MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 39235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_005042	GGA	2	6	170117	170122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33239623
4002	NC_005042	GCT	2	6	170123	170128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239623
4003	NC_005042	CTT	2	6	170184	170189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239623
4004	NC_005042	CTT	2	6	170224	170229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239623
4005	NC_005042	ATG	2	6	170241	170246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239623
4006	NC_005042	ATTT	2	8	170290	170297	25 %	75 %	0 %	0 %	33239623
4007	NC_005042	TTTTTG	2	12	170318	170329	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	33239623
4008	NC_005042	ATA	2	6	170402	170407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239623
4009	NC_005042	CTG	2	6	170499	170504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239623
4010	NC_005042	CAT	2	6	170516	170521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239623
4011	NC_005042	A	6	6	170580	170585	100 %	0 %	0 %	0 %	33239623
4012	NC_005042	TTGC	2	8	170684	170691	0 %	50 %	25 %	25 %	33239623
4013	NC_005042	TGG	2	6	170705	170710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33239623
4014	NC_005042	TTA	2	6	170721	170726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239623
4015	NC_005042	A	6	6	170804	170809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_005042	CAG	2	6	170821	170826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239624
4017	NC_005042	A	6	6	170922	170927	100 %	0 %	0 %	0 %	33239624
4018	NC_005042	AAT	2	6	170936	170941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239624
4019	NC_005042	AAC	2	6	171113	171118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239624
4020	NC_005042	T	6	6	171183	171188	0 %	100 %	0 %	0 %	33239624
4021	NC_005042	TTTA	2	8	171200	171207	25 %	75 %	0 %	0 %	33239624
4022	NC_005042	TTA	2	6	171243	171248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239624
4023	NC_005042	TGT	2	6	171350	171355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239624
4024	NC_005042	T	6	6	171503	171508	0 %	100 %	0 %	0 %	33239624
4025	NC_005042	CGC	2	6	171623	171628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33239624
4026	NC_005042	GT	3	6	171631	171636	0 %	50 %	50 %	0 %	33239624
4027	NC_005042	CAGT	2	8	171665	171672	25 %	25 %	25 %	25 %	33239624
4028	NC_005042	A	6	6	171759	171764	100 %	0 %	0 %	0 %	33239624
4029	NC_005042	GGCTT	2	10	171765	171774	0 %	40 %	40 %	20 %	33239624
4030	NC_005042	ATG	2	6	171801	171806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239624
4031	NC_005042	T	6	6	171864	171869	0 %	100 %	0 %	0 %	33239624
4032	NC_005042	TGT	2	6	171877	171882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239624
4033	NC_005042	GGA	2	6	171914	171919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33239624
4034	NC_005042	GTT	2	6	171921	171926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239624
4035	NC_005042	A	6	6	171977	171982	100 %	0 %	0 %	0 %	33239624
4036	NC_005042	T	6	6	172004	172009	0 %	100 %	0 %	0 %	33239624
4037	NC_005042	CCA	2	6	172038	172043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33239624
4038	NC_005042	TTG	2	6	172111	172116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239624
4039	NC_005042	T	6	6	172118	172123	0 %	100 %	0 %	0 %	33239624
4040	NC_005042	GAA	2	6	172200	172205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239624
4041	NC_005042	TTA	2	6	172218	172223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239624
4042	NC_005042	CAG	2	6	172228	172233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239624
4043	NC_005042	GAA	3	9	172248	172256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239624
4044	NC_005042	GAA	2	6	172392	172397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239624
4045	NC_005042	TTA	2	6	172499	172504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239624
4046	NC_005042	A	7	7	172509	172515	100 %	0 %	0 %	0 %	33239624
4047	NC_005042	GCAG	2	8	172536	172543	25 %	0 %	50 %	25 %	33239624
4048	NC_005042	CTTT	2	8	172561	172568	0 %	75 %	0 %	25 %	33239624
4049	NC_005042	GAT	2	6	172587	172592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239624
4050	NC_005042	GTA	2	6	172618	172623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239624
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4052	NC_005042	GTG	2	6	172708	172713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33239624
4053	NC_005042	GGA	2	6	172770	172775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33239624
4054	NC_005042	A	6	6	172822	172827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_005042	TGT	2	6	172835	172840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_005042	GT	4	8	172839	172846	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_005042	TTG	2	6	172942	172947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239625
4058	NC_005042	TGC	2	6	172980	172985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239625
4059	NC_005042	TGA	2	6	173055	173060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239625
4060	NC_005042	GTT	2	6	173091	173096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239625
4061	NC_005042	AAC	2	6	173106	173111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239625
4062	NC_005042	T	6	6	173112	173117	0 %	100 %	0 %	0 %	33239625
4063	NC_005042	CTG	2	6	173153	173158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239625
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4072	NC_005042	GAAA	2	8	173453	173460	75 %	0 %	25 %	0 %	33239625
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4082	NC_005042	ATT	2	6	173845	173850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239625
4083	NC_005042	TGC	2	6	173978	173983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239625
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4090	NC_005042	AG	3	6	174340	174345	50 %	0 %	50 %	0 %	33239625
4091	NC_005042	TTG	2	6	174347	174352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239625
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4096	NC_005042	TTA	2	6	174497	174502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239625
4097	NC_005042	AT	3	6	174533	174538	50 %	50 %	0 %	0 %	33239625
4098	NC_005042	AT	4	8	174569	174576	50 %	50 %	0 %	0 %	33239625
4099	NC_005042	AAT	2	6	174587	174592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239625
