MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 39235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_005042	C	6	6	597972	597977	0 %	0 %	0 %	100 %	33240086
13502	NC_005042	TGC	2	6	598047	598052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240086
13503	NC_005042	ATCT	2	8	598091	598098	25 %	50 %	0 %	25 %	33240086
13504	NC_005042	T	6	6	598104	598109	0 %	100 %	0 %	0 %	33240086
13505	NC_005042	A	6	6	598116	598121	100 %	0 %	0 %	0 %	33240086
13506	NC_005042	TCC	2	6	598143	598148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33240086
13507	NC_005042	CAC	2	6	598232	598237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33240086
13508	NC_005042	CAATAC	2	12	598238	598249	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	33240086
13509	NC_005042	T	7	7	598319	598325	0 %	100 %	0 %	0 %	33240086
13510	NC_005042	T	6	6	598349	598354	0 %	100 %	0 %	0 %	33240086
13511	NC_005042	TTTATT	2	12	598362	598373	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	33240086
13512	NC_005042	TTA	2	6	598381	598386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240086
13513	NC_005042	TAA	2	6	598410	598415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240086
13514	NC_005042	ATT	2	6	598416	598421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240086
13515	NC_005042	ATT	2	6	598438	598443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240086
13516	NC_005042	A	6	6	598488	598493	100 %	0 %	0 %	0 %	33240086
13517	NC_005042	AAT	2	6	598507	598512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240086
13518	NC_005042	TTTA	2	8	598552	598559	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_005042	TAT	2	6	598573	598578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13520	NC_005042	GAA	2	6	598618	598623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13521	NC_005042	AAC	2	6	598689	598694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13522	NC_005042	GAA	2	6	598730	598735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13523	NC_005042	TTAT	2	8	598736	598743	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13524	NC_005042	GTA	2	6	598820	598825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13525	NC_005042	AGC	2	6	598841	598846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13526	NC_005042	TTG	2	6	598975	598980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13527	NC_005042	TGT	2	6	599006	599011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13528	NC_005042	AAT	2	6	599062	599067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_005042	T	7	7	599087	599093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13530	NC_005042	AATC	2	8	599151	599158	50 %	25 %	0 %	25 %	33240087
13531	NC_005042	AG	3	6	599197	599202	50 %	0 %	50 %	0 %	33240087
13532	NC_005042	T	6	6	599218	599223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_005042	GAA	2	6	599280	599285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13534	NC_005042	TGA	2	6	599309	599314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13535	NC_005042	AT	3	6	599315	599320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13536	NC_005042	GAA	2	6	599355	599360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13537	NC_005042	TGC	2	6	599367	599372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13538	NC_005042	A	6	6	599383	599388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_005042	GCC	2	6	599389	599394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13540	NC_005042	T	7	7	599410	599416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13541	NC_005042	AAAT	2	8	599454	599461	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_005042	AT	3	6	599556	599561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_005042	A	7	7	599572	599578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13544	NC_005042	A	6	6	599888	599893	100 %	0 %	0 %	0 %	33240089
13545	NC_005042	T	7	7	599916	599922	0 %	100 %	0 %	0 %	33240089
13546	NC_005042	AGA	2	6	599965	599970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13547	NC_005042	ATA	2	6	600061	600066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_005042	AATC	2	8	600092	600099	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13549	NC_005042	GAG	2	6	600236	600241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33240090
13550	NC_005042	AAAG	2	8	600243	600250	75 %	0 %	25 %	0 %	33240090
13551	NC_005042	CTA	2	6	600334	600339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13552	NC_005042	AAG	2	6	600350	600355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13553	NC_005042	CTT	2	6	600385	600390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13554	NC_005042	AG	3	6	600459	600464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13555	NC_005042	AT	4	8	600643	600650	50 %	50 %	0 %	0 %	33240091
13556	NC_005042	T	6	6	600694	600699	0 %	100 %	0 %	0 %	33240091
13557	NC_005042	AGA	2	6	600752	600757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240091
13558	NC_005042	AGA	2	6	600776	600781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240091
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13560	NC_005042	TCT	2	6	600864	600869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240091
13561	NC_005042	AG	3	6	600878	600883	50 %	0 %	50 %	0 %	33240091
13562	NC_005042	TTCA	2	8	600971	600978	25 %	50 %	0 %	25 %	33240091
