018	NC_005071	CTG	2	6	2312607	2312612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864451
46019	NC_005071	CTG	2	6	2312702	2312707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864451
46020	NC_005071	CCA	2	6	2312780	2312785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864451
46021	NC_005071	AGC	2	6	2312836	2312841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864451
46022	NC_005071	GCC	2	6	2312846	2312851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864451
46023	NC_005071	AGG	2	6	2312911	2312916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33864451
46024	NC_005071	TGC	2	6	2312964	2312969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864451
46025	NC_005071	CCG	2	6	2312985	2312990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864451
46026	NC_005071	CTG	2	6	2313034	2313039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864451
46027	NC_005071	AGGTGG	2	12	2313049	2313060	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	33864451
46028	NC_005071	CTCGA	2	10	2313111	2313120	20 %	20 %	20 %	40 %	33864451
46029	NC_005071	AAGC	2	8	2313144	2313151	50 %	0 %	25 %	25 %	33864451
46030	NC_005071	GAT	2	6	2313268	2313273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33864451
46031	NC_005071	AAGC	2	8	2313343	2313350	50 %	0 %	25 %	25 %	33864451
46032	NC_005071	TGCCG	2	10	2313382	2313391	0 %	20 %	40 %	40 %	33864451
46033	NC_005071	TGG	2	6	2313467	2313472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864451
46034	NC_005071	TC	3	6	2313639	2313644	0 %	50 %	0 %	50 %	33864451
46035	NC_005071	ATG	2	6	2313696	2313701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33864451
46036	NC_005071	CAA	2	6	2313788	2313793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33864451
46037	NC_005071	CGC	2	6	2313826	2313831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864451
46038	NC_005071	GGC	2	6	2313839	2313844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864451
46039	NC_005071	TGAA	2	8	2313855	2313862	50 %	25 %	25 %	0 %	33864451
46040	NC_005071	TTC	2	6	2313869	2313874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33864451
46041	NC_005071	CCAA	2	8	2313947	2313954	50 %	0 %	0 %	50 %	33864451
46042	NC_005071	CCA	2	6	2314016	2314021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46043	NC_005071	AAC	2	6	2314066	2314071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33864452
46044	NC_005071	CAA	2	6	2314088	2314093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33864452
46045	NC_005071	A	8	8	2314092	2314099	100 %	0 %	0 %	0 %	33864452
46046	NC_005071	CTG	2	6	2314160	2314165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864452
46047	NC_005071	A	6	6	2314177	2314182	100 %	0 %	0 %	0 %	33864452
46048	NC_005071	CACT	2	8	2314232	2314239	25 %	25 %	0 %	50 %	33864452
46049	NC_005071	ACCG	2	8	2314244	2314251	25 %	0 %	25 %	50 %	33864452
46050	NC_005071	GCA	2	6	2314315	2314320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864452
46051	NC_005071	CCAACC	2	12	2314439	2314450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864452
46052	NC_005071	CCG	2	6	2314466	2314471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864452
46053	NC_005071	ATG	2	6	2314477	2314482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33864452
46054	NC_005071	CACG	2	8	2314544	2314551	25 %	0 %	25 %	50 %	33864452
46055	NC_005071	ACC	2	6	2314653	2314658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864452
46056	NC_005071	ACAG	2	8	2314684	2314691	50 %	0 %	25 %	25 %	33864452
46057	NC_005071	TGC	2	6	2314700	2314705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864452
46058	NC_005071	GC	3	6	2314856	2314861	0 %	0 %	50 %	50 %	33864453
46059	NC_005071	ACC	2	6	2314871	2314876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864453
46060	NC_005071	GCA	2	6	2314881	2314886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864453
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46062	NC_005071	CAA	2	6	2314923	2314928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33864453
46063	NC_005071	ATCA	2	8	2314966	2314973	50 %	25 %	0 %	25 %	33864453
46064	NC_005071	AAAC	2	8	2314994	2315001	75 %	0 %	0 %	25 %	33864453
46065	NC_005071	GCA	2	6	2315024	2315029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864453
46066	NC_005071	ACCA	3	12	2315036	2315047	50 %	0 %	0 %	50 %	33864453
46067	NC_005071	A	6	6	2315138	2315143	100 %	0 %	0 %	0 %	33864453
46068	NC_005071	CAA	2	6	2315179	2315184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33864453
46069	NC_005071	A	7	7	2315231	2315237	100 %	0 %	0 %	0 %	33864453
46070	NC_005071	AGC	2	6	2315290	2315295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864453
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46072	NC_005071	ACC	2	6	2315378	2315383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864453
46073	NC_005071	TAA	2	6	2315423	2315428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33864453
