MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 39235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32002	NC_005042	GATA	2	8	1422895	1422902	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32003	NC_005042	GTTA	2	8	1422903	1422910	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32004	NC_005042	CTT	2	6	1423032	1423037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32005	NC_005042	CA	4	8	1423038	1423045	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32006	NC_005042	GCT	2	6	1423136	1423141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32007	NC_005042	AGC	2	6	1423156	1423161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32008	NC_005042	AGGA	2	8	1423168	1423175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32009	NC_005042	GCT	2	6	1423201	1423206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32010	NC_005042	AATTA	2	10	1423209	1423218	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32011	NC_005042	A	6	6	1423224	1423229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32012	NC_005042	AGAAA	2	10	1423376	1423385	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32013	NC_005042	TCT	2	6	1423487	1423492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32014	NC_005042	CGA	2	6	1423571	1423576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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32016	NC_005042	TTTC	2	8	1423648	1423655	0 %	75 %	0 %	25 %	33241011
32017	NC_005042	GA	3	6	1423703	1423708	50 %	0 %	50 %	0 %	33241011
32018	NC_005042	ATT	2	6	1423755	1423760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241011
32019	NC_005042	TTA	2	6	1423776	1423781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241011
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32022	NC_005042	CTG	2	6	1423849	1423854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241011
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32037	NC_005042	TG	3	6	1424487	1424492	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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32039	NC_005042	CAAC	2	8	1424557	1424564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32040	NC_005042	T	6	6	1424565	1424570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32041	NC_005042	ACTAA	2	10	1424583	1424592	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32042	NC_005042	A	7	7	1424591	1424597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32043	NC_005042	TGG	2	6	1424612	1424617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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32046	NC_005042	T	6	6	1424784	1424789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32047	NC_005042	TA	3	6	1424800	1424805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32048	NC_005042	A	7	7	1424839	1424845	100 %	0 %	0 %	0 %	33241012
32049	NC_005042	AGAT	2	8	1424907	1424914	50 %	25 %	25 %	0 %	33241012
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32053	NC_005042	AGCA	2	8	1425114	1425121	50 %	0 %	25 %	25 %	33241012
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32058	NC_005042	ACTAC	2	10	1425281	1425290	40 %	20 %	0 %	40 %	33241012
32059	NC_005042	TGTAGT	2	12	1425309	1425320	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	33241012
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32063	NC_005042	TTA	2	6	1425475	1425480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241012
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32065	NC_005042	AT	3	6	1425510	1425515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32095	NC_005042	ATT	2	6	1426753	1426758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32124	NC_005042	TCA	2	6	1428385	1428390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241017
32125	NC_005042	A	6	6	1428409	1428414	100 %	0 %	0 %	0 %	33241017
32126	NC_005042	TAA	2	6	1428448	1428453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241017
32127	NC_005042	AGA	2	6	1428460	1428465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241017
32128	NC_005042	GCA	2	6	1428531	1428536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241017
32129	NC_005042	ATG	3	9	1428558	1428566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241017
32130	NC_005042	ATT	2	6	1428626	1428631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241017
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32132	NC_005042	GAT	2	6	1428723	1428728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241017
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32138	NC_005042	AGC	2	6	1428941	1428946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241018
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32143	NC_005042	G	6	6	1429248	1429253	0 %	0 %	100 %	0 %	33241018
32144	NC_005042	CAG	2	6	1429300	1429305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241018
32145	NC_005042	CAT	2	6	1429323	1429328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241018
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32147	NC_005042	CAATA	2	10	1429405	1429414	60 %	20 %	0 %	20 %	33241018
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32150	NC_005042	CTC	2	6	1429479	1429484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32151	NC_005042	TGG	2	6	1429496	1429501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32152	NC_005042	TCCAAT	2	12	1429544	1429555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32153	NC_005042	TA	3	6	1429645	1429650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32154	NC_005042	A	6	6	1429676	1429681	100 %	0 %	0 %	0 %	33241019
32155	NC_005042	TAA	2	6	1429689	1429694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241019
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32157	NC_005042	AACC	2	8	1429769	1429776	50 %	0 %	0 %	50 %	33241019
