MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 39235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_005042	ACT	2	6	193482	193487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239648
4502	NC_005042	CTT	3	9	193517	193525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239648
4503	NC_005042	TGA	2	6	193548	193553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239648
4504	NC_005042	AAT	2	6	193554	193559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239648
4505	NC_005042	TGC	2	6	193596	193601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239648
4506	NC_005042	CTC	3	9	193679	193687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239648
4507	NC_005042	TTG	2	6	193691	193696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239648
4508	NC_005042	GAAG	2	8	193729	193736	50 %	0 %	50 %	0 %	33239648
4509	NC_005042	GT	4	8	193775	193782	0 %	50 %	50 %	0 %	33239648
4510	NC_005042	TTC	2	6	193809	193814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239648
4511	NC_005042	TGG	2	6	193896	193901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33239649
4512	NC_005042	CAT	2	6	193916	193921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239649
4513	NC_005042	TGC	2	6	193938	193943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239649
4514	NC_005042	TAG	2	6	193947	193952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239649
4515	NC_005042	ATTG	2	8	193976	193983	25 %	50 %	25 %	0 %	33239649
4516	NC_005042	TGTT	2	8	194049	194056	0 %	75 %	25 %	0 %	33239649
4517	NC_005042	GGAT	2	8	194070	194077	25 %	25 %	50 %	0 %	33239649
4518	NC_005042	TA	3	6	194162	194167	50 %	50 %	0 %	0 %	33239649
4519	NC_005042	ATC	2	6	194202	194207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239649
4520	NC_005042	T	6	6	194224	194229	0 %	100 %	0 %	0 %	33239649
4521	NC_005042	T	7	7	194255	194261	0 %	100 %	0 %	0 %	33239649
4522	NC_005042	AGC	2	6	194302	194307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239649
4523	NC_005042	ATAA	2	8	194324	194331	75 %	25 %	0 %	0 %	33239649
4524	NC_005042	TTTC	2	8	194335	194342	0 %	75 %	0 %	25 %	33239649
4525	NC_005042	TGG	2	6	194347	194352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33239649
4526	NC_005042	TGA	2	6	194425	194430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239649
4527	NC_005042	ATTA	2	8	194440	194447	50 %	50 %	0 %	0 %	33239649
4528	NC_005042	AAT	2	6	194450	194455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239649
4529	NC_005042	TCGAA	2	10	194470	194479	40 %	20 %	20 %	20 %	33239649
4530	NC_005042	GGAA	2	8	194755	194762	50 %	0 %	50 %	0 %	33239649
4531	NC_005042	A	6	6	194761	194766	100 %	0 %	0 %	0 %	33239649
4532	NC_005042	AAAG	2	8	194803	194810	75 %	0 %	25 %	0 %	33239649
4533	NC_005042	GT	3	6	194880	194885	0 %	50 %	50 %	0 %	33239649
4534	NC_005042	TAA	2	6	194896	194901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239649
4535	NC_005042	TGC	2	6	194932	194937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239649
4536	NC_005042	TTC	2	6	194958	194963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239649
4537	NC_005042	ATT	2	6	195049	195054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239649
4538	NC_005042	GCA	2	6	195121	195126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239650
4539	NC_005042	TCA	2	6	195141	195146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239650
4540	NC_005042	GTT	2	6	195147	195152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239650
4541	NC_005042	GAA	2	6	195175	195180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239650
4542	NC_005042	TAGA	2	8	195185	195192	50 %	25 %	25 %	0 %	33239650
4543	NC_005042	CTT	2	6	195221	195226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239650
4544	NC_005042	TCAACT	2	12	195238	195249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239650
4545	NC_005042	T	6	6	195285	195290	0 %	100 %	0 %	0 %	33239650
4546	NC_005042	AGA	2	6	195382	195387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239650
4547	NC_005042	TCT	2	6	195490	195495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239650
4548	NC_005042	ATTT	3	12	195543	195554	25 %	75 %	0 %	0 %	33239651
4549	NC_005042	AT	3	6	195567	195572	50 %	50 %	0 %	0 %	33239651
4550	NC_005042	T	7	7	195661	195667	0 %	100 %	0 %	0 %	33239651
4551	NC_005042	T	6	6	195689	195694	0 %	100 %	0 %	0 %	33239651
4552	NC_005042	CTAA	2	8	195698	195705	50 %	25 %	0 %	25 %	33239651
4553	NC_005042	TTC	2	6	195727	195732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239651
