MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 39235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_005042	TAA	2	6	554170	554175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240036
12502	NC_005042	TGT	2	6	554247	554252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240037
12503	NC_005042	GCA	2	6	554318	554323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240037
12504	NC_005042	TCG	2	6	554373	554378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12505	NC_005042	GTT	2	6	554398	554403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_005042	GTTT	2	8	554436	554443	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_005042	ATTT	2	8	554634	554641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_005042	T	6	6	554701	554706	0 %	100 %	0 %	0 %	33240038
12509	NC_005042	CTAT	2	8	554709	554716	25 %	50 %	0 %	25 %	33240038
12510	NC_005042	AAG	2	6	554811	554816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240038
12511	NC_005042	TTGGT	2	10	554851	554860	0 %	60 %	40 %	0 %	33240038
12512	NC_005042	GAAT	2	8	554877	554884	50 %	25 %	25 %	0 %	33240038
12513	NC_005042	ATT	2	6	554891	554896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240038
12514	NC_005042	AAATAG	2	12	554940	554951	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	33240038
12515	NC_005042	CTT	2	6	554960	554965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240038
12516	NC_005042	AAG	2	6	555004	555009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240038
12517	NC_005042	AAT	2	6	555021	555026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_005042	TC	3	6	555148	555153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12519	NC_005042	TAA	2	6	555171	555176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_005042	CTTT	2	8	555202	555209	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12521	NC_005042	A	6	6	555226	555231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_005042	GATT	2	8	555237	555244	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_005042	TAA	2	6	555274	555279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_005042	AG	3	6	555290	555295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_005042	AGCAA	2	10	555473	555482	60 %	0 %	20 %	20 %	33240039
12526	NC_005042	TAA	2	6	555541	555546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240039
12527	NC_005042	T	6	6	555626	555631	0 %	100 %	0 %	0 %	33240039
12528	NC_005042	AAAG	2	8	555649	555656	75 %	0 %	25 %	0 %	33240039
12529	NC_005042	TCT	2	6	555675	555680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240039
12530	NC_005042	ATT	2	6	555724	555729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_005042	ATT	2	6	555737	555742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_005042	TAAA	2	8	555759	555766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_005042	TATTT	2	10	555769	555778	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_005042	ATC	2	6	555817	555822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240040
12535	NC_005042	TGA	2	6	555883	555888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240040
12536	NC_005042	CTTG	2	8	555908	555915	0 %	50 %	25 %	25 %	33240040
12537	NC_005042	AC	4	8	555919	555926	50 %	0 %	0 %	50 %	33240040
12538	NC_005042	AAC	2	6	556042	556047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240040
12539	NC_005042	ATT	2	6	556063	556068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240040
12540	NC_005042	A	6	6	556100	556105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_005042	GAG	2	6	556174	556179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_005042	ACG	2	6	556195	556200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240041
12543	NC_005042	TGTTC	2	10	556204	556213	0 %	60 %	20 %	20 %	33240041
12544	NC_005042	ATG	2	6	556255	556260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240041
12545	NC_005042	CAAAA	2	10	556366	556375	80 %	0 %	0 %	20 %	33240041
12546	NC_005042	TTAA	2	8	556376	556383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12547	NC_005042	TTG	2	6	556431	556436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12548	NC_005042	TTC	2	6	556511	556516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12549	NC_005042	AAG	2	6	556523	556528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_005042	ACTG	2	8	556555	556562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12551	NC_005042	A	9	9	556615	556623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_005042	TTA	2	6	556629	556634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_005042	T	8	8	556640	556647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_005042	TAATTT	2	12	556720	556731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_005042	T	6	6	556752	556757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_005042	T	6	6	556778	556783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_005042	GAA	2	6	556802	556807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240042
12558	NC_005042	CCA	2	6	556808	556813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33240042
12559	NC_005042	CATT	2	8	556871	556878	25 %	50 %	0 %	25 %	33240042
12560	NC_005042	CTT	2	6	556890	556895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240042
12561	NC_005042	T	6	6	556894	556899	0 %	100 %	0 %	0 %	33240042
12562	NC_005042	CTT	2	6	556990	556995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240042
12563	NC_005042	TCT	2	6	557027	557032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240042
12564	NC_005042	ATA	2	6	557052	557057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12565	NC_005042	TTC	2	6	557059	557064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12566	NC_005042	ATT	2	6	557075	557080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12567	NC_005042	TTA	2	6	557197	557202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240043
12568	NC_005042	TTA	2	6	557206	557211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240043
12569	NC_005042	AAT	2	6	557242	557247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240043
12570	NC_005042	TATAT	2	10	557283	557292	40 %	60 %	0 %	0 %	33240043
12571	NC_005042	AAC	2	6	557346	557351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12572	NC_005042	AAT	2	6	557358	557363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_005042	AAAT	2	8	557371	557378	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12574	NC_005042	TAA	2	6	557393	557398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12575	NC_005042	AT	3	6	557405	557410	50 %	50 %	0 %	0 %	33240044
12576	NC_005042	TTA	2	6	557489	557494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240044
12577	NC_005042	AAC	2	6	557497	557502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240044
12578	NC_005042	AGA	2	6	557609	557614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240044
12579	NC_005042	GTT	2	6	557722	557727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240044
12580	NC_005042	TTA	2	6	557753	557758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12581	NC_005042	TAA	2	6	557815	557820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240045
12582	NC_005042	T	6	6	557890	557895	0 %	100 %	0 %	0 %	33240045
12583	NC_005042	T	6	6	557988	557993	0 %	100 %	0 %	0 %	33240045
12584	NC_005042	TAGTT	2	10	558009	558018	20 %	60 %	20 %	0 %	33240045
12585	NC_005042	TTTTC	2	10	558020	558029	0 %	80 %	0 %	20 %	33240045
