MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 39235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_005042	TCC	2	6	348693	348698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239818
8002	NC_005042	TC	3	6	348760	348765	0 %	50 %	0 %	50 %	33239818
8003	NC_005042	TAA	2	6	348867	348872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239818
8004	NC_005042	CGCTTG	2	12	348914	348925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239818
8005	NC_005042	TTA	2	6	348947	348952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239818
8006	NC_005042	ATTTC	2	10	349000	349009	20 %	60 %	0 %	20 %	33239818
8007	NC_005042	CAA	2	6	349022	349027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239818
8008	NC_005042	ATT	2	6	349089	349094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239818
8009	NC_005042	CTT	2	6	349148	349153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239818
8010	NC_005042	CTT	3	9	349258	349266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239818
8011	NC_005042	TAA	2	6	349311	349316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239818
8012	NC_005042	TCA	2	6	349387	349392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239818
8013	NC_005042	CTG	2	6	349430	349435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239818
8014	NC_005042	ACA	2	6	349462	349467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239818
8015	NC_005042	TC	3	6	349469	349474	0 %	50 %	0 %	50 %	33239818
8016	NC_005042	CAT	3	9	349475	349483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239818
8017	NC_005042	TGT	2	6	349635	349640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239818
8018	NC_005042	TTG	2	6	349659	349664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239818
8019	NC_005042	A	6	6	349793	349798	100 %	0 %	0 %	0 %	33239818
8020	NC_005042	ATTA	2	8	349922	349929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_005042	CTC	2	6	349956	349961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239819
8022	NC_005042	GAT	2	6	350011	350016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239819
8023	NC_005042	CTT	2	6	350085	350090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239819
8024	NC_005042	TGA	2	6	350171	350176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239819
8025	NC_005042	ATG	2	6	350230	350235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239819
8026	NC_005042	TGCTTA	2	12	350237	350248	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	33239819
8027	NC_005042	TTTA	2	8	350267	350274	25 %	75 %	0 %	0 %	33239819
8028	NC_005042	CTG	2	6	350420	350425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239819
8029	NC_005042	GAG	2	6	350465	350470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33239819
8030	NC_005042	ACA	2	6	350488	350493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239819
8031	NC_005042	A	6	6	350616	350621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_005042	TAATT	2	10	350668	350677	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_005042	ATT	2	6	350758	350763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239820
8034	NC_005042	TA	3	6	350794	350799	50 %	50 %	0 %	0 %	33239820
8035	NC_005042	TTC	2	6	350908	350913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239820
8036	NC_005042	CAAA	2	8	350959	350966	75 %	0 %	0 %	25 %	33239820
8037	NC_005042	CTT	2	6	350967	350972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239820
8038	NC_005042	ATTGC	2	10	350976	350985	20 %	40 %	20 %	20 %	33239820
8039	NC_005042	TAAA	2	8	351034	351041	75 %	25 %	0 %	0 %	33239820
8040	NC_005042	AGA	2	6	351057	351062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239820
8041	NC_005042	ATTT	2	8	351105	351112	25 %	75 %	0 %	0 %	33239820
8042	NC_005042	AAG	2	6	351222	351227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239821
8043	NC_005042	TTG	2	6	351278	351283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239821
8044	NC_005042	GTTGA	2	10	351344	351353	20 %	40 %	40 %	0 %	33239821
8045	NC_005042	TTC	2	6	351365	351370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239821
8046	NC_005042	AGG	2	6	351432	351437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33239821
8047	NC_005042	TCC	2	6	351476	351481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239821
8048	NC_005042	T	6	6	351504	351509	0 %	100 %	0 %	0 %	33239821
8049	NC_005042	GTTTT	2	10	351522	351531	0 %	80 %	20 %	0 %	33239821
8050	NC_005042	GGA	2	6	351552	351557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33239821
8051	NC_005042	TGT	2	6	351591	351596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239821
8052	NC_005042	GAA	2	6	351604	351609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239821
8053	NC_005042	TTG	2	6	351629	351634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239821
8054	NC_005042	GAGT	2	8	351665	351672	25 %	25 %	50 %	0 %	33239821
8055	NC_005042	GAC	2	6	351700	351705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239821
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8057	NC_005042	TCT	2	6	351810	351815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239821
8058	NC_005042	AAG	3	9	351920	351928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239821
8059	NC_005042	GACT	2	8	351946	351953	25 %	25 %	25 %	25 %	33239821
8060	NC_005042	TAC	2	6	351961	351966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239821
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8062	NC_005042	ATCA	2	8	352055	352062	50 %	25 %	0 %	25 %	33239821
8063	NC_005042	AGT	2	6	352172	352177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239821
8064	NC_005042	ATA	2	6	352207	352212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239821
8065	NC_005042	CCA	2	6	352217	352222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33239821
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8067	NC_005042	T	6	6	352370	352375	0 %	100 %	0 %	0 %	33239821
8068	NC_005042	AAAT	2	8	352404	352411	75 %	25 %	0 %	0 %	33239821
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8072	NC_005042	TTGATT	2	12	352512	352523	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	33239821
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8074	NC_005042	AGA	2	6	352690	352695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_005042	ATT	2	6	352710	352715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_005042	T	7	7	352912	352918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_005042	CTTG	2	8	352994	353001	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8078	NC_005042	AATT	2	8	353040	353047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_005042	TGA	2	6	353064	353069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8081	NC_005042	AGG	2	6	353203	353208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_005042	ACT	2	6	353214	353219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8084	NC_005042	GGC	2	6	353348	353353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8085	NC_005042	CGAA	2	8	353373	353380	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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8087	NC_005042	TTG	2	6	353524	353529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8089	NC_005042	GCA	2	6	353626	353631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8091	NC_005042	GAA	2	6	353722	353727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8093	NC_005042	ATT	2	6	353812	353817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_005042	GGC	2	6	353836	353841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8095	NC_005042	CTG	2	6	353851	353856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8096	NC_005042	CAT	2	6	353878	353883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8097	NC_005042	GAA	2	6	353963	353968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_005042	CTG	2	6	353988	353993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_005042	ACGC	2	8	354145	354152	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8100	NC_005042	GAA	2	6	354226	354231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_005042	GGT	2	6	354300	354305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_005042	GTC	2	6	354314	354319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_005042	TCGTG	2	10	354323	354332	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8104	NC_005042	CCG	2	6	354410	354415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8105	NC_005042	GGA	2	6	354426	354431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_005042	TCA	2	6	354451	354456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8107	NC_005042	AC	3	6	354477	354482	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8108	NC_005042	TAC	2	6	354484	354489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8109	NC_005042	GCA	2	6	354507	354512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_005042	AGCA	2	8	354523	354530	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8111	NC_005042	AC	3	6	354646	354651	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8112	NC_005042	GGA	3	9	354707	354715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_005042	TGA	2	6	354731	354736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_005042	CCT	2	6	354788	354793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8115	NC_005042	ACA	2	6	354803	354808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_005042	TAA	2	6	354881	354886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_005042	A	6	6	354890	354895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_005042	CAA	2	6	354957	354962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8119	NC_005042	GTT	2	6	355050	355055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8121	NC_005042	GTT	2	6	355187	355192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_005042	TGAA	2	8	355197	355204	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_005042	CTTT	2	8	355223	355230	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8124	NC_005042	TTC	2	6	355262	355267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8125	NC_005042	ATT	2	6	355270	355275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_005042	CAG	2	6	355285	355290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8127	NC_005042	TTA	2	6	355358	355363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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