MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 39235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_005042	TCA	2	6	1017474	1017479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240542
23003	NC_005042	AGA	2	6	1017507	1017512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240542
23004	NC_005042	TAG	2	6	1017540	1017545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240542
23005	NC_005042	CT	3	6	1017555	1017560	0 %	50 %	0 %	50 %	33240542
23006	NC_005042	TGA	2	6	1017714	1017719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240542
23007	NC_005042	AAG	2	6	1017727	1017732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240542
23008	NC_005042	AAC	2	6	1017754	1017759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240542
23009	NC_005042	AAG	2	6	1017767	1017772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240542
23010	NC_005042	ATC	2	6	1017944	1017949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240542
23011	NC_005042	GAT	2	6	1018045	1018050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240542
23012	NC_005042	TGG	2	6	1018066	1018071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33240542
23013	NC_005042	ATTGG	2	10	1018091	1018100	20 %	40 %	40 %	0 %	33240542
23014	NC_005042	CAT	2	6	1018183	1018188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240542
23015	NC_005042	AGG	2	6	1018275	1018280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33240542
23016	NC_005042	TTA	2	6	1018295	1018300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240542
23017	NC_005042	TTTA	2	8	1018359	1018366	25 %	75 %	0 %	0 %	33240542
23018	NC_005042	GAA	2	6	1018369	1018374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240542
23019	NC_005042	CAC	2	6	1018376	1018381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33240542
23020	NC_005042	ACT	2	6	1018407	1018412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240542
23021	NC_005042	AGG	2	6	1018416	1018421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33240542
23022	NC_005042	AAT	2	6	1018434	1018439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240543
23023	NC_005042	TAA	2	6	1018486	1018491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240543
23024	NC_005042	AAC	2	6	1018493	1018498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240543
23025	NC_005042	TCA	2	6	1018512	1018517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240543
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23027	NC_005042	AT	3	6	1018572	1018577	50 %	50 %	0 %	0 %	33240543
23028	NC_005042	TAA	2	6	1018631	1018636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240543
23029	NC_005042	GTGG	2	8	1018660	1018667	0 %	25 %	75 %	0 %	33240543
23030	NC_005042	ATAA	2	8	1018668	1018675	75 %	25 %	0 %	0 %	33240543
23031	NC_005042	TTC	2	6	1018693	1018698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240543
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23033	NC_005042	A	6	6	1018788	1018793	100 %	0 %	0 %	0 %	33240543
23034	NC_005042	ATCC	2	8	1018959	1018966	25 %	25 %	0 %	50 %	33240543
23035	NC_005042	CTA	2	6	1019005	1019010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240543
23036	NC_005042	GAC	2	6	1019011	1019016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240543
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23038	NC_005042	CAA	2	6	1019031	1019036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240543
23039	NC_005042	GAA	2	6	1019055	1019060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240543
23040	NC_005042	AAATT	2	10	1019065	1019074	60 %	40 %	0 %	0 %	33240543
23041	NC_005042	A	8	8	1019142	1019149	100 %	0 %	0 %	0 %	33240543
23042	NC_005042	AAAG	2	8	1019235	1019242	75 %	0 %	25 %	0 %	33240543
23043	NC_005042	AAG	2	6	1019314	1019319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240543
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23051	NC_005042	AAG	2	6	1019563	1019568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240543
23052	NC_005042	AGA	2	6	1019676	1019681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240543
23053	NC_005042	AATC	2	8	1019727	1019734	50 %	25 %	0 %	25 %	33240543
23054	NC_005042	GTG	2	6	1019779	1019784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33240543
23055	NC_005042	AATC	2	8	1019787	1019794	50 %	25 %	0 %	25 %	33240543
23056	NC_005042	GTA	2	6	1019826	1019831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240543
23057	NC_005042	CAAAA	2	10	1019844	1019853	80 %	0 %	0 %	20 %	33240543
23058	NC_005042	A	6	6	1019850	1019855	100 %	0 %	0 %	0 %	33240543
23059	NC_005042	ACT	2	6	1019892	1019897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240543
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23062	NC_005042	AGA	2	6	1020063	1020068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240543
23063	NC_005042	CAA	2	6	1020210	1020215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23064	NC_005042	TTC	2	6	1020328	1020333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240544
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23067	NC_005042	GA	3	6	1020547	1020552	50 %	0 %	50 %	0 %	33240544
23068	NC_005042	CAG	2	6	1020588	1020593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240544
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23073	NC_005042	AT	3	6	1020773	1020778	50 %	50 %	0 %	0 %	33240544
23074	NC_005042	TC	3	6	1020863	1020868	0 %	50 %	0 %	50 %	33240544
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23079	NC_005042	AG	4	8	1021268	1021275	50 %	0 %	50 %	0 %	33240544
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23083	NC_005042	CCTA	2	8	1021482	1021489	25 %	25 %	0 %	50 %	33240544