13563	NC_005042	ATTG	2	8	600986	600993	25 %	50 %	25 %	0 %	33240091
13564	NC_005042	GAA	4	12	601005	601016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240091
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13566	NC_005042	ATTC	2	8	601176	601183	25 %	50 %	0 %	25 %	33240092
13567	NC_005042	TCA	2	6	601187	601192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240092
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13569	NC_005042	TG	3	6	601294	601299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_005042	AAT	2	6	601323	601328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13571	NC_005042	T	6	6	601344	601349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13572	NC_005042	GAA	2	6	601350	601355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13573	NC_005042	TTA	2	6	601523	601528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13574	NC_005042	TTTCT	2	10	601546	601555	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13575	NC_005042	TAAC	2	8	601577	601584	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13576	NC_005042	CAA	2	6	601634	601639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240093
13577	NC_005042	TAAG	2	8	601706	601713	50 %	25 %	25 %	0 %	33240093
13578	NC_005042	GAATG	2	10	601746	601755	40 %	20 %	40 %	0 %	33240093
13579	NC_005042	GA	3	6	601772	601777	50 %	0 %	50 %	0 %	33240093
13580	NC_005042	CTG	3	9	601778	601786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240093
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13584	NC_005042	TCTA	2	8	601866	601873	25 %	50 %	0 %	25 %	33240093
13585	NC_005042	GATG	2	8	601885	601892	25 %	25 %	50 %	0 %	33240093
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13588	NC_005042	CTA	2	6	601970	601975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240093
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13590	NC_005042	CTT	2	6	602038	602043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13591	NC_005042	AG	3	6	602061	602066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13592	NC_005042	TGC	2	6	602104	602109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13593	NC_005042	AAT	2	6	602134	602139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13594	NC_005042	AG	3	6	602225	602230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13595	NC_005042	CTT	2	6	602259	602264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13596	NC_005042	ATG	2	6	602323	602328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13597	NC_005042	T	6	6	602362	602367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13598	NC_005042	ATT	2	6	602374	602379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13599	NC_005042	TCA	2	6	602437	602442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240094
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13601	NC_005042	A	6	6	602496	602501	100 %	0 %	0 %	0 %	33240094
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13603	NC_005042	AAT	2	6	602524	602529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240094
13604	NC_005042	TAA	2	6	602669	602674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240094
13605	NC_005042	CAG	2	6	602728	602733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240094
13606	NC_005042	TGAA	2	8	602919	602926	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13607	NC_005042	T	6	6	602944	602949	0 %	100 %	0 %	0 %	33240095
13608	NC_005042	GAA	2	6	603018	603023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240095
13609	NC_005042	GA	3	6	603040	603045	50 %	0 %	50 %	0 %	33240095
13610	NC_005042	AGT	2	6	603071	603076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240095
13611	NC_005042	ATAA	2	8	603094	603101	75 %	25 %	0 %	0 %	33240095
13612	NC_005042	CAA	2	6	603210	603215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240096
13613	NC_005042	ATT	2	6	603242	603247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240096
13614	NC_005042	TAT	2	6	603335	603340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_005042	GAA	2	6	603447	603452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240097
13616	NC_005042	TCT	2	6	603537	603542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240097
13617	NC_005042	CT	3	6	603578	603583	0 %	50 %	0 %	50 %	33240097
13618	NC_005042	CAA	2	6	603586	603591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240097
13619	NC_005042	GAA	2	6	603624	603629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13620	NC_005042	GCAA	2	8	603776	603783	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13621	NC_005042	TAA	2	6	603842	603847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13622	NC_005042	TAG	2	6	603892	603897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13623	NC_005042	TC	3	6	603929	603934	0 %	50 %	0 %	50 %	33240098
13624	NC_005042	CT	3	6	603963	603968	0 %	50 %	0 %	50 %	33240098
13625	NC_005042	AAT	2	6	603997	604002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240098
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13627	NC_005042	TAG	2	6	604091	604096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240098
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13629	NC_005042	GAT	2	6	604139	604144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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