MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 plasmid pDC3000B

Total Repeats: 1205

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004632	A	6	6	55439	55444	100 %	0 %	0 %	0 %	29171605
1002	NC_004632	GTC	2	6	55468	55473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171605
1003	NC_004632	GTG	2	6	55530	55535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171605
1004	NC_004632	TGT	2	6	55568	55573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29171605
1005	NC_004632	ACC	2	6	55642	55647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171605
1006	NC_004632	TGAC	2	8	55739	55746	25 %	25 %	25 %	25 %	29171605
1007	NC_004632	CACG	2	8	55799	55806	25 %	0 %	25 %	50 %	29171605
1008	NC_004632	CGAT	2	8	55817	55824	25 %	25 %	25 %	25 %	29171605
1009	NC_004632	ACC	2	6	55849	55854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171605
1010	NC_004632	G	6	6	55908	55913	0 %	0 %	100 %	0 %	29171605
1011	NC_004632	ACC	2	6	55970	55975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171605
1012	NC_004632	AGC	2	6	55997	56002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171605
1013	NC_004632	AGG	2	6	56009	56014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29171605
1014	NC_004632	ACG	2	6	56030	56035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171605
1015	NC_004632	ATG	2	6	56188	56193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171605
1016	NC_004632	CAG	2	6	56285	56290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171605
1017	NC_004632	GCG	2	6	56300	56305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171605
1018	NC_004632	GGC	2	6	56338	56343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171605
1019	NC_004632	GC	3	6	56350	56355	0 %	0 %	50 %	50 %	29171605
1020	NC_004632	ACCG	2	8	56406	56413	25 %	0 %	25 %	50 %	29171605
1021	NC_004632	CGG	2	6	56448	56453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171605
1022	NC_004632	AAGC	2	8	56527	56534	50 %	0 %	25 %	25 %	29171605
1023	NC_004632	ACA	2	6	56600	56605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29171605
1024	NC_004632	ACA	2	6	56671	56676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29171606
1025	NC_004632	GGCC	2	8	56749	56756	0 %	0 %	50 %	50 %	29171606
1026	NC_004632	CGG	2	6	57003	57008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171606
1027	NC_004632	AGA	2	6	57048	57053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29171606
1028	NC_004632	GCC	2	6	57101	57106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29171606
1029	NC_004632	CA	3	6	57124	57129	50 %	0 %	0 %	50 %	29171606
1030	NC_004632	CGG	2	6	57148	57153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171606
1031	NC_004632	CTGAC	2	10	57246	57255	20 %	20 %	20 %	40 %	29171606
1032	NC_004632	ATCAGG	2	12	57261	57272	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	29171606
1033	NC_004632	GAA	2	6	57295	57300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29171606
1034	NC_004632	G	6	6	57317	57322	0 %	0 %	100 %	0 %	29171606
1035	NC_004632	TGA	2	6	57378	57383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171606
1036	NC_004632	CGC	2	6	57406	57411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29171606
1037	NC_004632	CGC	2	6	57436	57441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29171606
1038	NC_004632	CA	3	6	57460	57465	50 %	0 %	0 %	50 %	29171606
1039	NC_004632	GCG	2	6	57500	57505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171606
1040	NC_004632	TGA	2	6	57552	57557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171606
1041	NC_004632	CAT	2	6	57727	57732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171606
1042	NC_004632	GGC	2	6	57754	57759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171606
1043	NC_004632	ACA	2	6	57843	57848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29171607
1044	NC_004632	CGC	2	6	57868	57873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29171607
1045	NC_004632	GAC	2	6	57876	57881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171607
1046	NC_004632	GC	3	6	57905	57910	0 %	0 %	50 %	50 %	29171607
1047	NC_004632	CAG	2	6	58088	58093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171607
1048	NC_004632	TGC	2	6	58133	58138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171607
1049	NC_004632	TGG	2	6	58140	58145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171607
1050	NC_004632	GTG	2	6	58159	58164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171607
1051	NC_004632	CTG	2	6	58182	58187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171607
1052	NC_004632	TGC	2	6	58192	58197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171607
1053	NC_004632	CCT	2	6	58463	58468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29171608
1054	NC_004632	TGG	2	6	58479	58484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171608
1055	NC_004632	CTG	2	6	58494	58499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171608
1056	NC_004632	TGA	2	6	58594	58599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171608
1057	NC_004632	CGG	2	6	58802	58807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171608
1058	NC_004632	TCA	2	6	58810	58815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171608
1059	NC_004632	ATG	2	6	58926	58931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171608
1060	NC_004632	ACC	2	6	59082	59087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171608
1061	NC_004632	G	6	6	59090	59095	0 %	0 %	100 %	0 %	29171608
1062	NC_004632	TGT	2	6	59182	59187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29171608