4554	NC_005042	GCA	2	6	195785	195790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239651
4555	NC_005042	ATT	2	6	195824	195829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239651
4556	NC_005042	AAT	2	6	195865	195870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239651
4557	NC_005042	TAA	2	6	195898	195903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239651
4558	NC_005042	CTT	2	6	195933	195938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239651
4559	NC_005042	GAA	2	6	196058	196063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239651
4560	NC_005042	TCT	2	6	196082	196087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239651
4561	NC_005042	GTT	2	6	196112	196117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239651
4562	NC_005042	TGT	2	6	196120	196125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239651
4563	NC_005042	CTC	2	6	196194	196199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239651
4564	NC_005042	AAT	2	6	196207	196212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239651
4565	NC_005042	CAG	2	6	196239	196244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239651
4566	NC_005042	AGTT	2	8	196261	196268	25 %	50 %	25 %	0 %	33239651
4567	NC_005042	ATG	2	6	196281	196286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239651
4568	NC_005042	TGA	3	9	196301	196309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239651
4569	NC_005042	TCT	2	6	196331	196336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239651
4570	NC_005042	CAA	2	6	196391	196396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239651
4571	NC_005042	CCA	2	6	196405	196410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33239651
4572	NC_005042	GAA	2	6	196413	196418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239651
4573	NC_005042	ATG	2	6	196429	196434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239651
4574	NC_005042	TTG	2	6	196500	196505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239651
4575	NC_005042	GATT	2	8	196514	196521	25 %	50 %	25 %	0 %	33239651
4576	NC_005042	ATG	2	6	196534	196539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239651
4577	NC_005042	TTG	2	6	196546	196551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239651
4578	NC_005042	TAA	2	6	196578	196583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239651
4579	NC_005042	TTC	2	6	196696	196701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239651
4580	NC_005042	ATT	2	6	196721	196726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239651
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4582	NC_005042	A	6	6	196775	196780	100 %	0 %	0 %	0 %	33239652
4583	NC_005042	TGC	2	6	196848	196853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239652
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4585	NC_005042	TA	3	6	196908	196913	50 %	50 %	0 %	0 %	33239652
4586	NC_005042	T	7	7	196918	196924	0 %	100 %	0 %	0 %	33239652
4587	NC_005042	TA	3	6	197015	197020	50 %	50 %	0 %	0 %	33239652
4588	NC_005042	ATTC	2	8	197060	197067	25 %	50 %	0 %	25 %	33239652
4589	NC_005042	ATC	2	6	197079	197084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239652
4590	NC_005042	ACTG	2	8	197317	197324	25 %	25 %	25 %	25 %	33239652
4591	NC_005042	GATT	2	8	197340	197347	25 %	50 %	25 %	0 %	33239652
4592	NC_005042	CAA	3	9	197358	197366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239652
4593	NC_005042	AGT	2	6	197417	197422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239652
4594	NC_005042	CTT	2	6	197483	197488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239652
4595	NC_005042	AACCT	2	10	197582	197591	40 %	20 %	0 %	40 %	33239652
4596	NC_005042	T	9	9	197629	197637	0 %	100 %	0 %	0 %	33239652
4597	NC_005042	ATGAA	2	10	197673	197682	60 %	20 %	20 %	0 %	33239652
4598	NC_005042	TGA	2	6	197844	197849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239653
4599	NC_005042	AATT	2	8	197864	197871	50 %	50 %	0 %	0 %	33239653
4600	NC_005042	AGG	2	6	197879	197884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33239653
4601	NC_005042	CCAAG	2	10	197947	197956	40 %	0 %	20 %	40 %	33239653
4602	NC_005042	GCA	2	6	197985	197990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239653
4603	NC_005042	T	8	8	198022	198029	0 %	100 %	0 %	0 %	33239653
4604	NC_005042	GCA	2	6	198036	198041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239653
4605	NC_005042	TGA	2	6	198054	198059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239653
4606	NC_005042	TGT	2	6	198083	198088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239653
