MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 chromosome

Total Repeats: 125962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_004578	CG	3	6	863025	863030	0 %	0 %	50 %	50 %	28868024
17003	NC_004578	AC	3	6	863136	863141	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17004	NC_004578	GCA	2	6	863181	863186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17005	NC_004578	GCCA	2	8	863234	863241	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17006	NC_004578	CTT	2	6	863247	863252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17007	NC_004578	CTG	2	6	863405	863410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28868025
17008	NC_004578	CGA	2	6	863422	863427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28868025
17009	NC_004578	GTT	2	6	863447	863452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28868025
17010	NC_004578	ATC	2	6	863510	863515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28868025
17011	NC_004578	CGT	3	9	863522	863530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28868025
17012	NC_004578	CAC	2	6	863534	863539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28868025
17013	NC_004578	A	6	6	863644	863649	100 %	0 %	0 %	0 %	28868026
17014	NC_004578	TGG	2	6	863652	863657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28868026
17015	NC_004578	GGC	2	6	863713	863718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28868026
17016	NC_004578	ATC	2	6	863725	863730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28868026
17017	NC_004578	CAT	2	6	863739	863744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28868026
17018	NC_004578	TCAAG	2	10	863841	863850	40 %	20 %	20 %	20 %	28868026
17019	NC_004578	GTC	2	6	863861	863866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28868026
17020	NC_004578	T	6	6	863949	863954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17021	NC_004578	GTAGAG	2	12	863959	863970	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
17022	NC_004578	TGT	2	6	864008	864013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17023	NC_004578	GCGT	2	8	864118	864125	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17024	NC_004578	CGG	2	6	864171	864176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28868027
17025	NC_004578	GGT	2	6	864220	864225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28868027
17026	NC_004578	CGG	2	6	864231	864236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28868027
17027	NC_004578	GCG	2	6	864332	864337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28868027
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17029	NC_004578	TGC	2	6	864386	864391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28868027
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17031	NC_004578	CAT	2	6	864411	864416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28868027
17032	NC_004578	CCA	2	6	864422	864427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28868027
17033	NC_004578	ATC	2	6	864436	864441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28868027
17034	NC_004578	TGACC	2	10	864444	864453	20 %	20 %	20 %	40 %	28868027
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17038	NC_004578	CAC	2	6	864699	864704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28868027
17039	NC_004578	GTC	2	6	864754	864759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28868027
17040	NC_004578	CTG	3	9	864844	864852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28868027
17041	NC_004578	GCTG	2	8	864959	864966	0 %	25 %	50 %	25 %	28868027
17042	NC_004578	AAG	2	6	865079	865084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28868027
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17044	NC_004578	CAT	2	6	865107	865112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28868027
17045	NC_004578	GC	5	10	865204	865213	0 %	0 %	50 %	50 %	28868027
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17049	NC_004578	GCG	2	6	865388	865393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17050	NC_004578	CT	3	6	865417	865422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17051	NC_004578	GAA	2	6	865434	865439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17052	NC_004578	GCA	2	6	865445	865450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28868028
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17054	NC_004578	TGG	2	6	865556	865561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28868028
17055	NC_004578	GCTGGT	2	12	865584	865595	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	28868028
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17057	NC_004578	TGC	2	6	865611	865616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28868028
17058	NC_004578	CTG	2	6	865756	865761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28868028
17059	NC_004578	ACG	2	6	865766	865771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28868028
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17062	NC_004578	CGA	2	6	865875	865880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28868028
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17064	NC_004578	GGC	2	6	865908	865913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28868028
17065	NC_004578	CTG	2	6	865942	865947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28868028
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17067	NC_004578	CAA	2	6	865992	865997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28868028
