MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 39235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_005042	GCG	2	6	660792	660797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15002	NC_005042	T	7	7	660804	660810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_005042	T	8	8	660852	660859	0 %	100 %	0 %	0 %	33240177
15004	NC_005042	GCCT	2	8	660862	660869	0 %	25 %	25 %	50 %	33240177
15005	NC_005042	TTC	2	6	661003	661008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240177
15006	NC_005042	CAG	2	6	661038	661043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240177
15007	NC_005042	AG	3	6	661165	661170	50 %	0 %	50 %	0 %	33240177
15008	NC_005042	CTT	2	6	661218	661223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240177
15009	NC_005042	AAG	2	6	661297	661302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240177
15010	NC_005042	ATG	2	6	661440	661445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240177
15011	NC_005042	GCA	2	6	661566	661571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240177
15012	NC_005042	CTA	2	6	661623	661628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240177
15013	NC_005042	GCCAA	2	10	661646	661655	40 %	0 %	20 %	40 %	33240177
15014	NC_005042	TGA	2	6	661783	661788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240177
15015	NC_005042	A	7	7	661788	661794	100 %	0 %	0 %	0 %	33240177
15016	NC_005042	CTT	2	6	661803	661808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240177
15017	NC_005042	CTG	2	6	661818	661823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240177
15018	NC_005042	ATT	2	6	661841	661846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240177
15019	NC_005042	CTC	2	6	661912	661917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33240177
15020	NC_005042	T	8	8	661950	661957	0 %	100 %	0 %	0 %	33240177
15021	NC_005042	TTG	2	6	662010	662015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240177
15022	NC_005042	AAG	2	6	662065	662070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_005042	ACG	2	6	662076	662081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15024	NC_005042	AGA	2	6	662182	662187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240178
15025	NC_005042	TGG	2	6	662431	662436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33240178
15026	NC_005042	GAT	2	6	662486	662491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240178
15027	NC_005042	CAA	2	6	662570	662575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240178
15028	NC_005042	AAT	2	6	662630	662635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240178
15029	NC_005042	TTA	2	6	662646	662651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240178
15030	NC_005042	ACA	2	6	662714	662719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240178
15031	NC_005042	CAGAT	2	10	662727	662736	40 %	20 %	20 %	20 %	33240178
15032	NC_005042	GGAG	2	8	662748	662755	25 %	0 %	75 %	0 %	33240178
15033	NC_005042	TTA	2	6	662765	662770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240178
15034	NC_005042	ACT	2	6	662861	662866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240178
15035	NC_005042	TAA	2	6	662946	662951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240178
15036	NC_005042	AT	3	6	662979	662984	50 %	50 %	0 %	0 %	33240178
15037	NC_005042	CCT	2	6	663035	663040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33240178
15038	NC_005042	TAAT	2	8	663057	663064	50 %	50 %	0 %	0 %	33240178
15039	NC_005042	TAAT	2	8	663078	663085	50 %	50 %	0 %	0 %	33240178
15040	NC_005042	ATG	2	6	663150	663155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240178
15041	NC_005042	A	6	6	663225	663230	100 %	0 %	0 %	0 %	33240178
15042	NC_005042	GAG	2	6	663231	663236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33240178
15043	NC_005042	TGG	2	6	663299	663304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33240178
15044	NC_005042	GCAA	2	8	663412	663419	50 %	0 %	25 %	25 %	33240178
15045	NC_005042	AGA	2	6	663467	663472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240178
15046	NC_005042	TGA	2	6	663493	663498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240178
15047	NC_005042	TTA	2	6	663651	663656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240178
15048	NC_005042	TCG	2	6	663658	663663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240178
15049	NC_005042	GAAT	2	8	663666	663673	50 %	25 %	25 %	0 %	33240178
15050	NC_005042	TTG	2	6	663676	663681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240178
15051	NC_005042	TAA	2	6	663706	663711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240178
15052	NC_005042	A	6	6	663710	663715	100 %	0 %	0 %	0 %	33240178
15053	NC_005042	TTA	2	6	663763	663768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240178
15054	NC_005042	ATG	2	6	663774	663779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240178
15055	NC_005042	AAT	2	6	663785	663790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240178
15056	NC_005042	TTAA	2	8	663842	663849	50 %	50 %	0 %	0 %	33240178
15057	NC_005042	A	8	8	663848	663855	100 %	0 %	0 %	0 %	33240178
15058	NC_005042	A	7	7	663870	663876	100 %	0 %	0 %	0 %	33240179
15059	NC_005042	GCT	2	6	664008	664013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240179
15060	NC_005042	TGG	2	6	664070	664075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33240179
15061	NC_005042	TGA	2	6	664088	664093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240179
15062	NC_005042	ATC	2	6	664097	664102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240179
15063	NC_005042	GAA	2	6	664107	664112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240179
15064	NC_005042	TTG	2	6	664386	664391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240179
15065	NC_005042	AAG	2	6	664431	664436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240179
15066	NC_005042	AGT	2	6	664460	664465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240179
