MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 39235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_005042	CAAG	2	8	1062028	1062035	50 %	0 %	25 %	25 %	33240582
24002	NC_005042	AGG	2	6	1062069	1062074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33240582
24003	NC_005042	AAGA	2	8	1062137	1062144	75 %	0 %	25 %	0 %	33240582
24004	NC_005042	TAA	2	6	1062179	1062184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24005	NC_005042	CTAATA	2	12	1062256	1062267	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24006	NC_005042	TCT	2	6	1062268	1062273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24007	NC_005042	AAT	2	6	1062282	1062287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240583
24008	NC_005042	CTTCA	2	10	1062316	1062325	20 %	40 %	0 %	40 %	33240583
24009	NC_005042	TTGCT	2	10	1062376	1062385	0 %	60 %	20 %	20 %	33240583
24010	NC_005042	TGC	2	6	1062394	1062399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240583
24011	NC_005042	TCCA	2	8	1062442	1062449	25 %	25 %	0 %	50 %	33240583
24012	NC_005042	TACC	2	8	1062450	1062457	25 %	25 %	0 %	50 %	33240583
24013	NC_005042	AATT	2	8	1062564	1062571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24014	NC_005042	TGA	2	6	1062615	1062620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240584
24015	NC_005042	T	6	6	1062621	1062626	0 %	100 %	0 %	0 %	33240584
24016	NC_005042	AGC	3	9	1062669	1062677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240584
24017	NC_005042	A	6	6	1062710	1062715	100 %	0 %	0 %	0 %	33240584
24018	NC_005042	TCAA	2	8	1062793	1062800	50 %	25 %	0 %	25 %	33240584
24019	NC_005042	T	7	7	1062805	1062811	0 %	100 %	0 %	0 %	33240584
24020	NC_005042	CAGTTG	2	12	1062911	1062922	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	33240584
24021	NC_005042	ACTT	2	8	1062942	1062949	25 %	50 %	0 %	25 %	33240584
24022	NC_005042	ACTA	2	8	1062996	1063003	50 %	25 %	0 %	25 %	33240584
24023	NC_005042	TC	3	6	1063028	1063033	0 %	50 %	0 %	50 %	33240584
24024	NC_005042	CAT	2	6	1063070	1063075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240584
24025	NC_005042	TCT	2	6	1063081	1063086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240584
24026	NC_005042	AGTCA	2	10	1063089	1063098	40 %	20 %	20 %	20 %	33240584
24027	NC_005042	CAA	2	6	1063193	1063198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240584
24028	NC_005042	TGA	2	6	1063234	1063239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240584
24029	NC_005042	CTA	2	6	1063271	1063276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240584
24030	NC_005042	TTA	2	6	1063282	1063287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240584
24031	NC_005042	AAC	2	6	1063293	1063298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240584
24032	NC_005042	AACC	2	8	1063317	1063324	50 %	0 %	0 %	50 %	33240584
24033	NC_005042	TTC	2	6	1063341	1063346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240584
24034	NC_005042	A	7	7	1063392	1063398	100 %	0 %	0 %	0 %	33240584
24035	NC_005042	TCT	2	6	1063410	1063415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240584
24036	NC_005042	CTC	2	6	1063440	1063445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33240584
24037	NC_005042	AGC	2	6	1063449	1063454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240584
24038	NC_005042	TA	3	6	1063644	1063649	50 %	50 %	0 %	0 %	33240584
24039	NC_005042	CTG	2	6	1063685	1063690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240584
24040	NC_005042	CTT	2	6	1063732	1063737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240584
24041	NC_005042	GAG	2	6	1063892	1063897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33240584
24042	NC_005042	AAT	2	6	1063959	1063964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240584
24043	NC_005042	TCC	2	6	1063977	1063982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33240584
24044	NC_005042	TAAT	3	12	1064200	1064211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24045	NC_005042	TCC	2	6	1064296	1064301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33240585
24046	NC_005042	AGA	3	9	1064345	1064353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240585
24047	NC_005042	CTT	2	6	1064466	1064471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240585
24048	NC_005042	TCT	2	6	1064474	1064479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240585
24049	NC_005042	ATG	2	6	1064482	1064487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240585
24050	NC_005042	AGC	2	6	1064567	1064572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240585
24051	NC_005042	TAA	2	6	1064635	1064640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240585
24052	NC_005042	AGA	2	6	1064657	1064662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240585
24053	NC_005042	TTA	2	6	1064825	1064830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240585
24054	NC_005042	TGCA	2	8	1064899	1064906	25 %	25 %	25 %	25 %	33240585
24055	NC_005042	AT	3	6	1064928	1064933	50 %	50 %	0 %	0 %	33240585
24056	NC_005042	A	6	6	1064948	1064953	100 %	0 %	0 %	0 %	33240585
24057	NC_005042	T	6	6	1064964	1064969	0 %	100 %	0 %	0 %	33240585
24058	NC_005042	TAAA	2	8	1065085	1065092	75 %	25 %	0 %	0 %	33240585
24059	NC_005042	TAA	2	6	1065131	1065136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240585
24060	NC_005042	CAA	2	6	1065147	1065152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240585
24061	NC_005042	TAA	2	6	1065161	1065166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240585
24062	NC_005042	A	6	6	1065165	1065170	100 %	0 %	0 %	0 %	33240585
24063	NC_005042	GCA	2	6	1065192	1065197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240585
24064	NC_005042	AGGA	2	8	1065233	1065240	50 %	0 %	50 %	0 %	33240585
24065	NC_005042	TGG	2	6	1065324	1065329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33240585
24066	NC_005042	CCTT	2	8	1065339	1065346	0 %	50 %	0 %	50 %	33240585
