MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004578	GCC	2	6	207730	207735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867424
4002	NC_004578	GAA	2	6	207814	207819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867425
4003	NC_004578	CGC	2	6	207921	207926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867425
4004	NC_004578	CGC	2	6	208001	208006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867425
4005	NC_004578	AAG	2	6	208063	208068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867425
4006	NC_004578	GCG	2	6	208070	208075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867425
4007	NC_004578	ACC	2	6	208144	208149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867425
4008	NC_004578	GCT	2	6	208152	208157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867425
4009	NC_004578	TGGT	2	8	208252	208259	0 %	50 %	50 %	0 %	28867425
4010	NC_004578	GGT	2	6	208278	208283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867425
4011	NC_004578	GTC	2	6	208313	208318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867425
4012	NC_004578	TTC	2	6	208362	208367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867425
4013	NC_004578	GC	3	6	208392	208397	0 %	0 %	50 %	50 %	28867425
4014	NC_004578	AACG	2	8	208420	208427	50 %	0 %	25 %	25 %	28867425
4015	NC_004578	ATC	2	6	208435	208440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867425
4016	NC_004578	GCCA	2	8	208462	208469	25 %	0 %	25 %	50 %	28867425
4017	NC_004578	GCC	2	6	208491	208496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867425
4018	NC_004578	CTG	2	6	208501	208506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867425
4019	NC_004578	GT	3	6	208546	208551	0 %	50 %	50 %	0 %	28867425
4020	NC_004578	CAC	2	6	208596	208601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867425
4021	NC_004578	CTGC	2	8	208626	208633	0 %	25 %	25 %	50 %	28867425
4022	NC_004578	TGC	2	6	208652	208657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867425
4023	NC_004578	TCA	2	6	208664	208669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867425
4024	NC_004578	ATC	2	6	208705	208710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867425
4025	NC_004578	GGT	2	6	208725	208730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867425
4026	NC_004578	TTC	3	9	208756	208764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867425
4027	NC_004578	AAG	2	6	208774	208779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867425
4028	NC_004578	CGT	2	6	208815	208820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867425
4029	NC_004578	GCC	2	6	208876	208881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867425
4030	NC_004578	CGG	2	6	208899	208904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867425
4031	NC_004578	TGT	2	6	208934	208939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867425
4032	NC_004578	TAC	3	9	209002	209010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867425
4033	NC_004578	AGA	2	6	209031	209036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867425
4034	NC_004578	TGC	2	6	209168	209173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867425
4035	NC_004578	GCA	2	6	209180	209185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867425
4036	NC_004578	CGT	2	6	209203	209208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867425
4037	NC_004578	GCG	2	6	209209	209214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867425
4038	NC_004578	GAA	2	6	209241	209246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867425
4039	NC_004578	GCTG	2	8	209319	209326	0 %	25 %	50 %	25 %	28867425
4040	NC_004578	TGCG	2	8	209357	209364	0 %	25 %	50 %	25 %	28867425
4041	NC_004578	ACGAAG	2	12	209369	209380	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	28867425
4042	NC_004578	TC	3	6	209400	209405	0 %	50 %	0 %	50 %	28867425
4043	NC_004578	GTGC	2	8	209407	209414	0 %	25 %	50 %	25 %	28867425
4044	NC_004578	GCC	2	6	209488	209493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867425
4045	NC_004578	CTG	2	6	209527	209532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867425
4046	NC_004578	GCA	2	6	209546	209551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867425
4047	NC_004578	CAG	2	6	209617	209622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867425
4048	NC_004578	TGC	2	6	209690	209695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867425
4049	NC_004578	GC	3	6	209754	209759	0 %	0 %	50 %	50 %	28867425
4050	NC_004578	GC	3	6	209779	209784	0 %	0 %	50 %	50 %	28867425
4051	NC_004578	GCT	2	6	209820	209825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867425
4052	NC_004578	CTG	2	6	209852	209857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867426
4053	NC_004578	ATCA	2	8	209879	209886	50 %	25 %	0 %	25 %	28867426
4054	NC_004578	GAG	2	6	209915	209920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28867426
4055	NC_004578	CCA	2	6	209991	209996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867426
4056	NC_004578	TTA	2	6	210019	210024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28867426
4057	NC_004578	CATG	2	8	210046	210053	25 %	25 %	25 %	25 %	28867426
4058	NC_004578	TGG	2	6	210069	210074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867426
4059	NC_004578	GGTT	2	8	210091	210098	0 %	50 %	50 %	0 %	28867426
4060	NC_004578	ACT	2	6	210183	210188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867426
4061	NC_004578	GGC	2	6	210346	210351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867426
4062	NC_004578	AAC	2	6	210389	210394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28867426
4063	NC_004578	GCT	2	6	210514	210519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867427
4064	NC_004578	GTG	2	6	210520	210525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867427
4065	NC_004578	TCA	2	6	210579	210584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867427
4066	NC_004578	GCG	2	6	210651	210656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867427
4067	NC_004578	CGTG	2	8	210678	210685	0 %	25 %	50 %	25 %	28867427
4068	NC_004578	ATC	2	6	210686	210691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867427
4069	NC_004578	CTT	2	6	210718	210723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867427
4070	NC_004578	CTT	2	6	210784	210789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867427
4071	NC_004578	TGC	2	6	210807	210812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867427
4072	NC_004578	CCATCG	2	12	210816	210827	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	28867427
4073	NC_004578	AAG	2	6	210866	210871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867427
4074	NC_004578	CGA	2	6	210874	210879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867427
4075	NC_004578	GGC	2	6	210962	210967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867427
4076	NC_004578	GAA	2	6	211051	211056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867427
