MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 39235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_005042	TTG	2	6	126874	126879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239571
3002	NC_005042	TAG	2	6	126909	126914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239571
3003	NC_005042	TCC	2	6	126978	126983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239571
3004	NC_005042	A	6	6	126986	126991	100 %	0 %	0 %	0 %	33239571
3005	NC_005042	GC	3	6	126997	127002	0 %	0 %	50 %	50 %	33239571
3006	NC_005042	ATT	2	6	127012	127017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239571
3007	NC_005042	AAT	2	6	127051	127056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239571
3008	NC_005042	CAG	2	6	127073	127078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239571
3009	NC_005042	ATT	2	6	127082	127087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239571
3010	NC_005042	AGC	2	6	127116	127121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239571
3011	NC_005042	TTA	2	6	127241	127246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239571
3012	NC_005042	TCAAA	2	10	127279	127288	60 %	20 %	0 %	20 %	33239571
3013	NC_005042	AAT	2	6	127309	127314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239571
3014	NC_005042	TCT	2	6	127348	127353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239571
3015	NC_005042	AGA	2	6	127356	127361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239571
3016	NC_005042	ATT	2	6	127371	127376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239571
3017	NC_005042	AAG	2	6	127382	127387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239571
3018	NC_005042	TTAGAT	2	12	127441	127452	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	33239571
3019	NC_005042	AGTT	2	8	127478	127485	25 %	50 %	25 %	0 %	33239571
3020	NC_005042	AATC	2	8	127489	127496	50 %	25 %	0 %	25 %	33239571
3021	NC_005042	AT	3	6	127502	127507	50 %	50 %	0 %	0 %	33239571
3022	NC_005042	TGA	2	6	127518	127523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239571
3023	NC_005042	TCT	2	6	127545	127550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239571
3024	NC_005042	ATC	2	6	127562	127567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239571
3025	NC_005042	TTA	2	6	127582	127587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239571
3026	NC_005042	CGGA	2	8	127609	127616	25 %	0 %	50 %	25 %	33239571
3027	NC_005042	AGG	2	6	127623	127628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33239571
3028	NC_005042	A	6	6	127687	127692	100 %	0 %	0 %	0 %	33239571
3029	NC_005042	CAA	2	6	127706	127711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239571
3030	NC_005042	AG	3	6	127720	127725	50 %	0 %	50 %	0 %	33239571
3031	NC_005042	ATT	2	6	127739	127744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239572
3032	NC_005042	TAT	2	6	127880	127885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239572
3033	NC_005042	ATTAG	2	10	127912	127921	40 %	40 %	20 %	0 %	33239572
3034	NC_005042	TGC	2	6	127923	127928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239572
3035	NC_005042	AAT	2	6	127989	127994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239572
3036	NC_005042	TGC	2	6	128028	128033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239572
3037	NC_005042	ATT	2	6	128077	128082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239572
3038	NC_005042	T	6	6	128091	128096	0 %	100 %	0 %	0 %	33239572
3039	NC_005042	TCC	2	6	128127	128132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239572
3040	NC_005042	TAA	2	6	128133	128138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239572
3041	NC_005042	ACA	2	6	128140	128145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239572
3042	NC_005042	TTA	2	6	128150	128155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239572
3043	NC_005042	TC	3	6	128176	128181	0 %	50 %	0 %	50 %	33239572
3044	NC_005042	TCC	2	6	128185	128190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239572
3045	NC_005042	CCA	2	6	128197	128202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33239572
3046	NC_005042	CAG	2	6	128237	128242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239572
3047	NC_005042	A	6	6	128254	128259	100 %	0 %	0 %	0 %	33239572
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3049	NC_005042	ATA	2	6	128329	128334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239572
3050	NC_005042	AAT	2	6	128335	128340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239572
3051	NC_005042	CCA	2	6	128343	128348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33239572
3052	NC_005042	T	6	6	128371	128376	0 %	100 %	0 %	0 %	33239572
3053	NC_005042	ATT	2	6	128401	128406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239572
3054	NC_005042	ACC	2	6	128526	128531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33239572
3055	NC_005042	TATC	2	8	128585	128592	25 %	50 %	0 %	25 %	33239572
3056	NC_005042	CGA	2	6	128656	128661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239572
3057	NC_005042	TGA	2	6	128693	128698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_005042	TAG	2	6	128726	128731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_005042	T	9	9	128734	128742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_005042	ATTTT	2	10	128778	128787	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_005042	AAT	2	6	128795	128800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_005042	ACT	2	6	128837	128842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_005042	AAT	2	6	128855	128860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_005042	TGG	2	6	128901	128906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33239573
