MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 39235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_005042	ATT	3	9	1129261	1129269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25502	NC_005042	AAT	2	6	1129292	1129297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25503	NC_005042	T	6	6	1129347	1129352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25504	NC_005042	CCA	2	6	1129409	1129414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25505	NC_005042	TACT	2	8	1129436	1129443	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25506	NC_005042	TTTA	2	8	1129446	1129453	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25507	NC_005042	TCA	2	6	1129549	1129554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240676
25508	NC_005042	GCT	3	9	1129579	1129587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240676
25509	NC_005042	TTC	2	6	1129593	1129598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240676
25510	NC_005042	TTC	2	6	1129600	1129605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240676
25511	NC_005042	CAA	2	6	1129613	1129618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240676
25512	NC_005042	AT	3	6	1129648	1129653	50 %	50 %	0 %	0 %	33240676
25513	NC_005042	TTCCA	2	10	1129707	1129716	20 %	40 %	0 %	40 %	33240676
25514	NC_005042	AAC	2	6	1129734	1129739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240676
25515	NC_005042	AAG	2	6	1129744	1129749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240676
25516	NC_005042	T	8	8	1129760	1129767	0 %	100 %	0 %	0 %	33240676
25517	NC_005042	AAT	2	6	1129790	1129795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25518	NC_005042	TATT	2	8	1129804	1129811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25519	NC_005042	AACTAT	2	12	1129849	1129860	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25520	NC_005042	AG	3	6	1129950	1129955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25521	NC_005042	TCAA	2	8	1129976	1129983	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25522	NC_005042	CAT	2	6	1129986	1129991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25523	NC_005042	AG	3	6	1130029	1130034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25524	NC_005042	CTG	2	6	1130056	1130061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25525	NC_005042	ACA	2	6	1130076	1130081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25526	NC_005042	TCA	2	6	1130118	1130123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25527	NC_005042	AAC	2	6	1130177	1130182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25528	NC_005042	CAA	2	6	1130279	1130284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25529	NC_005042	GCTTT	2	10	1130307	1130316	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
25530	NC_005042	AAT	2	6	1130336	1130341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25531	NC_005042	GTT	2	6	1130368	1130373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25532	NC_005042	TC	3	6	1130457	1130462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25533	NC_005042	ACA	2	6	1130523	1130528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25534	NC_005042	CCT	2	6	1130532	1130537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25535	NC_005042	TTG	2	6	1130602	1130607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25536	NC_005042	AAG	2	6	1130661	1130666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25537	NC_005042	A	6	6	1130681	1130686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25538	NC_005042	ATT	2	6	1130789	1130794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25539	NC_005042	GTT	2	6	1130826	1130831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240678
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25541	NC_005042	AATA	2	8	1130984	1130991	75 %	25 %	0 %	0 %	33240678
25542	NC_005042	TC	3	6	1131022	1131027	0 %	50 %	0 %	50 %	33240678
25543	NC_005042	TTGG	2	8	1131040	1131047	0 %	50 %	50 %	0 %	33240678
25544	NC_005042	ATT	2	6	1131064	1131069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25545	NC_005042	AAG	2	6	1131090	1131095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25546	NC_005042	AT	3	6	1131153	1131158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25547	NC_005042	TTA	2	6	1131300	1131305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25548	NC_005042	GAG	2	6	1131329	1131334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25549	NC_005042	TTG	2	6	1131379	1131384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240679
25550	NC_005042	CTTA	2	8	1131542	1131549	25 %	50 %	0 %	25 %	33240679
25551	NC_005042	GAT	2	6	1131561	1131566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240679
25552	NC_005042	AGA	2	6	1131575	1131580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240679
25553	NC_005042	TTCTC	2	10	1131588	1131597	0 %	60 %	0 %	40 %	33240679
25554	NC_005042	CAAA	2	8	1131745	1131752	75 %	0 %	0 %	25 %	33240679
25555	NC_005042	TCTT	2	8	1131787	1131794	0 %	75 %	0 %	25 %	33240679
25556	NC_005042	TTCCT	2	10	1131805	1131814	0 %	60 %	0 %	40 %	33240679
25557	NC_005042	AAG	2	6	1131865	1131870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240679
25558	NC_005042	CAAT	2	8	1131877	1131884	50 %	25 %	0 %	25 %	33240679
25559	NC_005042	TGC	2	6	1131989	1131994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240679
25560	NC_005042	AATGC	2	10	1132023	1132032	40 %	20 %	20 %	20 %	33240679
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25563	NC_005042	A	8	8	1132242	1132249	100 %	0 %	0 %	0 %	33240679
25564	NC_005042	TTAA	2	8	1132250	1132257	50 %	50 %	0 %	0 %	33240679
25565	NC_005042	ATA	2	6	1132326	1132331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25566	NC_005042	AAG	2	6	1132340	1132345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25567	NC_005042	ATA	2	6	1132380	1132385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25568	NC_005042	TAT	2	6	1132401	1132406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25569	NC_005042	AAAAAG	2	12	1132421	1132432	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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25574	NC_005042	TAA	3	9	1132685	1132693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240680
25575	NC_005042	TAAT	2	8	1132718	1132725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25577	NC_005042	TAT	2	6	1132831	1132836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25578	NC_005042	AAT	2	6	1132982	1132987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25579	NC_005042	ATTG	2	8	1133263	1133270	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25580	NC_005042	T	6	6	1133276	1133281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25581	NC_005042	TA	3	6	1133287	1133292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25599	NC_005042	GTAA	2	8	1134118	1134125	50 %	25 %	25 %	0 %	33240682
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25601	NC_005042	TGTA	2	8	1134174	1134181	25 %	50 %	25 %	0 %	33240682
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25606	NC_005042	AATT	2	8	1134369	1134376	50 %	50 %	0 %	0 %	33240682
25607	NC_005042	ACT	2	6	1134411	1134416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240682
25608	NC_005042	T	6	6	1134442	1134447	0 %	100 %	0 %	0 %	33240682
25609	NC_005042	AAAG	2	8	1134463	1134470	75 %	0 %	25 %	0 %	33240682
25610	NC_005042	TCTT	2	8	1134543	1134550	0 %	75 %	0 %	25 %	33240682
25611	NC_005042	CAAG	2	8	1134554	1134561	50 %	0 %	25 %	25 %	33240682
25612	NC_005042	CTT	2	6	1134568	1134573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240682
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25619	NC_005042	CAA	2	6	1135202	1135207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25620	NC_005042	A	8	8	1135242	1135249	100 %	0 %	0 %	0 %	33240683
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25986	NC_005042	GCA	2	6	1151500	1151505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240700
25987	NC_005042	TTG	2	6	1151519	1151524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240700
25988	NC_005042	AGC	2	6	1151535	1151540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240700
25989	NC_005042	CAG	2	6	1151569	1151574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240700
25990	NC_005042	T	7	7	1151631	1151637	0 %	100 %	0 %	0 %	33240700
25991	NC_005042	ATT	2	6	1151640	1151645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240700
25992	NC_005042	ATTA	2	8	1151658	1151665	50 %	50 %	0 %	0 %	33240700
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25998	NC_005042	CAA	2	6	1151819	1151824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240700
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