MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_004578	CGG	2	6	913316	913321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28868067
18003	NC_004578	TCA	2	6	913371	913376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28868067
18004	NC_004578	GCT	2	6	913489	913494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18005	NC_004578	TGA	2	6	913606	913611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18006	NC_004578	AGT	2	6	913615	913620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18007	NC_004578	GCAAGC	2	12	913641	913652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18008	NC_004578	GTC	2	6	913739	913744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18009	NC_004578	TTGA	2	8	913871	913878	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18010	NC_004578	TGC	2	6	913911	913916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18011	NC_004578	ACC	2	6	913919	913924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18012	NC_004578	GCG	2	6	914025	914030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18013	NC_004578	CG	3	6	914219	914224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18014	NC_004578	GCT	2	6	914242	914247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18015	NC_004578	TGA	2	6	914268	914273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18016	NC_004578	TGA	2	6	914275	914280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18017	NC_004578	GCG	2	6	914347	914352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18018	NC_004578	GAT	2	6	914419	914424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18019	NC_004578	CGA	2	6	914467	914472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18020	NC_004578	GCTG	2	8	914529	914536	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18021	NC_004578	CGC	2	6	914559	914564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18022	NC_004578	ACA	2	6	914652	914657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18023	NC_004578	GC	3	6	914668	914673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18024	NC_004578	TGC	2	6	914862	914867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18025	NC_004578	TGGT	2	8	914926	914933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18026	NC_004578	GACG	2	8	914967	914974	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18027	NC_004578	CTG	2	6	915006	915011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18028	NC_004578	TCAT	2	8	915044	915051	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18029	NC_004578	ACC	2	6	915058	915063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18030	NC_004578	GCC	2	6	915070	915075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18031	NC_004578	TCAC	2	8	915146	915153	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18032	NC_004578	CAG	2	6	915196	915201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18033	NC_004578	CAG	2	6	915220	915225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18034	NC_004578	TGC	2	6	915243	915248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18035	NC_004578	ACC	2	6	915255	915260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18036	NC_004578	GGT	2	6	915292	915297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18037	NC_004578	GT	3	6	915350	915355	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18038	NC_004578	CAT	2	6	915375	915380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18039	NC_004578	AGAA	2	8	915401	915408	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18040	NC_004578	CGT	2	6	915429	915434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18041	NC_004578	TCGT	2	8	915500	915507	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18042	NC_004578	CCT	2	6	915519	915524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18043	NC_004578	AGC	2	6	915530	915535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18044	NC_004578	CATC	2	8	915561	915568	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18045	NC_004578	GCT	2	6	915614	915619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18046	NC_004578	ACC	2	6	915651	915656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18047	NC_004578	CAG	2	6	915806	915811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18048	NC_004578	ATG	2	6	915815	915820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18049	NC_004578	TCG	2	6	915884	915889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18050	NC_004578	TGA	3	9	915921	915929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18051	NC_004578	GGC	2	6	915931	915936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18052	NC_004578	CCA	2	6	915948	915953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18053	NC_004578	TGA	2	6	915990	915995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18054	NC_004578	CCA	2	6	916002	916007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18055	NC_004578	GT	3	6	916037	916042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18056	NC_004578	CAT	2	6	916045	916050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28868068
18057	NC_004578	CGT	2	6	916081	916086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28868068
18058	NC_004578	CAG	2	6	916107	916112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28868068
18059	NC_004578	CAG	2	6	916323	916328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28868068
18060	NC_004578	T	7	7	916376	916382	0 %	100 %	0 %	0 %	28868068
18061	NC_004578	GTC	2	6	916385	916390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28868068
18062	NC_004578	TGG	2	6	916403	916408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28868068
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18064	NC_004578	GTT	3	9	916601	916609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28868069
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18067	NC_004578	CAT	2	6	916636	916641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28868069
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18083	NC_004578	TGGCC	2	10	917275	917284	0 %	20 %	40 %	40 %	28868069
18084	NC_004578	CCGC	2	8	917313	917320	0 %	0 %	25 %	75 %	28868069
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18097	NC_004578	CTGA	2	8	918021	918028	25 %	25 %	25 %	25 %	28868070
18098	NC_004578	GC	3	6	918089	918094	0 %	0 %	50 %	50 %	28868070
18099	NC_004578	TCG	2	6	918122	918127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28868070
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18111	NC_004578	GCA	3	9	918784	918792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28868071
18112	NC_004578	CCG	2	6	918815	918820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28868071
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18122	NC_004578	GGT	2	6	919218	919223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18124	NC_004578	TGG	2	6	919292	919297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18125	NC_004578	AGC	2	6	919327	919332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18126	NC_004578	CGC	2	6	919357	919362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18127	NC_004578	TGG	2	6	919371	919376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18128	NC_004578	CTG	3	9	919394	919402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18129	NC_004578	CT	3	6	919404	919409	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18130	NC_004578	AG	3	6	919443	919448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18131	NC_004578	CGT	2	6	919468	919473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18133	NC_004578	TGC	3	9	919552	919560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18134	NC_004578	CTCA	2	8	919566	919573	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18135	NC_004578	CA	3	6	919572	919577	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18136	NC_004578	CAAT	2	8	919634	919641	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18137	NC_004578	TGC	2	6	919726	919731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28868072
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18146	NC_004578	GA	3	6	920222	920227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18147	NC_004578	T	6	6	920358	920363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18249	NC_004578	ACGG	2	8	926546	926553	25 %	0 %	50 %	25 %	28868076
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18494	NC_004578	CAC	2	6	939695	939700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18495	NC_004578	ATC	2	6	939803	939808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18496	NC_004578	TTCCC	2	10	939826	939835	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
18497	NC_004578	ACA	2	6	939843	939848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18498	NC_004578	GAT	2	6	939883	939888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28868092
18499	NC_004578	GTTC	2	8	939934	939941	0 %	50 %	25 %	25 %	28868092
18500	NC_004578	TGG	2	6	939947	939952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28868092

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