4607	NC_005042	CAG	2	6	198094	198099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239653
4608	NC_005042	TGC	2	6	198119	198124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239653
4609	NC_005042	ATTGG	2	10	198135	198144	20 %	40 %	40 %	0 %	33239653
4610	NC_005042	TGC	2	6	198179	198184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239653
4611	NC_005042	AGG	2	6	198251	198256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33239653
4612	NC_005042	A	7	7	198300	198306	100 %	0 %	0 %	0 %	33239653
4613	NC_005042	CTA	2	6	198321	198326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239653
4614	NC_005042	TCA	2	6	198432	198437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239653
4615	NC_005042	GTT	2	6	198444	198449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239653
4616	NC_005042	CTG	2	6	198562	198567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239653
4617	NC_005042	T	7	7	198629	198635	0 %	100 %	0 %	0 %	33239653
4618	NC_005042	GAA	2	6	198648	198653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239653
4619	NC_005042	CCT	2	6	198702	198707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4620	NC_005042	TCC	2	6	198793	198798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239654
4621	NC_005042	CTT	2	6	198802	198807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239654
4622	NC_005042	TGA	2	6	198833	198838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239654
4623	NC_005042	GT	4	8	198839	198846	0 %	50 %	50 %	0 %	33239654
4624	NC_005042	CTT	2	6	198923	198928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239654
4625	NC_005042	GCT	3	9	198957	198965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239654
4626	NC_005042	AATT	2	8	198985	198992	50 %	50 %	0 %	0 %	33239654
4627	NC_005042	TGA	2	6	199028	199033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239654
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4629	NC_005042	AT	3	6	199054	199059	50 %	50 %	0 %	0 %	33239654
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4631	NC_005042	CTTT	2	8	199108	199115	0 %	75 %	0 %	25 %	33239654
4632	NC_005042	TGA	2	6	199127	199132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239654
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4634	NC_005042	CTG	2	6	199156	199161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239654
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4650	NC_005042	GCA	2	6	199950	199955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239654
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4654	NC_005042	AGA	2	6	200166	200171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239654
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4657	NC_005042	A	8	8	200288	200295	100 %	0 %	0 %	0 %	33239655
4658	NC_005042	GA	3	6	200309	200314	50 %	0 %	50 %	0 %	33239655
4659	NC_005042	AG	3	6	200351	200356	50 %	0 %	50 %	0 %	33239655
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4678	NC_005042	TTAT	2	8	201078	201085	25 %	75 %	0 %	0 %	33239656
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4683	NC_005042	TGA	2	6	201361	201366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4684	NC_005042	GTT	2	6	201404	201409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4685	NC_005042	TCTT	2	8	201453	201460	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4686	NC_005042	GCT	2	6	201545	201550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239657
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4876	NC_005042	AGC	2	6	209990	209995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239666
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4878	NC_005042	GCT	2	6	210112	210117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239666
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4881	NC_005042	TCCA	2	8	210206	210213	25 %	25 %	0 %	50 %	33239666
4882	NC_005042	TTA	2	6	210214	210219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239666
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4884	NC_005042	TTG	2	6	210300	210305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239666
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4888	NC_005042	CAATTG	2	12	210364	210375	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33239666
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4907	NC_005042	A	6	6	211340	211345	100 %	0 %	0 %	0 %	33239668
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4926	NC_005042	TAA	2	6	212549	212554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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