MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 39235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_005042	GGC	2	6	683381	683386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33240201
15502	NC_005042	AT	3	6	683429	683434	50 %	50 %	0 %	0 %	33240201
15503	NC_005042	CTC	2	6	683503	683508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33240201
15504	NC_005042	CAG	2	6	683536	683541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240201
15505	NC_005042	TTA	2	6	683563	683568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240201
15506	NC_005042	TAA	2	6	683575	683580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240201
15507	NC_005042	ATG	2	6	683593	683598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240201
15508	NC_005042	AGA	2	6	683655	683660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240201
15509	NC_005042	TTGAT	2	10	683740	683749	20 %	60 %	20 %	0 %	33240201
15510	NC_005042	ATTG	2	8	683751	683758	25 %	50 %	25 %	0 %	33240201
15511	NC_005042	AGA	2	6	683825	683830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240201
15512	NC_005042	A	6	6	683830	683835	100 %	0 %	0 %	0 %	33240201
15513	NC_005042	TCA	2	6	683844	683849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240201
15514	NC_005042	CTC	2	6	683851	683856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33240201
15515	NC_005042	GTT	2	6	683912	683917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240201
15516	NC_005042	TTTA	2	8	683923	683930	25 %	75 %	0 %	0 %	33240201
15517	NC_005042	AGC	2	6	683947	683952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240201
15518	NC_005042	TAA	2	6	683989	683994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240201
15519	NC_005042	GAT	2	6	684000	684005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240201
15520	NC_005042	AGTG	2	8	684023	684030	25 %	25 %	50 %	0 %	33240201
15521	NC_005042	GAT	2	6	684038	684043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240201
15522	NC_005042	AGT	2	6	684128	684133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240201
15523	NC_005042	CTT	2	6	684186	684191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240201
15524	NC_005042	T	6	6	684190	684195	0 %	100 %	0 %	0 %	33240201
15525	NC_005042	TAG	2	6	684235	684240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240201
15526	NC_005042	TGA	2	6	684257	684262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240201
15527	NC_005042	TTGA	2	8	684276	684283	25 %	50 %	25 %	0 %	33240201
15528	NC_005042	TAA	2	6	684302	684307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240201
15529	NC_005042	TGT	2	6	684386	684391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240201
15530	NC_005042	GCA	2	6	684508	684513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240201
15531	NC_005042	TTC	2	6	684539	684544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240202
15532	NC_005042	T	6	6	684577	684582	0 %	100 %	0 %	0 %	33240202
15533	NC_005042	A	6	6	684681	684686	100 %	0 %	0 %	0 %	33240202
15534	NC_005042	AGG	2	6	684716	684721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33240202
15535	NC_005042	ATG	2	6	684741	684746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240202
15536	NC_005042	AGT	2	6	684797	684802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240202
15537	NC_005042	CTT	2	6	684813	684818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240202
15538	NC_005042	TC	3	6	684855	684860	0 %	50 %	0 %	50 %	33240202
15539	NC_005042	T	6	6	684879	684884	0 %	100 %	0 %	0 %	33240202
15540	NC_005042	T	7	7	684893	684899	0 %	100 %	0 %	0 %	33240202
15541	NC_005042	GAG	2	6	684900	684905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33240202
15542	NC_005042	ATT	2	6	684944	684949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240203
15543	NC_005042	GCTTT	2	10	684996	685005	0 %	60 %	20 %	20 %	33240203
15544	NC_005042	AAG	2	6	685047	685052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240203
15545	NC_005042	ATT	2	6	685077	685082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240203
15546	NC_005042	TTG	2	6	685177	685182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240203
15547	NC_005042	T	6	6	685187	685192	0 %	100 %	0 %	0 %	33240203
15548	NC_005042	TGTT	2	8	685217	685224	0 %	75 %	25 %	0 %	33240203
15549	NC_005042	GAT	2	6	685252	685257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15550	NC_005042	CTT	2	6	685282	685287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240204
15551	NC_005042	TATT	2	8	685300	685307	25 %	75 %	0 %	0 %	33240204
15552	NC_005042	GAG	2	6	685325	685330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33240204
15553	NC_005042	CT	3	6	685365	685370	0 %	50 %	0 %	50 %	33240204
15554	NC_005042	CGTT	2	8	685483	685490	0 %	50 %	25 %	25 %	33240204
15555	NC_005042	TTG	2	6	685512	685517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240204
15556	NC_005042	T	8	8	685519	685526	0 %	100 %	0 %	0 %	33240204
15557	NC_005042	CAG	2	6	685582	685587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240204
15558	NC_005042	TAGT	2	8	685612	685619	25 %	50 %	25 %	0 %	33240204
15559	NC_005042	T	8	8	685629	685636	0 %	100 %	0 %	0 %	33240204
15560	NC_005042	GTT	2	6	685654	685659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240204
15561	NC_005042	CTG	2	6	685660	685665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240204
15562	NC_005042	AGT	2	6	685677	685682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240204
15563	NC_005042	TTA	2	6	685717	685722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240204
