MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 39235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_005042	T	8	8	148581	148588	0 %	100 %	0 %	0 %	33239599
3502	NC_005042	AATA	2	8	148664	148671	75 %	25 %	0 %	0 %	33239599
3503	NC_005042	ATT	2	6	148706	148711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239599
3504	NC_005042	TC	3	6	148719	148724	0 %	50 %	0 %	50 %	33239599
3505	NC_005042	TTGC	2	8	148725	148732	0 %	50 %	25 %	25 %	33239599
3506	NC_005042	AAT	2	6	148774	148779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_005042	TTC	2	6	148874	148879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239600
3508	NC_005042	TAA	2	6	148953	148958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239600
3509	NC_005042	CTT	2	6	148972	148977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239600
3510	NC_005042	TTC	2	6	148978	148983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239600
3511	NC_005042	CATT	2	8	149006	149013	25 %	50 %	0 %	25 %	33239600
3512	NC_005042	CAA	2	6	149023	149028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239600
3513	NC_005042	TTTG	2	8	149037	149044	0 %	75 %	25 %	0 %	33239600
3514	NC_005042	T	7	7	149100	149106	0 %	100 %	0 %	0 %	33239600
3515	NC_005042	TAAA	2	8	149151	149158	75 %	25 %	0 %	0 %	33239600
3516	NC_005042	ATA	2	6	149178	149183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239600
3517	NC_005042	AT	4	8	149212	149219	50 %	50 %	0 %	0 %	33239600
3518	NC_005042	A	7	7	149220	149226	100 %	0 %	0 %	0 %	33239600
3519	NC_005042	TTA	3	9	149232	149240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239600
3520	NC_005042	ATA	2	6	149251	149256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239600
3521	NC_005042	T	7	7	149306	149312	0 %	100 %	0 %	0 %	33239600
3522	NC_005042	TAAT	2	8	149321	149328	50 %	50 %	0 %	0 %	33239600
3523	NC_005042	AT	3	6	149388	149393	50 %	50 %	0 %	0 %	33239600
3524	NC_005042	A	6	6	149410	149415	100 %	0 %	0 %	0 %	33239600
3525	NC_005042	TTA	2	6	149463	149468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239601
3526	NC_005042	T	6	6	149490	149495	0 %	100 %	0 %	0 %	33239601
3527	NC_005042	AATC	2	8	149517	149524	50 %	25 %	0 %	25 %	33239601
3528	NC_005042	TCTT	2	8	149556	149563	0 %	75 %	0 %	25 %	33239601
3529	NC_005042	TTG	2	6	149570	149575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239601
3530	NC_005042	GTT	2	6	149604	149609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239601
3531	NC_005042	ACCAAG	2	12	149643	149654	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	33239601
3532	NC_005042	GCT	4	12	149671	149682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239601
3533	NC_005042	CTG	2	6	149696	149701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239601
3534	NC_005042	CTT	2	6	149722	149727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239601
3535	NC_005042	ATT	2	6	149748	149753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239601
3536	NC_005042	GCT	2	6	149785	149790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239601
3537	NC_005042	CAA	2	6	149813	149818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239601
3538	NC_005042	ATG	2	6	149819	149824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239601
3539	NC_005042	GTC	2	6	149826	149831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239601
3540	NC_005042	CAA	2	6	149852	149857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239601
3541	NC_005042	A	7	7	149856	149862	100 %	0 %	0 %	0 %	33239601
3542	NC_005042	TCT	2	6	149863	149868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239601
3543	NC_005042	CAC	2	6	149909	149914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33239601
3544	NC_005042	AGA	2	6	149937	149942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239601
3545	NC_005042	CAT	2	6	149957	149962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239601
3546	NC_005042	T	7	7	149962	149968	0 %	100 %	0 %	0 %	33239601
3547	NC_005042	AT	3	6	150007	150012	50 %	50 %	0 %	0 %	33239601
3548	NC_005042	GAA	2	6	150014	150019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239601
3549	NC_005042	A	7	7	150075	150081	100 %	0 %	0 %	0 %	33239601
3550	NC_005042	TGA	2	6	150085	150090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239601
3551	NC_005042	TAA	2	6	150212	150217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239601
3552	NC_005042	CAT	2	6	150224	150229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239601
3553	NC_005042	ATTG	2	8	150235	150242	25 %	50 %	25 %	0 %	33239601
3554	NC_005042	CAC	2	6	150245	150250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33239601
3555	NC_005042	AAT	2	6	150256	150261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239601
3556	NC_005042	TGG	2	6	150306	150311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33239601
3557	NC_005042	ATT	2	6	150370	150375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239601
3558	NC_005042	A	6	6	150418	150423	100 %	0 %	0 %	0 %	33239601
3559	NC_005042	TAA	2	6	150464	150469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_005042	ATTAG	2	10	150484	150493	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_005042	T	6	6	150503	150508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_005042	TAAT	2	8	150516	150523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_005042	ATA	2	6	150530	150535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_005042	GTA	2	6	150576	150581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_005042	TTG	2	6	150584	150589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_005042	CCAAT	2	10	150611	150620	40 %	20 %	0 %	40 %	33239602
3567	NC_005042	AGA	2	6	150642	150647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239602
