MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 39235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34502	NC_005042	AGT	2	6	1537874	1537879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241121
34503	NC_005042	AGG	2	6	1537907	1537912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241121
34504	NC_005042	GGT	2	6	1538007	1538012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241121
34505	NC_005042	TGG	2	6	1538039	1538044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241121
34506	NC_005042	GCT	2	6	1538064	1538069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241121
34507	NC_005042	CAT	2	6	1538112	1538117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241121
34508	NC_005042	GCA	2	6	1538187	1538192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241121
34509	NC_005042	GTA	2	6	1538226	1538231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241121
34510	NC_005042	GCA	2	6	1538253	1538258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241121
34511	NC_005042	CTT	2	6	1538345	1538350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241121
34512	NC_005042	TGG	2	6	1538361	1538366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241121
34513	NC_005042	ACAA	2	8	1538385	1538392	75 %	0 %	0 %	25 %	33241121
34514	NC_005042	CAC	2	6	1538442	1538447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33241121
34515	NC_005042	GT	3	6	1538461	1538466	0 %	50 %	50 %	0 %	33241121
34516	NC_005042	CGG	2	6	1538477	1538482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33241121
34517	NC_005042	AAC	2	6	1538496	1538501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241121
34518	NC_005042	GAAA	2	8	1538525	1538532	75 %	0 %	25 %	0 %	33241121
34519	NC_005042	TCA	2	6	1538582	1538587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241121
34520	NC_005042	TCA	2	6	1538747	1538752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241121
34521	NC_005042	GGT	2	6	1538763	1538768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241121
34522	NC_005042	TGC	2	6	1538783	1538788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241121
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34525	NC_005042	TGGCT	2	10	1538910	1538919	0 %	40 %	40 %	20 %	33241121
34526	NC_005042	ATG	2	6	1538947	1538952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241121
34527	NC_005042	CAG	2	6	1539042	1539047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241121
34528	NC_005042	TAG	2	6	1539070	1539075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241121
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34531	NC_005042	CTG	2	6	1539175	1539180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241121
34532	NC_005042	TGA	2	6	1539184	1539189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241121
34533	NC_005042	TCA	2	6	1539191	1539196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241121
34534	NC_005042	AAG	2	6	1539257	1539262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241121
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34536	NC_005042	TCT	2	6	1539345	1539350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241121
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34538	NC_005042	TGT	2	6	1539398	1539403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241121
34539	NC_005042	ATA	2	6	1539670	1539675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241121
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34542	NC_005042	CGCC	2	8	1539791	1539798	0 %	0 %	25 %	75 %	33241121
34543	NC_005042	CGT	2	6	1539892	1539897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241122
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34546	NC_005042	TGGT	2	8	1540293	1540300	0 %	50 %	50 %	0 %	33241122
34547	NC_005042	ATC	2	6	1540364	1540369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241122
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34553	NC_005042	TC	3	6	1540855	1540860	0 %	50 %	0 %	50 %	33241122
34554	NC_005042	CTTGCT	2	12	1540876	1540887	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	33241122
34555	NC_005042	ACACA	2	10	1540964	1540973	60 %	0 %	0 %	40 %	33241122
34556	NC_005042	CAT	2	6	1540990	1540995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241122
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34558	NC_005042	TAAA	2	8	1541075	1541082	75 %	25 %	0 %	0 %	33241122
34559	NC_005042	AAG	2	6	1541114	1541119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241122
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34564	NC_005042	TTCC	2	8	1541401	1541408	0 %	50 %	0 %	50 %	33241122
34565	NC_005042	CTG	2	6	1541417	1541422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241122
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34570	NC_005042	TCAAT	2	10	1541697	1541706	40 %	40 %	0 %	20 %	33241122
34571	NC_005042	TG	3	6	1541910	1541915	0 %	50 %	50 %	0 %	33241122
34572	NC_005042	TCA	2	6	1541919	1541924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241122
34573	NC_005042	TTG	2	6	1541945	1541950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241122
34574	NC_005042	GA	3	6	1541955	1541960	50 %	0 %	50 %	0 %	33241122
34575	NC_005042	AC	3	6	1542007	1542012	50 %	0 %	0 %	50 %	33241122
34576	NC_005042	GAAAG	2	10	1542101	1542110	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
34577	NC_005042	CAG	2	6	1542121	1542126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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34589	NC_005042	T	6	6	1542646	1542651	0 %	100 %	0 %	0 %	33241123
34590	NC_005042	AAG	2	6	1542678	1542683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241123
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34597	NC_005042	TCTGG	2	10	1542959	1542968	0 %	40 %	40 %	20 %	33241123
34598	NC_005042	TTCT	2	8	1542970	1542977	0 %	75 %	0 %	25 %	33241123
34599	NC_005042	TC	3	6	1542982	1542987	0 %	50 %	0 %	50 %	33241123
34600	NC_005042	CAA	2	6	1543000	1543005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241123
34601	NC_005042	TGTA	2	8	1543048	1543055	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34602	NC_005042	ATA	3	9	1543124	1543132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241124
34603	NC_005042	GCAA	2	8	1543153	1543160	50 %	0 %	25 %	25 %	33241124
34604	NC_005042	GGAA	2	8	1543186	1543193	50 %	0 %	50 %	0 %	33241124
34605	NC_005042	ATA	2	6	1543201	1543206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241124
34606	NC_005042	CCTC	2	8	1543228	1543235	0 %	25 %	0 %	75 %	33241124
34607	NC_005042	AAAG	2	8	1543240	1543247	75 %	0 %	25 %	0 %	33241124
34608	NC_005042	GGA	2	6	1543266	1543271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241124
34609	NC_005042	TTG	2	6	1543281	1543286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241124
34610	NC_005042	ACT	2	6	1543321	1543326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241124
34611	NC_005042	A	6	6	1543400	1543405	100 %	0 %	0 %	0 %	33241124
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34615	NC_005042	ATT	2	6	1543579	1543584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241124
34616	NC_005042	TTA	2	6	1543594	1543599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241124
34617	NC_005042	T	6	6	1543600	1543605	0 %	100 %	0 %	0 %	33241124
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34982	NC_005042	CTA	2	6	1560121	1560126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241152
34983	NC_005042	CAA	3	9	1560170	1560178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241152
34984	NC_005042	AAC	2	6	1560201	1560206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241152
34985	NC_005042	CGA	2	6	1560384	1560389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241153
34986	NC_005042	T	6	6	1560400	1560405	0 %	100 %	0 %	0 %	33241153
34987	NC_005042	GTCA	2	8	1560419	1560426	25 %	25 %	25 %	25 %	33241153
34988	NC_005042	TGA	2	6	1560485	1560490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241154
34989	NC_005042	AGC	3	9	1560518	1560526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241154
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34991	NC_005042	ATG	2	6	1560553	1560558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241154
34992	NC_005042	TC	3	6	1560592	1560597	0 %	50 %	0 %	50 %	33241154
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