MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_004578	AAG	2	6	108761	108766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867326
2003	NC_004578	TGG	2	6	108776	108781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867326
2004	NC_004578	TGG	2	6	108833	108838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867326
2005	NC_004578	CTG	3	9	109039	109047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867327
2006	NC_004578	TGC	2	6	109065	109070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867327
2007	NC_004578	TGG	2	6	109086	109091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867327
2008	NC_004578	CGCC	2	8	109212	109219	0 %	0 %	25 %	75 %	28867327
2009	NC_004578	CAG	2	6	109231	109236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867327
2010	NC_004578	GC	3	6	109256	109261	0 %	0 %	50 %	50 %	28867327
2011	NC_004578	GC	3	6	109338	109343	0 %	0 %	50 %	50 %	28867327
2012	NC_004578	TGGGGT	2	12	109350	109361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867327
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2014	NC_004578	CGG	2	6	109524	109529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867327
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2016	NC_004578	GCTG	2	8	109617	109624	0 %	25 %	50 %	25 %	28867327
2017	NC_004578	CAA	2	6	109632	109637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28867327
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2044	NC_004578	GA	3	6	111096	111101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2058	NC_004578	AT	3	6	111858	111863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_004578	AC	3	6	111938	111943	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2061	NC_004578	GAG	2	6	111957	111962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_004578	ACC	2	6	111975	111980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867332
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2094	NC_004578	GC	3	6	113315	113320	0 %	0 %	50 %	50 %	28867332
2095	NC_004578	GT	3	6	113326	113331	0 %	50 %	50 %	0 %	28867332
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2104	NC_004578	CATG	2	8	113798	113805	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2109	NC_004578	GTC	2	6	114070	114075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867334
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2112	NC_004578	TCGG	2	8	114135	114142	0 %	25 %	50 %	25 %	28867334
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2116	NC_004578	TGG	2	6	114277	114282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867334
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2120	NC_004578	TGCC	2	8	114487	114494	0 %	25 %	25 %	50 %	28867334
2121	NC_004578	GTG	3	9	114609	114617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867334
2122	NC_004578	GCT	2	6	114629	114634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867334
2123	NC_004578	CG	3	6	114675	114680	0 %	0 %	50 %	50 %	28867334
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2125	NC_004578	TGC	2	6	114703	114708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867334
2126	NC_004578	CTG	2	6	114720	114725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867334
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2247	NC_004578	CT	3	6	120356	120361	0 %	50 %	0 %	50 %	28867340
2248	NC_004578	CTT	2	6	120366	120371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867340
2249	NC_004578	CAG	2	6	120430	120435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867340
2250	NC_004578	GCG	2	6	120538	120543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867340
2251	NC_004578	CAG	2	6	120598	120603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867340
2252	NC_004578	ATG	2	6	120647	120652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867340
2253	NC_004578	ACGC	2	8	120673	120680	25 %	0 %	25 %	50 %	28867340
2254	NC_004578	TTA	2	6	121023	121028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28867341
2255	NC_004578	CGG	2	6	121073	121078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867341
2256	NC_004578	CGCCT	2	10	121128	121137	0 %	20 %	20 %	60 %	28867341
2257	NC_004578	GCT	2	6	121176	121181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867341
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2259	NC_004578	TGA	2	6	121332	121337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867341
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2271	NC_004578	GCCAG	2	10	122015	122024	20 %	0 %	40 %	40 %	28867341
2272	NC_004578	GTC	3	9	122291	122299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867342
2273	NC_004578	ATGAC	2	10	122337	122346	40 %	20 %	20 %	20 %	28867342
2274	NC_004578	AGC	2	6	122358	122363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867342
2275	NC_004578	TCG	2	6	122568	122573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867342
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2281	NC_004578	CTG	2	6	122907	122912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867343
2282	NC_004578	T	6	6	122922	122927	0 %	100 %	0 %	0 %	28867343
2283	NC_004578	CGA	2	6	122933	122938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867343
2284	NC_004578	GGT	2	6	122972	122977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867343
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2286	NC_004578	GTC	2	6	123138	123143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867343
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2297	NC_004578	AAT	2	6	123812	123817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28867344
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2300	NC_004578	CTCAG	2	10	124091	124100	20 %	20 %	20 %	40 %	28867345
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2308	NC_004578	CGG	2	6	124649	124654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867346
2309	NC_004578	CTG	2	6	124665	124670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867346
2310	NC_004578	CAT	2	6	124694	124699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28867346
2311	NC_004578	GCC	2	6	124700	124705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867346
2312	NC_004578	GAC	2	6	124731	124736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867346
2313	NC_004578	GAA	2	6	124742	124747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28867346
2314	NC_004578	GCA	2	6	124814	124819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2315	NC_004578	CAGC	2	8	125006	125013	25 %	0 %	25 %	50 %	28867347
2316	NC_004578	CGC	2	6	125147	125152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867347
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2319	NC_004578	CAG	2	6	125238	125243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867347