3568	NC_005042	TGG	2	6	150668	150673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33239602
3569	NC_005042	TTC	2	6	150767	150772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239602
3570	NC_005042	AGA	2	6	150823	150828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239602
3571	NC_005042	CTT	2	6	150839	150844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239602
3572	NC_005042	CAA	2	6	150878	150883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239602
3573	NC_005042	TGA	2	6	150915	150920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239602
3574	NC_005042	GAA	2	6	150946	150951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239602
3575	NC_005042	CTT	2	6	151129	151134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239602
3576	NC_005042	TGA	3	9	151197	151205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239602
3577	NC_005042	ATA	2	6	151383	151388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239602
3578	NC_005042	ATT	2	6	151413	151418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239603
3579	NC_005042	T	6	6	151453	151458	0 %	100 %	0 %	0 %	33239603
3580	NC_005042	TAT	3	9	151505	151513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239603
3581	NC_005042	AGTT	2	8	151516	151523	25 %	50 %	25 %	0 %	33239603
3582	NC_005042	T	7	7	151522	151528	0 %	100 %	0 %	0 %	33239603
3583	NC_005042	AAT	2	6	151534	151539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239603
3584	NC_005042	TTG	2	6	151541	151546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239603
3585	NC_005042	CAG	2	6	151576	151581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239603
3586	NC_005042	TAA	3	9	151607	151615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239603
3587	NC_005042	AAT	2	6	151679	151684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239603
3588	NC_005042	TAA	2	6	151700	151705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239603
3589	NC_005042	ATAA	2	8	151723	151730	75 %	25 %	0 %	0 %	33239603
3590	NC_005042	T	8	8	151759	151766	0 %	100 %	0 %	0 %	33239603
3591	NC_005042	AAG	2	6	151793	151798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239603
3592	NC_005042	GAT	2	6	151823	151828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239603
3593	NC_005042	ACT	2	6	151892	151897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239603
3594	NC_005042	TAA	2	6	151964	151969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239603
3595	NC_005042	CTT	2	6	151997	152002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239603
3596	NC_005042	CTCTA	2	10	152033	152042	20 %	40 %	0 %	40 %	33239603
3597	NC_005042	T	6	6	152076	152081	0 %	100 %	0 %	0 %	33239603
3598	NC_005042	TTA	2	6	152095	152100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239603
3599	NC_005042	TAAA	2	8	152132	152139	75 %	25 %	0 %	0 %	33239603
3600	NC_005042	GAT	2	6	152146	152151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239603
3601	NC_005042	TAAT	3	12	152395	152406	50 %	50 %	0 %	0 %	33239604
3602	NC_005042	TACT	2	8	152423	152430	25 %	50 %	0 %	25 %	33239604
3603	NC_005042	T	8	8	152436	152443	0 %	100 %	0 %	0 %	33239604
3604	NC_005042	T	6	6	152473	152478	0 %	100 %	0 %	0 %	33239604
3605	NC_005042	TA	3	6	152481	152486	50 %	50 %	0 %	0 %	33239604
3606	NC_005042	GATTC	2	10	152530	152539	20 %	40 %	20 %	20 %	33239604
3607	NC_005042	CTT	2	6	152560	152565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239604
3608	NC_005042	AAG	2	6	152592	152597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239604
3609	NC_005042	TCT	2	6	152667	152672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239604
3610	NC_005042	TTG	2	6	152734	152739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239604
3611	NC_005042	ATA	2	6	152789	152794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239604
3612	NC_005042	TCC	2	6	152877	152882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239604
3613	NC_005042	TGA	2	6	152894	152899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239604
3614	NC_005042	TG	3	6	152962	152967	0 %	50 %	50 %	0 %	33239604
3615	NC_005042	ATG	2	6	153016	153021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239604
3616	NC_005042	TTA	2	6	153040	153045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239605
3617	NC_005042	A	6	6	153072	153077	100 %	0 %	0 %	0 %	33239605
3618	NC_005042	GCA	2	6	153078	153083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239605
3619	NC_005042	TAA	2	6	153116	153121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239605
3620	NC_005042	GCAAT	2	10	153139	153148	40 %	20 %	20 %	20 %	33239605
3621	NC_005042	TTTTA	2	10	153182	153191	20 %	80 %	0 %	0 %	33239605
3622	NC_005042	CTCC	2	8	153229	153236	0 %	25 %	0 %	75 %	33239605
3623	NC_005042	CAT	2	6	153334	153339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239605
3624	NC_005042	T	6	6	153375	153380	0 %	100 %	0 %	0 %	33239605
3625	NC_005042	TCT	2	6	153405	153410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239605
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3627	NC_005042	CT	3	6	153476	153481	0 %	50 %	0 %	50 %	33239605
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3725	NC_005042	T	6	6	157425	157430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3727	NC_005042	T	6	6	157448	157453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3748	NC_005042	TTCTGC	2	12	158378	158389	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	33239609
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3996	NC_005042	GCA	2	6	169960	169965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4000	NC_005042	TCAT	2	8	170106	170113	25 %	50 %	0 %	25 %	33239623

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