MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 39235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_005042	TTG	2	6	1561055	1561060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241155
35002	NC_005042	TTC	2	6	1561112	1561117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241155
35003	NC_005042	AGAA	2	8	1561121	1561128	75 %	0 %	25 %	0 %	33241155
35004	NC_005042	AATC	2	8	1561198	1561205	50 %	25 %	0 %	25 %	33241155
35005	NC_005042	CT	3	6	1561238	1561243	0 %	50 %	0 %	50 %	33241155
35006	NC_005042	ACCT	2	8	1561286	1561293	25 %	25 %	0 %	50 %	33241155
35007	NC_005042	TTC	2	6	1561351	1561356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241155
35008	NC_005042	T	6	6	1561369	1561374	0 %	100 %	0 %	0 %	33241155
35009	NC_005042	TGCATC	2	12	1561409	1561420	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	33241155
35010	NC_005042	CAA	2	6	1561435	1561440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241155
35011	NC_005042	GAC	2	6	1561519	1561524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241155
35012	NC_005042	CTT	2	6	1561619	1561624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241155
35013	NC_005042	TGAA	2	8	1561626	1561633	50 %	25 %	25 %	0 %	33241155
35014	NC_005042	TCC	2	6	1561650	1561655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241155
35015	NC_005042	AGT	2	6	1561659	1561664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241155
35016	NC_005042	TCAG	2	8	1561756	1561763	25 %	25 %	25 %	25 %	33241155
35017	NC_005042	TTGA	2	8	1561779	1561786	25 %	50 %	25 %	0 %	33241156
35018	NC_005042	GTTT	2	8	1561820	1561827	0 %	75 %	25 %	0 %	33241156
35019	NC_005042	T	6	6	1561825	1561830	0 %	100 %	0 %	0 %	33241156
35020	NC_005042	CCCT	2	8	1561842	1561849	0 %	25 %	0 %	75 %	33241156
35021	NC_005042	TAA	2	6	1561905	1561910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241156
35022	NC_005042	AGA	2	6	1561915	1561920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241156
35023	NC_005042	CAG	2	6	1561956	1561961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241156
35024	NC_005042	GAA	2	6	1561965	1561970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241156
35025	NC_005042	ACG	2	6	1562062	1562067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241156
35026	NC_005042	CCT	2	6	1562140	1562145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241157
35027	NC_005042	T	6	6	1562145	1562150	0 %	100 %	0 %	0 %	33241157
35028	NC_005042	TAG	2	6	1562177	1562182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241157
35029	NC_005042	TAA	2	6	1562222	1562227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241157
35030	NC_005042	ATC	2	6	1562275	1562280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241157
35031	NC_005042	GAA	2	6	1562285	1562290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241157
35032	NC_005042	TCA	3	9	1562329	1562337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241157
35033	NC_005042	TAA	2	6	1562360	1562365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241157
35034	NC_005042	T	6	6	1562388	1562393	0 %	100 %	0 %	0 %	33241157
35035	NC_005042	GAA	2	6	1562436	1562441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35036	NC_005042	TCC	2	6	1562456	1562461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241158
35037	NC_005042	CGA	2	6	1562481	1562486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241158
35038	NC_005042	TTA	2	6	1562517	1562522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241158
35039	NC_005042	GAT	2	6	1562617	1562622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241158
35040	NC_005042	GCC	2	6	1562656	1562661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33241158
35041	NC_005042	TCT	2	6	1562675	1562680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241158
35042	NC_005042	CTAA	2	8	1562754	1562761	50 %	25 %	0 %	25 %	33241158
35043	NC_005042	GGAA	2	8	1562774	1562781	50 %	0 %	50 %	0 %	33241158
35044	NC_005042	TCCT	2	8	1562801	1562808	0 %	50 %	0 %	50 %	33241158
35045	NC_005042	AGA	2	6	1562906	1562911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241158
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35047	NC_005042	A	6	6	1563022	1563027	100 %	0 %	0 %	0 %	33241158
35048	NC_005042	GCA	2	6	1563069	1563074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241158
35049	NC_005042	CGA	2	6	1563102	1563107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241158
35050	NC_005042	CCT	2	6	1563141	1563146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241158
35051	NC_005042	TAA	2	6	1563160	1563165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241158
35052	NC_005042	TAT	2	6	1563172	1563177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241158
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35055	NC_005042	CTT	2	6	1563370	1563375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241159
35056	NC_005042	GAG	2	6	1563423	1563428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241159
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35058	NC_005042	ATTG	2	8	1563528	1563535	25 %	50 %	25 %	0 %	33241159
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35060	NC_005042	AATT	2	8	1563713	1563720	50 %	50 %	0 %	0 %	33241160
35061	NC_005042	CGA	2	6	1563747	1563752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241160
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35063	NC_005042	CAT	2	6	1563886	1563891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241160
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35065	NC_005042	TCC	3	9	1563986	1563994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241160
35066	NC_005042	CTG	2	6	1564124	1564129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241160
35067	NC_005042	TGA	2	6	1564264	1564269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241161
35068	NC_005042	AC	3	6	1564280	1564285	50 %	0 %	0 %	50 %	33241161
35069	NC_005042	GTA	2	6	1564391	1564396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241161
35070	NC_005042	TCT	2	6	1564398	1564403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241161
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35074	NC_005042	T	6	6	1564533	1564538	0 %	100 %	0 %	0 %	33241161
35075	NC_005042	TCCT	2	8	1564591	1564598	0 %	50 %	0 %	50 %	33241161
35076	NC_005042	CAA	2	6	1564675	1564680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241161