4100	NC_005042	TTAT	2	8	174612	174619	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_005042	GAT	2	6	174627	174632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_005042	ATT	2	6	174661	174666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_005042	ATT	2	6	174692	174697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_005042	TATTT	2	10	174755	174764	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_005042	GAA	2	6	174818	174823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_005042	TGC	2	6	174906	174911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239626
4107	NC_005042	GGT	2	6	175024	175029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33239626
4108	NC_005042	T	6	6	175065	175070	0 %	100 %	0 %	0 %	33239626
4109	NC_005042	AGC	2	6	175071	175076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239626
4110	NC_005042	CTGAAG	2	12	175130	175141	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33239626
4111	NC_005042	AG	3	6	175215	175220	50 %	0 %	50 %	0 %	33239626
4112	NC_005042	TCG	2	6	175230	175235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239626
4113	NC_005042	CTC	2	6	175250	175255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239626
4114	NC_005042	AGC	2	6	175289	175294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239626
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4119	NC_005042	AGCA	2	8	175463	175470	50 %	0 %	25 %	25 %	33239626
4120	NC_005042	TTA	2	6	175499	175504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239626
4121	NC_005042	TCT	2	6	175522	175527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239626
4122	NC_005042	TAGA	2	8	175532	175539	50 %	25 %	25 %	0 %	33239626
4123	NC_005042	T	7	7	175568	175574	0 %	100 %	0 %	0 %	33239626
4124	NC_005042	AAG	2	6	175635	175640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239626
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4126	NC_005042	CTA	2	6	175748	175753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4253	NC_005042	A	6	6	181464	181469	100 %	0 %	0 %	0 %	33239635
4254	NC_005042	GT	3	6	181481	181486	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_005042	GA	3	6	181534	181539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_005042	CCA	2	6	181606	181611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33239636
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4258	NC_005042	CCT	2	6	181885	181890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239636
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4260	NC_005042	TGA	2	6	181914	181919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239636
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4262	NC_005042	CTA	2	6	181994	181999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239636
4263	NC_005042	TTC	3	9	182001	182009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239636
4264	NC_005042	A	6	6	182063	182068	100 %	0 %	0 %	0 %	33239636
4265	NC_005042	AT	3	6	182093	182098	50 %	50 %	0 %	0 %	33239636
4266	NC_005042	TTG	2	6	182124	182129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239636
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4269	NC_005042	TGC	2	6	182220	182225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239636
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4273	NC_005042	TAA	2	6	182345	182350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239636
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4276	NC_005042	AAT	2	6	182470	182475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239636
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4279	NC_005042	TTTC	2	8	182560	182567	0 %	75 %	0 %	25 %	33239636
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4283	NC_005042	TAATTT	2	12	182771	182782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4284	NC_005042	TTC	2	6	182805	182810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239637
4285	NC_005042	GTT	2	6	182882	182887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239637
4286	NC_005042	AGCC	3	12	182902	182913	25 %	0 %	25 %	50 %	33239637
4287	NC_005042	CG	3	6	182915	182920	0 %	0 %	50 %	50 %	33239637
4288	NC_005042	TAAA	2	8	182939	182946	75 %	25 %	0 %	0 %	33239637
4289	NC_005042	AT	3	6	183003	183008	50 %	50 %	0 %	0 %	33239637
4290	NC_005042	CTT	3	9	183035	183043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239637
4291	NC_005042	TCT	2	6	183097	183102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239637
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4297	NC_005042	TGCT	2	8	183332	183339	0 %	50 %	25 %	25 %	33239637
4298	NC_005042	AAAG	2	8	183452	183459	75 %	0 %	25 %	0 %	33239637
4299	NC_005042	TTG	2	6	183536	183541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239637
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4302	NC_005042	CTT	2	6	183601	183606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239637
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4328	NC_005042	CTAT	2	8	184809	184816	25 %	50 %	0 %	25 %	33239638
4329	NC_005042	T	6	6	184824	184829	0 %	100 %	0 %	0 %	33239638
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4344	NC_005042	CTT	2	6	185671	185676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4345	NC_005042	TCTGG	2	10	185691	185700	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4346	NC_005042	ATTG	2	8	185796	185803	25 %	50 %	25 %	0 %	33239639
4347	NC_005042	TGC	2	6	185832	185837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239639
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4351	NC_005042	T	6	6	186098	186103	0 %	100 %	0 %	0 %	33239640
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4359	NC_005042	TGC	2	6	186472	186477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239640
4360	NC_005042	GATC	2	8	186533	186540	25 %	25 %	25 %	25 %	33239640
4361	NC_005042	CTT	2	6	186645	186650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239640
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4366	NC_005042	ATG	2	6	186884	186889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239640
4367	NC_005042	ATT	2	6	186959	186964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239640
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4369	NC_005042	TTAT	2	8	187010	187017	25 %	75 %	0 %	0 %	33239640
4370	NC_005042	CT	3	6	187045	187050	0 %	50 %	0 %	50 %	33239640
4371	NC_005042	AGTC	2	8	187096	187103	25 %	25 %	25 %	25 %	33239640
4372	NC_005042	TAA	2	6	187147	187152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239640
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4375	NC_005042	GA	3	6	187408	187413	50 %	0 %	50 %	0 %	33239641
4376	NC_005042	ATA	2	6	187434	187439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239641
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