MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 39235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_005042	GTA	2	6	40705	40710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239493
1003	NC_005042	CTGGTA	2	12	40715	40726	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	33239493
1004	NC_005042	CAG	2	6	40781	40786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239493
1005	NC_005042	TAG	2	6	40791	40796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239493
1006	NC_005042	TGG	2	6	40797	40802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33239493
1007	NC_005042	CATG	2	8	40810	40817	25 %	25 %	25 %	25 %	33239493
1008	NC_005042	TTG	2	6	40859	40864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239493
1009	NC_005042	GGT	2	6	40888	40893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33239493
1010	NC_005042	GTT	2	6	40957	40962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_005042	AGC	2	6	40979	40984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239494
1012	NC_005042	CTTTT	2	10	40991	41000	0 %	80 %	0 %	20 %	33239494
1013	NC_005042	T	8	8	40997	41004	0 %	100 %	0 %	0 %	33239494
1014	NC_005042	CTT	2	6	41085	41090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239494
1015	NC_005042	TGT	2	6	41118	41123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239494
1016	NC_005042	AAG	2	6	41129	41134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239494
1017	NC_005042	CCATT	2	10	41206	41215	20 %	40 %	0 %	40 %	33239494
1018	NC_005042	CAC	2	6	41222	41227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_005042	GAAA	2	8	41245	41252	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_005042	AGC	2	6	41317	41322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_005042	ATC	2	6	41331	41336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_005042	TA	3	6	41390	41395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_005042	GATGA	2	10	41398	41407	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_005042	ATCT	2	8	41451	41458	25 %	50 %	0 %	25 %	33239495
1025	NC_005042	GCTA	2	8	41503	41510	25 %	25 %	25 %	25 %	33239495
1026	NC_005042	CCA	2	6	41582	41587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33239495
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1028	NC_005042	TGG	2	6	41683	41688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33239495
1029	NC_005042	AG	3	6	41805	41810	50 %	0 %	50 %	0 %	33239495
1030	NC_005042	ACA	2	6	41870	41875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239495
1031	NC_005042	TGA	2	6	41916	41921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239495
1032	NC_005042	GATT	2	8	41949	41956	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_005042	TAGG	2	8	41968	41975	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_005042	TAA	2	6	41994	41999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239496
1035	NC_005042	GAT	2	6	42016	42021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239496
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1039	NC_005042	TCT	2	6	42198	42203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239496
1040	NC_005042	GAA	2	6	42220	42225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239496
1041	NC_005042	ATT	2	6	42248	42253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239496
1042	NC_005042	TAAAG	2	10	42269	42278	60 %	20 %	20 %	0 %	33239496
1043	NC_005042	TGG	2	6	42341	42346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33239496
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1046	NC_005042	TAA	2	6	42461	42466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239496
1047	NC_005042	GTT	2	6	42511	42516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239496
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1051	NC_005042	TTA	2	6	42577	42582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239496
1052	NC_005042	TTGATT	2	12	42603	42614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	33239496
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1054	NC_005042	GCAA	2	8	42732	42739	50 %	0 %	25 %	25 %	33239496
1055	NC_005042	TCGGTG	2	12	42760	42771	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	33239496
1056	NC_005042	TCC	2	6	42776	42781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239496
1057	NC_005042	TAA	2	6	42830	42835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239496
1058	NC_005042	GAT	2	6	42956	42961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239496
1059	NC_005042	GCTTT	2	10	42972	42981	0 %	60 %	20 %	20 %	33239496
1060	NC_005042	TCC	2	6	42986	42991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239496
1061	NC_005042	TAA	2	6	43010	43015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239496
1062	NC_005042	T	6	6	43084	43089	0 %	100 %	0 %	0 %	33239496
1063	NC_005042	AAT	2	6	43091	43096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239496
1064	NC_005042	AAT	2	6	43138	43143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239496
1065	NC_005042	CTG	2	6	43189	43194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239496
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1067	NC_005042	T	6	6	43240	43245	0 %	100 %	0 %	0 %	33239496
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1073	NC_005042	T	7	7	43413	43419	0 %	100 %	0 %	0 %	33239496
1074	NC_005042	AAT	3	9	43535	43543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239496
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1093	NC_005042	AAAAC	2	10	44117	44126	80 %	0 %	0 %	20 %	33239497
