MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004578	GTC	2	6	157677	157682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867374
3002	NC_004578	AC	3	6	157716	157721	50 %	0 %	0 %	50 %	28867374
3003	NC_004578	ACG	2	6	157842	157847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867374
3004	NC_004578	GCTG	2	8	157861	157868	0 %	25 %	50 %	25 %	28867374
3005	NC_004578	TCA	2	6	157893	157898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867374
3006	NC_004578	TGC	2	6	157992	157997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867374
3007	NC_004578	TGC	2	6	158034	158039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867374
3008	NC_004578	GAA	2	6	158054	158059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867374
3009	NC_004578	CGC	2	6	158062	158067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867374
3010	NC_004578	GC	3	6	158156	158161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3011	NC_004578	GATC	2	8	158212	158219	25 %	25 %	25 %	25 %	28867375
3012	NC_004578	CGAC	2	8	158388	158395	25 %	0 %	25 %	50 %	28867375
3013	NC_004578	GGC	2	6	158537	158542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867375
3014	NC_004578	CAT	2	6	158590	158595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867375
3015	NC_004578	CAT	2	6	158758	158763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867375
3016	NC_004578	GGT	2	6	158769	158774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867375
3017	NC_004578	CGG	2	6	158779	158784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867375
3018	NC_004578	AAC	2	6	158808	158813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28867375
3019	NC_004578	GGT	2	6	158974	158979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_004578	GCG	2	6	158994	158999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_004578	GC	3	6	159002	159007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3022	NC_004578	AGG	2	6	159041	159046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_004578	AAG	2	6	159065	159070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867376
3024	NC_004578	CAA	2	6	159098	159103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28867376
3025	NC_004578	AAC	2	6	159189	159194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28867376
3026	NC_004578	CCG	2	6	159252	159257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867376
3027	NC_004578	GAA	2	6	159305	159310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867376
3028	NC_004578	AG	3	6	159382	159387	50 %	0 %	50 %	0 %	28867376
3029	NC_004578	AAG	2	6	159420	159425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867376
3030	NC_004578	ACC	2	6	159443	159448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867376
3031	NC_004578	CTG	2	6	159492	159497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867376
3032	NC_004578	GCC	2	6	159538	159543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867376
3033	NC_004578	AGC	2	6	159550	159555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867376
3034	NC_004578	AGCCA	2	10	159652	159661	40 %	0 %	20 %	40 %	28867376
3035	NC_004578	GCA	2	6	159662	159667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867376
3036	NC_004578	CAGCCG	2	12	159672	159683	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	28867376
3037	NC_004578	CTG	2	6	159750	159755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867376
3038	NC_004578	AGC	2	6	159773	159778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867376
3039	NC_004578	GCT	2	6	159791	159796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867376
3040	NC_004578	CGG	2	6	159804	159809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867376
3041	NC_004578	CTG	2	6	159867	159872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867376
3042	NC_004578	GCC	2	6	159899	159904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867376
3043	NC_004578	GTC	2	6	160015	160020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867377
3044	NC_004578	GCA	2	6	160041	160046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867377
3045	NC_004578	CTC	2	6	160114	160119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28867377
3046	NC_004578	CAC	2	6	160291	160296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867377
3047	NC_004578	TCG	2	6	160298	160303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867377
3048	NC_004578	CG	3	6	160362	160367	0 %	0 %	50 %	50 %	28867377
3049	NC_004578	CA	3	6	160397	160402	50 %	0 %	0 %	50 %	28867377
3050	NC_004578	CCG	2	6	160530	160535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867378
3051	NC_004578	CCTTA	2	10	160558	160567	20 %	40 %	0 %	40 %	28867378
3052	NC_004578	AGA	2	6	160591	160596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867378
3053	NC_004578	TGC	2	6	160677	160682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867378
3054	NC_004578	GC	3	6	160681	160686	0 %	0 %	50 %	50 %	28867378
3055	NC_004578	CTGC	2	8	160711	160718	0 %	25 %	25 %	50 %	28867378
3056	NC_004578	CCG	2	6	160722	160727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867378
3057	NC_004578	AGG	2	6	160752	160757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28867378
3058	NC_004578	GGCCGA	2	12	160834	160845	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	28867378
3059	NC_004578	GCG	2	6	160847	160852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867378
3060	NC_004578	GCT	2	6	160862	160867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867378
3061	NC_004578	GC	3	6	160871	160876	0 %	0 %	50 %	50 %	28867378
3062	NC_004578	CCG	2	6	160911	160916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867378
3063	NC_004578	CG	3	6	160918	160923	0 %	0 %	50 %	50 %	28867378
3064	NC_004578	GC	3	6	160925	160930	0 %	0 %	50 %	50 %	28867378
3065	NC_004578	GCT	2	6	160933	160938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867378
3066	NC_004578	CGG	2	6	160993	160998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867378
3067	NC_004578	CTG	2	6	161048	161053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867378
