MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 39235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_005042	TTTC	2	8	440467	440474	0 %	75 %	0 %	25 %	33239909
10002	NC_005042	CCA	2	6	440524	440529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33239910
10003	NC_005042	TTA	2	6	440565	440570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239910
10004	NC_005042	TCC	2	6	440587	440592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239910
10005	NC_005042	AT	3	6	440680	440685	50 %	50 %	0 %	0 %	33239910
10006	NC_005042	TCA	2	6	440712	440717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239910
10007	NC_005042	A	7	7	440756	440762	100 %	0 %	0 %	0 %	33239910
10008	NC_005042	GGTT	2	8	440864	440871	0 %	50 %	50 %	0 %	33239910
10009	NC_005042	T	7	7	440980	440986	0 %	100 %	0 %	0 %	33239910
10010	NC_005042	TAAT	2	8	441021	441028	50 %	50 %	0 %	0 %	33239910
10011	NC_005042	TAA	2	6	441155	441160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239910
10012	NC_005042	ATTA	2	8	441208	441215	50 %	50 %	0 %	0 %	33239910
10013	NC_005042	GAA	2	6	441517	441522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239911
10014	NC_005042	CTT	2	6	441601	441606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239911
10015	NC_005042	AAC	2	6	441608	441613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239911
10016	NC_005042	ACC	2	6	441683	441688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33239911
10017	NC_005042	TTA	2	6	441693	441698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239911
10018	NC_005042	GCT	2	6	441723	441728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239911
10019	NC_005042	ATT	2	6	441746	441751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239911
10020	NC_005042	T	6	6	441754	441759	0 %	100 %	0 %	0 %	33239911
10021	NC_005042	CCT	2	6	441795	441800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239911
10022	NC_005042	AAT	2	6	441911	441916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239911
10023	NC_005042	TTC	2	6	441926	441931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239911
10024	NC_005042	TCT	2	6	441963	441968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239911
10025	NC_005042	TAC	2	6	442025	442030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239911
10026	NC_005042	TGC	2	6	442054	442059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239911
10027	NC_005042	TTC	2	6	442073	442078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239911
10028	NC_005042	GCT	2	6	442107	442112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239911
10029	NC_005042	ACTG	2	8	442134	442141	25 %	25 %	25 %	25 %	33239911
10030	NC_005042	CT	3	6	442208	442213	0 %	50 %	0 %	50 %	33239911
10031	NC_005042	TTG	2	6	442229	442234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239911
10032	NC_005042	ATT	2	6	442272	442277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239911
10033	NC_005042	AAT	2	6	442289	442294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239911
10034	NC_005042	A	6	6	442308	442313	100 %	0 %	0 %	0 %	33239911
10035	NC_005042	GCG	2	6	442322	442327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33239911
10036	NC_005042	TGATT	2	10	442330	442339	20 %	60 %	20 %	0 %	33239911
10037	NC_005042	AAG	2	6	442353	442358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_005042	GAA	2	6	442363	442368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_005042	CCA	2	6	442393	442398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33239912
10040	NC_005042	TCA	2	6	442454	442459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239912
10041	NC_005042	TCTATA	2	12	442460	442471	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	33239912
10042	NC_005042	AAAG	2	8	442484	442491	75 %	0 %	25 %	0 %	33239912
10043	NC_005042	TATT	2	8	442556	442563	25 %	75 %	0 %	0 %	33239912
10044	NC_005042	CAA	2	6	442647	442652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239912
10045	NC_005042	CAG	2	6	442701	442706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239912
10046	NC_005042	GAT	2	6	442707	442712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239912
10047	NC_005042	GTT	2	6	442763	442768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239912
10048	NC_005042	GAA	2	6	442801	442806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239912
10049	NC_005042	AAG	2	6	442861	442866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239912
10050	NC_005042	CA	3	6	442934	442939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10051	NC_005042	A	6	6	442987	442992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_005042	TCT	2	6	443050	443055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_005042	TGA	2	6	443067	443072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_005042	TAA	2	6	443091	443096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110645912
10055	NC_005042	G	6	6	443099	443104	0 %	0 %	100 %	0 %	110645912
10056	NC_005042	AAT	2	6	443154	443159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110645912
10057	NC_005042	AGC	2	6	443174	443179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110645912
10058	NC_005042	TTA	2	6	443278	443283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110645912
10059	NC_005042	GGA	2	6	443349	443354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110645912
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10061	NC_005042	TAA	2	6	443464	443469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239913
10062	NC_005042	CAAAA	2	10	443609	443618	80 %	0 %	0 %	20 %	33239913
10063	NC_005042	TTA	2	6	443671	443676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239913
