MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 39235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24502	NC_005042	GTTT	2	8	1085514	1085521	0 %	75 %	25 %	0 %	33240605
24503	NC_005042	AAT	2	6	1085677	1085682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240605
24504	NC_005042	AAT	2	6	1085692	1085697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240605
24505	NC_005042	TGC	2	6	1085718	1085723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240605
24506	NC_005042	TTA	2	6	1085729	1085734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240605
24507	NC_005042	TAA	2	6	1085788	1085793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240605
24508	NC_005042	AGTTAA	2	12	1085794	1085805	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	33240605
24509	NC_005042	TAA	2	6	1085809	1085814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240605
24510	NC_005042	TAATT	2	10	1085820	1085829	40 %	60 %	0 %	0 %	33240606
24511	NC_005042	T	6	6	1085840	1085845	0 %	100 %	0 %	0 %	33240606
24512	NC_005042	TAT	2	6	1085851	1085856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240606
24513	NC_005042	AAGGAA	2	12	1085869	1085880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240606
24514	NC_005042	CGA	2	6	1085964	1085969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240606
24515	NC_005042	GA	3	6	1086137	1086142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24516	NC_005042	ACA	2	6	1086152	1086157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24517	NC_005042	ATTA	2	8	1086198	1086205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24518	NC_005042	TAG	2	6	1086207	1086212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24519	NC_005042	AG	3	6	1086250	1086255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24520	NC_005042	AAT	2	6	1086266	1086271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24521	NC_005042	TA	3	6	1086287	1086292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24522	NC_005042	AT	3	6	1086329	1086334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24523	NC_005042	TAA	2	6	1086439	1086444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24524	NC_005042	TA	3	6	1086457	1086462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24525	NC_005042	ATAA	2	8	1086471	1086478	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24526	NC_005042	AAG	2	6	1086496	1086501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24527	NC_005042	AAT	2	6	1086512	1086517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24528	NC_005042	GTA	2	6	1086548	1086553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240607
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24530	NC_005042	TAA	2	6	1086622	1086627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240607
24531	NC_005042	CTG	2	6	1086642	1086647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240607
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24533	NC_005042	AACT	2	8	1086681	1086688	50 %	25 %	0 %	25 %	33240607
24534	NC_005042	CTT	2	6	1086703	1086708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240607
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24536	NC_005042	A	6	6	1086738	1086743	100 %	0 %	0 %	0 %	33240607
24537	NC_005042	TTC	2	6	1086757	1086762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240607
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24541	NC_005042	CTG	3	9	1086936	1086944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240607
24542	NC_005042	TTA	2	6	1087094	1087099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240607
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24545	NC_005042	TGC	2	6	1087225	1087230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240607
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24547	NC_005042	TGC	2	6	1087300	1087305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240607
24548	NC_005042	TAG	2	6	1087333	1087338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240607
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24553	NC_005042	ATT	2	6	1087444	1087449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240608
24554	NC_005042	AATC	2	8	1087457	1087464	50 %	25 %	0 %	25 %	33240608
24555	NC_005042	TAA	2	6	1087472	1087477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240608
24556	NC_005042	A	7	7	1087500	1087506	100 %	0 %	0 %	0 %	33240608
24557	NC_005042	TTCT	2	8	1087511	1087518	0 %	75 %	0 %	25 %	33240608
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24561	NC_005042	ATT	2	6	1087582	1087587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24562	NC_005042	TTTG	2	8	1087696	1087703	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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24573	NC_005042	TA	4	8	1088037	1088044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24574	NC_005042	ATCA	2	8	1088090	1088097	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24575	NC_005042	AGC	2	6	1088137	1088142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240610
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24578	NC_005042	TTA	2	6	1088194	1088199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240610
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24580	NC_005042	AACG	2	8	1088282	1088289	50 %	0 %	25 %	25 %	33240610
24581	NC_005042	AT	3	6	1088388	1088393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24583	NC_005042	AAT	2	6	1088422	1088427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24589	NC_005042	AGA	2	6	1088812	1088817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240611
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24592	NC_005042	TTC	2	6	1088961	1088966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240611
24593	NC_005042	TGA	2	6	1088980	1088985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240611
24594	NC_005042	ATA	2	6	1089049	1089054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24595	NC_005042	A	6	6	1089075	1089080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24596	NC_005042	CAGG	2	8	1089084	1089091	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24597	NC_005042	TTGA	2	8	1089097	1089104	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24598	NC_005042	TGA	2	6	1089138	1089143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240612
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24601	NC_005042	GATT	2	8	1089258	1089265	25 %	50 %	25 %	0 %	33240612
24602	NC_005042	GCT	2	6	1089283	1089288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240612
24603	NC_005042	GAA	2	6	1089516	1089521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24604	NC_005042	AGT	2	6	1089524	1089529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24605	NC_005042	ACC	2	6	1089570	1089575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24606	NC_005042	AGA	2	6	1089628	1089633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240613
24607	NC_005042	TA	3	6	1089653	1089658	50 %	50 %	0 %	0 %	33240613
24608	NC_005042	CTT	2	6	1089764	1089769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240613
24609	NC_005042	A	6	6	1089785	1089790	100 %	0 %	0 %	0 %	33240613
24610	NC_005042	TGA	2	6	1089805	1089810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240613
24611	NC_005042	TCTA	2	8	1089841	1089848	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24612	NC_005042	AT	3	6	1089852	1089857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24613	NC_005042	ACA	2	6	1089983	1089988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240614
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24616	NC_005042	TTG	2	6	1090051	1090056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240614
24617	NC_005042	TTC	2	6	1090072	1090077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240614
24618	NC_005042	TGA	2	6	1090108	1090113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240614
24619	NC_005042	T	6	6	1090138	1090143	0 %	100 %	0 %	0 %	33240614
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24622	NC_005042	TCA	2	6	1090277	1090282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240614
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24993	NC_005042	T	6	6	1106876	1106881	0 %	100 %	0 %	0 %	33240643
24994	NC_005042	TTTTA	2	10	1106895	1106904	20 %	80 %	0 %	0 %	33240643
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24996	NC_005042	A	6	6	1107014	1107019	100 %	0 %	0 %	0 %	33240643
24997	NC_005042	AAACA	2	10	1107033	1107042	80 %	0 %	0 %	20 %	33240643
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