MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 39235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_005042	ATA	2	6	576987	576992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240064
13003	NC_005042	AT	3	6	577013	577018	50 %	50 %	0 %	0 %	33240064
13004	NC_005042	AAGT	2	8	577023	577030	50 %	25 %	25 %	0 %	33240064
13005	NC_005042	AAT	2	6	577050	577055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240064
13006	NC_005042	GTG	2	6	577242	577247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33240064
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13012	NC_005042	TCA	2	6	577562	577567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240064
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13014	NC_005042	CTTT	2	8	577626	577633	0 %	75 %	0 %	25 %	33240064
13015	NC_005042	T	6	6	577664	577669	0 %	100 %	0 %	0 %	33240064
13016	NC_005042	GAA	2	6	577680	577685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240064
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13018	NC_005042	TGC	2	6	577717	577722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240064
13019	NC_005042	TGA	2	6	577735	577740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240064
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13021	NC_005042	GGCC	2	8	577833	577840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13022	NC_005042	GGCC	2	8	577884	577891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13023	NC_005042	AGC	2	6	577894	577899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13025	NC_005042	GAT	2	6	577925	577930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13028	NC_005042	A	6	6	577995	578000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_005042	TTG	2	6	578014	578019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_005042	TAA	2	6	578040	578045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_005042	T	6	6	578059	578064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_005042	ATCTC	2	10	578072	578081	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13033	NC_005042	T	6	6	578126	578131	0 %	100 %	0 %	0 %	33240065
13034	NC_005042	CT	3	6	578166	578171	0 %	50 %	0 %	50 %	33240065
13035	NC_005042	CAT	3	9	578184	578192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240065
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13091	NC_005042	T	7	7	580145	580151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_005042	TATT	2	8	580174	580181	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13107	NC_005042	TAA	2	6	580770	580775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240066
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13109	NC_005042	CTTT	3	12	580845	580856	0 %	75 %	0 %	25 %	33240066
13110	NC_005042	ATTT	2	8	580895	580902	25 %	75 %	0 %	0 %	33240066
13111	NC_005042	TCA	2	6	580918	580923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240066
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13122	NC_005042	TA	3	6	581346	581351	50 %	50 %	0 %	0 %	33240066
13123	NC_005042	TCA	3	9	581353	581361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240066
13124	NC_005042	GAT	2	6	581372	581377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240066
13125	NC_005042	ATC	2	6	581385	581390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240066
13126	NC_005042	TAA	2	6	581404	581409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240066
13127	NC_005042	CA	3	6	581412	581417	50 %	0 %	0 %	50 %	33240066
13128	NC_005042	TAT	2	6	581432	581437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240066
13129	NC_005042	TTC	3	9	581454	581462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240066
13130	NC_005042	ATC	3	9	581619	581627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240066
13131	NC_005042	GTA	2	6	581630	581635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240066
13132	NC_005042	TTTC	2	8	581648	581655	0 %	75 %	0 %	25 %	33240066
13133	NC_005042	CAA	2	6	581675	581680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240066
13134	NC_005042	CTT	2	6	581681	581686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240066
13135	NC_005042	CAT	2	6	581705	581710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240066
13136	NC_005042	GCCA	2	8	581751	581758	25 %	0 %	25 %	50 %	33240066
13137	NC_005042	TCT	3	9	581809	581817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240066
13138	NC_005042	TCT	2	6	581821	581826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240066
13139	NC_005042	AAT	2	6	581841	581846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240066
13140	NC_005042	CTTC	2	8	581883	581890	0 %	50 %	0 %	50 %	33240066
13141	NC_005042	TC	4	8	581939	581946	0 %	50 %	0 %	50 %	33240066
13142	NC_005042	TAA	2	6	581966	581971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240066
13143	NC_005042	TTAA	2	8	581974	581981	50 %	50 %	0 %	0 %	33240066
13144	NC_005042	CCT	2	6	581984	581989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33240066
13145	NC_005042	CT	3	6	582077	582082	0 %	50 %	0 %	50 %	33240066
13146	NC_005042	ATC	2	6	582189	582194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240066
13147	NC_005042	ATTG	2	8	582198	582205	25 %	50 %	25 %	0 %	33240066
13148	NC_005042	T	7	7	582240	582246	0 %	100 %	0 %	0 %	33240066
13149	NC_005042	T	7	7	582252	582258	0 %	100 %	0 %	0 %	33240066
13150	NC_005042	CAT	6	18	582260	582277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240066
13151	NC_005042	AAT	2	6	582369	582374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240066
13152	NC_005042	TCA	2	6	582379	582384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240066
13153	NC_005042	TCA	2	6	582391	582396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240066
13154	NC_005042	TCA	3	9	582421	582429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240066
13155	NC_005042	CAT	6	18	582479	582496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240066
13156	NC_005042	AAT	2	6	582510	582515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240066
13157	NC_005042	TTC	2	6	582548	582553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240066
13158	NC_005042	TCATCT	2	12	582634	582645	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	33240066
13159	NC_005042	TCA	2	6	582676	582681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240066
13160	NC_005042	TTC	2	6	582723	582728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240066
13161	NC_005042	CTT	2	6	582800	582805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240066
13162	NC_005042	TCA	2	6	582838	582843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240066
13163	NC_005042	TCA	2	6	582880	582885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240066
13164	NC_005042	TA	3	6	582956	582961	50 %	50 %	0 %	0 %	33240066
13165	NC_005042	T	6	6	582970	582975	0 %	100 %	0 %	0 %	33240066
13166	NC_005042	ATC	2	6	583056	583061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240066
13167	NC_005042	ATT	2	6	583111	583116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240066
13168	NC_005042	CTT	2	6	583127	583132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240066
