MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 39235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30501	NC_005042	GAA	2	6	1353628	1353633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30502	NC_005042	GATA	2	8	1353718	1353725	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30503	NC_005042	GCC	2	6	1353746	1353751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30504	NC_005042	AGA	2	6	1353784	1353789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30505	NC_005042	AT	3	6	1353882	1353887	50 %	50 %	0 %	0 %	33240909
30506	NC_005042	CTT	2	6	1353907	1353912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240909
30507	NC_005042	TCT	2	6	1353958	1353963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240909
30508	NC_005042	ATT	2	6	1353974	1353979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240909
30509	NC_005042	TATT	2	8	1354060	1354067	25 %	75 %	0 %	0 %	33240909
30510	NC_005042	AAAT	2	8	1354139	1354146	75 %	25 %	0 %	0 %	33240909
30511	NC_005042	TAA	2	6	1354147	1354152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240909
30512	NC_005042	AGA	2	6	1354220	1354225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240909
30513	NC_005042	T	7	7	1354265	1354271	0 %	100 %	0 %	0 %	33240909
30514	NC_005042	ATT	2	6	1354274	1354279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240909
30515	NC_005042	AGTC	2	8	1354289	1354296	25 %	25 %	25 %	25 %	33240909
30516	NC_005042	TAAT	2	8	1354356	1354363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30517	NC_005042	TC	4	8	1354373	1354380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30518	NC_005042	AGA	2	6	1354387	1354392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30519	NC_005042	GCT	2	6	1354422	1354427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30520	NC_005042	GA	5	10	1354445	1354454	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30521	NC_005042	CTT	2	6	1354455	1354460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30522	NC_005042	ATC	2	6	1354461	1354466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30523	NC_005042	TAA	2	6	1354480	1354485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30524	NC_005042	ACT	2	6	1354508	1354513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30525	NC_005042	T	6	6	1354622	1354627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30526	NC_005042	TA	5	10	1354649	1354658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30527	NC_005042	CAA	2	6	1354690	1354695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30528	NC_005042	CTT	2	6	1354752	1354757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30529	NC_005042	AGCAA	2	10	1354783	1354792	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
30530	NC_005042	GAA	2	6	1354810	1354815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30531	NC_005042	A	8	8	1354814	1354821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30532	NC_005042	AAAG	2	8	1354878	1354885	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30533	NC_005042	GAA	2	6	1354891	1354896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30534	NC_005042	AAT	2	6	1355448	1355453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30535	NC_005042	CTA	2	6	1355486	1355491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30536	NC_005042	TAAA	2	8	1355492	1355499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30537	NC_005042	TTTG	2	8	1355515	1355522	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30538	NC_005042	AGA	2	6	1355547	1355552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30539	NC_005042	CAA	2	6	1355570	1355575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30540	NC_005042	ATA	2	6	1355609	1355614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30541	NC_005042	ATT	2	6	1355648	1355653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30542	NC_005042	AAGC	2	8	1355656	1355663	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30543	NC_005042	AT	3	6	1355689	1355694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30544	NC_005042	T	6	6	1355782	1355787	0 %	100 %	0 %	0 %	33240910
30545	NC_005042	GTT	2	6	1355805	1355810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240910
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30547	NC_005042	T	6	6	1355838	1355843	0 %	100 %	0 %	0 %	33240910
30548	NC_005042	TGATT	2	10	1355890	1355899	20 %	60 %	20 %	0 %	33240910
30549	NC_005042	TACT	2	8	1355938	1355945	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30550	NC_005042	TATT	2	8	1355954	1355961	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30551	NC_005042	ATA	2	6	1355972	1355977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30552	NC_005042	ATA	2	6	1355993	1355998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30553	NC_005042	TTC	2	6	1356051	1356056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30554	NC_005042	TTTAA	2	10	1356090	1356099	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30555	NC_005042	AAGA	2	8	1356236	1356243	75 %	0 %	25 %	0 %	33240911
30556	NC_005042	ATAA	2	8	1356254	1356261	75 %	25 %	0 %	0 %	33240911
30557	NC_005042	T	7	7	1356271	1356277	0 %	100 %	0 %	0 %	33240911
