MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_004578	CGC	2	6	940064	940069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28868092
18503	NC_004578	TGA	2	6	940074	940079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28868092
18504	NC_004578	GC	3	6	940098	940103	0 %	0 %	50 %	50 %	28868092
18505	NC_004578	ATTG	2	8	940117	940124	25 %	50 %	25 %	0 %	28868092
18506	NC_004578	GAT	2	6	940168	940173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28868092
18507	NC_004578	GCCG	2	8	940207	940214	0 %	0 %	50 %	50 %	28868092
18508	NC_004578	T	6	6	940249	940254	0 %	100 %	0 %	0 %	28868092
18509	NC_004578	TGC	2	6	940303	940308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28868092
18510	NC_004578	GC	3	6	940320	940325	0 %	0 %	50 %	50 %	28868092
18511	NC_004578	GCT	2	6	940389	940394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28868092
18512	NC_004578	GTT	2	6	940399	940404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28868092
18513	NC_004578	GAGT	2	8	940462	940469	25 %	25 %	50 %	0 %	28868092
18514	NC_004578	GCC	2	6	940512	940517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28868092
18515	NC_004578	TTG	2	6	940577	940582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28868092
18516	NC_004578	CGG	2	6	940597	940602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28868092
18517	NC_004578	GCCA	2	8	940689	940696	25 %	0 %	25 %	50 %	28868092
18518	NC_004578	GCCG	2	8	940759	940766	0 %	0 %	50 %	50 %	28868092
18519	NC_004578	CGC	2	6	940780	940785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28868092
18520	NC_004578	GT	3	6	940787	940792	0 %	50 %	50 %	0 %	28868092
18521	NC_004578	TGC	2	6	940845	940850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28868092
18522	NC_004578	AGC	2	6	940853	940858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28868092
18523	NC_004578	T	7	7	941024	941030	0 %	100 %	0 %	0 %	28868092
18524	NC_004578	CCG	2	6	941034	941039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28868092
18525	NC_004578	GCAC	2	8	941058	941065	25 %	0 %	25 %	50 %	28868092
18526	NC_004578	CATGG	2	10	941093	941102	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18527	NC_004578	GAT	2	6	941212	941217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18528	NC_004578	CGCCGA	2	12	941221	941232	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18529	NC_004578	AAGC	2	8	941249	941256	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18530	NC_004578	CCG	2	6	941321	941326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18531	NC_004578	TGC	2	6	941334	941339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18532	NC_004578	TTG	2	6	941430	941435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18533	NC_004578	TGA	2	6	941461	941466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18534	NC_004578	GC	3	6	941520	941525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18535	NC_004578	G	11	11	941645	941655	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18536	NC_004578	T	6	6	941780	941785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18537	NC_004578	A	7	7	941852	941858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18538	NC_004578	ATC	2	6	941878	941883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18539	NC_004578	CTG	2	6	941887	941892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18540	NC_004578	GCG	2	6	941983	941988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18541	NC_004578	GGA	2	6	942099	942104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28868093
18542	NC_004578	TCG	2	6	942110	942115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28868093
18543	NC_004578	GAT	2	6	942124	942129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28868093
18544	NC_004578	T	7	7	942189	942195	0 %	100 %	0 %	0 %	28868093
18545	NC_004578	AAG	2	6	942248	942253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28868093
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18547	NC_004578	CAT	2	6	942330	942335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28868093
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18549	NC_004578	A	7	7	942406	942412	100 %	0 %	0 %	0 %	28868093
18550	NC_004578	TCAG	2	8	942488	942495	25 %	25 %	25 %	25 %	28868093
18551	NC_004578	TAT	2	6	942588	942593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28868093
18552	NC_004578	CGC	2	6	942618	942623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28868093
18553	NC_004578	GCAGC	2	10	942657	942666	20 %	0 %	40 %	40 %	28868093
18554	NC_004578	TCA	2	6	942806	942811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28868093
18555	NC_004578	CCTC	2	8	942871	942878	0 %	25 %	0 %	75 %	28868093
18556	NC_004578	CGG	2	6	943053	943058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28868093
18557	NC_004578	GGA	2	6	943096	943101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28868093
18558	NC_004578	A	8	8	943217	943224	100 %	0 %	0 %	0 %	28868094
18559	NC_004578	TGG	2	6	943228	943233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28868094
18560	NC_004578	TTC	2	6	943235	943240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28868094
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18565	NC_004578	TGC	2	6	943481	943486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28868094
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18567	NC_004578	GGGC	2	8	943625	943632	0 %	0 %	75 %	25 %	28868094
18568	NC_004578	CT	3	6	943664	943669	0 %	50 %	0 %	50 %	28868094
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18571	NC_004578	CGGCTT	2	12	944021	944032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28868094
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18580	NC_004578	CGAT	2	8	944600	944607	25 %	25 %	25 %	25 %	28868095
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18587	NC_004578	TGA	2	6	945051	945056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28868095
18588	NC_004578	ATGA	2	8	945067	945074	50 %	25 %	25 %	0 %	28868095
18589	NC_004578	AC	3	6	945243	945248	50 %	0 %	0 %	50 %	28868095
18590	NC_004578	CGAG	2	8	945267	945274	25 %	0 %	50 %	25 %	28868095
18591	NC_004578	TGT	2	6	945275	945280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28868095
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18593	NC_004578	A	6	6	945514	945519	100 %	0 %	0 %	0 %	28868095
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18596	NC_004578	TGCA	2	8	945731	945738	25 %	25 %	25 %	25 %	28868095
18597	NC_004578	GCA	2	6	945813	945818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18599	NC_004578	GCGA	2	8	945974	945981	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18600	NC_004578	CCG	2	6	946069	946074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18601	NC_004578	TCG	2	6	946083	946088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18602	NC_004578	GT	3	6	946093	946098	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18603	NC_004578	GTG	2	6	946107	946112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18604	NC_004578	GTCT	2	8	946145	946152	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18605	NC_004578	CA	3	6	946177	946182	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18606	NC_004578	CAACA	2	10	946243	946252	60 %	0 %	0 %	40 %	28868096
18607	NC_004578	ATTTCA	2	12	946443	946454	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	28868096
18608	NC_004578	TCTG	2	8	946493	946500	0 %	50 %	25 %	25 %	28868096
18609	NC_004578	TAA	2	6	946539	946544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28868096
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18611	NC_004578	TCT	2	6	946672	946677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28868096
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18990	NC_004578	G	6	6	966327	966332	0 %	0 %	100 %	0 %	28868109
18991	NC_004578	CGC	2	6	966432	966437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28868109
18992	NC_004578	CGC	2	6	966465	966470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28868109
18993	NC_004578	CAC	2	6	966535	966540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28868109
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