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23091	NC_005042	AG	3	6	1021663	1021668	50 %	0 %	50 %	0 %	33240544
23092	NC_005042	TTA	2	6	1021736	1021741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240544
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23105	NC_005042	TAA	2	6	1022506	1022511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240546
23106	NC_005042	TAAA	2	8	1022536	1022543	75 %	25 %	0 %	0 %	33240546
23107	NC_005042	A	6	6	1022602	1022607	100 %	0 %	0 %	0 %	33240546
23108	NC_005042	CAACT	2	10	1022644	1022653	40 %	20 %	0 %	40 %	33240546
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23111	NC_005042	T	6	6	1022805	1022810	0 %	100 %	0 %	0 %	33240546
23112	NC_005042	TTGC	2	8	1022832	1022839	0 %	50 %	25 %	25 %	33240546
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23118	NC_005042	A	6	6	1023019	1023024	100 %	0 %	0 %	0 %	33240546
23119	NC_005042	AGC	2	6	1023071	1023076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240546
23120	NC_005042	AAT	2	6	1023087	1023092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240546
23121	NC_005042	G	6	6	1023096	1023101	0 %	0 %	100 %	0 %	33240546
23122	NC_005042	CAG	2	6	1023205	1023210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240546
23123	NC_005042	TGG	2	6	1023269	1023274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33240546
23124	NC_005042	TAT	2	6	1023343	1023348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240546
23125	NC_005042	CAA	2	6	1023403	1023408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240546
23126	NC_005042	GGT	2	6	1023450	1023455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33240546
23127	NC_005042	TAC	2	6	1023572	1023577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240546
23128	NC_005042	TTG	2	6	1023586	1023591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240546
23129	NC_005042	AGT	2	6	1023612	1023617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240546
23130	NC_005042	AATT	2	8	1023625	1023632	50 %	50 %	0 %	0 %	33240546
23131	NC_005042	CTA	2	6	1023699	1023704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240546
23132	NC_005042	GAA	2	6	1023765	1023770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240546
23133	NC_005042	AAC	2	6	1023786	1023791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240546
23134	NC_005042	AGC	2	6	1023818	1023823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240546
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23136	NC_005042	GGT	2	6	1023909	1023914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33240546
23137	NC_005042	TGA	2	6	1023974	1023979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240546
23138	NC_005042	GCT	2	6	1024011	1024016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240546
23139	NC_005042	AAC	2	6	1024052	1024057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240546
23140	NC_005042	TTG	2	6	1024105	1024110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240546
23141	NC_005042	AAG	2	6	1024117	1024122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240546
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23143	NC_005042	TAA	2	6	1024212	1024217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240546
23144	NC_005042	AAAT	2	8	1024269	1024276	75 %	25 %	0 %	0 %	33240547
23145	NC_005042	GCA	2	6	1024312	1024317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240547
23146	NC_005042	CAA	3	9	1024340	1024348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240547
23147	NC_005042	TAA	2	6	1024443	1024448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240547
23148	NC_005042	CT	3	6	1024455	1024460	0 %	50 %	0 %	50 %	33240547
23149	NC_005042	CCA	2	6	1024465	1024470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33240547
23150	NC_005042	ATT	2	6	1024485	1024490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240547
23151	NC_005042	TCA	2	6	1024579	1024584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240547
23152	NC_005042	TAA	2	6	1024589	1024594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240547
23153	NC_005042	AAC	2	6	1024605	1024610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240547
23154	NC_005042	TCC	2	6	1024617	1024622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33240547
23155	NC_005042	TCCA	2	8	1024640	1024647	25 %	25 %	0 %	50 %	33240547
23156	NC_005042	CAT	2	6	1024673	1024678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240547
23157	NC_005042	AAC	2	6	1024750	1024755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240547
23158	NC_005042	AAG	2	6	1024777	1024782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240547
23159	NC_005042	A	6	6	1024803	1024808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23160	NC_005042	TACT	2	8	1024827	1024834	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23161	NC_005042	TA	3	6	1024835	1024840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23162	NC_005042	TA	4	8	1024885	1024892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23163	NC_005042	AGC	2	6	1024908	1024913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23164	NC_005042	AAC	2	6	1024951	1024956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23165	NC_005042	TTGCA	2	10	1024990	1024999	20 %	40 %	20 %	20 %	33240548
23166	NC_005042	GAA	2	6	1025016	1025021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240548
23167	NC_005042	A	6	6	1025020	1025025	100 %	0 %	0 %	0 %	33240548
23168	NC_005042	A	6	6	1025079	1025084	100 %	0 %	0 %	0 %	33240548
23169	NC_005042	CTG	2	6	1025098	1025103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240548
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23171	NC_005042	TGG	2	6	1025228	1025233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33240548
