MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 39235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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39002	NC_005042	GAA	2	6	1741007	1741012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241328
39003	NC_005042	TAAAT	2	10	1741081	1741090	60 %	40 %	0 %	0 %	33241329
39004	NC_005042	T	7	7	1741144	1741150	0 %	100 %	0 %	0 %	33241329
39005	NC_005042	TTG	2	6	1741177	1741182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241329
39006	NC_005042	TTA	2	6	1741193	1741198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241329
39007	NC_005042	AGCC	2	8	1741200	1741207	25 %	0 %	25 %	50 %	33241329
39008	NC_005042	ACC	2	6	1741291	1741296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33241329
39009	NC_005042	TCG	2	6	1741298	1741303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241329
39010	NC_005042	GCT	3	9	1741328	1741336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241329
39011	NC_005042	TCG	2	6	1741432	1741437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241329
39012	NC_005042	TGT	2	6	1741517	1741522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241329
39013	NC_005042	AG	3	6	1741587	1741592	50 %	0 %	50 %	0 %	33241329
39014	NC_005042	T	6	6	1741628	1741633	0 %	100 %	0 %	0 %	33241329
39015	NC_005042	CTT	2	6	1741634	1741639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241329
39016	NC_005042	TAA	2	6	1741657	1741662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241329
39017	NC_005042	TGG	2	6	1741663	1741668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241329
39018	NC_005042	AGG	2	6	1741765	1741770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241329
39019	NC_005042	CTT	2	6	1741827	1741832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241329
39020	NC_005042	TTC	2	6	1741876	1741881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241329
39021	NC_005042	TTC	2	6	1741890	1741895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241329
39022	NC_005042	TAA	2	6	1741945	1741950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241329
39023	NC_005042	T	7	7	1741958	1741964	0 %	100 %	0 %	0 %	33241329
39024	NC_005042	AATG	2	8	1741973	1741980	50 %	25 %	25 %	0 %	33241329
39025	NC_005042	CTG	2	6	1742012	1742017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241329
39026	NC_005042	CTGCAT	2	12	1742037	1742048	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	33241329
39027	NC_005042	AAT	2	6	1742135	1742140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241329
39028	NC_005042	AAT	2	6	1742220	1742225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241329
39029	NC_005042	AGC	2	6	1742290	1742295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241329
39030	NC_005042	ATGAAG	2	12	1742392	1742403	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	33241329
39031	NC_005042	CTCC	2	8	1742420	1742427	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
39032	NC_005042	ATTT	2	8	1742449	1742456	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39033	NC_005042	AAAG	2	8	1742473	1742480	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39034	NC_005042	TGA	2	6	1742540	1742545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39035	NC_005042	A	7	7	1742549	1742555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39036	NC_005042	ATA	2	6	1742568	1742573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39037	NC_005042	T	7	7	1742604	1742610	0 %	100 %	0 %	0 %	33241330
39038	NC_005042	T	6	6	1742622	1742627	0 %	100 %	0 %	0 %	33241330
39039	NC_005042	CTC	2	6	1742722	1742727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241330
39040	NC_005042	TCC	2	6	1742735	1742740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241330
39041	NC_005042	A	6	6	1742864	1742869	100 %	0 %	0 %	0 %	33241330
39042	NC_005042	TCA	2	6	1742889	1742894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241330
39043	NC_005042	TA	3	6	1742999	1743004	50 %	50 %	0 %	0 %	33241330
39044	NC_005042	A	6	6	1743061	1743066	100 %	0 %	0 %	0 %	33241330
39045	NC_005042	A	6	6	1743195	1743200	100 %	0 %	0 %	0 %	33241330
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39047	NC_005042	TGAT	2	8	1743389	1743396	25 %	50 %	25 %	0 %	33241330
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39050	NC_005042	AGGGA	2	10	1743452	1743461	40 %	0 %	60 %	0 %	33241330
39051	NC_005042	TGA	2	6	1743477	1743482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241330
39052	NC_005042	TAA	2	6	1743497	1743502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241330
39053	NC_005042	ATTA	2	8	1743506	1743513	50 %	50 %	0 %	0 %	33241330
39054	NC_005042	CAA	2	6	1743550	1743555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241330
39055	NC_005042	ATT	2	6	1743593	1743598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241330
39056	NC_005042	TAA	2	6	1743713	1743718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241330
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39058	NC_005042	CAA	3	9	1743823	1743831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241330
39059	NC_005042	ATA	2	6	1743871	1743876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241330
39060	NC_005042	ATA	2	6	1743928	1743933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241330
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39062	NC_005042	TCTA	2	8	1744010	1744017	25 %	50 %	0 %	25 %	33241330
39063	NC_005042	AAT	2	6	1744024	1744029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241330
39064	NC_005042	AAG	2	6	1744043	1744048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241330
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39069	NC_005042	TAT	2	6	1744396	1744401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241330
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39073	NC_005042	ATA	2	6	1744525	1744530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241330
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39080	NC_005042	AAC	2	6	1744799	1744804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241330
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39103	NC_005042	GCAA	2	8	1745954	1745961	50 %	0 %	25 %	25 %	33241331
39104	NC_005042	C	7	7	1745976	1745982	0 %	0 %	0 %	100 %	33241331
39105	NC_005042	AGGAGA	2	12	1746070	1746081	50 %	0 %	50 %	0 %	33241331
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39109	NC_005042	TTTCTC	2	12	1746220	1746231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241331
39110	NC_005042	TCA	3	9	1746248	1746256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241331
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39112	NC_005042	TTA	2	6	1746341	1746346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241331
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39235	NC_005042	A	7	7	1751071	1751077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.