MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 39235

< Previous12...6263646566676869707172...7879Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_005042	AAGTA	2	10	1468500	1468509	60 %	20 %	20 %	0 %	33241062
33002	NC_005042	AAT	2	6	1468594	1468599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241062
33003	NC_005042	TAA	2	6	1468602	1468607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241062
33004	NC_005042	AT	3	6	1468612	1468617	50 %	50 %	0 %	0 %	33241062
33005	NC_005042	ATC	2	6	1468634	1468639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241062
33006	NC_005042	AGC	2	6	1468686	1468691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241062
33007	NC_005042	AAAT	2	8	1468703	1468710	75 %	25 %	0 %	0 %	33241062
33008	NC_005042	TAA	2	6	1468737	1468742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241062
33009	NC_005042	GAA	2	6	1468861	1468866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241062
33010	NC_005042	CAG	2	6	1468874	1468879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241062
33011	NC_005042	GGC	2	6	1468886	1468891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33241062
33012	NC_005042	ATT	2	6	1468933	1468938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241062
33013	NC_005042	AGT	2	6	1468951	1468956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241062
33014	NC_005042	TTTA	2	8	1468994	1469001	25 %	75 %	0 %	0 %	33241062
33015	NC_005042	TAT	2	6	1469037	1469042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241062
33016	NC_005042	CAA	2	6	1469045	1469050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241062
33017	NC_005042	AAG	2	6	1469069	1469074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241062
33018	NC_005042	TCAAT	3	15	1469136	1469150	40 %	40 %	0 %	20 %	33241062
33019	NC_005042	AGC	2	6	1469157	1469162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241062
33020	NC_005042	ACA	2	6	1469203	1469208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241063
33021	NC_005042	AAG	2	6	1469255	1469260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241063
33022	NC_005042	GCT	2	6	1469266	1469271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241063
33023	NC_005042	CAA	2	6	1469273	1469278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241063
33024	NC_005042	ATC	2	6	1469280	1469285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241063
33025	NC_005042	CTT	2	6	1469303	1469308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241063
33026	NC_005042	AAT	2	6	1469400	1469405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241063
33027	NC_005042	AAAT	2	8	1469522	1469529	75 %	25 %	0 %	0 %	33241063
33028	NC_005042	A	6	6	1469577	1469582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33029	NC_005042	A	6	6	1469599	1469604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33030	NC_005042	ATTA	2	8	1469618	1469625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33031	NC_005042	TAAAAC	2	12	1469685	1469696	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33032	NC_005042	ATC	2	6	1469708	1469713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33033	NC_005042	ATT	2	6	1469724	1469729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33034	NC_005042	GAT	2	6	1469794	1469799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241064
33035	NC_005042	GAA	2	6	1469887	1469892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241064
33036	NC_005042	TGCT	2	8	1469921	1469928	0 %	50 %	25 %	25 %	33241064
33037	NC_005042	ATG	2	6	1469930	1469935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241064
33038	NC_005042	ATT	2	6	1470013	1470018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33039	NC_005042	TTC	2	6	1470203	1470208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241065
33040	NC_005042	GTT	3	9	1470226	1470234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241065
33041	NC_005042	TGA	2	6	1470237	1470242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241065
33042	NC_005042	TTA	2	6	1470257	1470262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241065
33043	NC_005042	TCT	2	6	1470319	1470324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241065
33044	NC_005042	T	7	7	1470400	1470406	0 %	100 %	0 %	0 %	33241066
33045	NC_005042	CTG	2	6	1470465	1470470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241066
33046	NC_005042	CCT	2	6	1470581	1470586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241066
33047	NC_005042	AAAT	2	8	1470696	1470703	75 %	25 %	0 %	0 %	33241066
33048	NC_005042	TTCT	2	8	1470783	1470790	0 %	75 %	0 %	25 %	33241066
33049	NC_005042	AAC	2	6	1470796	1470801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241066
33050	NC_005042	CTC	2	6	1470870	1470875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241066
33051	NC_005042	CAGT	2	8	1470887	1470894	25 %	25 %	25 %	25 %	33241066
33052	NC_005042	CAC	2	6	1470981	1470986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33241066
33053	NC_005042	CTT	2	6	1471041	1471046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241066
33054	NC_005042	TAA	2	6	1471098	1471103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241066
33055	NC_005042	T	8	8	1471166	1471173	0 %	100 %	0 %	0 %	33241066
33056	NC_005042	CTA	2	6	1471242	1471247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241067
33057	NC_005042	GACGT	2	10	1471275	1471284	20 %	20 %	40 %	20 %	33241067
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33059	NC_005042	AATT	2	8	1471438	1471445	50 %	50 %	0 %	0 %	33241067
