MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 39235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_005042	TTTTC	2	10	1262092	1262101	0 %	80 %	0 %	20 %	33240810
28503	NC_005042	CAT	2	6	1262111	1262116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240810
28504	NC_005042	ATC	2	6	1262127	1262132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240810
28505	NC_005042	CT	3	6	1262261	1262266	0 %	50 %	0 %	50 %	33240810
28506	NC_005042	GCC	2	6	1262401	1262406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33240810
28507	NC_005042	AAG	2	6	1262517	1262522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240810
28508	NC_005042	CCT	2	6	1262539	1262544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33240810
28509	NC_005042	TTA	2	6	1262557	1262562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240810
28510	NC_005042	A	6	6	1262727	1262732	100 %	0 %	0 %	0 %	33240810
28511	NC_005042	GATT	2	8	1262746	1262753	25 %	50 %	25 %	0 %	33240810
28512	NC_005042	TTTC	2	8	1262778	1262785	0 %	75 %	0 %	25 %	33240810
28513	NC_005042	TCC	2	6	1262793	1262798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33240810
28514	NC_005042	CAAAA	2	10	1262805	1262814	80 %	0 %	0 %	20 %	33240810
28515	NC_005042	CTT	2	6	1262834	1262839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240810
28516	NC_005042	CTA	2	6	1262866	1262871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240810
28517	NC_005042	TCTG	2	8	1262924	1262931	0 %	50 %	25 %	25 %	33240810
28518	NC_005042	CTT	2	6	1262972	1262977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240810
28519	NC_005042	AGA	2	6	1262991	1262996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240810
28520	NC_005042	AAT	2	6	1262999	1263004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240810
28521	NC_005042	AGC	2	6	1263027	1263032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240810
28522	NC_005042	CT	3	6	1263072	1263077	0 %	50 %	0 %	50 %	33240810
28523	NC_005042	CCT	2	6	1263217	1263222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33240810
28524	NC_005042	TGTT	2	8	1263253	1263260	0 %	75 %	25 %	0 %	33240810
28525	NC_005042	GAG	2	6	1263332	1263337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33240810
28526	NC_005042	GAA	2	6	1263357	1263362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240810
28527	NC_005042	AGA	2	6	1263384	1263389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240810
28528	NC_005042	GATC	2	8	1263416	1263423	25 %	25 %	25 %	25 %	33240810
28529	NC_005042	AAAC	2	8	1263454	1263461	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28530	NC_005042	ATG	2	6	1263536	1263541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240811
28531	NC_005042	CAAC	2	8	1263546	1263553	50 %	0 %	0 %	50 %	33240811
28532	NC_005042	AAT	2	6	1263575	1263580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240811
28533	NC_005042	AAG	2	6	1263589	1263594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240811
28534	NC_005042	CT	3	6	1263620	1263625	0 %	50 %	0 %	50 %	33240811
28535	NC_005042	GAA	2	6	1263690	1263695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240811
28536	NC_005042	TGCAA	2	10	1263796	1263805	40 %	20 %	20 %	20 %	33240811
28537	NC_005042	GA	3	6	1263874	1263879	50 %	0 %	50 %	0 %	33240811
28538	NC_005042	GAG	2	6	1263927	1263932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33240811
28539	NC_005042	T	6	6	1263945	1263950	0 %	100 %	0 %	0 %	33240811
28540	NC_005042	GGA	2	6	1263971	1263976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33240811
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28542	NC_005042	CAG	2	6	1264077	1264082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240811
28543	NC_005042	T	6	6	1264085	1264090	0 %	100 %	0 %	0 %	33240811
28544	NC_005042	TGT	2	6	1264168	1264173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240811
28545	NC_005042	ACA	2	6	1264179	1264184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240811
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28547	NC_005042	GAA	2	6	1264268	1264273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240811
28548	NC_005042	GATG	2	8	1264282	1264289	25 %	25 %	50 %	0 %	33240811
28549	NC_005042	CGTG	2	8	1264297	1264304	0 %	25 %	50 %	25 %	33240811
28550	NC_005042	CAG	2	6	1264419	1264424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240811
28551	NC_005042	CTT	2	6	1264463	1264468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240811
28552	NC_005042	A	7	7	1264470	1264476	100 %	0 %	0 %	0 %	33240811
28553	NC_005042	GAA	2	6	1264592	1264597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240811
28554	NC_005042	AT	4	8	1264606	1264613	50 %	50 %	0 %	0 %	33240811
28555	NC_005042	AGA	2	6	1264618	1264623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240811
28556	NC_005042	TAAA	2	8	1264634	1264641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28557	NC_005042	T	6	6	1264672	1264677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28561	NC_005042	CAT	2	6	1264973	1264978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240812
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28568	NC_005042	T	6	6	1265340	1265345	0 %	100 %	0 %	0 %	33240812
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28572	NC_005042	TCA	2	6	1265480	1265485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240812
28573	NC_005042	ACTTGA	2	12	1265488	1265499	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33240812
28574	NC_005042	CTG	2	6	1265519	1265524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240812
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28578	NC_005042	TGA	2	6	1265616	1265621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240812
28579	NC_005042	T	6	6	1265627	1265632	0 %	100 %	0 %	0 %	33240812
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28588	NC_005042	CAA	2	6	1265986	1265991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240813
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28593	NC_005042	TGT	2	6	1266210	1266215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240813
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28603	NC_005042	GAG	2	6	1266598	1266603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33240813
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28605	NC_005042	GCA	2	6	1266655	1266660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240813
28606	NC_005042	AAGC	2	8	1266734	1266741	50 %	0 %	25 %	25 %	33240813
28607	NC_005042	TTAA	2	8	1266747	1266754	50 %	50 %	0 %	0 %	33240813
28608	NC_005042	TTA	2	6	1266844	1266849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240813
28609	NC_005042	TC	3	6	1266868	1266873	0 %	50 %	0 %	50 %	33240813
28610	NC_005042	T	7	7	1266874	1266880	0 %	100 %	0 %	0 %	33240813
28611	NC_005042	A	7	7	1266929	1266935	100 %	0 %	0 %	0 %	33240813
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28615	NC_005042	CTT	2	6	1267219	1267224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240813
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28617	NC_005042	CTT	2	6	1267391	1267396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240814
28618	NC_005042	CAA	2	6	1267418	1267423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240814
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28984	NC_005042	GAATT	2	10	1283994	1284003	40 %	40 %	20 %	0 %	33240828
28985	NC_005042	AGAACA	2	12	1284111	1284122	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	33240828
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28987	NC_005042	A	6	6	1284156	1284161	100 %	0 %	0 %	0 %	33240828
28988	NC_005042	AAT	2	6	1284263	1284268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28989	NC_005042	T	6	6	1284272	1284277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28990	NC_005042	AACT	2	8	1284284	1284291	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28991	NC_005042	GGA	2	6	1284337	1284342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33240829
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