15067	NC_005042	TAA	2	6	664547	664552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240179
15068	NC_005042	AAAG	2	8	664559	664566	75 %	0 %	25 %	0 %	33240179
15069	NC_005042	CAC	2	6	664600	664605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33240179
15070	NC_005042	TTA	2	6	664642	664647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240179
15071	NC_005042	TA	3	6	664652	664657	50 %	50 %	0 %	0 %	33240179
15072	NC_005042	TAA	2	6	664680	664685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240180
15073	NC_005042	TAA	2	6	664695	664700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240180
15074	NC_005042	ATTA	2	8	664804	664811	50 %	50 %	0 %	0 %	33240180
15075	NC_005042	GGAT	2	8	664824	664831	25 %	25 %	50 %	0 %	33240180
15076	NC_005042	TGC	2	6	664839	664844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240180
15077	NC_005042	AAT	2	6	664933	664938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240180
15078	NC_005042	GCT	2	6	665008	665013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240180
15079	NC_005042	GAT	2	6	665053	665058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240180
15080	NC_005042	TCC	2	6	665257	665262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33240180
15081	NC_005042	GTTTTA	2	12	665269	665280	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	33240180
15082	NC_005042	GAT	2	6	665338	665343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240180
15083	NC_005042	TAA	2	6	665402	665407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240180
15084	NC_005042	ATT	2	6	665411	665416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240180
15085	NC_005042	TCT	2	6	665470	665475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240180
15086	NC_005042	AAGAAA	2	12	665498	665509	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	33240180
15087	NC_005042	CTT	2	6	665545	665550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240180
15088	NC_005042	TCT	2	6	665551	665556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240180
15089	NC_005042	ATTG	2	8	665605	665612	25 %	50 %	25 %	0 %	33240180
15090	NC_005042	GTT	2	6	665620	665625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240180
15091	NC_005042	AG	3	6	665641	665646	50 %	0 %	50 %	0 %	33240180
15092	NC_005042	AGA	2	6	665668	665673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240180
15093	NC_005042	GTT	2	6	665693	665698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15094	NC_005042	T	6	6	665697	665702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15095	NC_005042	TAA	2	6	665745	665750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15096	NC_005042	T	6	6	665823	665828	0 %	100 %	0 %	0 %	33240181
15097	NC_005042	ATGA	2	8	665956	665963	50 %	25 %	25 %	0 %	33240181
15098	NC_005042	ATA	2	6	665979	665984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240181
15099	NC_005042	TAT	2	6	666000	666005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_005042	T	6	6	666024	666029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15101	NC_005042	ATA	2	6	666034	666039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_005042	TAC	3	9	666094	666102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15103	NC_005042	TAAA	2	8	666137	666144	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15104	NC_005042	TATT	2	8	666162	666169	25 %	75 %	0 %	0 %	33240182
15105	NC_005042	AAT	2	6	666208	666213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240182
15106	NC_005042	CTT	2	6	666257	666262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240182
15107	NC_005042	CAATTT	2	12	666278	666289	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	33240182
15108	NC_005042	ATT	2	6	666338	666343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240182
15109	NC_005042	CTT	2	6	666450	666455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240182
15110	NC_005042	CTT	2	6	666458	666463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240182
15111	NC_005042	ATT	2	6	666519	666524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240182
15112	NC_005042	AGG	2	6	666534	666539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15113	NC_005042	TAT	2	6	666551	666556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15114	NC_005042	T	6	6	666561	666566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15115	NC_005042	T	6	6	666664	666669	0 %	100 %	0 %	0 %	33240183
15116	NC_005042	TTA	2	6	666703	666708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240183
15117	NC_005042	GATG	2	8	666731	666738	25 %	25 %	50 %	0 %	33240183
15118	NC_005042	ATG	2	6	666744	666749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240183
15119	NC_005042	TA	3	6	666815	666820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15120	NC_005042	CCA	2	6	666832	666837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33240184
15121	NC_005042	TAT	2	6	666857	666862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240184
15122	NC_005042	ACTT	2	8	666972	666979	25 %	50 %	0 %	25 %	33240184
15123	NC_005042	CTA	2	6	667013	667018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240184
15124	NC_005042	CTTG	2	8	667030	667037	0 %	50 %	25 %	25 %	33240184
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15374	NC_005042	A	8	8	677617	677624	100 %	0 %	0 %	0 %	33240197
15375	NC_005042	A	7	7	677630	677636	100 %	0 %	0 %	0 %	33240197
15376	NC_005042	TCT	2	6	677681	677686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240198
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15455	NC_005042	T	6	6	680976	680981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15456	NC_005042	GTTC	2	8	681029	681036	0 %	50 %	25 %	25 %	33240201
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15480	NC_005042	TTTG	2	8	682205	682212	0 %	75 %	25 %	0 %	33240201
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15495	NC_005042	CTT	2	6	683044	683049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240201
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