33060	NC_005042	AGG	2	6	1471454	1471459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241067
33061	NC_005042	TTAG	2	8	1471467	1471474	25 %	50 %	25 %	0 %	33241067
33062	NC_005042	ACA	2	6	1471475	1471480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241067
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33064	NC_005042	TGC	2	6	1471672	1471677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241068
33065	NC_005042	GCCAA	2	10	1471680	1471689	40 %	0 %	20 %	40 %	33241068
33066	NC_005042	GAAA	2	8	1471723	1471730	75 %	0 %	25 %	0 %	33241068
33067	NC_005042	ATG	2	6	1471791	1471796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241068
33068	NC_005042	AGT	2	6	1471868	1471873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241068
33069	NC_005042	ATC	2	6	1471909	1471914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241068
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33071	NC_005042	A	7	7	1471927	1471933	100 %	0 %	0 %	0 %	33241068
33072	NC_005042	GAA	2	6	1472081	1472086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241068
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33074	NC_005042	AGCA	2	8	1472212	1472219	50 %	0 %	25 %	25 %	33241068
33075	NC_005042	CA	3	6	1472218	1472223	50 %	0 %	0 %	50 %	33241068
33076	NC_005042	TCC	2	6	1472279	1472284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241068
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33079	NC_005042	TTC	2	6	1472436	1472441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241068
33080	NC_005042	TGC	2	6	1472455	1472460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241068
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33082	NC_005042	GA	3	6	1472560	1472565	50 %	0 %	50 %	0 %	33241068
33083	NC_005042	A	6	6	1472602	1472607	100 %	0 %	0 %	0 %	33241068
33084	NC_005042	GGA	2	6	1472633	1472638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241068
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33086	NC_005042	TTC	2	6	1472658	1472663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241068
33087	NC_005042	GCG	2	6	1472729	1472734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33241068
33088	NC_005042	TAT	2	6	1472924	1472929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33089	NC_005042	TC	3	6	1473036	1473041	0 %	50 %	0 %	50 %	33241069
33090	NC_005042	TA	3	6	1473083	1473088	50 %	50 %	0 %	0 %	33241069
33091	NC_005042	TCAAA	2	10	1473098	1473107	60 %	20 %	0 %	20 %	33241069
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33093	NC_005042	ACAA	2	8	1473251	1473258	75 %	0 %	0 %	25 %	33241069
33094	NC_005042	ATG	2	6	1473373	1473378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241069
33095	NC_005042	AATT	2	8	1473448	1473455	50 %	50 %	0 %	0 %	33241069
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33099	NC_005042	GGAA	2	8	1473562	1473569	50 %	0 %	50 %	0 %	33241069
33100	NC_005042	CAA	2	6	1473596	1473601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241069
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33103	NC_005042	AGG	2	6	1473860	1473865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241069
33104	NC_005042	GTG	2	6	1474006	1474011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241069
33105	NC_005042	TCT	2	6	1474073	1474078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241069
33106	NC_005042	A	6	6	1474138	1474143	100 %	0 %	0 %	0 %	33241069
33107	NC_005042	CAA	2	6	1474264	1474269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241069
33108	NC_005042	ATT	2	6	1474271	1474276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241069
33109	NC_005042	TTA	2	6	1474354	1474359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33110	NC_005042	TAT	2	6	1474366	1474371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241070
33111	NC_005042	ATT	2	6	1474403	1474408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241070
33112	NC_005042	TTTA	2	8	1474424	1474431	25 %	75 %	0 %	0 %	33241070
33113	NC_005042	AGC	2	6	1474484	1474489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241070
33114	NC_005042	ATT	2	6	1474560	1474565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241070
33115	NC_005042	AAC	2	6	1474568	1474573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241070
33116	NC_005042	GTTCAG	2	12	1474654	1474665	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	33241070
33117	NC_005042	GCT	2	6	1474690	1474695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241070
33118	NC_005042	TAA	2	6	1474706	1474711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241070
33119	NC_005042	TCA	2	6	1474944	1474949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241070
33120	NC_005042	GAT	2	6	1475014	1475019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241070
33121	NC_005042	TCTT	2	8	1475033	1475040	0 %	75 %	0 %	25 %	33241070
33122	NC_005042	TTC	2	6	1475057	1475062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241070
33123	NC_005042	TCG	2	6	1475069	1475074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241070
33124	NC_005042	CTT	2	6	1475078	1475083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241070
33125	NC_005042	T	7	7	1475087	1475093	0 %	100 %	0 %	0 %	33241070
33126	NC_005042	TTC	2	6	1475132	1475137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241070
33127	NC_005042	CAA	2	6	1475299	1475304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241070
33128	NC_005042	AT	3	6	1475374	1475379	50 %	50 %	0 %	0 %	33241070
33129	NC_005042	TCA	2	6	1475382	1475387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241070
