MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 39235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_005042	CAT	3	9	1399310	1399318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31502	NC_005042	T	8	8	1399318	1399325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31503	NC_005042	CAAA	2	8	1399334	1399341	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31504	NC_005042	TTTA	2	8	1399350	1399357	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31505	NC_005042	TAA	2	6	1399377	1399382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31506	NC_005042	AG	3	6	1399383	1399388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31507	NC_005042	TCT	2	6	1399392	1399397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31508	NC_005042	ATA	2	6	1399530	1399535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31509	NC_005042	A	7	7	1399544	1399550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31510	NC_005042	CTG	2	6	1399616	1399621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31511	NC_005042	TATT	2	8	1399696	1399703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31512	NC_005042	AAT	2	6	1399721	1399726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31513	NC_005042	TTGG	2	8	1399798	1399805	0 %	50 %	50 %	0 %	33240981
31514	NC_005042	AG	3	6	1399835	1399840	50 %	0 %	50 %	0 %	33240981
31515	NC_005042	A	7	7	1399849	1399855	100 %	0 %	0 %	0 %	33240981
31516	NC_005042	TTA	2	6	1399931	1399936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240981
31517	NC_005042	A	7	7	1399950	1399956	100 %	0 %	0 %	0 %	33240981
31518	NC_005042	AAGGA	2	10	1400015	1400024	60 %	0 %	40 %	0 %	33240981
31519	NC_005042	A	6	6	1400027	1400032	100 %	0 %	0 %	0 %	33240981
31520	NC_005042	TTG	2	6	1400046	1400051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31521	NC_005042	TGA	2	6	1400101	1400106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31522	NC_005042	A	7	7	1400119	1400125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31523	NC_005042	AAG	2	6	1400159	1400164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240982
31524	NC_005042	ATT	2	6	1400170	1400175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240982
31525	NC_005042	TTG	2	6	1400205	1400210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240982
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31528	NC_005042	CTTC	2	8	1400262	1400269	0 %	50 %	0 %	50 %	33240982
31529	NC_005042	GGT	2	6	1400289	1400294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33240982
31530	NC_005042	GGT	2	6	1400315	1400320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33240982
31531	NC_005042	TGGCTC	2	12	1400344	1400355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240982
31532	NC_005042	TGA	2	6	1400374	1400379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240982
31533	NC_005042	TGG	2	6	1400463	1400468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33240982
31534	NC_005042	AAT	2	6	1400558	1400563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240982
31535	NC_005042	GAGC	2	8	1400566	1400573	25 %	0 %	50 %	25 %	33240982
31536	NC_005042	TTA	2	6	1400748	1400753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240982
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31538	NC_005042	CTGG	2	8	1400906	1400913	0 %	25 %	50 %	25 %	33240982
31539	NC_005042	AACCCA	2	12	1400918	1400929	50 %	0 %	0 %	50 %	33240982
31540	NC_005042	CTT	2	6	1401032	1401037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240982
31541	NC_005042	CCTAG	2	10	1401062	1401071	20 %	20 %	20 %	40 %	33240982
31542	NC_005042	CAA	2	6	1401170	1401175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240983
31543	NC_005042	ATCC	2	8	1401188	1401195	25 %	25 %	0 %	50 %	33240983
31544	NC_005042	AAT	2	6	1401221	1401226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240983
31545	NC_005042	ATA	2	6	1401249	1401254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240983
31546	NC_005042	AAG	3	9	1401260	1401268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240983
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31548	NC_005042	CATG	2	8	1401354	1401361	25 %	25 %	25 %	25 %	33240983
31549	NC_005042	AT	3	6	1401379	1401384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31550	NC_005042	CTA	2	6	1401402	1401407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31551	NC_005042	AAAT	2	8	1401454	1401461	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31552	NC_005042	AG	3	6	1401518	1401523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31553	NC_005042	CAT	2	6	1401571	1401576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240984
31554	NC_005042	CCA	2	6	1401581	1401586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33240984
31555	NC_005042	ATC	4	12	1401592	1401603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240984
31556	NC_005042	GAA	2	6	1401613	1401618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240984
31557	NC_005042	TTA	2	6	1401733	1401738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31558	NC_005042	ATC	2	6	1401768	1401773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31559	NC_005042	A	8	8	1401790	1401797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31560	NC_005042	GAG	2	6	1401809	1401814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31561	NC_005042	ATCA	2	8	1401852	1401859	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31562	NC_005042	AAAG	2	8	1401877	1401884	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31563	NC_005042	AAAAC	2	10	1401900	1401909	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31564	NC_005042	TAA	2	6	1401948	1401953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31565	NC_005042	AGAA	2	8	1401964	1401971	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31566	NC_005042	TA	3	6	1401999	1402004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31569	NC_005042	T	6	6	1402103	1402108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31574	NC_005042	ATT	2	6	1402228	1402233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240985
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31581	NC_005042	TA	3	6	1402396	1402401	50 %	50 %	0 %	0 %	33240985
31582	NC_005042	GGT	2	6	1402436	1402441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33240985
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31585	NC_005042	TGA	2	6	1402651	1402656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240985
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31596	NC_005042	TAT	2	6	1403004	1403009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240985
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31598	NC_005042	GATA	2	8	1403056	1403063	50 %	25 %	25 %	0 %	33240985
31599	NC_005042	CA	3	6	1403113	1403118	50 %	0 %	0 %	50 %	33240985
31600	NC_005042	AT	3	6	1403131	1403136	50 %	50 %	0 %	0 %	33240985
31601	NC_005042	ATATT	2	10	1403153	1403162	40 %	60 %	0 %	0 %	33240985
31602	NC_005042	TA	3	6	1403185	1403190	50 %	50 %	0 %	0 %	33240985
31603	NC_005042	CCA	2	6	1403245	1403250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33240985
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31606	NC_005042	AT	3	6	1403433	1403438	50 %	50 %	0 %	0 %	33240985
31607	NC_005042	ATTAAA	2	12	1403459	1403470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240985
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31610	NC_005042	TA	4	8	1403535	1403542	50 %	50 %	0 %	0 %	33240985
31611	NC_005042	GCT	2	6	1403558	1403563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240985
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31991	NC_005042	TTC	2	6	1422228	1422233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241010
31992	NC_005042	AAAT	2	8	1422317	1422324	75 %	25 %	0 %	0 %	33241010
31993	NC_005042	AAC	2	6	1422348	1422353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241010
31994	NC_005042	TTTG	2	8	1422480	1422487	0 %	75 %	25 %	0 %	33241010
31995	NC_005042	TGG	2	6	1422510	1422515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241010
31996	NC_005042	GAA	2	6	1422528	1422533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241010
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31998	NC_005042	CTTAA	2	10	1422707	1422716	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31999	NC_005042	AGCGA	2	10	1422752	1422761	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
32000	NC_005042	AC	3	6	1422797	1422802	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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