30558	NC_005042	AGT	2	6	1356374	1356379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240911
30559	NC_005042	AGC	2	6	1356427	1356432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240911
30560	NC_005042	TAG	2	6	1356556	1356561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240911
30561	NC_005042	GAT	2	6	1356680	1356685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240911
30562	NC_005042	ATTC	2	8	1356730	1356737	25 %	50 %	0 %	25 %	33240911
30563	NC_005042	AGA	2	6	1356742	1356747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240911
30564	NC_005042	A	6	6	1356808	1356813	100 %	0 %	0 %	0 %	33240911
30565	NC_005042	CAG	2	6	1356843	1356848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240911
30566	NC_005042	TAG	2	6	1356855	1356860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240911
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30571	NC_005042	ATT	2	6	1356948	1356953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240911
30572	NC_005042	TGG	2	6	1356956	1356961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33240911
30573	NC_005042	TGGGCA	2	12	1357027	1357038	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	33240911
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30576	NC_005042	TTTC	2	8	1357148	1357155	0 %	75 %	0 %	25 %	33240912
30577	NC_005042	AGCG	2	8	1357235	1357242	25 %	0 %	50 %	25 %	33240912
30578	NC_005042	ATT	2	6	1357344	1357349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240912
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30585	NC_005042	TCT	2	6	1357724	1357729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240912
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30587	NC_005042	GAA	2	6	1357807	1357812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30588	NC_005042	CTA	2	6	1357871	1357876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240913
30589	NC_005042	AGTC	2	8	1357906	1357913	25 %	25 %	25 %	25 %	33240913
30590	NC_005042	CTAA	2	8	1358018	1358025	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30591	NC_005042	ATTTTT	2	12	1358094	1358105	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30592	NC_005042	T	7	7	1358101	1358107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30593	NC_005042	AAG	2	6	1358123	1358128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30594	NC_005042	TCA	2	6	1358162	1358167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30595	NC_005042	TAT	2	6	1358171	1358176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240914
30596	NC_005042	TTA	2	6	1358177	1358182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240914
30597	NC_005042	CAAA	2	8	1358274	1358281	75 %	0 %	0 %	25 %	33240914
30598	NC_005042	TAA	2	6	1358287	1358292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240914
30599	NC_005042	CCA	2	6	1358328	1358333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33240914
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30601	NC_005042	GTTTA	2	10	1358485	1358494	20 %	60 %	20 %	0 %	33240914
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30603	NC_005042	TC	3	6	1358517	1358522	0 %	50 %	0 %	50 %	33240914
30604	NC_005042	TCC	2	6	1358539	1358544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33240914
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30606	NC_005042	T	9	9	1358563	1358571	0 %	100 %	0 %	0 %	33240914
30607	NC_005042	A	6	6	1358626	1358631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30608	NC_005042	TAA	2	6	1358648	1358653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30609	NC_005042	GA	3	6	1358661	1358666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30610	NC_005042	CTC	2	6	1358744	1358749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30611	NC_005042	TAA	2	6	1358750	1358755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30612	NC_005042	ATT	2	6	1358765	1358770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30613	NC_005042	TTA	2	6	1358779	1358784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30614	NC_005042	TAAA	2	8	1358826	1358833	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30615	NC_005042	CCTCAT	2	12	1358836	1358847	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
30616	NC_005042	T	6	6	1358874	1358879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30617	NC_005042	AAC	2	6	1358909	1358914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30618	NC_005042	TAA	2	6	1358951	1358956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30619	NC_005042	CTTG	2	8	1358979	1358986	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30620	NC_005042	ATA	2	6	1359026	1359031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30621	NC_005042	AG	3	6	1359082	1359087	50 %	0 %	50 %	0 %	33240915
30622	NC_005042	CAC	2	6	1359098	1359103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33240915
30623	NC_005042	TCA	2	6	1359166	1359171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240915
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30625	NC_005042	ATCAA	2	10	1359208	1359217	60 %	20 %	0 %	20 %	33240915
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