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33132	NC_005042	TTCA	2	8	1475528	1475535	25 %	50 %	0 %	25 %	33241070
33133	NC_005042	CTG	2	6	1475545	1475550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241070
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33147	NC_005042	ATC	2	6	1476746	1476751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241070
33148	NC_005042	TGC	2	6	1476812	1476817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241070
33149	NC_005042	A	6	6	1476928	1476933	100 %	0 %	0 %	0 %	33241070
33150	NC_005042	CAAT	2	8	1476976	1476983	50 %	25 %	0 %	25 %	33241070
33151	NC_005042	TAC	2	6	1477010	1477015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241070
33152	NC_005042	ATC	2	6	1477061	1477066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241070
33153	NC_005042	ATC	3	9	1477100	1477108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241070
33154	NC_005042	CTAA	2	8	1477139	1477146	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33155	NC_005042	AAAT	2	8	1477242	1477249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33156	NC_005042	ACAA	2	8	1477340	1477347	75 %	0 %	0 %	25 %	33241071
33157	NC_005042	TC	3	6	1477354	1477359	0 %	50 %	0 %	50 %	33241071
33158	NC_005042	GCAA	2	8	1477369	1477376	50 %	0 %	25 %	25 %	33241071
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33163	NC_005042	GGAA	2	8	1477788	1477795	50 %	0 %	50 %	0 %	33241071
33164	NC_005042	A	6	6	1477811	1477816	100 %	0 %	0 %	0 %	33241071
33165	NC_005042	AAC	2	6	1477831	1477836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241071
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33182	NC_005042	TGGT	2	8	1478417	1478424	0 %	50 %	50 %	0 %	33241072
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33222	NC_005042	A	6	6	1479854	1479859	100 %	0 %	0 %	0 %	33241073
33223	NC_005042	AGT	2	6	1479879	1479884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241074
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33233	NC_005042	ATA	2	6	1480246	1480251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241074
33234	NC_005042	CA	3	6	1480282	1480287	50 %	0 %	0 %	50 %	33241074
33235	NC_005042	TCA	3	9	1480337	1480345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241074
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33357	NC_005042	CTT	2	6	1485547	1485552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241081
33358	NC_005042	TA	3	6	1485557	1485562	50 %	50 %	0 %	0 %	33241081
33359	NC_005042	CAAG	2	8	1485571	1485578	50 %	0 %	25 %	25 %	33241081
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33365	NC_005042	TAA	2	6	1485927	1485932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33382	NC_005042	AGTA	2	8	1486761	1486768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33383	NC_005042	AG	3	6	1486855	1486860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33384	NC_005042	TTG	2	6	1486882	1486887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33392	NC_005042	A	6	6	1487109	1487114	100 %	0 %	0 %	0 %	33241084
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33433	NC_005042	TTG	2	6	1488733	1488738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33475	NC_005042	ATC	4	12	1490980	1490991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241087
33476	NC_005042	CTT	2	6	1491017	1491022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241087
33477	NC_005042	CTC	2	6	1491067	1491072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241087
33478	NC_005042	T	6	6	1491105	1491110	0 %	100 %	0 %	0 %	33241087
33479	NC_005042	TC	3	6	1491112	1491117	0 %	50 %	0 %	50 %	33241087
33480	NC_005042	CT	3	6	1491144	1491149	0 %	50 %	0 %	50 %	33241087
33481	NC_005042	TC	3	6	1491249	1491254	0 %	50 %	0 %	50 %	33241087
33482	NC_005042	CAA	2	6	1491257	1491262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241087
33483	NC_005042	ACA	2	6	1491282	1491287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241087
33484	NC_005042	ACA	2	6	1491320	1491325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241087
33485	NC_005042	AGC	2	6	1491334	1491339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241087
33486	NC_005042	TCT	2	6	1491356	1491361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241087
33487	NC_005042	TCT	2	6	1491379	1491384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241087
33488	NC_005042	TCT	2	6	1491395	1491400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241087
33489	NC_005042	GTT	2	6	1491449	1491454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241087
33490	NC_005042	CAA	2	6	1491456	1491461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241087
33491	NC_005042	CTG	2	6	1491481	1491486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241087
33492	NC_005042	TTGA	2	8	1491600	1491607	25 %	50 %	25 %	0 %	33241087
33493	NC_005042	TCT	2	6	1491608	1491613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241087
33494	NC_005042	TTG	3	9	1491766	1491774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241087
33495	NC_005042	TTC	2	6	1491823	1491828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241087
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33497	NC_005042	AAT	2	6	1492006	1492011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241087
33498	NC_005042	TG	3	6	1492034	1492039	0 %	50 %	50 %	0 %	33241087
33499	NC_005042	TTA	2	6	1492139	1492144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241087
33500	NC_005042	T	6	6	1492205	1492210	0 %	100 %	0 %	0 %	33241087

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