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46075	NC_005071	GCA	2	6	2315505	2315510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864453
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46077	NC_005071	CAA	2	6	2315575	2315580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33864453
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46079	NC_005071	CAAT	2	8	2315648	2315655	50 %	25 %	0 %	25 %	33864454
46080	NC_005071	ATCG	2	8	2315658	2315665	25 %	25 %	25 %	25 %	33864454
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46084	NC_005071	CGA	2	6	2315795	2315800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864454
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46086	NC_005071	TGA	2	6	2315905	2315910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33864454
46087	NC_005071	CCAAG	2	10	2316038	2316047	40 %	0 %	20 %	40 %	33864454
46088	NC_005071	TCA	2	6	2316055	2316060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33864454
46089	NC_005071	TAA	2	6	2316096	2316101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33864454
46090	NC_005071	CGGG	2	8	2316141	2316148	0 %	0 %	75 %	25 %	33864454
46091	NC_005071	CCT	2	6	2316203	2316208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33864454
46092	NC_005071	TC	3	6	2316209	2316214	0 %	50 %	0 %	50 %	33864454
46093	NC_005071	GCA	2	6	2316229	2316234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864454
46094	NC_005071	GGC	2	6	2316256	2316261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864454
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46098	NC_005071	CCA	2	6	2316440	2316445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864454
46099	NC_005071	CTGG	2	8	2316452	2316459	0 %	25 %	50 %	25 %	33864454
46100	NC_005071	CAT	2	6	2316491	2316496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33864454
46101	NC_005071	GCG	2	6	2316504	2316509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864454
46102	NC_005071	A	7	7	2316510	2316516	100 %	0 %	0 %	0 %	33864454
46103	NC_005071	CAA	2	6	2316530	2316535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33864454
46104	NC_005071	GCT	2	6	2316575	2316580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864454
46105	NC_005071	CAC	2	6	2316591	2316596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864454
46106	NC_005071	AGCCTC	2	12	2316640	2316651	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	33864455
46107	NC_005071	ACG	2	6	2316677	2316682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864455
46108	NC_005071	CGG	2	6	2316685	2316690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864455
46109	NC_005071	CCA	2	6	2316798	2316803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864455
46110	NC_005071	GCA	3	9	2316816	2316824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864455
46111	NC_005071	AGC	2	6	2316852	2316857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864455
46112	NC_005071	CCA	3	9	2316882	2316890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864455
46113	NC_005071	GCC	2	6	2316944	2316949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33864455
46114	NC_005071	GGC	2	6	2316957	2316962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864455
46115	NC_005071	CAC	2	6	2317027	2317032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33864455
46116	NC_005071	TCA	2	6	2317076	2317081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33864455
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46118	NC_005071	AGCA	2	8	2317210	2317217	50 %	0 %	25 %	25 %	33864455
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46214	NC_005071	AC	3	6	2321941	2321946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46215	NC_005071	CAAAA	2	10	2321952	2321961	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
46216	NC_005071	A	6	6	2321958	2321963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46217	NC_005071	TCA	2	6	2322014	2322019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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46220	NC_005071	AAAC	2	8	2322103	2322110	75 %	0 %	0 %	25 %	33864460
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46225	NC_005071	TG	3	6	2322335	2322340	0 %	50 %	50 %	0 %	33864460
46226	NC_005071	CAT	2	6	2322419	2322424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33864460
46227	NC_005071	A	6	6	2322473	2322478	100 %	0 %	0 %	0 %	33864460
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46230	NC_005071	A	6	6	2322599	2322604	100 %	0 %	0 %	0 %	33864460
46231	NC_005071	A	6	6	2322716	2322721	100 %	0 %	0 %	0 %	33864460
46232	NC_005071	GAC	2	6	2322736	2322741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864460
46233	NC_005071	ACA	2	6	2322801	2322806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33864460
46234	NC_005071	GA	3	6	2322847	2322852	50 %	0 %	50 %	0 %	33864460
46235	NC_005071	AGG	2	6	2323008	2323013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33864460