1063	NC_004632	GCA	2	6	59225	59230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171608
1064	NC_004632	ACCT	2	8	59289	59296	25 %	25 %	0 %	50 %	29171608
1065	NC_004632	GCC	3	9	59358	59366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29171608
1066	NC_004632	CAA	2	6	59393	59398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29171608
1067	NC_004632	ATG	2	6	59512	59517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171608
1068	NC_004632	GAT	2	6	59664	59669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171608
1069	NC_004632	T	7	7	59747	59753	0 %	100 %	0 %	0 %	29171608
1070	NC_004632	GCC	3	9	59883	59891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29171608
1071	NC_004632	G	6	6	59920	59925	0 %	0 %	100 %	0 %	29171608
1072	NC_004632	GC	3	6	59974	59979	0 %	0 %	50 %	50 %	29171608
1073	NC_004632	CTG	2	6	60012	60017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171608
1074	NC_004632	CTGC	2	8	60045	60052	0 %	25 %	25 %	50 %	29171608
1075	NC_004632	GAT	2	6	60071	60076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171608
1076	NC_004632	GTC	2	6	60093	60098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171608
1077	NC_004632	TGG	2	6	60106	60111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171608
1078	NC_004632	ATG	2	6	60207	60212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171608
1079	NC_004632	CGT	2	6	60220	60225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171608
1080	NC_004632	GAT	2	6	60347	60352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171608
1081	NC_004632	TGA	2	6	60361	60366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171608
1082	NC_004632	AGG	2	6	60449	60454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29171608
1083	NC_004632	GGC	2	6	60477	60482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171608
1084	NC_004632	TGC	2	6	60512	60517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171608
1085	NC_004632	G	6	6	60576	60581	0 %	0 %	100 %	0 %	29171608
1086	NC_004632	TTCA	2	8	60697	60704	25 %	50 %	0 %	25 %	29171609
1087	NC_004632	ATG	2	6	60705	60710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171609
1088	NC_004632	TCA	2	6	60722	60727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171609
1089	NC_004632	GATC	2	8	60758	60765	25 %	25 %	25 %	25 %	29171609
1090	NC_004632	GCC	2	6	60778	60783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29171609
1091	NC_004632	TGA	2	6	60839	60844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171609
1092	NC_004632	ATT	2	6	60850	60855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29171609
1093	NC_004632	AAG	2	6	60975	60980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29171610
1094	NC_004632	TGC	2	6	61105	61110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171610
1095	NC_004632	CGC	2	6	61169	61174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29171610
1096	NC_004632	ACG	2	6	61193	61198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171610
1097	NC_004632	AGGTC	2	10	61324	61333	20 %	20 %	40 %	20 %	29171610
1098	NC_004632	TGG	2	6	61338	61343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171610
1099	NC_004632	GAC	2	6	61355	61360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171610
1100	NC_004632	GACC	2	8	61363	61370	25 %	0 %	25 %	50 %	29171610
1101	NC_004632	AAGCAG	2	12	61490	61501	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	29171610
1102	NC_004632	ACC	2	6	61539	61544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171610
1103	NC_004632	TGT	2	6	61763	61768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29171611
1104	NC_004632	TTC	2	6	61777	61782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29171611
1105	NC_004632	ACC	2	6	61801	61806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171611
1106	NC_004632	TGG	2	6	61832	61837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171611
1107	NC_004632	CTG	2	6	61879	61884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171611
1108	NC_004632	TGA	2	6	61937	61942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171611
1109	NC_004632	CCA	2	6	61946	61951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171611
1110	NC_004632	CTG	3	9	61960	61968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171611
1111	NC_004632	GCA	2	6	62010	62015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171611
1112	NC_004632	CCTGG	2	10	62065	62074	0 %	20 %	40 %	40 %	29171611
1113	NC_004632	TGA	2	6	62132	62137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171611
1114	NC_004632	GAG	2	6	62176	62181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29171611
1115	NC_004632	GAG	2	6	62248	62253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29171611
1116	NC_004632	ATG	2	6	62270	62275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171611
1117	NC_004632	GTT	2	6	62403	62408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29171611
1118	NC_004632	GCG	2	6	62409	62414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171611
1119	NC_004632	CGC	2	6	62432	62437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29171611
1120	NC_004632	AGTG	2	8	62491	62498	25 %	25 %	50 %	0 %	29171611
1121	NC_004632	TGG	2	6	62531	62536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171611
1122	NC_004632	GC	3	6	62569	62574	0 %	0 %	50 %	50 %	29171611
1123	NC_004632	TCAGGC	2	12	62664	62675	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	29171611
1124	NC_004632	TCA	2	6	62795	62800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171611
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