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32200	NC_005042	TCT	2	6	1431626	1431631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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32221	NC_005042	AG	3	6	1432394	1432399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32222	NC_005042	GAA	2	6	1432412	1432417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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32224	NC_005042	CA	3	6	1432467	1432472	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32225	NC_005042	ACTA	2	8	1432509	1432516	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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32234	NC_005042	CTT	2	6	1432889	1432894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241023
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32237	NC_005042	TAATT	2	10	1433034	1433043	40 %	60 %	0 %	0 %	33241023
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32239	NC_005042	TTCT	2	8	1433116	1433123	0 %	75 %	0 %	25 %	33241023
32240	NC_005042	ATA	2	6	1433221	1433226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32241	NC_005042	ATC	2	6	1433228	1433233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32242	NC_005042	AAT	2	6	1433239	1433244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32243	NC_005042	TGC	2	6	1433298	1433303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32244	NC_005042	GAC	2	6	1433452	1433457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32245	NC_005042	CAT	2	6	1433462	1433467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32246	NC_005042	AAC	2	6	1433504	1433509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32247	NC_005042	AAG	2	6	1433565	1433570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241024
32248	NC_005042	T	6	6	1433572	1433577	0 %	100 %	0 %	0 %	33241024
32249	NC_005042	GCT	2	6	1433592	1433597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241024
32250	NC_005042	CTT	2	6	1433668	1433673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241024
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32265	NC_005042	AGG	2	6	1434568	1434573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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32267	NC_005042	AAT	2	6	1434600	1434605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32272	NC_005042	AT	3	6	1434863	1434868	50 %	50 %	0 %	0 %	33241025
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32309	NC_005042	AT	3	6	1436970	1436975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32310	NC_005042	ACA	2	6	1437014	1437019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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32357	NC_005042	TA	3	6	1439434	1439439	50 %	50 %	0 %	0 %	33241031
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32365	NC_005042	TCAT	2	8	1439791	1439798	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32366	NC_005042	CTT	2	6	1439815	1439820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32367	NC_005042	CAA	3	9	1439826	1439834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32368	NC_005042	TTA	2	6	1439842	1439847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32369	NC_005042	A	6	6	1439899	1439904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32370	NC_005042	TCT	2	6	1440059	1440064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241032
32371	NC_005042	CCA	2	6	1440118	1440123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33241032
32372	NC_005042	T	6	6	1440150	1440155	0 %	100 %	0 %	0 %	33241032
32373	NC_005042	AAC	2	6	1440208	1440213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241032
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32376	NC_005042	TCCA	2	8	1440315	1440322	25 %	25 %	0 %	50 %	33241032
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32384	NC_005042	TAAA	2	8	1440627	1440634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32385	NC_005042	ATCT	2	8	1440655	1440662	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32386	NC_005042	ACA	3	9	1440705	1440713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241034
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32441	NC_005042	AAG	2	6	1442923	1442928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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32472	NC_005042	CTCC	2	8	1444504	1444511	0 %	25 %	0 %	75 %	33241036
32473	NC_005042	CAA	2	6	1444583	1444588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241036
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32478	NC_005042	TAA	2	6	1444888	1444893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32479	NC_005042	AATT	2	8	1444898	1444905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32480	NC_005042	CATAT	2	10	1444906	1444915	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32481	NC_005042	A	6	6	1444920	1444925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32482	NC_005042	CAAT	2	8	1444927	1444934	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32483	NC_005042	TAA	2	6	1444942	1444947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32484	NC_005042	TCCAA	2	10	1444976	1444985	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
32485	NC_005042	AGAA	2	8	1445036	1445043	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32486	NC_005042	A	6	6	1445053	1445058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32487	NC_005042	TAAAT	2	10	1445087	1445096	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32488	NC_005042	A	6	6	1445130	1445135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32489	NC_005042	TA	3	6	1445153	1445158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32491	NC_005042	ATA	2	6	1445263	1445268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32492	NC_005042	AAG	2	6	1445326	1445331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32493	NC_005042	A	6	6	1445336	1445341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32494	NC_005042	AAT	2	6	1445405	1445410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241038
32495	NC_005042	CAC	2	6	1445417	1445422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33241038
32496	NC_005042	ACC	3	9	1445427	1445435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33241038
32497	NC_005042	TCTT	2	8	1445455	1445462	0 %	75 %	0 %	25 %	33241038
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32499	NC_005042	GTC	2	6	1445491	1445496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241038
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