46236	NC_005071	TCA	2	6	2323017	2323022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33864460
46237	NC_005071	GTG	2	6	2323027	2323032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33864460
46238	NC_005071	TCC	2	6	2323042	2323047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33864460
46239	NC_005071	CTC	3	9	2323048	2323056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33864460
46240	NC_005071	GCAGTA	2	12	2323068	2323079	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33864460
46241	NC_005071	TCA	2	6	2323087	2323092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33864460
46242	NC_005071	AGC	2	6	2323201	2323206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46243	NC_005071	TCA	2	6	2323361	2323366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46244	NC_005071	CAG	2	6	2323372	2323377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46245	NC_005071	GTT	2	6	2323408	2323413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46246	NC_005071	CTC	2	6	2323423	2323428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33864461
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46254	NC_005071	CCGC	2	8	2323679	2323686	0 %	0 %	25 %	75 %	33864461
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46268	NC_005071	GCT	2	6	2324233	2324238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864462
46269	NC_005071	CAAT	2	8	2324395	2324402	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46270	NC_005071	GCTGAT	2	12	2324427	2324438	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46271	NC_005071	CAG	2	6	2324496	2324501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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46273	NC_005071	AGC	2	6	2324615	2324620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864463
46274	NC_005071	TGC	2	6	2324788	2324793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864463
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46325	NC_005071	GGTT	2	8	2327297	2327304	0 %	50 %	50 %	0 %	33864464
46326	NC_005071	TG	3	6	2327313	2327318	0 %	50 %	50 %	0 %	33864464
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46340	NC_005071	CAG	3	9	2327855	2327863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864465
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46353	NC_005071	CAG	2	6	2328280	2328285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33864465
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46472	NC_005071	CGAGTA	2	12	2333554	2333565	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33864471
46473	NC_005071	AGCA	2	8	2333567	2333574	50 %	0 %	25 %	25 %	33864471
46474	NC_005071	GCT	2	6	2333591	2333596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864471
46475	NC_005071	GTTG	2	8	2333637	2333644	0 %	50 %	50 %	0 %	33864471
46476	NC_005071	TGC	2	6	2333698	2333703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33864471
46477	NC_005071	GGCT	2	8	2333709	2333716	0 %	25 %	50 %	25 %	33864471
46478	NC_005071	TCAA	2	8	2333745	2333752	50 %	25 %	0 %	25 %	33864471
46479	NC_005071	CAAA	2	8	2333899	2333906	75 %	0 %	0 %	25 %	33864471
46480	NC_005071	GCG	2	6	2333948	2333953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33864471
46481	NC_005071	GCCAG	2	10	2334081	2334090	20 %	0 %	40 %	40 %	33864471
46482	NC_005071	GCA	2	6	2334205	2334210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46483	NC_005071	GCT	2	6	2334279	2334284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46484	NC_005071	CAT	2	6	2334285	2334290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46485	NC_005071	AAC	2	6	2334311	2334316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46486	NC_005071	ACT	2	6	2334324	2334329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46487	NC_005071	CAG	2	6	2334339	2334344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46488	NC_005071	TTC	2	6	2334411	2334416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46489	NC_005071	TGC	2	6	2334436	2334441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46490	NC_005071	AAGC	2	8	2334444	2334451	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46491	NC_005071	A	6	6	2334495	2334500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46492	NC_005071	TTG	2	6	2334573	2334578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46493	NC_005071	TAC	2	6	2334640	2334645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46494	NC_005071	GGCT	2	8	2334679	2334686	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46495	NC_005071	AAT	2	6	2334727	2334732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46497	NC_005071	CTG	2	6	2334761	2334766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46498	NC_005071	CAAA	2	8	2334778	2334785	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46499	NC_005071	TCAA	2	8	2334827	2334834	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46500	NC_005071	CTG	2	6	2334869	2334874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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