15564	NC_005042	TCT	2	6	685779	685784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240204
15565	NC_005042	AAC	2	6	685997	686002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240205
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15568	NC_005042	TCC	2	6	686094	686099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33240205
15569	NC_005042	CCTT	2	8	686110	686117	0 %	50 %	0 %	50 %	33240205
15570	NC_005042	TCT	3	9	686131	686139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240205
15571	NC_005042	TGT	2	6	686193	686198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240205
15572	NC_005042	TG	3	6	686233	686238	0 %	50 %	50 %	0 %	33240205
15573	NC_005042	TTC	2	6	686250	686255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240205
15574	NC_005042	ATC	2	6	686307	686312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240205
15575	NC_005042	ATG	2	6	686368	686373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240205
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15577	NC_005042	TA	3	6	686461	686466	50 %	50 %	0 %	0 %	33240206
15578	NC_005042	A	6	6	686484	686489	100 %	0 %	0 %	0 %	33240206
15579	NC_005042	GCAG	2	8	686552	686559	25 %	0 %	50 %	25 %	33240206
15580	NC_005042	TGAT	2	8	686653	686660	25 %	50 %	25 %	0 %	33240206
15581	NC_005042	TGGAA	2	10	686683	686692	40 %	20 %	40 %	0 %	33240206
15582	NC_005042	GTT	2	6	686817	686822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240206
15583	NC_005042	TAC	2	6	686851	686856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240206
15584	NC_005042	ATT	2	6	686882	686887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240206
15585	NC_005042	TTC	2	6	686911	686916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240206
15586	NC_005042	A	6	6	686936	686941	100 %	0 %	0 %	0 %	33240206
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15588	NC_005042	GCG	2	6	686978	686983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33240206
15589	NC_005042	TCA	2	6	687099	687104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240206
15590	NC_005042	TTG	2	6	687111	687116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240206
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15592	NC_005042	GT	4	8	687241	687248	0 %	50 %	50 %	0 %	33240206
15593	NC_005042	T	6	6	687250	687255	0 %	100 %	0 %	0 %	33240206
15594	NC_005042	AAT	2	6	687406	687411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240207
15595	NC_005042	TGT	2	6	687475	687480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240207
15596	NC_005042	TGT	2	6	687490	687495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240207
15597	NC_005042	A	6	6	687503	687508	100 %	0 %	0 %	0 %	33240207
15598	NC_005042	TTG	2	6	687519	687524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240207
15599	NC_005042	ATG	2	6	687540	687545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240207
15600	NC_005042	ACA	2	6	687546	687551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240207
15601	NC_005042	ATTTT	2	10	687583	687592	20 %	80 %	0 %	0 %	33240207
15602	NC_005042	GGA	2	6	687611	687616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33240207
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15604	NC_005042	CAG	2	6	687722	687727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240207
15605	NC_005042	AGAT	2	8	687757	687764	50 %	25 %	25 %	0 %	33240207
15606	NC_005042	TTA	2	6	687924	687929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240207
15607	NC_005042	AT	3	6	687931	687936	50 %	50 %	0 %	0 %	33240207
15608	NC_005042	AG	3	6	687946	687951	50 %	0 %	50 %	0 %	33240207
15609	NC_005042	TCT	2	6	687956	687961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240207
15610	NC_005042	GTT	2	6	687964	687969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240207
15611	NC_005042	TTG	2	6	687984	687989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240207
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15613	NC_005042	GTT	2	6	688214	688219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240207
15614	NC_005042	TTCA	2	8	688245	688252	25 %	50 %	0 %	25 %	33240207
15615	NC_005042	AAT	2	6	688262	688267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240207
15616	NC_005042	GCA	2	6	688274	688279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240207
15617	NC_005042	TAG	2	6	688294	688299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240207
15618	NC_005042	CAA	2	6	688301	688306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240207
15619	NC_005042	ATGTAG	2	12	688318	688329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240207
15620	NC_005042	TGC	2	6	688381	688386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240207
15621	NC_005042	GGA	2	6	688697	688702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33240207
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15993	NC_005042	TGT	2	6	704946	704951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15994	NC_005042	TCT	2	6	704955	704960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15995	NC_005042	GAATT	2	10	705004	705013	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15996	NC_005042	TTGA	2	8	705067	705074	25 %	50 %	25 %	0 %	33240229
15997	NC_005042	TGT	2	6	705250	705255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240229
15998	NC_005042	GAG	2	6	705285	705290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33240229
15999	NC_005042	AAGACA	2	12	705427	705438	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	33240229
16000	NC_005042	TCA	2	6	705442	705447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240229

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