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35080	NC_005042	TTAA	2	8	1564935	1564942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35081	NC_005042	TTA	2	6	1564960	1564965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35082	NC_005042	A	6	6	1564990	1564995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35083	NC_005042	A	6	6	1565046	1565051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35084	NC_005042	GCTG	2	8	1565055	1565062	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35085	NC_005042	TAA	2	6	1565077	1565082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35086	NC_005042	TCT	2	6	1565166	1565171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35087	NC_005042	TAAA	3	12	1565267	1565278	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35088	NC_005042	TTCA	2	8	1565285	1565292	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35089	NC_005042	TTA	2	6	1565397	1565402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241162
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35092	NC_005042	ACC	2	6	1565498	1565503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33241162
35093	NC_005042	ACA	2	6	1565552	1565557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241162
35094	NC_005042	TTGC	2	8	1565580	1565587	0 %	50 %	25 %	25 %	33241162
35095	NC_005042	GA	3	6	1565590	1565595	50 %	0 %	50 %	0 %	33241162
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35102	NC_005042	AAT	2	6	1566136	1566141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241163
35103	NC_005042	AATT	2	8	1566192	1566199	50 %	50 %	0 %	0 %	33241163
35104	NC_005042	TCT	2	6	1566214	1566219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241163
35105	NC_005042	AATTT	2	10	1566239	1566248	40 %	60 %	0 %	0 %	33241163
35106	NC_005042	AAG	2	6	1566321	1566326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241163
35107	NC_005042	GTG	2	6	1566489	1566494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241163
35108	NC_005042	AGC	2	6	1566517	1566522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241163
35109	NC_005042	AGG	2	6	1566580	1566585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241163
35110	NC_005042	TTC	2	6	1566603	1566608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241163
35111	NC_005042	ATC	2	6	1566621	1566626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241163
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35114	NC_005042	A	6	6	1566704	1566709	100 %	0 %	0 %	0 %	33241163
35115	NC_005042	ATTA	3	12	1566801	1566812	50 %	50 %	0 %	0 %	33241163
35116	NC_005042	ATCA	2	8	1566852	1566859	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35117	NC_005042	TGA	2	6	1566872	1566877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35118	NC_005042	ATT	2	6	1566906	1566911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35119	NC_005042	AGA	2	6	1566924	1566929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35120	NC_005042	T	6	6	1567028	1567033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35343	NC_005042	TAAA	2	8	1577605	1577612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35344	NC_005042	GAA	2	6	1577634	1577639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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35360	NC_005042	AGC	2	6	1578102	1578107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241175
35361	NC_005042	TGG	2	6	1578196	1578201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241175
35362	NC_005042	TTA	2	6	1578385	1578390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241175
35363	NC_005042	ATT	2	6	1578419	1578424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241175
35364	NC_005042	TAA	2	6	1578470	1578475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241175
35365	NC_005042	AAT	2	6	1578496	1578501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241175
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35367	NC_005042	TAA	2	6	1578615	1578620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241176
35368	NC_005042	CT	3	6	1578652	1578657	0 %	50 %	0 %	50 %	33241176
35369	NC_005042	GTAT	2	8	1578743	1578750	25 %	50 %	25 %	0 %	33241176
35370	NC_005042	AGC	2	6	1578850	1578855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241176
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35374	NC_005042	ATA	2	6	1579045	1579050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35375	NC_005042	TGC	2	6	1579089	1579094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241177
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35400	NC_005042	TTAA	2	8	1580187	1580194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35401	NC_005042	AGCTA	2	10	1580204	1580213	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35402	NC_005042	TTA	2	6	1580228	1580233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35403	NC_005042	TCCT	2	8	1580402	1580409	0 %	50 %	0 %	50 %	33241178
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35406	NC_005042	TAA	2	6	1580476	1580481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241178
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35422	NC_005042	CTT	2	6	1581469	1581474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241179
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35471	NC_005042	TGAA	2	8	1584460	1584467	50 %	25 %	25 %	0 %	33241180
35472	NC_005042	A	6	6	1584488	1584493	100 %	0 %	0 %	0 %	33241180
35473	NC_005042	TAAA	2	8	1584514	1584521	75 %	25 %	0 %	0 %	33241180
35474	NC_005042	AGC	2	6	1584523	1584528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241180
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35478	NC_005042	TCT	3	9	1584751	1584759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241180
35479	NC_005042	ATA	2	6	1584790	1584795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241180
35480	NC_005042	AT	3	6	1584812	1584817	50 %	50 %	0 %	0 %	33241180
35481	NC_005042	A	6	6	1584941	1584946	100 %	0 %	0 %	0 %	33241180
35482	NC_005042	ATG	2	6	1585099	1585104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241181
35483	NC_005042	AATT	2	8	1585213	1585220	50 %	50 %	0 %	0 %	33241181
35484	NC_005042	TGC	2	6	1585267	1585272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241181
35485	NC_005042	ATC	2	6	1585297	1585302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241181
35486	NC_005042	CTA	2	6	1585428	1585433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241181
35487	NC_005042	ACATG	2	10	1585434	1585443	40 %	20 %	20 %	20 %	33241181
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