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17069	NC_004578	GCGG	2	8	866056	866063	0 %	0 %	75 %	25 %	28868028
17070	NC_004578	GGC	2	6	866086	866091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28868028
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17075	NC_004578	GC	3	6	866242	866247	0 %	0 %	50 %	50 %	28868028
17076	NC_004578	TGGC	3	12	866254	866265	0 %	25 %	50 %	25 %	28868028
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17081	NC_004578	TCGC	2	8	866423	866430	0 %	25 %	25 %	50 %	28868028
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17086	NC_004578	TGG	2	6	866679	866684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28868029
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17089	NC_004578	GCTG	2	8	866791	866798	0 %	25 %	50 %	25 %	28868029
17090	NC_004578	CGA	2	6	866872	866877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28868029
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17097	NC_004578	T	6	6	867240	867245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17098	NC_004578	GCA	3	9	867267	867275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28868030
17099	NC_004578	GAC	2	6	867304	867309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28868030
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17102	NC_004578	T	6	6	867512	867517	0 %	100 %	0 %	0 %	28868030
17103	NC_004578	GT	3	6	867526	867531	0 %	50 %	50 %	0 %	28868030
17104	NC_004578	CTC	2	6	867546	867551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17105	NC_004578	CAAA	2	8	867571	867578	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17106	NC_004578	GAT	2	6	867662	867667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28868031
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17108	NC_004578	TGGC	2	8	867742	867749	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17109	NC_004578	CGC	2	6	867809	867814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28868032
17110	NC_004578	CAT	2	6	867866	867871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28868032
17111	NC_004578	TTC	2	6	867909	867914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28868032
17112	NC_004578	CTG	2	6	867936	867941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28868032
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17119	NC_004578	TA	3	6	868197	868202	50 %	50 %	0 %	0 %	28868032
17120	NC_004578	TTC	2	6	868305	868310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28868032
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17122	NC_004578	GCTGG	2	10	868352	868361	0 %	20 %	60 %	20 %	28868032
17123	NC_004578	TGC	2	6	868381	868386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28868032
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17125	NC_004578	TGC	2	6	868432	868437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28868032
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17228	NC_004578	GCC	2	6	873411	873416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28868035
17229	NC_004578	GCTG	2	8	873451	873458	0 %	25 %	50 %	25 %	28868035
17230	NC_004578	TGG	2	6	873493	873498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28868035
17231	NC_004578	GAT	2	6	873522	873527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28868035
17232	NC_004578	CTGG	2	8	873530	873537	0 %	25 %	50 %	25 %	28868035
17233	NC_004578	GCGCTG	2	12	873543	873554	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	28868035
17234	NC_004578	GCG	2	6	873562	873567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28868035
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17236	NC_004578	GTC	2	6	873756	873761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28868036
17237	NC_004578	GTG	2	6	874105	874110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28868036
17238	NC_004578	GGCA	2	8	874158	874165	25 %	0 %	50 %	25 %	28868036
17239	NC_004578	GCT	2	6	874251	874256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17240	NC_004578	CG	3	6	874353	874358	0 %	0 %	50 %	50 %	28868037
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17360	NC_004578	CTATGC	2	12	880274	880285	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	28868043
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17483	NC_004578	CGG	2	6	886985	886990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28868048
17484	NC_004578	CAGGGT	2	12	887003	887014	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	28868048
17485	NC_004578	ATGCC	2	10	887020	887029	20 %	20 %	20 %	40 %	28868048
17486	NC_004578	TCT	2	6	887089	887094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28868048
17487	NC_004578	GC	3	6	887305	887310	0 %	0 %	50 %	50 %	28868049
17488	NC_004578	CTG	2	6	887353	887358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28868049
17489	NC_004578	GC	3	6	887376	887381	0 %	0 %	50 %	50 %	28868049
17490	NC_004578	CG	3	6	887396	887401	0 %	0 %	50 %	50 %	28868049
17491	NC_004578	TCA	2	6	887438	887443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28868049
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17495	NC_004578	TTG	2	6	887720	887725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28868049
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17499	NC_004578	CCG	2	6	887976	887981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28868049
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