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1098	NC_005042	TAC	2	6	44272	44277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239497
1099	NC_005042	TCC	2	6	44284	44289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239497
1100	NC_005042	TTTC	2	8	44350	44357	0 %	75 %	0 %	25 %	33239497
1101	NC_005042	TCA	2	6	44390	44395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239497
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1110	NC_005042	TTTA	2	8	44707	44714	25 %	75 %	0 %	0 %	33239497
1111	NC_005042	TCT	2	6	44786	44791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239497
1112	NC_005042	CCACT	2	10	44807	44816	20 %	20 %	0 %	60 %	33239497
1113	NC_005042	ATT	2	6	44824	44829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239497
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1115	NC_005042	TGGT	2	8	44889	44896	0 %	50 %	50 %	0 %	33239497
1116	NC_005042	GAA	2	6	44922	44927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239497
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1120	NC_005042	GATCAA	2	12	44994	45005	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	33239497
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1123	NC_005042	CAA	2	6	45249	45254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239497
1124	NC_005042	ATT	2	6	45265	45270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239497
1125	NC_005042	TTA	2	6	45288	45293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239497
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1127	NC_005042	A	6	6	45329	45334	100 %	0 %	0 %	0 %	33239497
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1129	NC_005042	T	6	6	45420	45425	0 %	100 %	0 %	0 %	33239497
1130	NC_005042	AAT	2	6	45433	45438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239497
1131	NC_005042	TGT	2	6	45444	45449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239497
1132	NC_005042	GTT	2	6	45452	45457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239497
1133	NC_005042	GTA	2	6	45521	45526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239497
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1137	NC_005042	A	7	7	45675	45681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_005042	A	6	6	45715	45720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_005042	TGAT	2	8	45729	45736	25 %	50 %	25 %	0 %	33239498
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1254	NC_005042	A	6	6	50765	50770	100 %	0 %	0 %	0 %	33239500
1255	NC_005042	CTT	2	6	50774	50779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239500
1256	NC_005042	TG	3	6	50857	50862	0 %	50 %	50 %	0 %	33239500
1257	NC_005042	T	6	6	50973	50978	0 %	100 %	0 %	0 %	33239500
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1259	NC_005042	TAA	2	6	51149	51154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239500
1260	NC_005042	GAA	2	6	51211	51216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239500
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1262	NC_005042	GATG	2	8	51267	51274	25 %	25 %	50 %	0 %	33239500
1263	NC_005042	AAC	2	6	51275	51280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239500
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1317	NC_005042	TGA	2	6	53517	53522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239501
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1319	NC_005042	TAAT	2	8	53585	53592	50 %	50 %	0 %	0 %	33239501
1320	NC_005042	CTTT	2	8	53606	53613	0 %	75 %	0 %	25 %	33239501
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1339	NC_005042	TCT	2	6	54373	54378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239501
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1344	NC_005042	TTGA	2	8	54508	54515	25 %	50 %	25 %	0 %	33239501
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1351	NC_005042	TGT	2	6	54973	54978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239502
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1370	NC_005042	CA	3	6	55892	55897	50 %	0 %	0 %	50 %	33239503
1371	NC_005042	TAT	2	6	55930	55935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239503
1372	NC_005042	T	7	7	56000	56006	0 %	100 %	0 %	0 %	33239503
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1375	NC_005042	CTG	2	6	56227	56232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239503
1376	NC_005042	CTG	2	6	56242	56247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239503
1377	NC_005042	T	6	6	56288	56293	0 %	100 %	0 %	0 %	33239503
1378	NC_005042	AATG	2	8	56298	56305	50 %	25 %	25 %	0 %	33239503
1379	NC_005042	CCA	3	9	56328	56336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33239503
1380	NC_005042	TTGA	2	8	56359	56366	25 %	50 %	25 %	0 %	33239503
1381	NC_005042	ATG	2	6	56413	56418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1382	NC_005042	TCCA	2	8	56419	56426	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1383	NC_005042	AT	3	6	56453	56458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1384	NC_005042	CTA	2	6	56569	56574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239504
1385	NC_005042	GAT	2	6	56583	56588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239504
1386	NC_005042	TTGT	2	8	56611	56618	0 %	75 %	25 %	0 %	33239504
1387	NC_005042	TAAA	2	8	56644	56651	75 %	25 %	0 %	0 %	33239504
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1389	NC_005042	TC	3	6	56767	56772	0 %	50 %	0 %	50 %	33239504
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