2320	NC_004578	CAG	2	6	125252	125257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867347
2321	NC_004578	CGC	2	6	125270	125275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867347
2322	NC_004578	TGG	2	6	125305	125310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867347
2323	NC_004578	CG	3	6	125321	125326	0 %	0 %	50 %	50 %	28867347
2324	NC_004578	GAC	2	6	125328	125333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867347
2325	NC_004578	CTG	2	6	125385	125390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867347
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2328	NC_004578	CTG	2	6	125505	125510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867347
2329	NC_004578	CGG	2	6	125612	125617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867347
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2331	NC_004578	GCT	2	6	125816	125821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867347
2332	NC_004578	GCG	2	6	125846	125851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867347
2333	NC_004578	ATGCCG	2	12	125860	125871	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	28867347
2334	NC_004578	TGG	2	6	125939	125944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867347
2335	NC_004578	T	6	6	125946	125951	0 %	100 %	0 %	0 %	28867347
2336	NC_004578	CCG	2	6	125992	125997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28867347
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2338	NC_004578	CGGG	2	8	126155	126162	0 %	0 %	75 %	25 %	28867347
2339	NC_004578	GCG	2	6	126169	126174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867347
2340	NC_004578	GGC	2	6	126177	126182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867347
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2342	NC_004578	TGC	2	6	126238	126243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867347
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2344	NC_004578	ACG	2	6	126303	126308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867347
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2346	NC_004578	TGC	2	6	126527	126532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867347
2347	NC_004578	CGT	2	6	126541	126546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867347
2348	NC_004578	GAG	2	6	126585	126590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28867347
2349	NC_004578	CTG	2	6	126597	126602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867347
2350	NC_004578	GCA	2	6	126698	126703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867347
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2353	NC_004578	CCTG	2	8	126983	126990	0 %	25 %	25 %	50 %	28867348
2354	NC_004578	GC	3	6	127028	127033	0 %	0 %	50 %	50 %	28867348
2355	NC_004578	GAT	2	6	127068	127073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867348
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2357	NC_004578	ACC	2	6	127176	127181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867348
2358	NC_004578	AGC	2	6	127192	127197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867348
2359	NC_004578	GC	3	6	127237	127242	0 %	0 %	50 %	50 %	28867348
2360	NC_004578	GCA	2	6	127295	127300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867348
2361	NC_004578	GGC	2	6	127319	127324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867348
2362	NC_004578	TGA	2	6	127349	127354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867348
2363	NC_004578	GCG	2	6	127403	127408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867348
2364	NC_004578	CGG	2	6	127532	127537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867348
2365	NC_004578	CAGC	2	8	127547	127554	25 %	0 %	25 %	50 %	28867348
2366	NC_004578	GCT	2	6	127567	127572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867348
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2368	NC_004578	GAT	2	6	127659	127664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867348
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2370	NC_004578	CTT	2	6	127717	127722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28867349
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2372	NC_004578	GCA	2	6	127776	127781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867349
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2437	NC_004578	TGCG	2	8	131419	131426	0 %	25 %	50 %	25 %	28867351
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2440	NC_004578	AAGCG	2	10	131736	131745	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2441	NC_004578	TG	3	6	131788	131793	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2442	NC_004578	CTTA	2	8	131807	131814	25 %	50 %	0 %	25 %	28867352
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2457	NC_004578	GTG	2	6	132422	132427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2459	NC_004578	GAT	2	6	132573	132578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867353
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2482	NC_004578	GCTTG	2	10	133373	133382	0 %	40 %	40 %	20 %	28867353
2483	NC_004578	CGGT	2	8	133423	133430	0 %	25 %	50 %	25 %	28867353
2484	NC_004578	GTT	2	6	133560	133565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28867353
2485	NC_004578	GCGCA	2	10	133582	133591	20 %	0 %	40 %	40 %	28867353
2486	NC_004578	TGG	2	6	133601	133606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28867353
2487	NC_004578	GAC	2	6	133629	133634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867353
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2490	NC_004578	CAC	2	6	133685	133690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867353
2491	NC_004578	GTC	3	9	133710	133718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867353
2492	NC_004578	CAC	2	6	133722	133727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867353
2493	NC_004578	CAG	2	6	133752	133757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867353
2494	NC_004578	CAG	2	6	133764	133769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28867353
2495	NC_004578	ACTG	2	8	133772	133779	25 %	25 %	25 %	25 %	28867353
2496	NC_004578	CCA	2	6	133802	133807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28867353
2497	NC_004578	GGC	2	6	133947	133952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28867353
2498	NC_004578	GGCA	2	8	133992	133999	25 %	0 %	50 %	25 %	28867353
2499	NC_004578	CGT	2	6	134051	134056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28867353
2500	NC_004578	ATG	2	6	134077	134082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28867353

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