4077	NC_004578	A	6	6	211256	211261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_004578	A	6	6	211352	211357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_004578	T	7	7	211377	211383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_004578	CTG	2	6	211456	211461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_004578	CAG	2	6	211521	211526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_004578	CAG	2	6	211569	211574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_004578	ACCG	2	8	211577	211584	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4084	NC_004578	CAG	2	6	211710	211715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_004578	GCGCT	2	10	211720	211729	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4086	NC_004578	CAG	2	6	211767	211772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_004578	GGC	2	6	211830	211835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_004578	CAC	2	6	211953	211958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4089	NC_004578	CGA	2	6	211999	212004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_004578	ATAG	2	8	212010	212017	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_004578	TCG	2	6	212107	212112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_004578	CG	3	6	212125	212130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4093	NC_004578	AAC	2	6	212139	212144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_004578	CCA	2	6	212168	212173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4095	NC_004578	TCCGA	2	10	212222	212231	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4096	NC_004578	CAC	2	6	212265	212270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4097	NC_004578	TTG	2	6	212308	212313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_004578	CGGT	2	8	212397	212404	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4099	NC_004578	GCAG	2	8	212593	212600	25 %	0 %	50 %	25 %	28867428
4100	NC_004578	GCC	2	6	212603	212608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867428
4101	NC_004578	CAG	2	6	212714	212719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867428
4102	NC_004578	ACG	2	6	212746	212751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867428
4103	NC_004578	GTG	2	6	212786	212791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867428
4104	NC_004578	AGCG	2	8	212801	212808	25 %	0 %	50 %	25 %	28867428
4105	NC_004578	ATC	2	6	212840	212845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867428
4106	NC_004578	CGC	2	6	212873	212878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867428
4107	NC_004578	TGC	2	6	212978	212983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867428
4108	NC_004578	GAAC	2	8	213028	213035	50 %	0 %	25 %	25 %	28867428
4109	NC_004578	GCC	2	6	213047	213052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867428
4110	NC_004578	CG	3	6	213086	213091	0 %	0 %	50 %	50 %	28867428
4111	NC_004578	CCG	2	6	213111	213116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867428
4112	NC_004578	TC	3	6	213174	213179	0 %	50 %	0 %	50 %	28867428
4113	NC_004578	TGC	2	6	213225	213230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867428
4114	NC_004578	CGG	2	6	213235	213240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867428
4115	NC_004578	CGGA	2	8	213264	213271	25 %	0 %	50 %	25 %	28867428
4116	NC_004578	GAA	2	6	213302	213307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867428
4117	NC_004578	ACT	2	6	213378	213383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867428
4118	NC_004578	GTG	2	6	213434	213439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867428
4119	NC_004578	GCCTG	2	10	213445	213454	0 %	20 %	40 %	40 %	28867428
4120	NC_004578	GCA	2	6	213462	213467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867428
4121	NC_004578	ACC	2	6	213584	213589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4122	NC_004578	GGCAG	2	10	213623	213632	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4123	NC_004578	GTG	2	6	213633	213638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_004578	TCG	2	6	213709	213714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_004578	GC	4	8	213742	213749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4126	NC_004578	TGG	2	6	213849	213854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4252	NC_004578	GAC	2	6	220709	220714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867432
4253	NC_004578	GCTTGC	2	12	220801	220812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867432
4254	NC_004578	ACT	2	6	220833	220838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867432
4255	NC_004578	TCA	2	6	220842	220847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867432
4256	NC_004578	GCA	2	6	220957	220962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867432
4257	NC_004578	CG	3	6	221023	221028	0 %	0 %	50 %	50 %	28867432
4258	NC_004578	AGC	2	6	221049	221054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867432
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4261	NC_004578	AGC	2	6	221189	221194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867433
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4263	NC_004578	TCG	2	6	221228	221233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867433
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4269	NC_004578	TCG	2	6	221599	221604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4270	NC_004578	CAT	2	6	221606	221611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4271	NC_004578	TTG	2	6	221707	221712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4272	NC_004578	AGC	2	6	221769	221774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4273	NC_004578	CAT	2	6	221850	221855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4274	NC_004578	GAAA	2	8	221869	221876	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4275	NC_004578	TTC	2	6	221971	221976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4277	NC_004578	ATC	2	6	222037	222042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4279	NC_004578	TCCT	2	8	222063	222070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4280	NC_004578	GCA	2	6	222190	222195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4281	NC_004578	ATC	2	6	222237	222242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4282	NC_004578	GGC	2	6	222353	222358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4283	NC_004578	ATT	2	6	222519	222524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4284	NC_004578	T	8	8	222532	222539	0 %	100 %	0 %	0 %	28867434
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4313	NC_004578	AAG	2	6	224361	224366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4371	NC_004578	GTA	2	6	226954	226959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867437
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