10064	NC_005042	GCA	2	6	443688	443693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239913
10065	NC_005042	CCA	2	6	443705	443710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33239913
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10069	NC_005042	AG	3	6	443807	443812	50 %	0 %	50 %	0 %	33239913
10070	NC_005042	AT	3	6	443826	443831	50 %	50 %	0 %	0 %	33239913
10071	NC_005042	ATT	2	6	443841	443846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239913
10072	NC_005042	GAA	2	6	443905	443910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239913
10073	NC_005042	AATG	2	8	443911	443918	50 %	25 %	25 %	0 %	33239913
10074	NC_005042	CAG	2	6	443923	443928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239913
10075	NC_005042	AGA	2	6	443961	443966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239913
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10078	NC_005042	TTTG	2	8	444052	444059	0 %	75 %	25 %	0 %	33239913
10079	NC_005042	T	9	9	444082	444090	0 %	100 %	0 %	0 %	33239913
10080	NC_005042	TTTA	2	8	444119	444126	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_005042	TAA	3	9	444139	444147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_005042	ATT	2	6	444159	444164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_005042	ATT	2	6	444192	444197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_005042	AT	3	6	444209	444214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_005042	TAGATT	2	12	444295	444306	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	33239914
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10088	NC_005042	TGC	2	6	444467	444472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239914
10089	NC_005042	CAA	2	6	444535	444540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239914
10090	NC_005042	GAT	2	6	444577	444582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_005042	T	6	6	444699	444704	0 %	100 %	0 %	0 %	33239915
10092	NC_005042	TTGG	2	8	444712	444719	0 %	50 %	50 %	0 %	33239915
10093	NC_005042	TAGAA	2	10	444726	444735	60 %	20 %	20 %	0 %	33239915
10094	NC_005042	T	6	6	444738	444743	0 %	100 %	0 %	0 %	33239915
10095	NC_005042	ATC	2	6	444795	444800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239915
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10097	NC_005042	AT	3	6	444869	444874	50 %	50 %	0 %	0 %	33239915
10098	NC_005042	TTA	2	6	444880	444885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239915
10099	NC_005042	TGA	3	9	444913	444921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239915
10100	NC_005042	TAT	2	6	444936	444941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239915
10101	NC_005042	T	8	8	444984	444991	0 %	100 %	0 %	0 %	33239915
10102	NC_005042	TCT	2	6	444998	445003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239915
10103	NC_005042	TGT	2	6	445015	445020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239915
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10105	NC_005042	TCT	2	6	445045	445050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239915
10106	NC_005042	TCT	2	6	445066	445071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239915
10107	NC_005042	TAT	2	6	445097	445102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239915
10108	NC_005042	ATA	2	6	445105	445110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239915
10109	NC_005042	TCTT	2	8	445149	445156	0 %	75 %	0 %	25 %	33239915
10110	NC_005042	T	6	6	445245	445250	0 %	100 %	0 %	0 %	33239915
10111	NC_005042	ATT	2	6	445257	445262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239915
10112	NC_005042	CTT	2	6	445328	445333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239915
10113	NC_005042	TGA	2	6	445370	445375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239915
10114	NC_005042	T	6	6	445410	445415	0 %	100 %	0 %	0 %	33239915
10115	NC_005042	GTT	2	6	445425	445430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239915
10116	NC_005042	TAA	2	6	445435	445440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239915
10117	NC_005042	ATC	2	6	445473	445478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239915
10118	NC_005042	GA	3	6	445483	445488	50 %	0 %	50 %	0 %	33239915
10119	NC_005042	CTTGAA	2	12	445613	445624	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33239915
10120	NC_005042	TTC	2	6	445635	445640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239915
10121	NC_005042	TTCT	2	8	445647	445654	0 %	75 %	0 %	25 %	33239915
10122	NC_005042	AGG	2	6	445679	445684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33239915
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10124	NC_005042	GAG	3	9	445802	445810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33239915
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10231	NC_005042	CTG	2	6	450279	450284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239921
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10233	NC_005042	A	6	6	450416	450421	100 %	0 %	0 %	0 %	33239921
10234	NC_005042	A	6	6	450453	450458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10235	NC_005042	TTTA	2	8	450460	450467	25 %	75 %	0 %	0 %	33239922
10236	NC_005042	CTTG	2	8	450484	450491	0 %	50 %	25 %	25 %	33239922
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10242	NC_005042	AAC	2	6	450614	450619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239922
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10244	NC_005042	TTTC	2	8	450647	450654	0 %	75 %	0 %	25 %	33239922
10245	NC_005042	TCC	2	6	450670	450675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239922
10246	NC_005042	CTT	2	6	450701	450706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239922
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