24067	NC_005042	AGG	2	6	1065467	1065472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33240585
24068	NC_005042	GCAA	2	8	1065495	1065502	50 %	0 %	25 %	25 %	33240585
24069	NC_005042	A	8	8	1065571	1065578	100 %	0 %	0 %	0 %	33240585
24070	NC_005042	TC	3	6	1065620	1065625	0 %	50 %	0 %	50 %	33240585
24071	NC_005042	AAC	2	6	1065662	1065667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240585
24072	NC_005042	AAAG	2	8	1065681	1065688	75 %	0 %	25 %	0 %	33240585
24073	NC_005042	AATA	2	8	1065689	1065696	75 %	25 %	0 %	0 %	33240585
24074	NC_005042	GAA	3	9	1065777	1065785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240585
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24077	NC_005042	GAA	2	6	1065980	1065985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240586
24078	NC_005042	AGAAA	2	10	1065989	1065998	80 %	0 %	20 %	0 %	33240586
24079	NC_005042	AG	3	6	1066006	1066011	50 %	0 %	50 %	0 %	33240586
24080	NC_005042	TCA	2	6	1066014	1066019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240586
24081	NC_005042	T	7	7	1066100	1066106	0 %	100 %	0 %	0 %	33240586
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24085	NC_005042	TTC	2	6	1066301	1066306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240586
24086	NC_005042	AAC	2	6	1066310	1066315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240586
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24088	NC_005042	GGA	2	6	1066386	1066391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33240586
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24091	NC_005042	A	6	6	1066452	1066457	100 %	0 %	0 %	0 %	33240586
24092	NC_005042	AGG	2	6	1066535	1066540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33240586
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24102	NC_005042	GTG	2	6	1067079	1067084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33240587
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24104	NC_005042	GAG	2	6	1067148	1067153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33240587
24105	NC_005042	ACTA	2	8	1067275	1067282	50 %	25 %	0 %	25 %	33240587
24106	NC_005042	TCA	2	6	1067327	1067332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240587
24107	NC_005042	CAG	2	6	1067424	1067429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240587
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24109	NC_005042	AGAA	2	8	1067521	1067528	75 %	0 %	25 %	0 %	33240587
24110	NC_005042	TC	3	6	1067555	1067560	0 %	50 %	0 %	50 %	33240587
24111	NC_005042	CTC	2	6	1067577	1067582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33240587
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24120	NC_005042	AAC	2	6	1067884	1067889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240587
24121	NC_005042	CTC	2	6	1067952	1067957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33240587
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24233	NC_005042	TGT	2	6	1073065	1073070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240591
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24240	NC_005042	A	6	6	1073285	1073290	100 %	0 %	0 %	0 %	33240591
24241	NC_005042	TTA	3	9	1073296	1073304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240591
24242	NC_005042	TCT	2	6	1073317	1073322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240591
24243	NC_005042	AGC	2	6	1073496	1073501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240592
24244	NC_005042	AAT	2	6	1073506	1073511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240592
24245	NC_005042	AGT	2	6	1073554	1073559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240592
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24247	NC_005042	TCA	2	6	1073639	1073644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240593
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24290	NC_005042	A	7	7	1075878	1075884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24291	NC_005042	AGA	2	6	1075922	1075927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24481	NC_005042	ATC	2	6	1084443	1084448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240604
24482	NC_005042	GCA	2	6	1084471	1084476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240604
24483	NC_005042	CTG	2	6	1084502	1084507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240604
24484	NC_005042	GCAA	2	8	1084516	1084523	50 %	0 %	25 %	25 %	33240604
24485	NC_005042	TAT	2	6	1084533	1084538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240604
24486	NC_005042	TCT	2	6	1084539	1084544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240604
24487	NC_005042	GA	3	6	1084549	1084554	50 %	0 %	50 %	0 %	33240604
24488	NC_005042	AAG	2	6	1084577	1084582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240605
24489	NC_005042	TGG	2	6	1084583	1084588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33240605
24490	NC_005042	TGG	2	6	1084651	1084656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33240605
24491	NC_005042	TCTT	2	8	1084690	1084697	0 %	75 %	0 %	25 %	33240605
24492	NC_005042	GCT	3	9	1084730	1084738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240605
24493	NC_005042	CTG	2	6	1084836	1084841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240605
24494	NC_005042	GCT	2	6	1084907	1084912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240605
24495	NC_005042	AGTA	2	8	1085014	1085021	50 %	25 %	25 %	0 %	33240605
24496	NC_005042	ATC	2	6	1085044	1085049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240605
24497	NC_005042	TAA	2	6	1085122	1085127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240605
24498	NC_005042	TATAAT	2	12	1085239	1085250	50 %	50 %	0 %	0 %	33240605
24499	NC_005042	GGT	2	6	1085315	1085320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33240605
24500	NC_005042	AGA	2	6	1085338	1085343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240605

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