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3069	NC_004578	TGC	2	6	161136	161141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867378
3070	NC_004578	AGC	2	6	161199	161204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867378
3071	NC_004578	CAG	2	6	161270	161275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867378
3072	NC_004578	AGC	2	6	161292	161297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867378
3073	NC_004578	GC	3	6	161330	161335	0 %	0 %	50 %	50 %	28867378
3074	NC_004578	CCA	2	6	161349	161354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867378
3075	NC_004578	GCT	2	6	161473	161478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867378
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3077	NC_004578	CTGG	2	8	161612	161619	0 %	25 %	50 %	25 %	28867378
3078	NC_004578	CGGC	2	8	161638	161645	0 %	0 %	50 %	50 %	28867378
3079	NC_004578	GTG	2	6	161652	161657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867378
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3081	NC_004578	ACCG	2	8	161746	161753	25 %	0 %	25 %	50 %	28867378
3082	NC_004578	CGG	2	6	161782	161787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867378
3083	NC_004578	GC	3	6	161802	161807	0 %	0 %	50 %	50 %	28867378
3084	NC_004578	GTG	2	6	161838	161843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867378
3085	NC_004578	CTG	3	9	161891	161899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867378
3086	NC_004578	CGA	2	6	161902	161907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867378
3087	NC_004578	ACCA	2	8	161912	161919	50 %	0 %	0 %	50 %	28867378
3088	NC_004578	CCTGGA	2	12	161920	161931	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	28867378
3089	NC_004578	GCGGT	2	10	161970	161979	0 %	20 %	60 %	20 %	28867378
3090	NC_004578	TGG	2	6	161982	161987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867378
3091	NC_004578	CAC	2	6	162016	162021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867378
3092	NC_004578	CGA	2	6	162022	162027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867378
3093	NC_004578	CTG	2	6	162032	162037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867378
3094	NC_004578	GCTG	2	8	162090	162097	0 %	25 %	50 %	25 %	28867378
3095	NC_004578	A	6	6	162161	162166	100 %	0 %	0 %	0 %	28867378
3096	NC_004578	TGAA	2	8	162255	162262	50 %	25 %	25 %	0 %	28867378
3097	NC_004578	CAA	2	6	162316	162321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28867378
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3105	NC_004578	GCTG	2	8	162652	162659	0 %	25 %	50 %	25 %	28867379
3106	NC_004578	GTCGCG	2	12	162741	162752	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	28867379
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3108	NC_004578	GGT	2	6	162890	162895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867379
3109	NC_004578	CAC	2	6	162914	162919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867379
3110	NC_004578	CGG	2	6	162941	162946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867379
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3112	NC_004578	CGG	2	6	163042	163047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867379
3113	NC_004578	AAT	2	6	163063	163068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_004578	ACA	2	6	163081	163086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_004578	T	6	6	163152	163157	0 %	100 %	0 %	0 %	28867380
3116	NC_004578	CTG	2	6	163163	163168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867380
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3118	NC_004578	TGG	2	6	163276	163281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867380
3119	NC_004578	GGCGT	2	10	163362	163371	0 %	20 %	60 %	20 %	28867380
3120	NC_004578	GC	3	6	163400	163405	0 %	0 %	50 %	50 %	28867380
3121	NC_004578	CGA	2	6	163424	163429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867380
3122	NC_004578	CCG	2	6	163432	163437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867380
3123	NC_004578	ATC	2	6	163578	163583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867380
3124	NC_004578	TGGTCG	2	12	163594	163605	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	28867380
3125	NC_004578	TGCG	2	8	163651	163658	0 %	25 %	50 %	25 %	28867380
3126	NC_004578	TCG	2	6	163711	163716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867380
3127	NC_004578	CGCAT	2	10	163913	163922	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3128	NC_004578	TTG	2	6	163925	163930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_004578	GCT	2	6	163970	163975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867381
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3222	NC_004578	CCGCAT	2	12	168980	168991	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	28867385
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3235	NC_004578	GTA	2	6	169504	169509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3248	NC_004578	GCA	2	6	169929	169934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867386
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3373	NC_004578	TGC	2	6	176472	176477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867393
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3377	NC_004578	TCA	2	6	176725	176730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867394
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3386	NC_004578	TG	3	6	177050	177055	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3484	NC_004578	CA	3	6	181585	181590	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3489	NC_004578	CA	3	6	181887	181892	50 %	0 %	0 %	50 %	28867402
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3497	NC_004578	GCG	2	6	182094	182099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867402
3498	NC_004578	AGC	2	6	182132	182137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867402
3499	NC_004578	CTT	2	6	182152	182157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867402
3500	NC_004578	CGA	2	6	182265	182270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867402

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