3065	NC_005042	ATG	2	6	128918	128923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239573
3066	NC_005042	GTA	2	6	128981	128986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239573
3067	NC_005042	AGA	2	6	129019	129024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239573
3068	NC_005042	TAG	2	6	129039	129044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239573
3069	NC_005042	ATT	3	9	129068	129076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239573
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3071	NC_005042	TTC	2	6	129177	129182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239573
3072	NC_005042	TGA	2	6	129241	129246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239573
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3078	NC_005042	TCT	2	6	129845	129850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239573
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3080	NC_005042	AGATA	2	10	129916	129925	60 %	20 %	20 %	0 %	33239573
3081	NC_005042	CAA	2	6	129935	129940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239573
3082	NC_005042	ATTGG	2	10	129966	129975	20 %	40 %	40 %	0 %	33239573
3083	NC_005042	GA	4	8	129998	130005	50 %	0 %	50 %	0 %	33239573
3084	NC_005042	GC	3	6	130040	130045	0 %	0 %	50 %	50 %	33239573
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3089	NC_005042	ATTT	2	8	130257	130264	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_005042	TAAA	2	8	130274	130281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3093	NC_005042	AGTT	2	8	130432	130439	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_005042	T	7	7	130438	130444	0 %	100 %	0 %	0 %	33239575
3095	NC_005042	TC	3	6	130498	130503	0 %	50 %	0 %	50 %	33239575
3096	NC_005042	TTG	2	6	130687	130692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239575
3097	NC_005042	ATT	2	6	130797	130802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239575
3098	NC_005042	TAATTT	2	12	130838	130849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239575
3099	NC_005042	GCA	2	6	130924	130929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_005042	TTA	2	6	130933	130938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_005042	AAT	2	6	130939	130944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_005042	TAA	2	6	130974	130979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_005042	AGA	2	6	130986	130991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_005042	ATTTA	2	10	130996	131005	40 %	60 %	0 %	0 %	33239576
3105	NC_005042	T	6	6	131014	131019	0 %	100 %	0 %	0 %	33239576
3106	NC_005042	AGA	2	6	131035	131040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239576
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3108	NC_005042	AAT	2	6	131064	131069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239576
3109	NC_005042	T	6	6	131077	131082	0 %	100 %	0 %	0 %	33239576
3110	NC_005042	TAAA	2	8	131120	131127	75 %	25 %	0 %	0 %	33239576
3111	NC_005042	ATT	2	6	131139	131144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239576
3112	NC_005042	T	7	7	131163	131169	0 %	100 %	0 %	0 %	33239576
3113	NC_005042	TAT	2	6	131210	131215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239576
3114	NC_005042	TGAT	2	8	131241	131248	25 %	50 %	25 %	0 %	33239577
3115	NC_005042	TGTA	2	8	131263	131270	25 %	50 %	25 %	0 %	33239577
3116	NC_005042	TCT	2	6	131303	131308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239577
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3119	NC_005042	ATTGT	2	10	131357	131366	20 %	60 %	20 %	0 %	33239577
3120	NC_005042	T	6	6	131462	131467	0 %	100 %	0 %	0 %	33239577
3121	NC_005042	TCT	2	6	131522	131527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239577
3122	NC_005042	TAAA	2	8	131619	131626	75 %	25 %	0 %	0 %	33239577
3123	NC_005042	TGT	2	6	131631	131636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239577
3124	NC_005042	TACT	2	8	131684	131691	25 %	50 %	0 %	25 %	33239577
3125	NC_005042	CAT	2	6	131737	131742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239577
3126	NC_005042	CAT	2	6	131746	131751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239577
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3143	NC_005042	T	6	6	132197	132202	0 %	100 %	0 %	0 %	33239577
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3151	NC_005042	TGT	2	6	132406	132411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239577
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3241	NC_005042	TAAT	2	8	136735	136742	50 %	50 %	0 %	0 %	33239585
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3247	NC_005042	CCT	2	6	137225	137230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239585
3248	NC_005042	GGA	2	6	137236	137241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33239585
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3250	NC_005042	GAG	2	6	137325	137330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33239585
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3254	NC_005042	ATA	2	6	137389	137394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239585
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3259	NC_005042	T	6	6	137633	137638	0 %	100 %	0 %	0 %	33239585
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3368	NC_005042	CTTTA	2	10	142459	142468	20 %	60 %	0 %	20 %	33239591
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3371	NC_005042	AGT	2	6	142526	142531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239591
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