MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 39235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_005042	A	6	6	238257	238262	100 %	0 %	0 %	0 %	33239693
5502	NC_005042	GTA	2	6	238292	238297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239693
5503	NC_005042	TGC	2	6	238360	238365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239694
5504	NC_005042	CTT	2	6	238374	238379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239694
5505	NC_005042	CTT	2	6	238479	238484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239694
5506	NC_005042	CAT	2	6	238576	238581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239694
5507	NC_005042	TGC	2	6	238600	238605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239694
5508	NC_005042	TTA	2	6	238700	238705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239694
5509	NC_005042	CTA	2	6	238794	238799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239694
5510	NC_005042	A	6	6	238821	238826	100 %	0 %	0 %	0 %	33239694
5511	NC_005042	AAAG	2	8	238868	238875	75 %	0 %	25 %	0 %	33239694
5512	NC_005042	CAAT	2	8	238901	238908	50 %	25 %	0 %	25 %	33239694
5513	NC_005042	AAG	2	6	238942	238947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239694
5514	NC_005042	T	6	6	238959	238964	0 %	100 %	0 %	0 %	33239694
5515	NC_005042	TTG	2	6	239070	239075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239694
5516	NC_005042	GTAA	2	8	239192	239199	50 %	25 %	25 %	0 %	33239694
5517	NC_005042	ATT	2	6	239246	239251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239694
5518	NC_005042	TATT	2	8	239258	239265	25 %	75 %	0 %	0 %	33239694
5519	NC_005042	ATT	2	6	239438	239443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239694
5520	NC_005042	TGC	2	6	239455	239460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239694
5521	NC_005042	A	6	6	239481	239486	100 %	0 %	0 %	0 %	33239694
5522	NC_005042	TGT	2	6	239488	239493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239694
5523	NC_005042	AAG	2	6	239530	239535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239694
5524	NC_005042	AAT	3	9	239554	239562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239694
5525	NC_005042	AAC	2	6	239590	239595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239694
5526	NC_005042	AAC	2	6	239668	239673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239694
5527	NC_005042	TGC	2	6	239674	239679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239694
5528	NC_005042	GAA	2	6	239691	239696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239694
5529	NC_005042	TCC	2	6	239806	239811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239694
5530	NC_005042	CAA	2	6	239832	239837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239694
5531	NC_005042	CCA	2	6	239867	239872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33239694
5532	NC_005042	AGC	2	6	239881	239886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239694
5533	NC_005042	GCTAGT	2	12	239897	239908	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	33239694
5534	NC_005042	CAA	2	6	239916	239921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239694
5535	NC_005042	CTG	3	9	239922	239930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239694
5536	NC_005042	ACC	2	6	239935	239940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33239694
5537	NC_005042	TAT	2	6	240084	240089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_005042	AGT	2	6	240124	240129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_005042	TA	3	6	240149	240154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_005042	ACG	2	6	240215	240220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239695
5541	NC_005042	AAG	2	6	240242	240247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239695
5542	NC_005042	TTTA	2	8	240293	240300	25 %	75 %	0 %	0 %	33239695
5543	NC_005042	TGGT	2	8	240370	240377	0 %	50 %	50 %	0 %	33239695
5544	NC_005042	TGTGT	2	10	240411	240420	0 %	60 %	40 %	0 %	33239695
5545	NC_005042	TGA	2	6	240434	240439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239695
5546	NC_005042	AGA	2	6	240452	240457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239695
5547	NC_005042	AAT	2	6	240536	240541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239695
5548	NC_005042	ATG	2	6	240580	240585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239695
5549	NC_005042	GTT	2	6	240606	240611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239695
5550	NC_005042	ATG	2	6	240616	240621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239695
5551	NC_005042	GCT	3	9	240660	240668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239695
5552	NC_005042	TGATT	2	10	240674	240683	20 %	60 %	20 %	0 %	33239695
5553	NC_005042	ATG	2	6	240696	240701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239695
5554	NC_005042	GAA	2	6	240738	240743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239695
5555	NC_005042	TTC	2	6	240785	240790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239695
5556	NC_005042	TTA	2	6	240794	240799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239695
5557	NC_005042	AG	3	6	240810	240815	50 %	0 %	50 %	0 %	33239695
5558	NC_005042	TAA	2	6	240842	240847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239695
5559	NC_005042	TGA	2	6	240929	240934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239695
5560	NC_005042	AAG	2	6	240937	240942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239695
5561	NC_005042	ATT	2	6	240987	240992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239695
5562	NC_005042	TGC	2	6	241025	241030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239695
5563	NC_005042	GTG	2	6	241042	241047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33239695
5564	NC_005042	GCA	2	6	241065	241070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239695
5565	NC_005042	TGA	2	6	241088	241093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239695
5566	NC_005042	AG	3	6	241129	241134	50 %	0 %	50 %	0 %	33239695
5567	NC_005042	GAA	2	6	241268	241273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239696
5568	NC_005042	GAT	2	6	241376	241381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239696
5569	NC_005042	TTG	2	6	241430	241435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239696
5570	NC_005042	AGC	2	6	241450	241455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239696
5571	NC_005042	TAA	2	6	241480	241485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239696
5572	NC_005042	CGT	2	6	241572	241577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239696