13169	NC_005042	TGA	2	6	583156	583161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240066
13170	NC_005042	TCT	2	6	583165	583170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240066
13171	NC_005042	TTC	2	6	583176	583181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240066
13172	NC_005042	T	7	7	583272	583278	0 %	100 %	0 %	0 %	33240066
13173	NC_005042	T	6	6	583340	583345	0 %	100 %	0 %	0 %	33240066
13174	NC_005042	GATT	2	8	583374	583381	25 %	50 %	25 %	0 %	33240066
13175	NC_005042	TGT	2	6	583414	583419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240066
13176	NC_005042	TAT	2	6	583473	583478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240066
13177	NC_005042	AAGC	2	8	583531	583538	50 %	0 %	25 %	25 %	33240066
13178	NC_005042	CTCA	2	8	583602	583609	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13179	NC_005042	CT	3	6	583626	583631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13180	NC_005042	TCT	2	6	583658	583663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13181	NC_005042	CAA	2	6	583670	583675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13182	NC_005042	AGG	2	6	583685	583690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13183	NC_005042	ATC	2	6	583725	583730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13184	NC_005042	CCT	2	6	583843	583848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13185	NC_005042	GA	3	6	583873	583878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13186	NC_005042	CAA	3	9	583951	583959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13187	NC_005042	GTA	2	6	584001	584006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13188	NC_005042	GTT	2	6	584078	584083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13189	NC_005042	GGTA	2	8	584111	584118	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13190	NC_005042	TCA	2	6	584128	584133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13191	NC_005042	TTAA	2	8	584203	584210	50 %	50 %	0 %	0 %	33240067
13192	NC_005042	CTTC	2	8	584227	584234	0 %	50 %	0 %	50 %	33240067
13193	NC_005042	AGG	2	6	584267	584272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33240067
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13195	NC_005042	TTG	2	6	584364	584369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240067
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13197	NC_005042	GAAAAT	2	12	584408	584419	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	33240068
13198	NC_005042	GCA	2	6	584454	584459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240068
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13200	NC_005042	AAGA	2	8	584482	584489	75 %	0 %	25 %	0 %	33240068
13201	NC_005042	TCT	2	6	584496	584501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240068
13202	NC_005042	AG	3	6	584556	584561	50 %	0 %	50 %	0 %	33240068
13203	NC_005042	AAG	2	6	584640	584645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13204	NC_005042	TGATT	2	10	584684	584693	20 %	60 %	20 %	0 %	33240069
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13207	NC_005042	AGTTC	2	10	584849	584858	20 %	40 %	20 %	20 %	33240069
13208	NC_005042	GA	3	6	584891	584896	50 %	0 %	50 %	0 %	33240069
13209	NC_005042	AGA	2	6	584936	584941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13210	NC_005042	TGA	2	6	585054	585059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240070
13211	NC_005042	TCT	2	6	585069	585074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240070
13212	NC_005042	TGGTT	2	10	585122	585131	0 %	60 %	40 %	0 %	33240070
13213	NC_005042	AAC	2	6	585148	585153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240070
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13215	NC_005042	A	7	7	585260	585266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13216	NC_005042	AGA	2	6	585270	585275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13217	NC_005042	CAT	2	6	585276	585281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13218	NC_005042	TTA	2	6	585295	585300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13219	NC_005042	CGA	2	6	585336	585341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13220	NC_005042	AGA	2	6	585350	585355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13221	NC_005042	TAC	2	6	585364	585369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13222	NC_005042	GTT	2	6	585391	585396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240071
13223	NC_005042	CTTT	2	8	585410	585417	0 %	75 %	0 %	25 %	33240071
13224	NC_005042	TGT	2	6	585444	585449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240071
13225	NC_005042	CTTT	2	8	585476	585483	0 %	75 %	0 %	25 %	33240071
13226	NC_005042	CTTT	2	8	585491	585498	0 %	75 %	0 %	25 %	33240071
13227	NC_005042	GCT	2	6	585514	585519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240071
13228	NC_005042	GCT	2	6	585532	585537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240071
13229	NC_005042	T	6	6	585537	585542	0 %	100 %	0 %	0 %	33240071
13230	NC_005042	GTT	2	6	585547	585552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240071
13231	NC_005042	CTT	2	6	585579	585584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240071
13232	NC_005042	GTA	2	6	585589	585594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240071
13233	NC_005042	TGGC	2	8	585647	585654	0 %	25 %	50 %	25 %	33240071
13234	NC_005042	TTG	2	6	585655	585660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240071
13235	NC_005042	TGC	2	6	585681	585686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240071
13236	NC_005042	TTC	2	6	585709	585714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240071
13237	NC_005042	AAG	2	6	585716	585721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240071
13238	NC_005042	CAA	2	6	585761	585766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240071
13239	NC_005042	AGA	2	6	585921	585926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13240	NC_005042	TGTCA	2	10	585956	585965	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13241	NC_005042	TAA	2	6	586004	586009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13242	NC_005042	TAA	2	6	586070	586075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13243	NC_005042	TCT	2	6	586120	586125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240072
13244	NC_005042	AAT	2	6	586142	586147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240072
13245	NC_005042	GGT	2	6	586204	586209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33240072
13246	NC_005042	AGC	2	6	586264	586269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240072
13247	NC_005042	AAG	2	6	586375	586380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240073
13248	NC_005042	AC	3	6	586418	586423	50 %	0 %	0 %	50 %	33240073
13249	NC_005042	CTT	2	6	586464	586469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240073
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13378	NC_005042	AAT	2	6	592204	592209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240080
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