23172	NC_005042	ATGG	2	8	1025247	1025254	25 %	25 %	50 %	0 %	33240548
23173	NC_005042	TGA	2	6	1025453	1025458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240548
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23175	NC_005042	A	7	7	1025535	1025541	100 %	0 %	0 %	0 %	33240549
23176	NC_005042	GAA	2	6	1025667	1025672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240549
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23179	NC_005042	AATC	2	8	1025809	1025816	50 %	25 %	0 %	25 %	33240549
23180	NC_005042	TGA	2	6	1025888	1025893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240549
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23185	NC_005042	CAA	2	6	1026181	1026186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240549
23186	NC_005042	TGA	2	6	1026221	1026226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240549
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23188	NC_005042	A	6	6	1026384	1026389	100 %	0 %	0 %	0 %	33240549
23189	NC_005042	AAG	2	6	1026410	1026415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240549
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23191	NC_005042	TAG	2	6	1026466	1026471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240550
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23195	NC_005042	AT	3	6	1026653	1026658	50 %	50 %	0 %	0 %	33240550
23196	NC_005042	AGT	2	6	1026663	1026668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240550
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23204	NC_005042	ATC	3	9	1027048	1027056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240551
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23222	NC_005042	CT	3	6	1027970	1027975	0 %	50 %	0 %	50 %	33240552
23223	NC_005042	GCAA	2	8	1028043	1028050	50 %	0 %	25 %	25 %	33240552
23224	NC_005042	CTT	2	6	1028065	1028070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240552
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23226	NC_005042	TC	3	6	1028287	1028292	0 %	50 %	0 %	50 %	33240552
23227	NC_005042	AAT	2	6	1028384	1028389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240552
23228	NC_005042	GCT	2	6	1028460	1028465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240552
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23230	NC_005042	TCC	2	6	1028483	1028488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33240552
23231	NC_005042	TC	3	6	1028571	1028576	0 %	50 %	0 %	50 %	33240552
23232	NC_005042	CCCAT	2	10	1028581	1028590	20 %	20 %	0 %	60 %	33240552
23233	NC_005042	GCT	2	6	1028619	1028624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240552
23234	NC_005042	TTGG	2	8	1028663	1028670	0 %	50 %	50 %	0 %	33240552
23235	NC_005042	ACT	2	6	1028678	1028683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240552
23236	NC_005042	TCT	2	6	1028715	1028720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240552
23237	NC_005042	CCT	2	6	1028727	1028732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33240552
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23239	NC_005042	CTT	2	6	1028881	1028886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240552
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23359	NC_005042	AGA	2	6	1034669	1034674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240557
23360	NC_005042	TGA	2	6	1034698	1034703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240557
23361	NC_005042	AGA	2	6	1034752	1034757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240557
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23369	NC_005042	AAAG	2	8	1035104	1035111	75 %	0 %	25 %	0 %	33240557
23370	NC_005042	GAA	2	6	1035119	1035124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240557
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23372	NC_005042	TGA	2	6	1035250	1035255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240557
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23411	NC_005042	ATT	2	6	1036499	1036504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23470	NC_005042	GCT	2	6	1038633	1038638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240561
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23477	NC_005042	TGG	2	6	1039174	1039179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33240562
23478	NC_005042	TC	3	6	1039189	1039194	0 %	50 %	0 %	50 %	33240562
23479	NC_005042	AAG	2	6	1039207	1039212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240562
23480	NC_005042	AAT	2	6	1039221	1039226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240562
23481	NC_005042	CT	3	6	1039248	1039253	0 %	50 %	0 %	50 %	33240562
23482	NC_005042	TTCCA	2	10	1039339	1039348	20 %	40 %	0 %	40 %	33240562
23483	NC_005042	TCCT	2	8	1039414	1039421	0 %	50 %	0 %	50 %	33240562
23484	NC_005042	ATT	2	6	1039457	1039462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240562
23485	NC_005042	T	7	7	1039461	1039467	0 %	100 %	0 %	0 %	33240562
23486	NC_005042	TTGC	2	8	1039474	1039481	0 %	50 %	25 %	25 %	33240562
23487	NC_005042	GCT	2	6	1039508	1039513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240562
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23490	NC_005042	CCA	2	6	1039606	1039611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33240562
23491	NC_005042	GCT	2	6	1039616	1039621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240562
23492	NC_005042	CAA	2	6	1039662	1039667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240562
23493	NC_005042	TGA	2	6	1039717	1039722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240562
23494	NC_005042	TCA	2	6	1039742	1039747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240562
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