5573	NC_005042	TTGG	2	8	241603	241610	0 %	50 %	50 %	0 %	33239696
5574	NC_005042	TTCC	2	8	241638	241645	0 %	50 %	0 %	50 %	33239696
5575	NC_005042	TGA	2	6	241724	241729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239697
5576	NC_005042	TTG	2	6	241740	241745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239697
5577	NC_005042	GCTT	2	8	241769	241776	0 %	50 %	25 %	25 %	33239697
5578	NC_005042	A	8	8	241801	241808	100 %	0 %	0 %	0 %	33239697
5579	NC_005042	GAT	2	6	241830	241835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239697
5580	NC_005042	GAA	2	6	241890	241895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239697
5581	NC_005042	AGG	2	6	241901	241906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33239697
5582	NC_005042	CTG	2	6	241944	241949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239697
5583	NC_005042	TTC	2	6	241952	241957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239697
5584	NC_005042	TTCT	2	8	241969	241976	0 %	75 %	0 %	25 %	33239697
5585	NC_005042	GTT	2	6	241985	241990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239697
5586	NC_005042	TCG	2	6	242018	242023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239697
5587	NC_005042	CT	3	6	242076	242081	0 %	50 %	0 %	50 %	33239697
5588	NC_005042	AGA	2	6	242129	242134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239697
5589	NC_005042	AGG	2	6	242135	242140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33239697
5590	NC_005042	GA	3	6	242208	242213	50 %	0 %	50 %	0 %	33239697
5591	NC_005042	TTC	2	6	242254	242259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239697
5592	NC_005042	AGA	2	6	242441	242446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239697
5593	NC_005042	ATT	2	6	242453	242458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239697
5594	NC_005042	GAG	2	6	242472	242477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33239697
5595	NC_005042	TTG	2	6	242520	242525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239697
5596	NC_005042	GCGCGT	2	12	242544	242555	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33239697
5597	NC_005042	TTGG	2	8	242564	242571	0 %	50 %	50 %	0 %	33239697
5598	NC_005042	CATT	2	8	242611	242618	25 %	50 %	0 %	25 %	33239697
5599	NC_005042	ACT	2	6	242639	242644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239697
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5602	NC_005042	CGT	2	6	242830	242835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239697
5603	NC_005042	CAG	2	6	242886	242891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239697
5604	NC_005042	TGT	2	6	242915	242920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239697
5605	NC_005042	ATT	2	6	242925	242930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239697
5606	NC_005042	AAT	2	6	242969	242974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239697
5607	NC_005042	AGACAA	2	12	243330	243341	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	33239697
5608	NC_005042	AGA	2	6	243353	243358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239697
5609	NC_005042	ATG	2	6	243394	243399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239697
5610	NC_005042	CAA	2	6	243429	243434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239697
5611	NC_005042	AATT	2	8	243508	243515	50 %	50 %	0 %	0 %	33239697
5612	NC_005042	GATC	2	8	243528	243535	25 %	25 %	25 %	25 %	33239697
5613	NC_005042	CAG	2	6	243700	243705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239697
5614	NC_005042	TTG	2	6	243748	243753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239697
5615	NC_005042	GTA	2	6	243807	243812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239697
5616	NC_005042	ACT	2	6	243825	243830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239697
5617	NC_005042	GAA	2	6	243918	243923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239697
5618	NC_005042	TGGT	2	8	243937	243944	0 %	50 %	50 %	0 %	33239697
5619	NC_005042	GTT	2	6	243954	243959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239697
5620	NC_005042	A	7	7	243983	243989	100 %	0 %	0 %	0 %	33239697
5621	NC_005042	A	6	6	244027	244032	100 %	0 %	0 %	0 %	33239697
5622	NC_005042	GGA	2	6	244056	244061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33239697
5623	NC_005042	TAT	2	6	244073	244078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239697
5624	NC_005042	TGA	2	6	244089	244094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239697
5625	NC_005042	CTA	2	6	244199	244204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_005042	AG	3	6	244284	244289	50 %	0 %	50 %	0 %	33239698
5627	NC_005042	AGG	2	6	244304	244309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33239698
5628	NC_005042	AGG	2	6	244316	244321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33239698
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5653	NC_005042	GAAA	2	8	245091	245098	75 %	0 %	25 %	0 %	33239698
5654	NC_005042	ATT	2	6	245203	245208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5655	NC_005042	CAT	2	6	245319	245324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239699
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5662	NC_005042	ATT	2	6	245484	245489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5663	NC_005042	A	7	7	245495	245501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5664	NC_005042	T	6	6	245521	245526	0 %	100 %	0 %	0 %	33239700
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5674	NC_005042	TCAA	2	8	245929	245936	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5675	NC_005042	CTT	2	6	245966	245971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239701
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5731	NC_005042	AT	3	6	248600	248605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5732	NC_005042	TAA	2	6	248611	248616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5733	NC_005042	CTT	2	6	248620	248625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5734	NC_005042	CTC	2	6	248661	248666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5735	NC_005042	ATA	2	6	248674	248679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5736	NC_005042	T	7	7	248709	248715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5743	NC_005042	CTC	2	6	248891	248896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239704
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5869	NC_005042	AT	3	6	254820	254825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5870	NC_005042	GA	3	6	254837	254842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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