12586	NC_005042	GAAG	2	8	558162	558169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12587	NC_005042	AACA	2	8	558195	558202	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12588	NC_005042	CCT	2	6	558225	558230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12589	NC_005042	T	8	8	558317	558324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12590	NC_005042	CTC	2	6	558327	558332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12591	NC_005042	TTGGGG	2	12	558348	558359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12592	NC_005042	A	6	6	558384	558389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_005042	AAG	3	9	558401	558409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12594	NC_005042	GAA	2	6	558418	558423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_005042	A	6	6	558448	558453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_005042	GCT	2	6	558487	558492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240046
12597	NC_005042	CTTG	2	8	558505	558512	0 %	50 %	25 %	25 %	33240046
12598	NC_005042	GCTT	2	8	558559	558566	0 %	50 %	25 %	25 %	33240046
12599	NC_005042	CTT	2	6	558627	558632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240046
12600	NC_005042	CATA	2	8	558708	558715	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12601	NC_005042	AT	3	6	558730	558735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12602	NC_005042	ATT	2	6	558741	558746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_005042	AATC	2	8	558754	558761	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12604	NC_005042	AGAA	2	8	558771	558778	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12605	NC_005042	A	6	6	558788	558793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12606	NC_005042	TA	3	6	558840	558845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12607	NC_005042	TTAA	2	8	558856	558863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_005042	TAA	2	6	558873	558878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12609	NC_005042	TTTGT	2	10	558944	558953	0 %	80 %	20 %	0 %	33240047
12610	NC_005042	CTA	2	6	558960	558965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240047
12611	NC_005042	CAT	2	6	558981	558986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240047
12612	NC_005042	CTG	2	6	559002	559007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240047
12613	NC_005042	AAAG	2	8	559012	559019	75 %	0 %	25 %	0 %	33240047
12614	NC_005042	TTG	2	6	559045	559050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240047
12615	NC_005042	TTC	2	6	559105	559110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240047
12616	NC_005042	TGT	2	6	559208	559213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240047
12617	NC_005042	ACC	2	6	559216	559221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33240047
12618	NC_005042	TTCA	2	8	559240	559247	25 %	50 %	0 %	25 %	33240047
12619	NC_005042	GCT	2	6	559274	559279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240047
12620	NC_005042	CTA	2	6	559296	559301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240047
12621	NC_005042	TCA	2	6	559304	559309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240047
12622	NC_005042	GCT	2	6	559383	559388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240047
12623	NC_005042	TCC	2	6	559407	559412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33240047
12624	NC_005042	AAATA	2	10	559459	559468	80 %	20 %	0 %	0 %	33240047
12625	NC_005042	CTA	2	6	559487	559492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240047
12626	NC_005042	AAT	2	6	559710	559715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12627	NC_005042	ATTT	3	12	559720	559731	25 %	75 %	0 %	0 %	33240048
12628	NC_005042	ATA	2	6	559766	559771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240048
12629	NC_005042	AGT	2	6	559783	559788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240048
12630	NC_005042	TGC	2	6	559809	559814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240048
12631	NC_005042	TAA	2	6	559918	559923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240048
12632	NC_005042	GA	3	6	559925	559930	50 %	0 %	50 %	0 %	33240048
12633	NC_005042	TGC	2	6	560013	560018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240048
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12650	NC_005042	AT	3	6	560691	560696	50 %	50 %	0 %	0 %	33240049
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12685	NC_005042	CTT	2	6	561972	561977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12686	NC_005042	TTAAA	2	10	561995	562004	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12687	NC_005042	ATTT	2	8	562062	562069	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12688	NC_005042	TAGA	2	8	562090	562097	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12689	NC_005042	AGAA	2	8	562153	562160	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12690	NC_005042	CTT	2	6	562168	562173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12691	NC_005042	TAATC	2	10	562222	562231	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12692	NC_005042	TC	3	6	562260	562265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12693	NC_005042	GAT	2	6	562270	562275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12696	NC_005042	TGC	2	6	562342	562347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12723	NC_005042	TTAA	2	8	563861	563868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12724	NC_005042	GTT	2	6	563966	563971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12727	NC_005042	TC	3	6	564063	564068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12728	NC_005042	TGCTT	2	10	564088	564097	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12729	NC_005042	CT	3	6	564166	564171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12730	NC_005042	T	6	6	564171	564176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12731	NC_005042	TGTACT	2	12	564230	564241	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12732	NC_005042	TA	4	8	564263	564270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12733	NC_005042	GA	4	8	564271	564278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12734	NC_005042	A	6	6	564323	564328	100 %	0 %	0 %	0 %	33240054
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12736	NC_005042	ATC	2	6	564381	564386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240054
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12739	NC_005042	A	6	6	564542	564547	100 %	0 %	0 %	0 %	33240054
12740	NC_005042	CTT	5	15	564566	564580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240054
12741	NC_005042	CCTT	2	8	564625	564632	0 %	50 %	0 %	50 %	33240054
12742	NC_005042	ATT	2	6	564720	564725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240054
12743	NC_005042	TCC	2	6	564745	564750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33240054
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12746	NC_005042	GATT	2	8	565144	565151	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12747	NC_005042	ACAA	2	8	565326	565333	75 %	0 %	0 %	25 %	33240055
12748	NC_005042	AAG	2	6	565492	565497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240056
12749	NC_005042	TTG	2	6	565499	565504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240056
12750	NC_005042	TGT	2	6	565530	565535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240056
12751	NC_005042	CAA	2	6	565540	565545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240056
12752	NC_005042	GAT	2	6	565599	565604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240056
12753	NC_005042	GCT	2	6	565609	565614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240056
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